胡桃坂仁志 (Hitoshi Kurumizaka) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学定量生命科学研究所教授
: (兼任)大学院理学系研究科教授

学位: 博士(学術)(埼玉大学)

J-GLOBAL ID: 200901022444507243
researchmap会員ID: 5000098770

外部リンク: https://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/lab/kurumizaka/

研究キーワード

研究分野

経歴

2018年4月 - 現在

東京大学, 定量生命科学研究所, 教授
2008年4月 - 2018年3月

早稲田大学, 理工学術院電気・情報生命工学科, 教授
2007年4月 - 2008年3月

早稲田大学, 理工学術院電気・情報生命工学科, 准教授
2004年9月 - 2007年3月

早稲田大学, 理工学術院電気・情報生命工学科, 助教授
2003年4月 - 2004年8月

早稲田大学, 理工学部電気・情報生命工学科, 助教授
1997年6月 - 2003年3月

理化学研究所, 研究員
1997年4月 - 1997年5月

National Institutes of Health, National Institute of Child Health and Human Development, Visiting Fellow
1996年4月 - 1997年3月

National Institutes of Health, National Institute of Child Health and Human Development （日本学術振興会）, 日本学術振興会海外特別研究員
1995年6月 - 1996年3月

National Institutes of Health, National Institute of Child Health and Human Development, Visiting Fellow
1995年4月 - 1995年5月

理化学研究所, 奨励研究員

学歴

1992年4月 - 1995年3月

埼玉大学大学院, 理工学研究科博士後期課程
1991年4月 - 1992年3月

東京薬科大学大学院, 薬学研究科博士後期課程
1989年4月 - 1991年3月

東京薬科大学大学院, 薬学研究科博士前期課程
1985年4月 - 1989年3月

東京薬科大学, 薬学部, 衛生薬学科

受賞

2025年3月

令和6年度東レ科学技術賞, ゲノム機能制御におけるクロマチン構造と機能の解明, 公益財団法人東レ科学振興会

胡桃坂仁志
2023年1月

上原賞, 上原記念生命科学財団
2021年4月

科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞研究部門, 文部科学省

胡桃坂仁志
2020年11月

持田記念学術賞, エピゲノム創薬のクロマチン構造基盤の構築, 公益財団法人持田記念医学薬学振興財団

胡桃坂仁志
2018年6月

柿内三郎記念賞, 公益社団法人日本生化学会

胡桃坂仁志
2018年4月

名誉教授, 早稲田大学

胡桃坂仁志

主要な論文

374

ImmuBubbles: Antibody-Shelled Gas-Core Nanobubbles as Ultrasound Contrast Agents.

Hamano N, Yano Y, Yamaguchi T, Yokota K, Tsubaki N, Obara M, Endo-Takahashi Y, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H, Kikkawa Y, Negishi Y.

ACS Appl. Nano Mater. 2026年2月11日査読有り
Structural basis of transcription-coupled H3K36 trimethylation by Set2 in coordination with FACT.

Kujirai T, Ehara H, Ito T, Henmi M, Oya E, Kobayashi T, Sekine SI, Kurumizaka H.

Sci Adv. 12(5) eaed1952 2026年1月30日査読有り
Reconstructing epigenomic dynamics through a single-cell multi-epigenome data integration framework.

Fujii T, Tomimatsu K, Kato M, Ito M, Sato S, Kurumizaka H, Sato Y, Maehara K, Kimura H, Harada A, Ohkawa Y.

Nat Commun. 16(1) 11006 2025年12月17日査読有り
A method for cryo-EM analysis of eukaryotic nucleosomes reconstituted in bacterial cells.

Ho CH, Kobayashi Y, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H.

iScience 29(1) 114453 2025年12月16日査読有り
Gene-scale in vitro reconstitution reveals histone acetylation directly controls chromatin architecture.

Fukai YT, Kujirai T, Wakamori M, Kanamura S, Yamauchi L, Zeraati S, Morita S, Tanegashima C, Kadota M, Shirouzu M, Kurumizaka H, Umehara T, Kawaguchi K.

Sci. Adv. 11(47) eadx9282 2025年11月19日査読有り
Structural basis of cyclobutane pyrimidine dimer recognition by UV-DDB in the nucleosome.

Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H.

Nat Commun. 16(1) 9709 2025年11月11日査読有り
Preparation of Chromatin Fragments From Human Cells for Cryo-EM Analysis.

Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Bio Protoc. 15(20) e5472 2025年10月20日査読有り
Intrinsically disordered region of Clr4/Suv39 regulates its enzymatic activity and ensures heterochromatin spreading.

Nakamura R, Hayashi A, Nakagawa R, Yoshimura Y, Horikoshi N, Kurumizaka H, Nakayama JI.

Nucleic Acids Res. 53(17) gkaf878 2025年9月5日査読有り
Exploring cadmium-binding proteins in Japanese scallops Mizuhopecten yessoensis: isolation and characterization.

Zheng Z, Namikawa Y, Kato Y, Lu P, Negishi L, Kurumizaka H, Nagata K, Suzuki M.

Environ Sci Pollut Res Int. 32(31) 18961-18974 2025年8月5日査読有り
The Gln-rich protein twip1 promotes high-density {110} twins formation in the shell of the limpet Cellana rota.

Li S, Liu X, Zheng Z, Oshima K, Zhu L, Kato Y, Negishi L, Kurumizaka H, Okumura T, Nagata K, Pokroy B, Suzuki M.

Proc Natl Acad Sci U S A. 122(30) e2503336122 2025年7月29日査読有り
Structural basis of RNAPII transcription on the nucleosome containing histone variant H2A.B.

Akatsu M, Hirano R, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine SI, Takizawa Y, Kurumizaka H.

EMBO J. 44(14) 4065-4087 2025年7月15日査読有り
Structural diversity of noncanonical nucleosomes: Functions in chromatin.

Hatazawa S, Horikoshi N, Kurumizaka H.

Curr Opin Struct Biol. 92 103054 2025年6月査読有り
Multiple structures of RNA polymerase II isolated from human nuclei by ChIP-CryoEM analysis.

Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Fujii T, Maehara K, Harada A, Negishi L, Ogasawara M, Yamaguchi Y, Ohkawa Y, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Nat Commun. 16(1) 4724 2025年5月28日査読有り
Structural basis of RNA polymerase II transcription on the H3-H4 octasome.

Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine SI, Takizawa Y, Kurumizaka H.

bioRxiv 2025.05.13.653634 2025年5月13日
Cryo-EM Structures of Native Chromatin Units From Human Cells.

Hatazawa S, Fukuda Y, Kobayashi Y, Negishi L, Kikkawa M, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Genes Cells. 30(3) e70019 2025年5月査読有り
Microfluidic nanobubbles produced using a micromixer for ultrasound imaging and gene delivery.

Yamaguchi T, Endo-Takahashi Y, Awaji K, Numazawa S, Onishi Y, Tada R, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H, Negishi Y.

Sci Rep. 15(1) 14871 2025年4月28日査読有り
Designer Catalyst-Enabled Regiodivergent Histone Acetylation.

Nozaki T, Onoda M, Habazaki M, Takeuchi Y, Ishida H, Sato Y, Kujirai T, Hanada K, Yamatsugu K, Kurumizaka H, Kimura H, Kono H, Kawashima SA, Kanai M.

J. Am. Chem. Soc. 147(16) 13732-13743 2025年4月13日査読有り
Cryo-EM Analysis of a Unique Subnucleosome Containing Centromere-Specific Histone Variant CENP-A.

Kawasaki O, Takizawa Y, Kiyokawa I, Kurumizaka H, Nozawa K.

Genes Cells. 30(2) e70016 2025年3月24日査読有り
Structural insights into promoter-proximal pausing of RNA polymerase II at +1 nucleosome.

Naganuma M, Kujirai T, Ehara H, Uejima T, Ito T, Goto M, Aoki M, Henmi M, Miyamoto-Kohno S, Shirouzu M, Kurumizaka H, Sekine SI.

Sci Adv. 11(10) eadu0577 2025年3月5日査読有り
Structural insights into how DEK nucleosome binding facilitates H3K27 trimethylation in chromatin.

Kujirai T, Echigoya K, Kishi Y, Saeki M, Ito T, Kato J, Negishi L, Kimura H, Masumoto H, Takizawa Y, Gotoh Y, Kurumizaka H.

Nat Struct Mol Biol. 2025年2月21日査読有り
Cryo-EM structures of the BAF-Lamin A/C complex bound to nucleosomes.

Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Nat Commun. 16(1) 1495 2025年2月10日査読有り
Chemical catalyst manipulating cancer epigenome and transcription.

Yamanashi Y, Takamaru S, Okabe A, Kaito S, Azumaya Y, Kamimura YR, Yamatsugu K, Kujirai T, Kurumizaka H, Iwama A, Kaneda A, Kawashima SA, Kanai M.

Nat Commun. 16(1) 887 2025年1月24日査読有り
FRET analysis of the unwrapping of nucleosomal DNA containing a sequence characteristic of the +_1 nucleosome.

Sunami T, Luo D, Sato S, Kato J, Yamanaka M, Akamatsu K, Kurumizaka H, Kono H.

Sci Rep. 15(1) 2169 2025年1月16日査読有り
Mechanistic insights into RAD51-mediated nucleosome binding and remodeling in homologous recombination.

Shioi T, Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H.

DNA Repair 154 103891 2025年査読有り
High-Resolution Cryo-EM Analyses of Nucleosomes.

Takizawa Y, Ho CH, Sato S, Danev R, Kurumizaka H.

Methods Mol Biol. 2919 91-107 2025年査読有り
Structural insights into how Cas9 targets nucleosomes.

Nagamura R, Kujirai T, Kato J, Shuto Y, Kusakizako T, Hirano H, Endo M, Toki S, Saika H, Kurumizaka H, Nureki O.

Nat Commun. 15(1) 10744 2024年12月30日査読有り
Asymmetric fluctuation of overlapping dinucleosome studied by cryoelectron microscopy and small-angle X-ray scattering.

Shimizu M, Tanaka H, Nishimura M, Sato N, Nozawa K, Ehara H, Sekine SI, Morishima K, Inoue R, Takizawa Y, Kurumizaka H, Sugiyama M.

PNAS Nexus. 3(11) pgae484 2024年10月27日査読有り
Nucleosomal DNA unwinding pathway through canonical and non-canonical histone disassembly.

Nozawa H, Nagae F, Ogihara S, Hirano R, Yamazaki H, Iizuka R, Akatsu M, Kujirai T, Takada S, Kurumizaka H, Uemura S.

Commun Biol. 7(1) 1144 2024年9月14日査読有り
The C-terminal 4CXXC-type zinc finger domain of CDCA7 recognizes hemimethylated DNA and modulates activities of chromatin remodeling enzyme HELLS.

Shinkai A, Hashimoto H, Shimura C, Fujimoto H, Fukuda K, Horikoshi N, Okano M, Niwa H, Debler EW, Kurumizaka H, Shinkai Y.

Nucleic Acids Res. 52(17) 10194-10219 2024年8月15日査読有り
ISWI chromatin remodeling complexes recruit NSD2 and H3K36me2 in pericentromeric heterochromatin.

Goto N, Suke K, Yonezawa N, Nishihara H, Handa T, Sato Y, Kujirai T, Kurumizaka H, Yamagata K, Kimura H.

Journal of Cell Biology 223(8) e202310084 2024年8月5日査読有り
BOD1L mediates chromatin binding and non-canonical function of H3K4 methyltransferase SETD1A.

Hoshii T, Kikuchi S, Kujirai T, Masuda T, Ito T, Yasuda S, Matsumoto M, Rahmutulla B, Fukuyo M, Murata T, Kurumizaka H, Kaneda A.

Nucleic Acids Res. 52(16) 9463-9480 2024年7月11日査読有り
Molecular and structural basis of the chromatin remodeling activity by Arabidopsis DDM1.

Osakabe A, Takizawa Y, Horikoshi N, Hatazawa S, Negishi L, Sato S, Berger F, Kakutani T, Kurumizaka H.

Nature Communications 15(1) 5187-5187 2024年7月11日査読有り
Cryo-EM structure and biochemical analyses of the nucleosome containing the cancer-associated histone H3 mutation E97K.

Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Sekine SI, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Genes Cells. 29(9) 769-781 2024年7月7日査読有り
Tropomyosin induces the synthesis of magnesian calcite in sea urchin spines.

Kato Y, Ha W, Zheng Z, Negishi L, Kawano J, Kurita Y, Kurumizaka H, Suzuki M.

Journal of Structural Biology 216(2) 108074-108074 2024年6月査読有り
High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals the Nucleosome Sliding and DNA Unwrapping/Wrapping Dynamics of Tail-less Nucleosomes.

Morioka S, Oishi T, Hatazawa S, Kakuta T, Ogoshi T, Umeda K, Kodera N, Kurumizaka H, Shibata M.

Nano Letters 24(17) 5246-5254 2024年5月1日査読有り
Cryo-EM structures of RAD51 assembled on nucleosomes containing a DSB site.

Shioi T, Hatazawa S, Oya E, Hosoya N, Kobayashi W, Ogasawara M, Kobayashi T, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Nature 628(8006) 212-220 2024年4月4日査読有り
Structural perspectives on transcription in chromatin.

Sekine SI, Ehara H, Kujirai T, Kurumizaka H.

Trends in Cell Biology 34(3) 211-224 2024年3月査読有り招待有り
Genome-wide mapping and cryo-EM structural analyses of the overlapping tri-nucleosome composed of hexasome-hexasome-octasome moieties.

Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Morishima K, Shimizu M, Kobayashi Y, Nozawa K, Takizawa Y, Sugiyama M, Ohkawa Y, Kurumizaka H.

Communications Biology 7(1) 61-61 2024年1月8日査読有り
Structural and Dynamic Changes of Nucleosome upon GATA3 Binding.

Ishida H, Matsumoto A, Tanaka H, Okuda A, Morishima K, Wade PA, Kurumizaka H, Sugiyama M, Kono H.

Journal of Molecular Biology 435(23) 168308-168308 2023年12月1日査読有り
Cryo-EM structures of RNA polymerase II-nucleosome complexes rewrapping transcribed DNA.

Akatsu M, Ehara H, Kujirai T, Fujita R, Ito T, Osumi K, Ogasawara M, Takizawa Y, Sekine SI, Kurumizaka H.

The Journal of Biological Chemistry 299(12) 105477-105477 2023年12月査読有り
Cryo-EM and biochemical analyses of the nucleosome containing the human histone H3 variant H3.8.

Hirai S, Kujirai T, Akatsu M, Ogasawara M, Ehara H, Sekine SI, Ohkawa Y, Takizawa Y, Kurumizaka H.

The Journal of Biochemistry 174(6) 549-559 2023年12月査読有り
Contributions of histone tail clipping and acetylation in nucleosome transcription by RNA polymerase II.

Oishi T, Hatazawa S, Kujirai T, Kato J, Kobayashi Y, Ogasawara M, Akatsu M, Ehara H, Sekine SI, Hayashi G, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Nucleic Acids Research 51(19) 10364-10374 2023年10月27日査読有り
Designer Adaptor Proteins for Functional Conversion of Peptides to Small-Molecule Ligands toward In-Cell Catalytic Protein Modification.

Fujimura A, Ishida H, Nozaki T, Terada S, Azumaya Y, Ishiguro T, Kamimura YR, Kujirai T, Kurumizaka H, Kono H, Yamatsugu K, Kawashima SA, Kanai M.

ACS Central Science 9(11) 2115-2128 2023年10月25日査読有り
HMGA2 directly mediates chromatin condensation in association with neuronal fate regulation.

Kuwayama N, Kujirai T, Kishi Y, Hirano R, Echigoya K, Fang L, Watanabe S, Nakao M, Suzuki Y, Ishiguro KI, Kurumizaka H, Gotoh Y.

Nature Communications 14(1) 6420-6420 2023年10月12日査読有り
A chemical catalyst enabling histone acylation with endogenous acyl-CoA.

Habazaki M, Mizumoto S, Kajino H, Kujirai T, Kurumizaka H, Kawashima SA, Yamatsugu K, Kanai M.

Nature Communications 14(1) 5790-5790 2023年9月22日査読有り
Chromatin structure related to oncogenesis.

Matsumoto S, Horikoshi N, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Cancer Science 114(8) 3068-3075 2023年8月査読有り
Structural Basis of Damaged Nucleotide Recognition by Transcribing RNA Polymerase II in the Nucleosome.

Osumi K, Kujirai T, Ehara H, Ogasawara M, Kinoshita C, Saotome M, Kagawa W, Sekine SI, Takizawa Y, Kurumizaka H.

Journal of Molecular Biology 435(13) 168130-168130 2023年7月1日査読有り
Structural Transition of the Nucleosome during Transcription Elongation.

Kujirai T, Ehara H, Sekine SI, Kurumizaka H.

Cells 12(10) 1388 2023年5月14日査読有り
High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spontaneous Nucleosome Sliding of H2A.Z at the Subsecond Time Scale

Shin Morioka, Shoko Sato, Naoki Horikoshi, Tomoya Kujirai, Takuya Tomita, Yudai Baba, Takahiro Kakuta, Tomoki Ogoshi, Leonardo Puppulin, Ayumi Sumino …

Nano Letters 2023年2月13日査読有り
The cryo‐EM structure of full‐length RAD52 protein contains an undecameric ring

Chiaki Kinoshita, Yoshimasa Takizawa, Mika Saotome, Shun Ogino, Hitoshi Kurumizaka, Wataru Kagawa

FEBS Open Bio 13(3) 408-418 2023年2月9日査読有り責任著者

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主要なMISC

RAD51によるクロマチン上での相同組換え開始機構

塩井琢郎, 畠澤卓, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

生化学 96(6) 854-858 2024年12月25日査読有り招待有り

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主要な書籍等出版物

実験医学増刊 Vol.43 No.15 構造生命科学 AlphaFold時代にどう活かす？生命機能を解く、変える、創るための技術と研究戦略

越後谷健太, 鯨井智也, 胡桃坂仁志 (担当:分担執筆, 範囲:遺伝子発現制御におけるクロマチン構造のダイナミクス) (原著:加藤英明, 西増弘志)

羊土社 2025年9月5日 (ISBN: 9784758104296)

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主要な講演・口頭発表等

626

Structures of RNA polymerase II transcribing chromatin inside human nuclei revealed by ChIP-cryoEM

Tomoya Kujirai

IAS Focused Program on Frontiers in Chromatin Biology and Epigenetics 2025年11月25日招待有り
Structural Studies of Chromatin as a Basis for Epigenetic Regulation

Hitoshi KURUMIZAKA

IAS Focused Program on Frontiers in Chromatin Biology and Epigenetics 2025年11月25日招待有り
ChIP-CryoEM reveals the DNA damage recognition mechanism of the UV-DDB complex in cells

Syota Matsumoto, Yoshimasa Takizawa, Kana Hashimoto, Mitsuo Ogasawara, Hitoshi Kurumizaka

International conference for DNA repair and genomic stability 2025年11月13日招待有り
Elucidating RNA Polymerase II (RNAPII) Transcription Through the Asymmetric Overlapping Dinucleosome by Cryo-EM Structural Analysis

陳之慧, 何承翰, 田中大貴, 鯨井智也, 小笠原光雄, 江原晴彦, 関根俊一, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第98回日本生化学会大会 2025年11月4日
ヒストンメチル化酵素Set2による転写に共役したH3K36トリメチル化機構

鯨井智也, 江原晴彦, 伊藤友子, 邉見真生, 大屋恵梨子, 小林武彦, 関根俊一, 胡桃坂仁志

第98回日本生化学会大会 2025年11月4日
アセチル化ヌクレオソームにおけるヒストンアセチル化酵素p300の結合様式と機能解析

畠澤卓, Zandian Mohamad, 橋本雅也, Xu Longxia, 伊藤恵理, Liu Jiuyang, 中村元紀, 小笠原光雄, 林剛介, 滝沢由政, Shi Xiaobing, Kutateladze Tatiana G., 胡桃坂仁志

第98回日本生化学会大会 2025年11月4日
クライオ電子顕微鏡解析によるヌクレオソーム損傷修復機構の解明

松本翔太, 滝沢由政, 橋本佳那, 小笠原光雄, 胡桃坂仁志

第98回日本生化学会大会 2025年11月4日
遺伝子制御を担うエピコードのクロマチン構造基盤

胡桃坂仁志

第98回日本生化学会大会 2025年11月4日
Cryo-electron tomography for visualization of chromatin architecture

滝沢由政

生理研研究会2025 / CryoEM workshop 2025 2025年10月29日自然科学研究機構生理学研究所招待有り
クライオ電子顕微鏡を用いたDNA修復機構におけるクロマチン上のDNA損傷認識機構の解析

日本放射線影響学会第68回大会/第6回アジア放射線研究会議(JRRS/ACRR2025)合同大会 2025年10月25日
Structural basis of ionizing radiation induced homologous recombination initiation by RAD51 on chromatin

日本放射線影響学会第68回大会/第6回アジア放射線研究会議(JRRS/ACRR2025)合同大会 2025年10月25日
ヌクレオソーム上における紫外線損傷認識機構の構造学的理解

松本翔太, 滝沢由政, 橋本佳那, ⼩笠原光雄, 胡桃坂仁志

日本遺伝学会第97回大会 2025年9月10日
Structural visualization of transcribing RNA polymerase II in human cells by ChIP-CryoEM

Tomoya Kujirai

CSHL Mechanisms of Eukaryotic Transcription 2025年8月28日
Chromatin structural versatility and epigenetic regulation of genome function

Hitoshi Kurumizaka

2025 VAI Epigenetics Symposium: Structural Insights and Innovations 2025年7月28日招待有り
ビジュアル・バイオケミストリーによるエピジェネティクスの理解

胡桃坂仁志

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月20日
多様なクロマチンの基盤構造の解明とエピジェネティック制御分子の開発

堀越直樹

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月20日
マウスES細胞におけるヒストンアセチル化酵素p300の活性制御とその生物学的機能のゲノム解析

伊藤恵理

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月19日
マウスES細胞におけるヒストンアセチル化酵素p300の活性制御とその生物学的機能のゲノム解析

伊藤恵理

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月19日
ヒト細胞核由来クロマチンのクライオ電子顕微鏡構造解析

畠澤卓

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月19日
セントロメアタンパク質によるヌクレオソーム転写制御

大石匠美

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 2025年6月19日
セントロメアタンパク質によるヌクレオソーム転写制御

大石匠美

第9回北陸エピジェネティクス研究会 2025年6月18日
マウスES細胞におけるヒストンアセチル化酵素p300の活性制御とその生物学的機能のゲノム解析

伊藤恵理

第9回北陸エピジェネティクス研究会 2025年6月18日
Cryo-EM analyses of xeroderma pigmentosum group E protein in nucleosomes

Syota Matsumoto

The EMBO | EMBL Symposium: The ageing genome: from mechanisms to disease 2025年6月12日
ヒストンバリアントmacroH2Aを含むモノヌクレオソームの構造解析

許文杰, 松本翔太, 滝沢由政, 小笠原光雄, 須賀遼, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月30日
ラミンB受容体とヌクレオソームとの複合体の構造解析および生化学的解析

飯塚愛斗, 堀越直樹, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月29日
XPF-ERCC1 によるヌクレオソーム近傍の損傷切り出し機構の解明

吉田彩, 松本翔太, 滝沢由政, 小笠原光雄, 倉岡功, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月29日
クライオ電子線トモグラフィーによるヒト細胞核内クロマチン構造の観察

松本翔太, 滝沢由政, 橋本佳那, 畠澤卓, Tony Wang, 吉川雅英, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月29日
RNA ポリメラーゼII によるヌクレオソーム転写機構の構造解析

鯨井智也, 江原晴彦, 加藤淳子, 伊藤友子, 大屋恵梨子, 山本京香, 平井誠也, 邉見真生, 根岸瑠美, 小笠原光雄, 山口雄輝, 小林武彦, 滝沢由政, 関根俊一, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月29日
Barrier-to-autointegration factor(BAF)とLamin A/C によるクロマチン制御機構の構造生物学的解析

堀越直樹, 三宅諒祐, 曽川-藤原千鶴, 小笠原光雄, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会 2025年1月29日
クロマチンが遺伝情報をコントロールする仕組み

胡桃坂仁志

千里ライフサイエンスセミナーW5「クロマチン研究~ゲノム・タンパク質・細胞からの理解~」 2025年1月17日公益財団法人千里ライフサイエンス振興財団招待有り
クロマチンによるエピジェネティックなゲノム制御メカニズム

Hitoshi Kurumizaka

CVMW2024心血管代謝週間 2024年12月8日招待有り
ヌクレオソームにおけるXPF-ERCC1によるDNA損傷認識の構造生物学的解析

吉田彩, 松本翔太, 滝沢由政, 小笠原光雄, 倉岡功, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月29日
ヌクレオソームにおけるXPF-ERCC1によるDNA損傷認識の構造生物学的解析

吉田彩, 松本翔太, 滝沢由政, 小笠原光雄, 倉岡功, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月29日
核ラミナ因子によるクロマチン構造の制御機構

堀越直樹, 三宅諒祐, 曽川-藤原千鶴, 小笠原光雄, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月29日招待有り
ヒストンバリアントmacroH2Aを含むヌクレオソームの構造機能解析

許文杰, 松本翔太, 滝沢由政, 小笠原光雄, 須賀遼, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
ヒトゲノム配列で再構成されるヌクレオソームのクライオ電子顕微鏡解析

伊藤恵理, 何承翰, 小林由紀, 小笠原光雄, 大川恭行, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
ヒストンアセチル化酵素p300のアセチル化ヌクレオソームに対する結合様式

畠澤卓, Xu Longxia, Zandian Mohamad, 橋本雅也, Liu Jiuyang, 中村元紀, 小笠原光雄, 林剛介, 滝沢由政, Shi Xiaobing, Kutateladze Tatiana, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
クロマチンアトラス解明に向けたクライオ電子顕微鏡構造解析

滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
クロマチン・ランドスケープの構造・機能基盤

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
ASH1L-ヌクレオソーム複合体のクライオ電子顕微鏡解析

何承翰, 滝沢由政, Vann Kendra, Liu Jiuyang, Kutateladze Tatiana, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日
細胞由来のヒストンバリアントH2A.Xを含むヌクレオソームの構造解析

庄皓桐, 畠澤卓, 何承翰, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日
細胞由来のヒストンバリアントH2A.Xを含むヌクレオソームの構造解析

庄皓桐, 畠澤卓, 何承翰, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日
RAD51による相同組換え初期のクロマチン構造変化

塩井琢郎, 畠澤卓, 大屋恵梨子, 細谷紀子, 小林航, 小笠原光雄, 小林武彦, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日招待有り
Structural studies for understanding chromatin function in genome regulation

2024年11月22日招待有り
Mechanism of immune signalling factor sequestration on chromatin by the adenovirus core protein VII

2024年11月21日
ChIP-CryoEM of nucleosome targeting histone variants from cells

2024年11月21日
Cryo-EM analyses of UV-damaged recognition protein UV-DDB in nucleosomes during nucleotide excision repair

2024年11月20日
クライオ電子顕微鏡を用いたヒトゲノムDNA配列におけるOLDNの探索

伊藤恵理, 何承翰, 小林由紀, 小笠原光雄, 大川恭行, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第97回日本生化学会大会 2024年11月7日
細胞由来のヒストンバリアントH2A.Xを含むヌクレオソームの構造解析

庄皓桐, 畠澤卓, 何承翰, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

第97回日本生化学会大会 2024年11月7日
ゲノム配列ヌクレオソームに対するパイオニア転写因子SOX2の結合機構

越後谷健太, 滝沢由政, 鯨井智也, 小笠原光雄, 林洋平, 胡桃坂仁志

第97回日本生化学会大会 2024年11月7日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

クロマチンにおけるDNA修復機構の構造基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 基盤研究(S) 2023年4月 - 2028年3月

胡桃坂仁志, 香川亘
エピジェネティクスの基盤原理解明と創薬のためのヒストンおよび再構成クロマチンの生産

国立研究開発法人日本医療研究開発機構生命科学・創薬研究支援基盤事業 2022年4月 - 2027年3月
胡桃坂クロマチンアトラスプロジェクト

JST ERATO 2019年10月 - 2025年3月
クロマチン上で起こる転写と共役した二重鎖切断修復の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2020年4月 - 2023年3月

胡桃坂仁志, 香川亘
ヌクレオソーム高次構造とダイナミクスによるクロマチン潜在能の解明

科学研究費助成事業(東京大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究（研究領域提案型）) 2018年6月 - 2023年3月
エピジェネティクス研究と創薬のための再構成クロマチンの生産と性状解析

AMED 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 2017年 - 2022年3月
細胞ポテンシャル測定システムの開発

JST CREST 2016年 - 2019年9月

大川恭行
動的クロマチン構造と機能

科学研究費助成事業(東京大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究（研究領域提案型）) 2018年4月 - 2019年3月
性スペクトラム構築の基盤となるエピゲノム情報の機能発現機構

科学研究費助成事業(東京大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究（研究領域提案型）) 2018年4月 - 2018年6月
機能的なクロマチンの再構成と高分解能3D構造・機能解析

科学研究費助成事業(東京大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究（研究領域提案型）) 2018年4月 - 2018年6月
ヌクレオソーム上で起こるＤＮＡ相同検索の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2012年4月 - 2015年3月

香川亘, 胡桃坂仁志, 五月女美香
構造解析用核内タンパク質等の生産と評価

AMED 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業
クロマチン動構造の国際共同研究ネットワーク形成

科学研究費助成事業(早稲田大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究（研究領域提案型）) 新学術領域研究（研究領域提案型）
再構成ヌクレオソームを用いた動的クロマチン構造の解明

科学研究費助成事業(早稲田大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型)
動的クロマチン構造と機能

科学研究費助成事業(早稲田大学) 科学研究費助成事業(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型)
クロマチンDNAにおける相同的組換え機構に関する研究

科学研究費助成事業(理化学研究所) 科学研究費助成事業(奨励研究(A)) 奨励研究(A)
ヒトにおける相同DNA組換えの分子機構に関する研究

科学研究費助成事業(理化学研究所) 科学研究費助成事業(奨励研究(A)) 奨励研究(A)
染色体の安定維持に重要なヒトRad51ファミリータンパク質の構造、機能解析

科学研究費助成事業(理化学研究所) 科学研究費助成事業(特定領域研究(C)) 特定領域研究(C)
DnaAドメインIVを用いた新規抗菌剤の探索開発プロセスの研究

科学研究費助成事業(九州大学) 科学研究費助成事業(基盤研究(B)) 基盤研究(B)
がん化防御に重要なDNA組換え修復装置の構造および機能解析

科学研究費助成事業(理化学研究所) 科学研究費助成事業(特定領域研究(C)) 特定領域研究(C)

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産業財産権

特許第6675119号選択的な染色体タンパク質のアシル化を行うための人工触媒システム

金井求、川島茂裕、山次健三、天本義史、青井勇樹、須藤宏城、永島臨、胡桃坂仁志、越阪部晃永、有村泰宏
特許第5403324号タンパク質又は遺伝子導入用試薬

武岡真司、武田直也、胡桃坂仁志、坂根勲、池ヶ谷菜海子、小幡洋輔、齋藤俊介

学術貢献活動

シンポジウム[2S02a]「細胞機能を規定するエピコードの分子基盤」

パネル司会・セッションチェア等

第98回日本生化学会大会 (国立京都国際会館（京都府京都市）) 2025年11月4日 - 2025年11月4日
第42回染色体ワークショップ・第23回核ダイナミクス研究会

その他

(グランドメルキュール別府湾リゾート＆スパ（大分県速見郡日出町）) 2025年1月29日 - 2025年1月31日
千里ライフサイエンスセミナーW5「クロマチン研究～ゲノム・タンパク質・細胞からの理解～」

パネル司会・セッションチェア等

公益財団法人千里ライフサイエンス振興財団 (千里ライフサイエンスセンター) 2025年1月17日 - 2025年1月17日
千里ライフサイエンスセミナーW5「クロマチン研究～ゲノム・タンパク質・細胞からの理解～」

企画立案・運営等

公益財団法人千里ライフサイエンス振興財団 (千里ライフサイエンスセンター) 2025年1月17日 - 2025年1月17日
セッション： [2PS-09] クロマチン・ランドスケープ：ゲノム機能制御の新境地を切り開く

パネル司会・セッションチェア等

第47回日本分子生物学会年会 (福岡国際会議場) 2024年11月28日 - 2024年11月28日
2024年3R&3C国際シンポジウム

企画立案・運営等

2024年11月18日 - 2024年11月22日

主要な社会貢献活動

CREST[生命力] 胡桃坂チーム「見て、触って、理解する遺伝子の本体・クロマチン」

出演, パネリスト

科学技術振興機構（JST）サイエンスアゴラ2025「科学とくらしともに語り紡ぐ未来」テレコムセンタービル、日本科学未来館 2025年10月26日 - 2025年10月26日

メディア報道

ゲノム上の紫外線損傷修復の瞬間細胞内で可視化

科学新聞 4面 2025年11月21日新聞・雑誌
クロマチンの動きをクライオ電顕で解く

シュプリンガーネイチャー・ジャパン株式会社 Nature ダイジェスト Vol. 21 No. 12 Japanese Author ページ36-39 2024年12月1日新聞・雑誌

胡桃坂仁志

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

主要な論文

主要なMISC

主要な書籍等出版物

主要な講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

学術貢献活動

主要な社会貢献活動

メディア報道

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