川口喬吾 (Kyogo Kawaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究所主任研究員
: 東京大学大学院理学系研究科知の物理学研究センター准教授 (クロスアポイントメント)

J-GLOBAL ID: 201801003042912643
researchmap会員ID: B000318167

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

理化学研究所, 開拓研究所, 主任研究員
2025年3月 - 現在

東京大学生物普遍性研究機構, 兼担教員
2023年4月 - 現在

東京大学, 大学院理学系研究科知の物理学研究センター, 准教授
2019年4月 - 2025年3月

理化学研究所開拓研究本部, 理研白眉研究チームリーダー
2018年9月 - 2025年3月

理化学研究所生命機能科学研究センター, 理研白眉研究チームリーダー
2022年4月 - 2024年3月

大阪大学, 大学院理学研究科生物科学専攻, 招へい准教授 (連携大学院)
2021年4月 - 2024年3月

神戸大学, 大学院医学研究科医科学専攻, 客員准教授 (連携大学院)
2017年4月 - 2019年3月

東京大学生物普遍性研究機構, 客員共同研究員
2015年4月 - 2018年8月

Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Postdoctoral fellow

学歴

2012年4月 - 2015年3月

東京大学大学院理学系研究科, 物理学専攻, 佐野研究室博士課程大学院生
2013年5月 - 2014年10月

京都大学, ウィルス研究所, 影山研究室指導委託研究生
2010年4月 - 2012年3月

東京大学大学院理学系研究科, 物理学専攻, 佐野研究室修士課程大学院生
2006年4月 - 2010年3月

東京大学

受賞

2026年4月

神戸賞 Young Investigator賞, 中谷財団
2026年4月

InaRISフェロー, 稲盛財団
2022年4月

Early Career Scientist Prize, C3 Commission on Statistical Physics of the IUPAP

川口喬吾
2016年3月

第10回領域11若手奨励賞, 日本物理学会

川口喬吾
2015年3月

研究奨励賞, 東京大学大学院理学系研究科

川口喬吾
2010年3月

理学部長賞, 東京大学理学部学生選抜国際派遣プログラム

川口喬吾

論文

Hermitian and non-Hermitian topology in active matter

Kazuki Sone, Kazuki Yokomizo, Kyogo Kawaguchi, Yuto Ashida

Reports on Progress in Physics 89(1) 016501-016501 2026年1月1日査読有り
Gene-scale in vitro reconstitution reveals histone acetylation directly controls chromatin architecture

Yohsuke T. Fukai, Tomoya Kujirai, Masatoshi Wakamori, Setsuko Kanamura, Lisa Yamauchi, Somayeh Zeraati, Satoshi Morita, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Mikako Shirouzu …

Science Advances 11(47) 2025年11月21日査読有り最終著者責任著者
Integer topological defects offer a methodology to quantify and classify active cell monolayers

Zihui Zhao, He Li, Yisong Yao, Yongfeng Zhao, Francesca Serra, Kyogo Kawaguchi, Hepeng Zhang, Masaki Sano

Nature Communications 16(1) 2025年3月12日査読有り
Universality in the dynamical phase transitions of Brownian motion

Takahiro Kanazawa, Kyogo Kawaguchi, Kyosuke Adachi

Physical Review Research 7(1) 013124 2025年2月3日査読有り責任著者
Homeotic and nonhomeotic patterns in the tetrapod vertebral formula

Rory T. Cerbus, Ichiro Hiratani, Kyogo Kawaguchi

Proceedings of the National Academy of Sciences 121(47) e2411421121 2024年11月11日査読有り最終著者責任著者
Predicting Heteropolymer Interactions: Demixing and Hypermixing of Disordered Protein Sequences

Physical Review X 14(3) 031011 2024年7月18日査読有り最終著者責任著者
Activity-induced ferromagnetism in one-dimensional quantum many-body systems

Kazuaki Takasan, Kyosuke Adachi, Kyogo Kawaguchi

Physical Review Research 6(2) 023096 2024年4月26日査読有り最終著者責任著者
LapTrack: linear assignment particle tracking with tunable metrics

Yohsuke T Fukai, Kyogo Kawaguchi

Bioinformatics 39(1) btac799 2022年12月10日査読有り最終著者
Gradual differentiation uncoupled from cell cycle exit generates heterogeneity in the epidermal stem cell layer

Katie Cockburn, Karl Annusver, David G. Gonzalez, Smirthy Ganesan, Dennis P. May, Kailin R. Mesa, Kyogo Kawaguchi, Maria Kasper, Valentina Greco

Nature Cell Biology 24(12) 1692-1700 2022年11月10日査読有り
Probing the rules of cell coordination in live tissues by interpretable machine learning based on graph neural networks

Takaki Yamamoto, Katie Cockburn, Valentina Greco, Kyogo Kawaguchi

PLOS Computational Biology 18(9) e1010477-e1010477 2022年9月6日査読有り
Activity-induced phase transition in a quantum many-body system

Kyosuke Adachi, Kazuaki Takasan, Kyogo Kawaguchi

Physical Review Research 4(1) 013194 2022年3月11日査読有り最終著者責任著者
Surface wetting by kinetic control of liquid-liquid phase separation

Kyosuke Adachi, Kyogo Kawaguchi

Physical Review E 104(4) L042801 2021年10月26日査読有り最終著者責任著者
Universality of active and passive phase separation in a lattice model

Kyosuke Adachi, Kyogo Kawaguchi

2020年12月4日
Chromatin state switching in a polymer model with mark-conformation coupling

Adachi Kyosuke, Kawaguchi Kyogo

PHYSICAL REVIEW E 100(6) 060401(R) 2019年12月査読有り最終著者責任著者
A large pool of actively cycling progenitors orchestrates self-renewal and injury repair of an ectodermal appendage.

Amnon Sharir, Pauline Marangoni, Rapolas Zilionis, Mian Wan, Tomas Wald, Jimmy K Hu, Kyogo Kawaguchi, David Castillo-Azofeifa, Leo Epstein, Kyle Harrington …

Nature Cell Biology 21(9) 1102-1112 2019年9月査読有り
Homeostatic Epidermal Stem Cell Self-Renewal Is Driven by Local Differentiation

Mesa Kailin R, Kawaguchi Kyogo, Cockburn Katie, Gonzalez David, Boucher Jonathan, Xin Tianchi, Klein Allon M, Greco Valentina

CELL STEM CELL 23(5) 677-+ 2018年11月査読有り
Unattainability of Carnot efficiency in thermal motors: Coarse graining and entropy production of Feynman-Smoluchowski ratchets

Nakayama Yohei, Kawaguchi Kyogo, Nakagawa Naoko

PHYSICAL REVIEW E 98(2) 022102 2018年8月3日査読有り
Dynamical crossover in a stochastic model of cell fate decision

Hiroki Yamaguchi, Kyogo Kawaguchi, Takahiro Sagawa

PHYSICAL REVIEW E 96(1) 012401 2017年7月査読有り
Topological defects control collective dynamics in neural progenitor cell cultures

Kyogo Kawaguchi, Ryoichiro Kageyama, Masaki Sano

NATURE 545(7654) 327-+ 2017年5月査読有り
Entropy Production of Nanosystems with Time Scale Separation

Shou-Wen Wang, Kyogo Kawaguchi, Shin-ichi Sasa, Lei-Han Tang

PHYSICAL REVIEW LETTERS 117(7) 070601 2016年8月査読有り

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MISC

Hydrodynamic origins of symmetric swimming strategies

Takahiro Kanazawa, Kenta Ishimoto, Kyogo Kawaguchi

arxiv 2026年3月最終著者責任著者
Coding sequence clustering universally predicts fine- and coarse-scale chromatin compartment landscapes

Rory T. Cerbus, Kyogo Kawaguchi, Ichiro Hiratani

2026年2月27日責任著者
Sequence grammar and dynamics of subcellular translation revealed by APEX-Ribo-Seq

Kotaro Tomuro, Takanori Akaiwa, Akane Harada, Kenta Kobayashi, Nobuyuki Shiina, Kyogo Kawaguchi, Yuichi Shichino, Shintaro Iwasaki

2025年5月29日責任著者
A Percolation Model of Emergence: Analyzing Transformers Trained on a Formal Language

Ekdeep Singh Lubana, Kyogo Kawaguchi, Robert P. Dick, Hidenori Tanaka

International Conference on Learning Representations (ICLR 2025) 2024年8月22日筆頭著者
Dynamical phase transitions in single particle Brownian motion without drift

Takahiro Kanazawa, Kyogo Kawaguchi, Kyosuke Adachi

2024年7月25日
Experimental identification of force, velocity, and nematic order relationships in active nematic cell monolayers

Masahito Uwamichi, He Li, Zihui Zhao, Yisong Yao, Hideo Higuchi, Kyogo Kawaguchi, Masaki Sano

2024年2月25日
成体組織恒常性維持機構の統計物理

川口喬吾

生体の科学 72(3) 2021年6月招待有り
Early-career researchers in the time of COVID-19: Benefits of structural support

Dwi U. Kemaladewi, Kyogo Kawaguchi

Cell Stem Cell 28(5) 814-815 2021年5月招待有り
Introductions to the Community: Early-Career Researchers in the Time of COVID-19

Jason Tchieu, Noelia Urbán, Alice Soragni, Kyogo Kawaguchi, Joel W. Blanchard, Lin Li

Cell Stem Cell 27(4) 508-510 2020年10月招待有り
Chirality-driven edge flow and non-Hermitian topology in active nematic cells

Lisa Yamauchi, Tomoya Hayata, Masahito Uwamichi, Tomoki Ozawa, Kyogo Kawaguchi

Arxiv 2020年8月25日
表皮幹細胞は隣接細胞の分化に促され分裂する

川口喬吾, Allon M. Klein

ライフサイエンス新着論文レビュー 2018年11月招待有り
細胞の集団運動とトポロジカル欠陥

川口喬吾, 影山龍一郎, 佐野雅己

生物物理 58(134) 2018年6月査読有り招待有り
細胞集団の配列と集積を定量化する

川口喬吾

日経バイオテク 2017年7月招待有り
トポロジカル欠陥に集まる神経幹細胞

川口喬吾, 佐野雅己

理学部ニュースレター 2017年7月招待有り
神経幹細胞はトポロジカル欠陥に集積する

川口喬吾, 影山龍一郎, 佐野雅己

ライフサイエンス新着論文レビュー 2017年6月招待有り
動く細胞集団の作る新しいパターンの発見～神経幹細胞はトポロジカル欠陥を選別する～

川口喬吾, 佐野雅己

東京大学大学院理学系研究科・理学部プレスリリース 2017年4月
In Vitro Reconstitution of Tissue Homeostasis and Stochastic Cell Fate Choice

Kyogo Kawaguchi, Allon M. Klein

BIOPHYSICAL JOURNAL 112(3) 434A-434A 2017年2月
恒常性の破れた細胞増殖の確率モデル

山口裕樹, 川口喬吾, 沙川貴大

日本物理学会講演概要集 71 2987-2987 2016年
F1-ATPase：非対称性の生む散逸ルール

川口喬吾, 佐々真一, 沙川貴大

新学術領域『ゆらぎと構造の協奏』News Letter vol. 5 2015年6月招待有り
24pAR-5 恒常的な組織分化ダイナミクスの確率モデル

山口裕樹, 川口喬吾, 沙川貴大

日本物理学会講演概要集 70 3451-3451 2015年

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書籍等出版物

戦後日本の学知と想像力―〈政治学を読み破った〉先に

川口喬吾 (担当:共著, 範囲:生物学と物理学のひびわれ――寺田寅彦の長い影)

吉田書店 2022年4月22日 (ISBN: 491059003X)
相分離生物学の全貌

白木賢太郎, 足立景亮, 川口喬吾 (担当:分担執筆, 範囲:相分離ダイナミクスと空間局在の理論モデル)

東京化学同人 2020年11月 (ISBN: 9784807913466)
物理科学,この1年 2020 (Parity)

パリティ編集委員会 (担当:分担執筆, 範囲:アクティブマター生物学)

丸善出版 2020年1月24日 (ISBN: 9784621304860)

講演・口頭発表等

生物系の非平衡と量子相転移

川口喬吾

量子生命科学会第８回大会 2026年5月28日招待有り
Symmetry, chirality, and topology in living matter

Kyogo Kawaguchi

Frontiers in Nonequilibrium Physics 2026 2026年5月14日招待有り
Symmetry and topology in tissues and body plans

川口喬吾

The 2nd ASPIRE Retreat 2026年1月26日招待有り
The grammar of genome folding: Patterned modifications and the tree of life

川口喬吾

International Symposium: Genome Architecture and Function 2025年11月25日招待有り
Physics and molecular grammar of biological heteropolymers

川口喬吾

SMART Symposium (China) 2025年10月25日招待有り
Biophysics: theory and experiment

川口喬吾

HFSP Science Summit Japan 2025 – High-Level Event 2025年10月3日招待有り
Structure and dynamics of reconstituted chromatin with defined histone modification patterns

川口喬吾

日本生物物理学会第63回年会 2025年9月25日招待有り
生物系ヘテロポリマーの物理と文法

川口喬吾

IIBMP2025 2025年9月4日
Physics and molecular grammar of biological heteropolymers

川口喬吾

Unifying Theories in High-Dimensional Biophysics, ICTS (India) 2025年7月28日招待有り
Active matter physics in multicellular dynamics and quantum models

川口喬吾

Korean Physical Society (KPS) Spring Meeting 2025年4月24日招待有り
生命現象の中のルール推定：非平衡物理から進化系統樹まで

川口喬吾

複雑生命系秩序懇談会 2025年1月20日招待有り
ヘテロポリマー間相互作用の予測：理論と数値実験

川口喬吾

日本物理学会第79回年次大会 2024年9月17日
Tissue homeostasis: theory and experiment

川口喬吾

PEBBLE BioFusion Camp 2024 2024年8月9日招待有り
Phase transitions in multiple scales of biology: from intracellular condensates to language models

川口喬吾

Conference of Condensed Matter Physics 2024 2024年8月6日招待有り
細胞内凝集体の共存原理: ヘテロポリマー間相互作用の理論予測から

川口喬吾

医生物学研究所「物理学・情報科学と生物学」研究会 2024年7月31日招待有り
Topology and coordination in multicellular tissues

川口喬吾

2024 international symposium on multicellular mechanobiology 2024年6月17日招待有り
生命の設計原理の探索：物理学・進化系統樹からのアプローチ

川口喬吾

第6回シンポジウム生物物理の新展開（東大本郷キャンパス） 2024年4月26日
生命現象と多体系・非平衡系の物理

川口喬吾

非平衡系の物理 2024年3月26日招待有り
Predicting heteropolymer interactions: demixing of disordered protein sequences

川口喬吾

IPR x RIKEN BDR Symposium 2024 2024年2月21日招待有り
生命現象とトポロジー：分子レベルから組織形成まで

川口喬吾

レーザー学会学術講演会第44回年次⼤会 2024年1月17日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

2028年4月 - 現在

基礎方程式とその意味 (東京大学教養学部)
2024年10月 - 現在

物理学実験II 「生物物理学」 (東京大学理学部物理学科)
2023年10月 - 現在

生物物理学 (東京大学理学部)

共同研究・競争的資金等の研究課題

核内液滴と3次元ゲノム構造：相分離とクロマチンが織りなす細胞核の秩序

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/創発的研究支援事業 2025年 - 2032年

川口喬吾
細胞内液滴のヘテロポリマー分子アセンブリの物理則と進化則の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2030年3月

川口喬吾, 瀧ノ上正浩
進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2030年3月

小林徹也, 川口喬吾, 青木一洋, 澤井哲, 戸田安香, 鈴木誉保, 瀧ノ上正浩, 斉藤稔, 細田一史, 杉村薫, 梅津大輝, 花井亮
細胞内構造を支えるヘテロポリマー間相互作用の網羅的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

川口喬吾, 岩崎信太郎
自己駆動する集団におけるカイラル輸送現象の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

早田智也, 川口喬吾, 小澤知己
情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

岡田康志, 松岡里実, 石島秋彦, 伊藤創祐, 川口喬吾, 池崎圭吾, 澤井哲, 佐々真一, 神原丈敏, 竹内一将, 猪股秀彦, 沙川貴大, 青木一洋, 小林徹也, 中島昭彦, 福岡創
ゆらぎと応答の基本限界から探索する生体分子の設計原理

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

岡田康志, 川口喬吾, 池崎圭吾, 佐々真一, 神原丈敏
Creating a symphony from noise: stochastic and coordinated regulation of stem cells in embryogenesis

Human Frontier Science Program Young Investigator Award 2019年6月 - 2022年5月

川口喬吾, Nicolas Rivron, Shantanu Singh
クロマチン構造転移の統計物理学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

川口喬吾
立体流路における神経幹細胞

日本学術振興会若手研究 2018年4月 - 2021年3月

川口喬吾
神経幹細胞の回転運動と3次元フローを幾何学的に制御する

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2020年3月

川口喬吾
組織体形成における細胞分化原理の解明

日本学術振興会海外特別研究員 2016年4月 - 2018年3月

川口喬吾
非平衡物理現象としての細胞分化

日本学術振興会特別研究員奨励費 (DC1) 2012年4月 - 2015年3月

川口喬吾

社会貢献活動

生命の物理学―分子から体の設計原理まで

講師

サイエンスフロントMITAKA 2026年5月16日 - 2026年5月16日
Chirality and Topology in Your Hands

講師

Nerd Nite Tokyo (online) 2020年11月13日 - 2020年11月13日

川口喬吾

基本情報

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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