李謙一 (Lee Ken-ichi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立感染症研究所細菌第一部主任研究官

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-4765-0989
J-GLOBAL ID: 201401036808032441
researchmap会員ID: B000242974

主に腸管出血性大腸菌の病原性、ゲノムに関する研究を行っています。
その他に各種病原菌のゲノム解析を行っています。

研究分野

論文

Atypical diarrhoeagenic Escherichia coli in milk related to a large foodborne outbreak.

Shouhei Hirose, Kenji Ohya, Tomoya Yoshinari, Takahiro Ohnishi, Katsumi Mizukami, Tomikatsu Suzuki, Kenji Takinami, Takayoshi Suzuki, Kenichi Lee, Sunao Iyoda, Yukihiro Akeda, Yuichiro Yahata, Yuuki Tsuchihashi, Tomimasa Sunagawa, Yukiko Hara-Kudo

Epidemiology and infection 151 e150 2023年9月11日
Global population structure, genomic diversity and carbohydrate fermentation characteristics of clonal complex 119 (CC119), an understudied Shiga toxin-producing E. coli (STEC) lineage including O165:H25 and O172:H25

中村佳司, Kazuko Seto, Kenichi Lee, Tadasuke Ooka, Yasuhiro Gotoh, Itsuki Taniguchi, Yoshitoshi Ogura, Jacques Georges Mainil, Denis Piérard, Tetsuya Harada, Yoshiki Etoh, Saori Ueda, Mitsuhiro Hamasaki, Junko Isobe, Keiko Kimata, Hiroshi Narimatsu, Jun Yatsuyanagi, Makoto Ohnishi, Sunao Iyoda, Tetsuya Hayashi

Microbial Genomics 9(3) 2023年3月23日査読有り
Real-time PCR assays to detect 10 Shiga toxin subtype (Stx1a, Stx1c, Stx1d, Stx2a, Stx2b, Stx2c, Stx2d, Stx2e, Stx2f, and Stx2g) genes

Tetsuya Harada, Yuki Wakabayashi, Kazuko Seto, Kenichi Lee, Sunao Iyoda, Kentaro Kawatsu

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 105(3) 115874-115874 2023年3月
High-throughput nanopore sequencing of Treponema pallidum tandem repeat genes arp and tp0470 reveals clade-specific patterns and recapitulates global whole genome phylogeny

Nicole A. P. Lieberman, Thaddeus D. Armstrong, Benjamin Chung, Daniel Pfalmer, Christopher M. Hennelly, Austin Haynes, Emily Romeis, Qian-Qiu Wang, Rui-Li Zhang, Cai-Xia Kou, Giulia Ciccarese, Ivano Dal Conte, Marco Cusini, Francesco Drago, Shu-ichi Nakayama, Kenichi Lee, Makoto Ohnishi, Kelika A. Konda, Silver K. Vargas, Maria Eguiluz, Carlos F. Caceres, Jeffrey D. Klausner, Oriol Mitja, Anne Rompalo, Fiona Mulcahy, Edward W. Hook, Irving F. Hoffman, Mitch M. Matoga, Heping Zheng, Bin Yang, Eduardo Lopez-Medina, Lady G. Ramirez, Justin D. Radolf, Kelly L. Hawley, Juan C. Salazar, Sheila A. Lukehart, Arlene C. Seña, Jonathan B. Parr, Lorenzo Giacani, Alexander L. Greninger

Frontiers in Microbiology 13 2022年9月20日
RNA‐binding protein Hfq downregulates locus of enterocyte effacement‐encoded regulators independent of small regulatory RNA in enterohemorrhagic Escherichia coli

Naoki Sudo, Kenichi Lee, Yasuhiko Sekine, Makoto Ohnishi, Sunao Iyoda

Molecular Microbiology 117(1) 86-101 2022年1月
Treponema pallidum genome sequencing from six continents reveals variability in vaccine candidate genes and dominance of Nichols clade strains in Madagascar

Nicole Lieberman, Michelle Jade Lin, hong xie, Lasata Shrestha, Tien Nguyen, Meei-Li Huang, Austin Haynes, Emily Romeis, Qian-Qiu Wang, Rui-Li Zhang, caixia Kou, Giulia Ciccarese, Ivano Dal Conte, Marco Cusini, Francesco Drago, Shu-ichi Nakayama, Kenichi Lee, Makoto Ohnishi, kelika konda, Silver K. Vargas, Maria Eguiluz, Carlos F. Caceres, Jeffrey D. Klausner, Oriol Mitjà, Anne Rompalo, Fiona Mulcahy, Edward W. Hook, Sheila A Lukehart, Amanda Casto, Pavitra Roychoudhury, Frank DiMaio, Lorenzo Giacani, Alexander Greninger

PLOS Neglected Tropical Diseases 15(12) 2021年12月22日
The global population structure and evolutionary history of the acquisition of major virulence factor-encoding genetic elements in Shiga toxin-producing Escherichia coli O121:H19

Ruriko Nishida, 中村佳司, Itsuki Taniguchi, Kazunori Murase, Tadasuke Ooka, Yoshitoshi Ogura, Yasuhiro Gotoh, Takehiko Itoh, Atsushi, Jacques Mainil, DEnis Piérard, Kazuko Seto, Tetsuya Harada, Junko Isobe, Keiko Kimata, Yoshiki Etoh, Mitsuhiro Hamasaki, Hiroshi Narimatsu, Jun Yatsuyanagi, Mitsuhiro Kameyama, Yuko Matsumoto, Yuhki Nagai, Jun Kawase, Eiji Yokoyama, Kazuhiko Ishikawa, Takayuki Shiomoto, Kenichi Lee, Dongchon Kang, Koichi Akashi, Makoto Ohnishi, Sunao Iyoda, Tetsuya Hayashi

Microbial Genomics 7(12) 2021年12月8日
サルモネラ(S.Stanley)感染を契機に発症した非典型溶血性尿毒症症候群の一例

澤井俊宏, 一岡聡子, 山本かずな, 増田俊樹, 坂井智行, 伊豫田淳, 泉谷秀昌, 李謙一, 大西真

日本小児腎臓病学会雑誌 34(1Suppl.) 162-162 2021年5月
Whole-Genome Sequencing of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli OX18 from a Fatal Hemolytic Uremic Syndrome Case.

Kenichi Lee, Atsushi Iguchi, Kazuhiro Uda, Sohshi Matsumura, Isao Miyairi, Kenji Ishikura, Makoto Ohnishi, Junji Seto, Kanako Ishikawa, Noriko Konishi, Hiromi Obata, Ichiro Furukawa, Hiromi Nagaoka, Hirotaka Morinushi, Natsuki Hama, Ryohei Nomoto, Hiroshi Nakajima, Hideaki Kariya, Mitsuhiro Hamasaki, Sunao Iyoda

Emerging infectious diseases 27(5) 1509-1512 2021年5月
Phylogenetic and genetic characterization of Treponema pallidum strains from syphilis patients in Japan by whole-genome sequence analysis from global perspectives

Shingo Nishiki, Kenichi Lee, Mizue Kanai, Shu-ichi Nakayama, Makoto Ohnishi

Scientific Reports 11(1) 2021年2月4日
An outbreak of food poisoning due to Escherichia coli serotype O7:H4 carrying astA for enteroaggregative E. coli heat-stable enterotoxin1 (EAST1)

Kaori Kashima, M. Sato, Y. Osaka, N. Sakakida, S. Kando, K. Ohtsuka, R. Doi, Y. Chiba, S. Takase, A. Fujiwara, S. Shimada, R. Ishii, A. Mizokoshi, M. Takano, Kenichi Lee, S. Iyoda, A. Honda

Epidemiology and Infection 149 2021年
Multiple-Locus Variable-Number Tandem Repeat Analysis Scheme for Non-O157 Shiga Toxin-Producing <i>Escherichia coli</i>: Focus on Serogroups O103, O121, O145, O165, and O91

Hidemasa Izumiya, Kenichi Lee, Nozomi Ishijima, Sunao Iyoda, Makoto Ohnishi

Japanese Journal of Infectious Diseases 73(6) 481-490 2020年11月30日
Additional Og-Typing PCR Techniques Targeting Escherichia coli-Novel and Shigella-Unique O-Antigen Biosynthesis Gene Clusters.

Atsushi Iguchi, Hironobu Nishii, Kazuko Seto, Jiro Mitobe, Kenichi Lee, Noriko Konishi, Hiromi Obata, Taisei Kikuchi, Sunao Iyoda

Journal of clinical microbiology 58(11) 2020年10月21日
Characterization of two Neisseria gonorrhoeae strains with high-level azithromycin resistance isolated in 2015 and 2018 in Japan

Ken Shimuta, Kenichi Lee, Mitsuru Yasuda, Keiichi Furubayashi, Chiaki Uchida, Shu-ichi Nakayama, Hideyuki Takahashi, Makoto Ohnishi

Sexually Transmitted Diseases Publish Ahead of Print 2020年9月23日
Global distribution of epidemic-related Shiga toxin 2 encoding phages among enteroaggregative Escherichia coli

Keiko Kimata, Kenichi Lee, Masanori Watahiki, Junko Isobe, Makoto Ohnishi, Sunao Iyoda

Scientific Reports 10(1) 2020年7月16日
Differential dynamics and impacts of prophages and plasmids on the pangenome and virulence factor repertoires of Shiga toxin-producing Escherichia coli O145:H28.

Keiji Nakamura, Kazunori Murase, Mitsuhiko P Sato, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh, Jacques Georges Mainil, Denis Piérard, Shuji Yoshino, Keiko Kimata, Junko Isobe, Kazuko Seto, Yoshiki Etoh, Hiroshi Narimatsu, Shioko Saito, Jun Yatsuyanagi, Kenichi Lee, Sunao Iyoda, Makoto Ohnishi, Tadasuke Ooka, Yasuhiro Gotoh, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi

Microbial genomics 6(1) 2020年1月査読有り
Enterohaemorrhagic Escherichia coli O121:H19 acquired an extended-spectrum β-lactamase gene during the development of an outbreak in two nurseries

Koji Kikuchi, Kenichi Lee, Hiroyuki Ueno, Kentaro Tomari, Sumie Kobori, Akihiko Kaetsu, Mari Matsui, Satowa Suzuki, Tsuyoshi Sekizuka, Makoto Kuroda, Motonobu Miyazaki, Makoto Ohnishi

Microbial Genomics 5(7) 2019年7月査読有り
Clonal expansion and spread of the ceftriaxone-resistant Neisseria gonorrhoeae strain FC428, identified in Japan in 2015, and closely related isolates.

Kenichi Lee, Shu-Ichi Nakayama, Kayo Osawa, Hiroyuki Yoshida, Soichi Arakawa, Kei-Ichi Furubayashi, Hiroshi Kameoka, Ken Shimuta, Takuya Kawahata, Magnus Unemo, Makoto Ohnishi

The Journal of antimicrobial chemotherapy 74(7) 1812-1819 2019年7月1日査読有り
Effective Surveillance Using Multilocus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis and Whole-Genome Sequencing for Enterohemorrhagic Escherichia coli O157

Kenichi Lee, Hidemasa Izumiya, Sunao Iyoda, Makoto Ohnishi

Applied and Environmental Microbiology 85(17) 2019年6月査読有り
Complete Genome Sequence of a Sequence Type 4846 Streptococcus pneumoniae Serotype 12F Strain Isolated from a Meningitis Case in Japan

Chang B, Morita M, Lee KI, Ohnishi M

Microbiology Resource Announcements 8(11) 2019年3月査読有り

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MISC

小児重症例から分離された腸管出血性大腸菌新規血清群OX18および関連株のゲノム解析

李謙一, 井口純, 宇田和宏, 松村壮史, 宮入烈, 石倉健司, 大西真, 伊豫田淳

日本細菌学雑誌 76(1) 87-87 2021年2月
食品由来感染症の病原体情報の解析及び共有化システムの構築に関する研究

泉谷秀昌, 伊豫田淳, 石原朋子, 李謙一, 大西真

食品由来感染症の病原体情報の解析及び共有化システムの構築に関する研究平成28年度総括・研究分担報告書 (Web) 11‐19 (WEB ONLY) 2017年
食品由来感染症の病原体情報の解析及び共有化システムの構築に関する研究

泉谷秀昌, 伊豫田淳, 石原朋子, 李謙一, 大西真, 寺嶋淳

食品由来感染症の病原体情報の解析及び共有化システムの構築に関する研究平成27年度総括・研究分担報告書 13‐19 2016年
重症の腸管出血性大腸菌感染症の病原性因子及び診療の標準化に関する研究「国内で分離される重症者由来の非典型的な腸管出血性大腸菌に関する研究」

伊豫田淳, 李謙一, 石嶋希, 石原朋子

重症の腸管出血性大腸菌感染症の病原性因子及び診療の標準化に関する研究平成26年度総括・分担研究報告書 8-15 2015年
サルモネラ薬剤耐性アイランド多コピー化の様式解明

李謙一, 関塚剛史, 黒田誠, 楠本正博, 内田郁夫, 岩田剛敏, 岡本晋, 矢部希見子, 稲岡隆史, 秋庭正人

日本獣医学会学術集会講演要旨集 157th 373 2014年8月11日
薬剤耐性アイランドの多コピー化に基づくサルモネラの耐性増強

李謙一, 稲岡隆史, 楠本正博, 内田郁夫, 岩田剛敏, 岡本晋, 矢部季見子, 秋庭正人

日本獣医学会学術集会講演要旨集 156th 250 2013年8月30日
食品中の有害衛生微生物を対象としたライブラリーシステム等の構築病原性大腸菌の病原性マーカーの検索,食中毒原因食品からの原因菌確保手法の確立

工藤由紀子, 齊藤志保子, 古川一郎, 河野智美, 青木佳代, 前田詠里子, 江藤良樹, 堀川和美, 李謙一, 小林直樹, 長尾清香, 山崎朗子

食品中の有害衛生微生物を対象としたライブラリーシステム等の構築平成22-24年度総合研究報告書 2013年
志賀毒素産生性大腸菌が保有する病原因子と血清群との関連性の解析

長尾清香, 李謙一, 小西良子, 工藤由起子

日本食品微生物学会学術総会講演要旨集 33rd 102 2012年10月25日
食品中の有害衛生微生物を対象としたライブラリーシステム等の構築病原性大腸菌の病原性マーカーの検索,食中毒原因食品からの原因菌確保手法の確立

工藤由起子, 李謙一, 瀧川雄一, 長尾清香, 山崎朗子

食品中の有害衛生微生物を対象としたライブラリーシステム等の構築平成23年度総括・分担研究報告書 2012年
カビの菌糸を介した志賀毒素産生性大腸菌O157の移動と増殖

李謙一, 渡辺麻衣子, 小西良子, 工藤由起子, 熊谷進

日本食品微生物学会学術総会講演要旨集 32nd 28 2011年9月20日
志賀毒素遺伝子型およびLSPA6lineageによる志賀毒素産生性大腸菌O157のストレス耐性パターンの差異

李謙一, FRENCH Nigel P, JONES Geoff, 工藤由起子, 小西良子, 熊谷進

日本食品衛生学会学術講演会講演要旨集 101st 52 2011年4月20日
志賀毒素産生性Escherichia coli O157のストレス耐性と遺伝型との関連性の解析

李謙一, NIGEL French, GEOFF Jones, 工藤由起子, 伊豫田淳, 小林秀樹, 小西良子, 熊谷進

日本獣医学会学術集会講演要旨集 151st 243 2011年3月1日
Fusarium属菌の同定に適する遺伝子指標の評価

渡辺麻衣子, 米澤隆弘, 李謙一, 熊谷進, 小西良子, 後藤慶一, 工藤由起子

日本食品微生物学会学術総会講演要旨集 31st 46 2010年10月8日
市販国産果実における真菌叢の解析

渡辺麻衣子, 堤史行, 小沼ルミ, 李謙一, 瓦田研介, 小西良子, 熊谷進, 高鳥浩介, 小沼博隆, 工藤由起子

日本食品衛生学会学術講演会講演要旨集 100th 60 2010年9月16日
チーズ製造モデル系におけるPenicillium camembertiによる腸管出血性大腸菌の増殖促進作用

李謙一, 渡辺麻衣子, 小西良子, 工藤由起子, 熊谷進

日本獣医学会学術集会講演要旨集 149th 268 2010年
食品汚染にかかわる真菌からの迅速な大量DNA抽出方法

渡辺麻衣子, 李謙一, 後藤慶一, 熊谷進, 小西良子, 工藤由起子

日本食品衛生学会学術講演会講演要旨集 98th 127-127 2009年10月8日
チーズスターターカビPenicillium camembertiによる腸管出血性大腸菌の増殖促進効果

李謙一, 渡辺麻衣子, 小西良子, 工藤由起子, 熊谷進

日本食品微生物学会学術総会講演要旨集 30th 100 2009年9月30日
アライグマおよびハクビシンにおける人獣共通感染症原因菌の保有状況

李謙一, 岩田剛敏, 中臺文, 加藤卓也, 羽山伸一, 廣田好和, 林谷秀樹

獣畜新報 61 215-216 2008年

李謙一

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