樋口雄大 (Yudai Higuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 弘前大学農学生命科学部分子生命科学科助教
: 岩手大学大学院連合農学研究科生物資源科学専攻生物分子機能学連合講座助教 (兼任)

学位: 博士（工学）(2020年3月長岡技術科学大学)

研究者番号: 70880045
J-GLOBAL ID: 201801006808958984
researchmap会員ID: B000299705

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 応用微生物学 /

経歴

2020年4月 - 現在

弘前大学, 農学生命科学部分子生命科学科, 助教

学歴

2016年4月 - 2019年3月

長岡技術科学大学大学院, 工学研究科, 生物統合工学専攻博士後期課程
2014年4月 - 2016年3月

長岡技術科学大学大学院, 工学研究科, 生物機能工学専攻修士課程
2012年4月 - 2014年3月

長岡技術科学大学, 工学部, 生物機能工学課程
2007年4月 - 2012年3月

一関工業高等専門学校, 物質化学工学科

論文

Calcium Hydroxide and Magnesium Oxide are Beneficial Bases for Selective Recovery of Ferulic Acid and Vanillic Acid Production from Wheat Bran

Irwan Kurnia, Akihiro Yoshida, Yudai Higuchi, Kazuya Isobe, Tomonori Sonoki

Waste and Biomass Valorization 2026年2月2日
Selective vanillate production from sugarcane bagasse-derived aromatic compounds using an engineered Pseudomonas sp. NGC7-based strain

Md. Jahangir Alam, Naoya Kodama, Kazuma Ikeda, Kanami Muraki, Yudai Higuchi, Masaya Fujita, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Hiroyuki Kurihara, Tomonori Sonoki

Journal of Bioscience and Bioengineering 141(2) 125-134 2026年2月
Large deletions including inverted repeats of the pseudo<i>CHS</i> gene in seed-coat-pigmented mutants derived from Japanese yellow soybean cultivars

Mashiro Yuhazu, Yudai Higuchi, Akira Kanazawa, Mineo Senda

Breeding Science 2025年8月26日
Catabolic System of Syringic Acid, a Key Intermediate of Lignin-Derived Aromatic Compounds, via a Novel Linear Pathway in Pseudomonas sp. NGC7

Zen Ookawa, Yudai Higuchi, Masaya Fujita, Tomonori Sonoki, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Journal of Agricultural and Food Chemistry 73(30) 18899-18913 2025年7月16日
Engineering a vanillate-producing strain of Pseudomonas sp. NGC7 corresponding to aromatic compounds derived from the continuous catalytic alkaline oxidation of sulfite lignin

Mami Kamada, Chieko Yasuta, Yudai Higuchi, Akihiro Yoshida, Irwan Kurnia, Chiho Sakamoto, Aya Takeuchi, Yuta Osaka, Kanami Muraki, Naofumi Kamimura …

Microbial Cell Factories 23(1) 2024年11月19日
Direct catalytic oxidation of rice husk lignin with hydroxide nanorod-modified copper foam and muconate production by engineered Pseudomonas sp. NGC7

Akihiro Yoshida, Irwan Kurnia, Yudai Higuchi, Yuta Osaka, Chieko Yasuta, Chiho Sakamoto, Mina Tamura, Tsubasa Takamatsu, Naofumi Kamimura, Eiji Masai …

Journal of Bioscience and Bioengineering 2024年11月
Direct extraction of biphasic organosolv lignin for producing aromatic aldehydes via alkaline oxidation

Hiroya Ishimaru, Takuya Yoshikawa, Yudai Higuchi, Yuta Nakasaka, Akihiro Yoshida, Tomonori Sonoki, Takao Masuda

Journal of the Taiwan Institute of Chemical Engineers 158 105009-105009 2024年5月
Catabolic System of 5-Formylferulic Acid, a Downstream Metabolite of a β-5-Type Lignin-Derived Dimer, in Sphingobium lignivorans SYK-6.

Mitsuru Kawazoe, Kenji Takahashi, Yosuke Tokue, Shojiro Hishiyama, Hayato Seki, Yudai Higuchi, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Journal of agricultural and food chemistry 2023年12月1日
Successful selective production of vanillic acid from depolymerized sulfite lignin and its application to poly(ethylene vanillate) synthesis

Yudai Higuchi, Hiroya Ishimaru, Takuya Yoshikawa, Takao Masuda, Chiho Sakamoto, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Daisuke Takeuchi, Tomonori Sonoki

Bioresource Technology 129450-129450 2023年7月
Stereoinversion via Alcohol Dehydrogenases Enables Complete Catabolism of β-1-Type Lignin-Derived Aromatic Isomers.

Ryo Kato, Kodai Maekawa, Shota Kobayashi, Shojiro Hishiyama, Rui Katahira, Miki Nambo, Yudai Higuchi, Eugene Kuatsjah, Gregg T Beckham, Naofumi Kamimura …

Applied and environmental microbiology 89(6) e0017123 2023年6月28日
Stereoinversion via alcohol dehydrogenases enables complete catabolism of β-1-type lignin-derived aromatic isomers

Ryo Kato, Kodai Maekawa, Shota Kobayashi, Shojiro Hishiyama, Rui Katahira, Miki Nambo, Yudai Higuchi, Eugene Kuatsjah, Gregg T. Beckham, Naofumi Kamimura …

bioRxiv 2023年1月25日
The Catabolic System of Acetovanillone and Acetosyringone in Sphingobium sp. Strain SYK-6 Useful for Upgrading Aromatic Compounds Obtained through Chemical Lignin Depolymerization.

Yudai Higuchi, Naofumi Kamimura, Hiroki Takenami, Yusei Kikuiri, Chieko Yasuta, Kenta Tanatani, Toru Shobuda, Yuichiro Otsuka, Masaya Nakamura, Tomonori Sonoki …

Applied and environmental microbiology e0072422 2022年8月8日査読有り筆頭著者
Pseudomonas sp. NGC7 as a microbial chassis for glucose-free muconate production from a variety of lignin-derived aromatics and its application to the production from sugar cane bagasse alkaline extract.

Miho Akutsu, Nanase Abe, Chiho Sakamoto, Yuki Kurimoto, Haruka Sugita, Makoto Tanaka, Yudai Higuchi, Kimitoshi Sakamoto, Naofumi Kamimura, Hiroyuki Kurihara …

Bioresource technology 359 127479 2022年6月査読有り
Bacterial catabolic system of acetovanillone and acetosyringone useful for upgrading aromatic compounds obtained through chemical lignin depolymerization

Yudai Higuchi, Naofumi Kamimura, Hiroki Takenami, Yusei Kikuiri, Chieko Yasuta, Kenta Tanatani, Toru Shobuda, Yuichiro Otsuka, Masaya Nakamura, Tomonori Sonoki …

bioRxiv 2022年4月筆頭著者
LsdD has a critical role in the dehydrodiconiferyl alcohol catabolism among eight lignostilbene α,β-dioxygenase isozymes in Sphingobium sp. strain SYK-6

Naofumi Kamimura, Yusaku Hirose, Ryuto Masuba, Ryo Kato, Kenji Takahashi, Yudai Higuchi, Shojiro Hishiyama, Eiji Masai

International Biodeterioration & Biodegradation 159 105208-105208 2021年4月査読有り
Roles of two glutathione S-transferases in the final step of the β-aryl ether cleavage pathway in Sphingobium sp. strain SYK-6

Yudai Higuchi, Daisuke Sato, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Scientific Reports 10(1) 2020年12月査読有り筆頭著者
Roles of two glutathione S-transferases in the final step of the β-aryl ether cleavage pathway in Sphingobium sp. strain SYK-6

Yudai Higuchi, Daisuke Sato, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

bioRxiv 2020年7月8日筆頭著者
Discovery of novel enzyme genes involved in the conversion of an arylglycerol-β-aryl ether metabolite and their use in generating a metabolic pathway for lignin valorization.

Higuchi Y, Kato R, Tsubota K, Kamimura N, Westwood NJ, Masai E

Metabolic engineering 55 258-267 2019年8月査読有り筆頭著者
Bacterial Catabolism of β-Hydroxypropiovanillone and β-Hydroxypropiosyringone Produced in the Reductive Cleavage of Arylglycerol-β-Aryl Ether in Lignin.

Higuchi Y, Aoki S, Takenami H, Kamimura N, Takahashi K, Hishiyama S, Lancefield CS, Ojo OS, Katayama Y, Westwood NJ …

Applied and environmental microbiology 84(7) 2018年4月1日査読有り筆頭著者
Bacterial catabolism of lignin-derived aromatics: New findings in a recent decade: Update on bacterial lignin catabolism

Naofumi Kamimura, Kenji Takahashi, Kosuke Mori, Takuma Araki, Masaya Fujita, Yudai Higuchi, Eiji Masai

ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS 9(6) 679-705 2017年12月査読有り

書籍等出版物

Lignin Valorization: Emerging Approaches

Yudai Higuchi, Kenji Takahashi, Naofumi Kamimura, Eiji Masai (担当:分担執筆, 範囲:Chapter 9 Bacterial Enzymes for the Cleavage of Lignin β-Aryl Ether Bonds: Properties and Applications)

ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY 2018年4月

産業財産権

特開2024-109093 アセトバニロン変換酵素遺伝子及びそれを用いた有用物質生産

樋口雄大, 園木和典, 政井英司, 上村直史
WO2023/120538 4-ヒドロキシ安息香酸の製造方法

鶴谷篤生, 栗原宏征, 園木和典, 樋口雄大
PCT/JP2022/013826 バニリン酸産生形質転換微生物及びその利用

園木和典, 樋口雄大, 政井英司, 上村直史, 吉田曉弘

共同研究・競争的資金等の研究課題

リグニンからのムコン酸生産能を向上させる排出ポンプ遺伝子の同定と発現制御

国立研究開発法人科学技術振興機構（JST）共創の場形成支援プログラム令和７年度次世代を担う人材育成支援支援タイプI 2025年10月 - 2027年3月

樋口雄大
リグニンからの化成品原料生産の実現の鍵となるアセトフェノン類変換酵素系の機能拡張

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2025年4月 - 2027年3月

樋口雄大
リグニン由来芳香族化合物への耐性に関わる薬剤排出ポンプの機能解析

公益財団法人発酵研究所 2023年度若手研究者助成 2023年4月 - 2025年3月

樋口雄大
リグニン由来芳香族化合物への耐性に関わる脂肪酸シス/トランス異性化調節機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

園木和典, 樋口雄大
リグニン由来芳香族化合物アセトバニロンの新規代謝系の解明と物質生産への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2022年4月 - 2025年3月

樋口雄大
リグニン由来抗菌物質アセトバニロンの高い資化性を持つ新規微生物株の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2020年9月 - 2022年3月

樋口雄大

受賞

2016年6月

ポスター奨励賞, Sphingobium属細菌におけるリグニン・ β-アリールエーテル下流代謝系の解明, 第57回新潟生化学懇話会

樋口雄大

MISC

化学とバイオの連携が具体化するリグニンからの芳香族ポリマー原料生産

園木和典, 磯部和也, 吉川琢也, 樋口雄大, 竹内大介, 吉田曉弘, 上村直史, 政井英司

日本画像学会誌 64(5) 514-520 2025年10月招待有り
化学とバイオが連携したリグニンからの芳香族ポリマー合成

園木和典, 樋口雄大, 吉川琢也, 上村直史, 竹内大介, 政井英司

月刊 BIO INDUSTRY 40(6) 26-31 2023年6月12日招待有り
シリーズ: 大学・官公庁研究機関の研究室紹介 (150) 弘前大学農学生命科学部分子生命科学科応用微生物学・微生物代謝機能学研究室

樋口雄大, 園木和典

紙パ技協誌 77(4) 60-61 2023年4月招待有り
非可食バイオマス活用に向けた弘前大学の微生物工学

園木和典, 樋口雄大, 吉田曉弘, 竹内大介

生物工学会誌 100(12) 682-683 2022年12月招待有り
リグニンからの芳香族ポリマー原料の選択的生産：サルファイトリグニンからのバニリン酸生産へのPseudomonas sp. NGC7株の適用

鎌田真未, 安田智恵子, 樋口雄大, 吉田曉弘, 坂本千穂, 大関さおり, 上村直史, 政井英司, 園木和典

創立100周年記念第74回日本生物工学会大会トピックス集 42-43 2022年11月招待有り

講演・口頭発表等

Elucidating catabolic system of syringic acid in Pseudomonas sp. NGC7 for lignin biorefinery

Zen Ookawa, Masaya Fujita, Yudai Higuchi, Tomonori Sonoki, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Development of Continuous Flow Reactor for Oxidative Depolymerization of Lignin with Mesh-Immobilized Copper Hydroxide Catalyst

Yuma Igarashi, Tsubasa Takamatsu, Yuma Shirakawa, Yudai Higuchi, Tomonori Sonoki, Akihiro Yoshida

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Optimization of reaction conditions on oxidative lignin depolymerization over Cu-based catalysts for total utilization of agricultural waste

Yuma Shirakawa, Tsubasa Takamatsu, Yuma Igarashi, Yudai Higuchi, Tomonori Sonoki, Akihiro Yoshida

Pacifichem 2025 2025年12月17日
リグニン分解物からのバニリン酸生産に伴ってそのアナログ化合物の分解能が阻害される分子機構の解明

池田和磨, 児玉直弥, 大川全, 樋口雄大, 藤田雅也, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会東北支部第160回大会 2025年11月29日
サトウキビバガス由来リグニン分解物からのバニリン酸生産の検討

村木香渚美, 羽柴祐希, 樋口雄大, 吉川琢也, 吉田曉弘, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会東北支部第160回大会 2025年11月29日
稲わらの触媒分解によるリグニンとセルロースの有効利用技術の開発

田中謙太郎, 白川夢大, 五十嵐悠真, 髙松翼, 樋口雄大, 園木和典, 吉田曉弘

公益社団法人石油学会郡山大会 (第55回石油・石油化学討論会) 2025年10月30日
水酸化銅メッシュ触媒を用いたリグニン酸化分解におけるバッチ式及びフロー式反応の比較

五十嵐悠真, 髙松翼, 田中謙太郎, 樋口雄大, 園木和典, 吉田曉弘

公益社団法人石油学会郡山大会 (第55回石油・石油化学討論会) 2025年10月30日
多様な芳香族混合物からのバニリン酸の選択的な生産を阻害する代謝プロセスの評価

池田和磨, 児玉直哉, 大川全, 樋口雄大, 上村直史, 政井英司, 園木和典

第77回日本生物工学会大会 2025年9月10日
サトウキビバガス由来リグニン分解物からのバニリン酸の選択的な生産に向けたPseudomonas sp. NGC7株の代謝最適化

村木香渚美, 羽柴祐希, 樋口雄大, 吉川琢也, 吉田曉弘, 上村直史, 政井英司, 園木和典

第77回日本生物工学会大会 2025年9月10日
Optimization of Conditions for Simultaneous Recovery of Aromatic Monomers and Cellulose from Rice Straw via Direct Oxidative Depolymerization Using a Copper Catalyst

田中謙太郎, 白川夢大, 髙松翼, 五十嵐悠真, 樋口雄大, 園木和典, 吉田曉弘

令和7年度化学系学協会東北大会 2025年9月7日
Oxidative Depolymerization of Lignin Using a Copper Hydroxide Catalyst Immobilized on a Copper Mesh

五十嵐悠真, 田中謙太郎, 白川夢大, 髙松翼, 樋口雄大, 園木和典, 吉田曉弘

令和7年度化学系学協会東北大会 2025年9月7日
リグニン由来芳⾹族化合物への耐性に関わる薬剤排出ポンプの機能解析

樋口雄大

公益財団法人発酵研究所第19回助成研究報告会 2025年6月6日
バガスアルカリ加水分解物からのバニリン酸生産においてシリンガ酸の分解が抑制される分子機構の解析

池田和磨, 児玉直哉, 大川全, 樋口雄大, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月8日
リグニンのアルカリ酸化分解物から4-ヒドロキシ安息香酸を生産する微生物株の作出

本城芽衣, 佐藤壮太, 樋口雄大, 入山就, 高松翼, 吉田暁弘, 若村修, 園木和典

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月6日
サトウキビバガス由来オルガノソルブリグニンからのバニリン酸生産系の構築

村木香渚美, 羽柴祐希, 樋口雄大, 吉川琢也, 逢坂優太, 渡辺利樹, 吉田曉弘, 上村直史, 政井英司, 竹内大介, 園木和典

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月6日
A Pseudomonas sp. NGC7-based engineered strain enables glucose-free 4-hydroxybenzoate production

Yuelin Wang, Saori Ozeki, Yudai Higuchi, Zen Ookawa, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Hiroyuki Kurihara, Tomonori Sonoki

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月6日
Pseudomonas sp. NGC7株における広葉樹リグニン由来の芳香族モノマー, シリンガ酸の代謝システム

大川全, 藤田雅也, 樋口雄大, 園木和典, 上村直史, 政井英司

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月5日
Pseudomonas sp. MHK4株のアセトフェノン類変換酵素系の機能解析

樋口雄大, 増井ゆい, 高橋和希, 東浦裕美, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会東北支部第159回大会 2024年9月28日
Pseudomonas sp. MHK4株由来tripartite efflux pumpの機能と役割の解明

入山就, 藤田雅也, 樋口雄大, 田辺幹雄, 千田俊哉, 園木和典

日本農芸化学会東北支部第159回大会 2024年9月28日
バニリン酸アナログの分解抑制を解消してバガスアルカリ加水分解物からバニリン酸を選択的に生産する分子機構の解明

池田和磨, 児玉直弥, 大川全, 樋口雄大, 上村直史, 政井英司, 園木和典

第76回日本生物工学会大会 2024年9月8日

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メディア報道

自然環境に存在する微生物の働きと利用

FMアップルウェーブりんご王国こうぎょくカレッジ 2024年6月2日テレビ・ラジオ番組
木材からのポリマー合成

陸奥新報 1面 2023年7月28日新聞・雑誌
製紙廃棄物から耐熱性ポリマー

日刊工業新聞 31面 2023年7月20日新聞・雑誌
もみ殻からプラ原料

東奥日報 22面 2023年5月14日新聞・雑誌

所属学協会

担当経験のある科目(授業)

2025年12月 - 現在

教職実践演習 (弘前大学)
2023年4月 - 現在

微生物遺伝学特論B (弘前大学大学院)
2023年4月 - 現在

微生物遺伝学特論A (弘前大学大学院)
2022年4月 - 現在

農学生命科学概論 (弘前大学)
2022年4月 - 現在

文献購読I (弘前大学)
2021年10月 - 現在

実践研究推進セミナー (弘前大学大学院)
2021年10月 - 現在

分子生命科学実験I (弘前大学)
2021年10月 - 現在

専門英語 (弘前大学)
2021年4月 - 現在

生物学専門実験 (弘前大学)
2020年10月 - 現在

遺伝子工学 (弘前大学)

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