孟令杰 (Lingjie Meng) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター特定助教

学位: 理学博士(2024年3月京都大学)

連絡先: lingjiekuicr.kyoto-u.ac.jp
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-9937-8860
J-GLOBAL ID: 202401017518877947
researchmap会員ID: R000065322

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I am currently working to understand the role of giant viruses (i.e., the viral phyla "Nucleocytoviricota" and "Mirusviricota") in the global marine ecosystem and to find evidence of how these viruses influence the evolution of their eukaryotic hosts. Benefiting from the development of various sequencing methods, I can see the light getting brighter in the dark room.

研究分野

ライフサイエンス / 生態学、環境学 /

経歴

2024年4月 - 現在

京都大学, 化学研究所, 特定助教
2022年5月 - 2024年3月

京都大学, 化学研究所, 特定研究員

学歴

2019年4月 - 2022年4月

京都大学, 大学院理学研究科, 生物科学

論文

Rapid diversification of a natural Heterosigma akashiwo virus population during a host bloom

Jun Xia, Lingjie Meng, Yue Fang, Hiroki Ban, Yusuke Okazaki, Takashi Yoshida, Hisashi Endo, Keizo Nagasaki, Hiroyuki Ogata

2026年2月7日
DeepKOALA: A Fast and Accurate Deep Learning Framework for KEGG Orthology Assignment

Zhaoxi Yu, Lingjie Meng, Canh Hao Nguyen, Hiroshi Mamitsuka, Minoru Kanehisa, Hiroyuki Ogata

2026年1月8日
Giant viruses specific to deep oceans show persistent presence and activity

Wenwen Liu, Komei Nagasaka, Junyi Wu, Hiroki Ban, Ethan Mimick, Lingjie Meng, Russell Y. Neches, Mohammad Moniruzzaman, Takashi Yoshida, Yosuke Nishimura …

mSystems 2025年12月17日
Haptophyte-infecting viruses change the genome condensing proteins of dinoflagellates

Haina Wang, Lingjie Meng, Sara Otaegi-Ugartemendia, Gabriela Nérida Condezo, Romain Blanc-Mathieu, Runar Stokke, Marius Rydningen Langvad, David Brandt, Jörn Kalinowski, Håkon Dahle …

Communications Biology 2025年3月28日
Genome-resolved year-round dynamics reveal a broad range of giant virus microdiversity

Yue Fang, Lingjie Meng, Jun Xia, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi, Keizo Nagasaki, Hisashi Endo, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Ogata

mSystems 2025年1月21日
Spatiotemporal dynamics of giant viruses within a deep freshwater lake reveal a distinct dark-water community

Liwen Zhang, Lingjie Meng, Yue Fang, Hiroyuki Ogata, Yusuke Okazaki

The ISME Journal 2024年9月23日査読有り
Gene transfer among viruses substantially contributes to gene gain of giant viruses.

Junyi Wu, Lingjie Meng, Morgan Gaïa, Hiroyuki Hikida, Yusuke Okazaki, Hisashi Endo, Hiroyuki Ogata

Molecular biology and evolution 2024年8月2日
Eukaryotic genomic data uncover an extensive host range of mirusviruses.

Hongda Zhao, Lingjie Meng, Hiroyuki Hikida, Hiroyuki Ogata

Current biology : CB 34(12) 2633-2643 2024年6月17日
A 1.5-Mb continuous endogenous viral region in the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis

Hongda Zhao, Ruixuan Zhang, Junyi Wu, Lingjie Meng, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Hikida, Hiroyuki Ogata

Virus Evolution 2023年11月9日
Genomic adaptation of giant viruses in polar oceans

Lingjie Meng, Tom O. Delmont, Morgan Gaïa, Eric Pelletier, Antonio Fernandez-Guerra, Samuel Chaffron, Russell Y. Neches, Junyi Wu, Hiroto Kaneko, Hisashi Endo …

Nature Communications 2023年10月12日
Mirusviruses link herpesviruses to giant viruses

Morgan Gaïa, Lingjie Meng, Eric Pelletier, Patrick Forterre, Chiara Vanni, Antonio Fernandez-Guerra, Olivier Jaillon, Patrick Wincker, Hiroyuki Ogata, Mart Krupovic …

Nature 2023年4月27日
Quantitative assessment of NCLDV–host interactions predicted by co-occurrence analyses

Lingjie Meng, Hisashi Endo, Romain Blanc-Mathieu, Samuel Chaffron, Rodrigo Hernández-Velázquez, Hiroto Kaneko, Hiroyuki Ogata

mSphere 6(2) 2020年10月16日
Phosphoproteomic analyses of kidneys of Atlantic salmon infected with Aeromonas salmonicida

Liu, P.-F., Du, Y., Meng, L., Li, X., Yang, D., Liu, Y.

Scientific Reports 9(1) 2019年
Colonization of Aeromonas salmonicida subsp. masoucida strains in Atlantic salmon (Salmo salar L.) during infection

Du, Y., Liu, P., Meng, L., Sharawy, Z., Liu, Y.

Aquaculture Research 49(5) 2018年
Development and Application of a Quantitative Real-time Polymerase Chain Reaction Assay for the Detection of Aeromonas salmonicida

Du, Y., Liu, Y., Xiao, P., Meng, L., Liu, P.

Journal of the World Aquaculture Society 48(4) 2017年
ALDH7A1 is a protein that protects Atlantic salmon against Aeromonas salmonicida at the early stages of infection

Liu, P.-F., Du, Y., Meng, L., Li, X., Liu, Y.

Fish and Shellfish Immunology 70 2017年
Proteomic analysis in kidneys of Atlantic salmon infected with Aeromonas salmonicida by iTRAQ

Liu, P.-F., Du, Y., Meng, L., Li, X., Liu, Y.

Developmental and Comparative Immunology 72 2017年
Involvement of LuxS in Aeromonas salmonicida metabolism, virulence and infection in Atlantic salmon (Salmo salar L)

Meng, L., Du, Y., Liu, P., Li, X., Liu, Y.

Fish and Shellfish Immunology 64 2017年
Metabolic profiling in kidneys of Atlantic salmon infected with Aeromonas salmonicida based on ¹H NMR

Liu, P.-F., Du, Y., Meng, L., Li, X., Liu, Y.

Fish and Shellfish Immunology 58 2016年
Colour preferences of juvenile turbot (Scophthalmus maximus)

Li, X., Chi, L., Tian, H., Meng, L., Zheng, J., Gao, X., Liu, Y.

Physiology and Behavior 156 2016年

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