徳永裕二 (Tokunaga Yuji) - マイポータル

基本情報

所属: 国際医療福祉大学成田薬学部准教授

学位: 博士（薬学）(2012年3月東京大学)

J-GLOBAL ID: 201801004336791611
researchmap会員ID: B000321501

研究キーワード

核磁気共鳴、タンパク質、核酸

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2026年4月 - 現在

国際医療福祉大学, 成田薬学部, 准教授
2021年11月 - 2026年3月

東京大学大学院薬学系研究科, 助教
2021年4月 - 2021年10月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 細胞分子工学研究部門, 研究員
2020年4月 - 2021年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 細胞分子工学研究部門, 若手任期付研究職員
2016年4月 - 2020年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬分子プロファイリング研究センター, 若手任期付研究職員
2013年8月 - 2016年3月

一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム, 研究開発部門, 博士研究員
2013年4月 - 2013年7月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬分子プロファイリング研究センター, 第一号職員
2012年4月 - 2013年3月

一般社団法人バイオ産業情報化コンソ―シアム, 研究開発部門, 博士研究員

学歴

2009年4月 - 2012年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科, 博士課程
2007年4月 - 2009年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科, 修士課程
2005年4月 - 2007年3月

東京大学, 薬学部, 薬学科
2003年4月 - 2005年3月

東京大学, 教養学部, 理科I類

受賞

2014年11月

JEOL RESONANCE賞（最優秀若手ポスター賞）, 日本核磁気共鳴学会
2014年7月

若手研究者奨励賞, 日本薬学会物理系薬学部会

論文

Publisher's Note: "Non-thermal acceleration of DNA base pairing by sub-terahertz irradiation" [J. Chem. Phys. 164, 065102 (2026)].

Johtaro Yamamoto, Yuji Tokunaga, Koh Takeuchi, Masahiko Imashimizu

The Journal of chemical physics 164(10) 2026年3月14日
Title: Non-thermal acceleration of DNA base pairing by sub-terahertz irradiation.

Johtaro Yamamoto, Yuji Tokunaga, Koh Takeuchi, Masahiko Imashimizu

The Journal of chemical physics 164(6) 2026年2月14日
Two-step target recognition for the competitive inhibition activity of an anti-VEGF aptamer.

Koh Takeuchi, Takumi Ueda, Misaki Imai, Miwa Fujisaki, Masanari Tsujimura, Yuji Tokunaga, Yutaka Kofuku, Ichio Shimada

RNA (new york, N.Y.) 31(10) 1368-1378 2025年9月16日
Cell permeability and target engagement of middle-sized molecules quantified by in-cell NMR.

Yota Sukigara, Hajime Kamoshida, Yuji Tokunaga, Miwa Fujisaki, Misaki Imai, Yoko Kobayashi, Yutaka Kofuku, Takumi Ueda, Ichio Shimada, Koh Takeuchi

Analytical chemistry 97(35) 18955-18964 2025年9月9日
Affinity-directed substrate/H+-antiport by a MATE transporter.

Koh Takeuchi, Takumi Ueda, Misaki Imai, Miwa Fujisaki, Mie Shimura, Yuji Tokunaga, Yutaka Kofuku, Ichio Shimada

Structure (London, England : 1993) 32(8) 1150-1164 2024年5月18日
The oxidative folding of nascent polypeptides provides electrons for reductive reactions in the ER.

Kaiku Uegaki, Yuji Tokunaga, Michio Inoue, Seiji Takashima, Kenji Inaba, Koh Takeuchi, Ryo Ushioda, Kazuhiro Nagata

Cell reports 42(7) 112742-112742 2023年7月25日
Nonthermal acceleration of protein hydration by sub-terahertz irradiation.

Jun-Ichi Sugiyama, Yuji Tokunaga, Mafumi Hishida, Masahito Tanaka, Koh Takeuchi, Daisuke Satoh, Masahiko Imashimizu

Nature communications 14(1) 2825-2825 2023年5月22日
Function-Related Dynamics in Multi-Spanning Helical Membrane Proteins Revealed by Solution NMR.

Koh Takeuchi, Yutaka Kofuku, Shunsuke Imai, Takumi Ueda, Yuji Tokunaga, Yuki Toyama, Yutaro Shiraishi, Ichio Shimada

Membranes 11(8) 2021年8月9日
Nonthermal excitation effects mediated by subterahertz radiation on hydrogen exchange in ubiquitin.

Yuji Tokunaga, Masahito Tanaka, Hitoshi Iida, Moto Kinoshita, Yuya Tojima, Koh Takeuchi, Masahiko Imashimizu

Biophysical journal 2021年5月1日
Conformational Plasticity of Cyclic Ras-Inhibitor Peptides Defines Cell Permeabilization Activity.

Koh Takeuchi, Imai Misaki, Yuji Tokunaga, Miwa Fujisaki, Hajime Kamoshida, Takeshi Takizawa, Hiroyuki Hanzawa, Ichio Shimada

Angewandte Chemie (International ed. in English) 60(12) 6567-6572 2021年3月15日
Role of NMR in High Ordered Structure Characterization of Monoclonal Antibodies.

Yuji Tokunaga, Koh Takeuchi

International journal of molecular sciences 22(1) 2020年12月22日
Control of Transcription Initiation by Biased Thermal Fluctuations on Repetitive Genomic Sequences.

Masahiko Imashimizu, Yuji Tokunaga, Ariel Afek, Hiroki Takahashi, Nobuo Shimamoto, David B Lukatsky

Biomolecules 10(9) 2020年9月9日
Targeting the cryptic sites: NMR-based strategy to improve protein druggability by controlling the conformational equilibrium.

Yumiko Mizukoshi, Koh Takeuchi, Yuji Tokunaga, Hitomi Matsuo, Misaki Imai, Miwa Fujisaki, Hajime Kamoshida, Takeshi Takizawa, Hiroyuki Hanzawa, Ichio Shimada

Science advances 6(40) 2020年9月
Structural Fingerprints of an Intact Monoclonal Antibody Acquired under Formulated Storage Conditions via 15N Direct Detection Nuclear Magnetic Resonance.

Yuji Tokunaga, Koh Takeuchi, Junya Okude, Kazutomo Ori, Takuya Torizawa, Ichio Shimada

Journal of medicinal chemistry 63(10) 5360-5366 2020年5月28日
Spotlight on the Ballet of Proteins: The Structural Dynamic Properties of Proteins Illuminated by Solution NMR.

Yuji Tokunaga, Thibault Viennet, Haribabu Arthanari, Koh Takeuchi

International journal of molecular sciences 21(5) 2020年3月6日
Osmostress enhances activating phosphorylation of Hog1 MAP kinase by mono-phosphorylated Pbs2 MAP2K.

Kazuo Tatebayashi, Katsuyoshi Yamamoto, Taichiro Tomida, Akiko Nishimura, Tomomi Takayama, Masaaki Oyama, Hiroko Kozuka-Hata, Satomi Adachi-Akahane, Yuji Tokunaga, Haruo Saito

The EMBO journal 39(5) e103444 2020年3月2日
Forbidden Coherence Transfer of ¹⁹F Nuclei to Quantitatively Measure the Dynamics of a CF₃-Containing Ligand in Receptor-Bound States.

Tokunaga Y, Takeuchi K, Shimada I

Molecules (Basel, Switzerland) 22(9) 2017年9月査読有り
Improvement of Ligand Affinity and Thermodynamic Properties by NMR-Based Evaluation of Local Dynamics and Surface Complementarity in the Receptor-Bound State

Yumiko Mizukoshi, Koh Takeuchi, Misa Arutaki, Yuji Tokunaga, Takeshi Takizawa, Hiroyuki Hanzawa, Ichio Shimada

ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 55(47) 14606-14609 2016年11月査読有り
Dynamic multidrug recognition by multidrug transcriptional repressor LmrR

Koh Takeuchi, Yuji Tokunaga, Misaki Imai, Hideo Takahashi, Ichio Shimada

SCIENTIFIC REPORTS 4 6922 2014年11月査読有り
Allosteric enhancement of MAP kinase p38α's activity and substrate selectivity by docking interactions.

Tokunaga Y, Takeuchi K, Takahashi H, Shimada I

Nature structural & molecular biology 21(8) 704-711 2014年8月査読有り

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MISC

異なる膜様環境下での光駆動膜タンパク質RxRの構造および熱安定性の比較解析

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異なる膜様環境下でのプロトンポンプ型ロドプシンRxRの構造および熱安定性の比較解析

菊間千滉, 鈴木里佳, 徳永裕二, 竹内恒, 小島慧一, 須藤雄気, 高橋栄夫

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
タンパク質が複雑な立体構造を持つことの意味を求めて

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ファルマシア 59(3) 241-241 2023年
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徳永裕二
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日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

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中分子の膜透過を評価し膜透過活性を付与する創薬基盤技術の構築

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膜タンパク質の膜貫通領域におけるシステイン残基を介したレドックス感知機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

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竹内恒, 徳永裕二
機能的構造平衡に基づく刺激に適合したキナーゼシグナル選別機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2017年4月 - 2019年3月

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機能的構造平衡のNMR解析による刺激に適合したキナーゼシグナル選別機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2016年8月 - 2018年3月

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