細川正人 (Masahito Hosokawa) - マイポータル

基本情報

所属: 早稲田大学理工学術院准教授
: bitBiome株式会社創業者/取締役CSO

学位: 博士(工学)(2010年3月東京農工大学)

研究者番号: 60722981
J-GLOBAL ID: 201401027638592804
researchmap会員ID: B000236387

外部リンク: https://www.hosokawa-lab.com/

研究分野

ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学 /

経歴

2022年4月 - 現在

国立研究開発法人科学技術振興機構, 創発研究者
2021年4月 - 現在

東京農工大学, 客員准教授
2021年4月 - 現在

早稲田大学, 大学院先進理工学研究科, 准教授
2018年11月 - 現在

bitBiome株式会社, 取締役CSO
2018年9月 - 2020年3月

早稲田大学, 理工学術院総合研究所, 次席研究員(研究院講師)
2015年10月 - 2019年3月

国立研究開発法人科学技術振興機構, さきがけ研究者
2014年4月 - 2016年3月

早稲田大学, ナノ理工学研究機構, 次席研究員（研究院助教）
2013年6月 - 2014年3月

早稲田大学, 理工学術院, 日本学術振興会特別研究員(PD)
2011年4月 - 2013年5月

静岡県立静岡がんセンター研究所, 新規薬剤開発・評価研究部, 日本学術振興会特別研究員(PD)
2010年4月 - 2011年3月

東京農工大学, 工学府, 日本学術振興会特別研究員(PD) DC2より資格変更

学歴

2008年4月 - 2010年3月

東京農工大学, 工学府博士後期課程, 生命工学専攻

受賞

2022年9月

経済産業大臣賞, 大学発ベンチャー表彰2022
2021年7月

第5回「バイオインダストリー奨励賞」, (一財)バイオインダストリー協会
2019年4月

平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞, 文部科学省

細川正人
2019年3月

イノベーション賞, 科学技術振興機構さきがけ（統合１細胞領域）

細川正人
2016年5月

第96春季年会優秀講演賞(学術), 日本化学会

細川正人

論文

A single amplified genome catalog reveals the dynamics of mobilome and resistome in the human microbiome.

Tetsuro Kawano-Sugaya, Koji Arikawa, Tatsuya Saeki, Taruho Endoh, Kazuma Kamata, Ayumi Matsuhashi, Masahito Hosokawa

Microbiome 12(1) 188-188 2024年10月2日査読有り責任著者
Large-scale single-virus genomics uncovers hidden diversity of river water viruses and diversified gene profiles.

Yohei Nishikawa, Ryota Wagatsuma, Yuko Tsukada, Lin Chia-Ling, Rieka Chijiiwa, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama

The ISME journal 2024年7月8日査読有り
Uncovering Endolysins against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Using a Microbial Single-Cell Genome Database.

Takuya Yoda, Ayumi Matsuhashi, Ai Matsushita, Shohei Shibagaki, Yukie Sasakura, Kazuteru Aoki, Masahito Hosokawa, Soichiro Tsuda

ACS infectious diseases 2024年6月21日査読有り責任著者
Analysis of microbial dynamics in the soybean root-associated environments from community to single-cell levels.

Masako Kifushi, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Toyoaki Anai, Haruko Takeyama

Journal of bioscience and bioengineering 137(6) 429-436 2024年6月査読有り
A combination of two-enzyme system and enzyme engineering improved the activity of a new PET hydrolase identified from soil bacterial genome

Hideaki Mabashi-Asazuma, Makoto Hirai, Shigeru Sakurai, Keigo Ide, Masato Kogawa, Ai Matsushita, Masahito Hosokawa, Soichiro Tsuda

bioRxiv 2024年2月
Tools for microbial single-cell genomics for obtaining uncultured microbial genomes

Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa

Biophysical Reviews 2023年9月8日査読有り筆頭著者責任著者
Target enrichment of uncultured human oral bacteria with phage-derived molecules found by single-cell genomics.

Masahito Hosokawa, Naoya Iwai, Koji Arikawa, Tatsuya Saeki, Taruho Endoh, Kazuma Kamata, Takuya Yoda, Soichiro Tsuda, Haruko Takeyama

Journal of bioscience and bioengineering 136(1) 58-66 2023年7月査読有り筆頭著者責任著者
Combined actions of bacteriophage-encoded genes in Wolbachia-induced male lethality.

Hiroshi Arai, Hisashi Anbutsu, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Kazuo Ishii, Masahito Hosokawa, Shiou-Ruei Lin, Masatoshi Ueda, Madoka Nakai, Yasuhisa Kunimi …

iScience 26(6) 106842-106842 2023年6月16日査読有り
Enhancing the sensitivity of bacterial single-cell RNA sequencing using RamDA-seq and Cas9-based rRNA depletion.

Mika Nishimura, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa

Journal of bioscience and bioengineering 2023年6月11日査読有り最終著者責任著者
Linking antigen specific T-cell dynamics in a microfluidic chip to single cell transcription patterns.

Hiroki Ide, Taiki Aoshi, Masato Saito, Wilfred Villariza Espulgar, Jonathan Campos Briones, Masahito Hosokawa, Hiroko Matsunaga, Koji Arikawa, Haruko Takeyama, Shohei Koyama …

Biochemical and biophysical research communications 657 8-15 2023年3月15日査読有り
Uncultured prokaryotic genomes in the spotlight: An examination of publicly available data from metagenomics and single-cell genomics.

Koji Arikawa, Masahito Hosokawa

Computational and structural biotechnology journal 21 4508-4518 2023年査読有り最終著者責任著者
Revealing within-species diversity in uncultured human gut bacteria with single-cell long-read sequencing.

Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Koji Arikawa, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa

Frontiers in microbiology 14 1133917-1133917 2023年査読有り最終著者責任著者
Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral.

Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano …

Microbiome 10(1) 220-220 2022年12月12日査読有り
Reproducible and sensitive micro-tissue RNA sequencing from formalin-fixed paraffin-embedded tissues for spatial gene expression analysis.

Hiroko Matsunaga, Koji Arikawa, Miki Yamazaki, Ryota Wagatsuma, Keigo Ide, Ashok Zachariah Samuel, Kazuya Takamochi, Kenji Suzuki, Takuo Hayashi, Masahito Hosokawa …

Scientific reports 12(1) 19511-19511 2022年11月14日査読有り
Cancer Cachexia among Patients with Advanced Non-Small-Cell Lung Cancer on Immunotherapy: An Observational Study with Exploratory Gut Microbiota Analysis.

Taiki Hakozaki, Alexis Nolin-Lapalme, Masato Kogawa, Yusuke Okuma, Shohei Nakamura, Danielle Moreau-Amaru, Taichi Tamura, Yukio Hosomi, Haruko Takeyama, Corentin Richard …

Cancers 14(21) 2022年11月2日査読有り
Validation of the application of gel beads-based single-cell genome sequencing platform to soil and seawater

Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ryota Wagatsuma, Katsuhiko Mineta, Kai Takahashi, Keigo Ide, Kei Yura, Hayedeh Behzad, Takashi Gojobori …

ISME Communications 2(1) 2022年9月29日査読有り筆頭著者責任著者
Identification of lipolytic enzymes using high-throughput single-cell screening and sorting of a metagenomic library.

Amani Alma'abadi, Hayedeh Behzad, Mohammed Alarawi, David Conchouso, Yoshimoto Saito, Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Haruko Takeyama, Katsuhiko Mineta …

New biotechnology 70 102-108 2022年9月25日査読有り
Male-killing-associated bacteriophage WO identified from comparisons of Wolbachia endosymbionts of Homona magnanima

bioRxiv 2022年6月13日
Identification of two cancer stem cell-like populations in triple-negative breast cancer xenografts.

Jun Nakayama, Hiroko Matsunaga, Koji Arikawa, Takuya Yoda, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama, Yusuke Yamamoto, Kentaro Semba

Disease models & mechanisms 15(6) 2022年5月25日査読有り
Strain-level profiling of viable microbial community by selective single-cell genome sequencing.

Masahito Hosokawa, Taruho Endoh, Kazuma Kamata, Koji Arikawa, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Haruko Takeyama

Scientific reports 12(1) 4443-4443 2022年3月15日査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

【あなたのラボから薬を生み出すアカデミア創薬の実践 All JAPAN体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線】(第1章)最新の疾患標的分子の探索・評価技術シングルセル/微小組織マルチオミクス解析

由良敬, 松永浩子, 細川正人, 和泉自泰, 村松知成, 福永津嵩, 浜田道昭, 馬場健史, 竹山春子

実験医学 42(2) 199-204 2024年2月
バイオものづくり成功のためのコンパス

細川正人

生物工学会誌 101(7) 378-379 2023年7月25日
未培養微生物遺伝子の大規模データを活用した酵素探索

細川正人, 細川正人, 津田宗一郎

酵素工学ニュ-ス (90) 2023年
未培養微生物群集からの網羅的1細胞ゲノム解析法の開発

細川正人

バイオサイエンスとインダストリー 80(4) 354-355 2022年7月
【臨床実装が進む次世代がんバイオマーカー新規の検出技術、AIが加速するリキッドバイオプシーとその先の診断モダリティ】(第2章)新たながん診断モダリティと検出技術マイクロバイオームを利用したがん診断技術の開発動向

佐伯達也, 笹倉由貴江, 細川正人

実験医学 40(10) 1529-1536 2022年6月
【若手研究者が拓くこれからの生物工学(後編)】細菌叢のシングルセル解析

細川正人

生物工学会誌 100(6) 298-301 2022年6月
マウス新生児心臓における空間的転写物発現の解析とその機能的役割

松永浩子, 牧野祐樹, 我妻竜太, 我妻竜太, 杉山夏緒里, 杉山夏緒里, 山崎美輝, 山崎美輝, 細川正人, 細川正人 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
アルツハイマーモデルマウス海馬における位置特異的な遺伝子発現状態の解明

山崎美輝, 山崎美輝, 依田卓也, 松永浩子, 細川正人, 細川正人, 細川正人, 細川正人, 竹山春子, 竹山春子 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
経済産業大臣賞膨大な微生物ゲノムデータベースを活用してバイオものづくり産業を革新する

細川正人

産学官連携ジャーナル 18(10) 9-10 2022年
Spatial transcriptomics reveals the two cancer stem cell-like populations in triple-negative breast cancer

Jun Nakayama, Hiroko Matsunaga, Koji Arikawa, Takuya Yoda, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama, Yusuke Yamamoto, Kentaro Semba

bioRxiv 2021年10月21日
Interview 2

細川正人

生物工学会誌 99(8) 444-445 2021年8月25日
【1細胞解析-技術と応用】技術 1細胞ゲノム解析で多様な細菌叢を捉える

細川正人, 小川雅人

医学のあゆみ 276(10) 947-954 2021年3月
シングルセルRNA-seq解析から明らかになった分裂酵母の目覚め機構

露崎隼, 細川正人, 竹山春子, 佐藤政充

バイオサイエンスとインダストリー 78(6) 507-509 2020年11月
環境細菌のシングルセルゲノム解析微小液滴を用いたゲノム解析手法とその応用例

西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 竹山春子

日本乳酸菌学会誌 31(1) 17-24 2020年3月
【シングルセルゲノミクス組織の機能、病態が1細胞レベルで見えてきた!】(第3章)技術開発マイクロバイオームのシングルセル解析

細川正人, 小川雅人, 竹山春子

実験医学 37(20) 3521-3526 2019年12月
難培養微生物を対象としたシングルセルゲノミクスの課題と展望 (特集細菌叢解析の光と影) -- (ゲノム進化・メタゲノム)

細川正人, 西川洋平, 竹山春子

生体の科学 68(2) 150-154 2017年3月
ドロップレット・マイクロフルイディクスによる超並列シングルセル解析

細川正人, 西川洋平, 竹山春子

Chemical sensors = 化学センサ 32(4) 159-165 2016年

書籍等出版物

未培養微生物研究の最新動向

青柳, 秀紀 (担当:分担執筆, 範囲:第 10 章未培養微生物を活用するためのシングルセルゲノム解析)

シーエムシー出版 2023年4月 (ISBN: 9784781317328)
シングルセル解析でなにがわかるか

竹山, 春子, 細川, 正人

化学同人 2020年7月 (ISBN: 9784759817348)

講演・口頭発表等

大規模遺伝子データを活用したCO2からのバイオものづくり

細川正人

BioJapan 製品評価技術基盤機構 CO2を直接原料としたバイオものづくりへの挑戦 2024年10月10日招待有り
大規模微生物遺伝子データの収集からものづくりへの展開

細川正人

バイオ関連化学シンポジウム若手フォーラム 2024年9月11日招待有り
微生物遺伝子ビッグデータの可能性：バイオものづくりへの革新的アプローチ

細川正人

お茶の水女子大学生物学科セミナー 2024年8月9日招待有り
アカデミアとスタートアップの二刀流に挑む

細川正人

産業技術総合研究所イノベーションスクール 2024年6月20日招待有り
未培養微生物の可能性を解き放つ: 大規模遺伝子データから酵素開発・バイオものづくりへ

細川正人

ライフサイエンス技術部会反応分科会講演会 2024年5月28日招待有り
微生物ビッグデータ・AI技術を統合した酵素探索技術

細川正人

日本農芸化学会2024年度大会シンポジウム「CO2固定能を有する微生物とそのデータの利活用によるカーボンニュートラルへの貢献とバイオものづくり産業の活性化に向けて」 2024年3月26日招待有り
マイクロバイオームの精密解析、ビッグデータからものづくりへの展開

細川正人

日本化学会第104春季年会(2024) イノベーション共創プログラム（CIP）：デジタルヘルスケアの最前線 2024年3月19日招待有り
Advances in Single-Cell Technologies: Analyzing Bacterial Genomes and Gene Expressions

Masahito Hosokawa

UQ-Waseda University Joint Symposium 2024年2月29日招待有り
未培養微生物の可能性を解き放つ: シングルセル解析からバイオものづくりへの展望

細川正人

化学生命工学講演会「化学生命の最前線２」 2024年2月8日招待有り
微生物ビッグデータ・AI・ロボティクスを統合した次世代のバイオものづくり

細川正人

第452回CBI学会講演会「自動化が拓く新たな価値の創造～コア技術×自動化～」 2024年1月26日招待有り
1細胞/微小組織マルチオミックスのオールインワン解析による生命科学研究支援

細川正人

臨床薬理学会 2023年12月15日招待有り
次世代バイオものづくりのための未培養微生物ゲノムデータベース

細川正人

第61回日本生物物理学会年会 2SKP 超越分子シンポジウム：基礎研究を超越し社会実装へつなげる 2023年11月15日招待有り
土壌微生物を知り理解するためのゲノム解析技術

細川正人

バイオインダストリー協会植物バイオ研究会・Food Bio Plus研究会公開講演会 2023年10月25日招待有り
未培養微生物の遺伝子獲得に向けたシングルセルゲノミクスの活用

細川正人

第75回日本生物工学会大会シンポジウム合成生物学が切り拓く次世代型天然物創薬 2023年9月4日招待有り
微生物ビッグデータ・AI・ロボティクスを統合した次世代のバイオものづくり

細川正人

エタンセルオンラインフォーラム 2023年8月31日
Unlock the full potential of microbes

SKS JAPAN セッション14 『精密発酵技術の最先端トレンド』 2023年7月28日招待有り
微生物遺伝子データで実現するバイオものづくり

細川正人

JBA バイオリーダーズ研修 2023 2023年7月20日招待有り
Microbial gene big data for biomanufacturing

「ビッグデータ解析と合成生物学の最近の進展：将来のバイオものづくりに向けた基盤技術」第5回 LINK-J・UCサンディエゴライフサイエンスシンポジウム 2023年6月28日招待有り
ヒト共生・未培養微生物におけるシングルセルゲノム解析の活用法

細川正人

第27回腸内細菌学会学術集会シンポジウム1 2023年6月27日招待有り
バクテリアのシングルセルRNA-seqで何ができるか

細川正人

大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会 2023年6月12日招待有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞内共生オルガネラのゲノム制御：技術革新から生命現象の理解と応用へ

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

有村慎一, 石原直忠, 竹中瑞樹, 鳥山欽哉, 松村浩由, 風間智彦, 庄司佳祐, 沼田圭司, 神吉智丈, 山田勇磨, 木内隆史, 高梨秀樹, 細川正人, 佐藤美由紀, 西村芳樹, 小笠原絵美, 矢守航
細胞質ゲノム編集と遺伝子導入技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

有村慎一, 奥野未来, 石綱史子, 高梨秀樹, 細川正人
接合伝達で獲得したプラスミドへの細菌細胞の初期適応過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2024年4月 - 2028年3月

野尻秀昭, 細川正人
腸内細菌による粘膜バリア構築とその破綻に関する統合的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2023年4月 - 2028年3月

長谷耕二, 新藏礼子, 細川正人, 大橋若奈, 松田幹
大規模1細胞ゲノムから設計する微生物叢の戦略的制御

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進創発的研究支援事業 2022年 - 2028年

細川正人
海底下生命から解き明かす生命の極限とその適応

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2027年3月

諸野祐樹, 伊藤元雄, 細川正人, 加納英明, 井尻暁, 阪口昌彦
肺炎球菌の細胞壁分解能が病態形成と薬剤耐性獲得に果たす役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

山口雅也, 川端重忠, 住友倫子, 細川正人, 山下隼人
１細胞解像度で紐解く不均質な細菌群集からの亜集団発生

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2023年6月 - 2026年3月

細川正人
腸内細菌による粘膜バリア制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2026年3月

長谷耕二, 新藏礼子, 細川正人
新規PET分解菌のシングルセルゲノム情報に基づくPET代謝の理解と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2024年6月 - 2026年3月

吉田昭介, 細川正人, 謝銘輝
シン・パレオゲノミクスが創る博物館資料群活用の新展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2021年4月 - 2024年3月

覚張隆史, 松前ひろみ, 金原正明, 本橋慶一, 岡崎健治, 中込滋樹, 石谷孔司, 細川正人, 和久大介
シングルセルゲノムデータに基づく未培養微生物の戦略的資源化プロセスの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

細川正人, 西川洋平
微小組織多領域シークエンスによる免疫療法治療抵抗性分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

林大久生, 高持一矢, 細川正人, 末原義之, 齋藤剛
新規生理活性物質生産株の超ハイスループットスクリーニングプラットフォーム構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2017年5月 - 2022年3月

竹山春子, 安藤正浩, 細川正人, 油谷幸代
1細胞ゲノムの非増幅シーケンスによる未培養微生物の完全長ゲノム取得

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2021年3月

細川正人
１細胞内のゲノム構造と転写活性制御を紐解くイメージ・シーケンス統合解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

細川正人
組織内の細胞多様性を明らかにする超並列ゲノム解析技術の創成

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業さきがけ統合1細胞解析のための革新的技術基盤 2015年10月 - 2019年3月

細川正人
微小反応場を利用した難培養微生物のシングルセルゲノム増幅法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

細川正人
マイクロフルイディックエンジニアリングの深化と生体分子高感度定量計測への展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2011年4月 - 2016年3月

庄子習一, 竹山春子, 水野潤, 関口哲志, 細川正人, 尹棟鉉, 鈴木美穂, 福田武司, 船津高志, 武田直也, モリテツシ, 枝川義邦
単一細胞内ＤＮＡ分子数の新規デジタルカウンティング手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

竹山春子, 横田恭子, 細川正人

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主要な産業財産権

特許第6877804号シングルセル解析を行う方法およびそのための装置

細川正人, 竹山春子, 西川洋平,小川雅人
特許第6744642号単一生物単位の配列情報の新規処理法

有川浩司, 細川正人, 竹山春子, 小川雅人, 井手圭吾
特許第6744648号単一生物単位の配列情報の新規処理法

有川浩司, 細川正人, 竹山春子, 小川雅人, 井手圭吾

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細川正人

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書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

主要な産業財産権

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