塩生真史 (Masafumi Shionyu) - マイポータル

基本情報

所属: 長浜バイオ大学バイオサイエンス学部准教授

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

J-GLOBAL ID: 200901093237222730
researchmap会員ID: 5000095833

外部リンク: http://b-lab.nagahama-i-bio.ac.jp/~m_shionyu/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2014年10月 - 現在

長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授
2005年4月 - 2014年9月

長浜バイオ大学バイオサイエンス学部, 講師
2003年4月 - 2005年3月

日本学術振興会, 特別研究員PD
2002年4月 - 2003年3月

名古屋大学大学院理学研究科, 助手
2000年7月 - 2002年3月

日本学術振興会, 特別研究員DC2

学歴

1997年4月 - 2002年3月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 生命理学専攻
1993年4月 - 1997年3月

名古屋大学, 理学部, 生物学科

論文

Acceleration of Protein Degradation by 20S Proteasome-Binding Peptides Generated by In Vitro Artificial Evolution

Yunhao Zhu, Kaishin Shigeyoshi, Yumiko Hayakawa, Sae Fujiwara, Masamichi Kishida, Hitoshi Ohki, Tomohisa Horibe, Masafumi Shionyu, Tamio Mizukami, Makoto Hasegawa

International Journal of Molecular Sciences 24(24) 17486-17486 2023年12月14日
Role of a bacterial glycolipid in Sec-independent membrane protein insertion.

Kaoru Nomura, Shoko Mori, Kohki Fujikawa, Tsukiho Osawa, Shugo Tsuda, Kumiko Yoshizawa-Kumagaye, Shun Masuda, Hideki Nishio, Taku Yoshiya, Takao Yoda …

Scientific reports 12(1) 12231-12231 2022年7月18日査読有り
Intermolecular Interactions between a Membrane Protein and a Glycolipid Essential for Membrane Protein Integration.

Shoko Mori, Kaoru Nomura, Kohki Fujikawa, Tsukiho Osawa, Masafumi Shionyu, Takao Yoda, Tsuyoshi Shirai, Shugo Tsuda, Kumiko Yoshizawa-Kumagaye, Shun Masuda …

ACS chemical biology 17(3) 609-618 2022年3月18日査読有り
Evaluating cepharanthine analogues as natural drugs against SARS-CoV-2.

Atsushi Hijikata, Clara Shionyu-Mitsuyama, Setsu Nakae, Masafumi Shionyu, Motonori Ota, Shigehiko Kanaya, Takatsugu Hirokawa, Shogo Nakajima, Koichi Watashi, Tsuyoshi Shirai

FEBS open bio 12(1) 285-294 2022年1月査読有り
Current status of structure-based drug repurposing against COVID-19 by targeting SARS-CoV-2 proteins.

Atsushi Hijikata, Clara Shionyu, Setsu Nakae, Masafumi Shionyu, Motonori Ota, Shigehiko Kanaya, Tsuyoshi Shirai

Biophysics and physicobiology 18 226-240 2021年査読有り
Knowledge-based structural models of SARS-CoV-2 proteins and their complexes with potential drugs.

Atsushi Hijikata, Clara Shionyu-Mitsuyama, Setsu Nakae, Masafumi Shionyu, Motonori Ota, Shigehiko Kanaya, Tsuyoshi Shirai

FEBS letters 594(12) 1960-1973 2020年6月査読有り
Pentagamavunon-1 (PGV-1) inhibits ROS metabolic enzymes and suppresses tumor cell growth by inducing M phase (prometaphase) arrest and cell senescence

Beni Lestari, Ikuko Nakamae, Noriko Yoneda-Kato, Tsumoru Morimoto, Shigehiko Kanaya, Takashi Yokoyama, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai, Edy Meiyanto, Jun-ya Kato

Scientific Reports 2019年12月査読有り
Curcumin Derivatives Verify the Essentiality of ROS Upregulation in Tumor Suppression

Ikuko Nakamae, Tsumoru Morimoto, Hiroki Shima, Masafumi Shionyu, Hisayo Fujiki, Noriko Yoneda-Kato, Takashi Yokoyama, Shigehiko Kanaya, Kiyomi Kakiuchi, Tsuyoshi Shirai …

Molecules 24(22) 4067-4067 2019年11月10日査読有り
Crystallization of Pearl Biomineralization Protein in Microgravity Environments

Nakae Setsu, Shionyu Masafumi, Ogawa Tomohisa, Shirai Tsuyoshi

INTERNATIONAL JOURNAL OF MICROGRAVITY SCIENCE AND APPLICATION 36(1) 2019年査読有り
Cover Image, Volume 86, Issue 6

Setsu Nakae, Masafumi Shionyu, Tomohisa Ogawa, Tsuyoshi Shirai

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 86(6) C1 2018年6月査読有り
Structures of jacalin-related lectin PPL3 regulating pearl shell biomineralization

Setsu Nakae, Masafumi Shionyu, Tomohisa Ogawa, Tsuyoshi Shirai

Proteins: Structure, Function and Bioinformatics 86(6) 644-653 2018年6月1日査読有り
Ridaifen-F conjugated with cell-penetrating peptides inhibits intracellular proteasome activities and induces drug-resistant cell death

Makoto Tanaka, Yunhao Zhu, Masafumi Shionyu, Nozomi Ota, Natsumi Shibata, Chihiro Watanabe, Akihito Mizusawa, Ryuzo Sasaki, Tamio Mizukami, Isamu Shiina …

European Journal of Medicinal Chemistry 146 636-650 2018年2月25日査読有り
Decoding disease-causing mechanisms of missense mutations from supramolecular structures

Atsushi Hijikata, Toshiyuki Tsuji, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 8541 2017年8月査読有り
The Role of the Prod1 Membrane Anchor in Newt Limb Regeneration

Kaoru Nomura, Yasushi Tanimoto, Fumio Hayashi, Erisa Harada, Xiao-Yuan Shan, Masafumi Shionyu, Atsushi Hijikata, Tsuyoshi Shirai, Kenichi Morigaki, Keiko Shimamoto

ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 56(1) 270-274 2017年1月査読有り
A novel tamoxifen derivative, ridaifen-F, is a nonpeptidic small-molecule proteasome inhibitor

Makoto Hasegawa, Yukari Yasuda, Makoto Tanaka, Kenya Nakata, Eri Umeda, Yanwen Wang, Chihiro Watanabe, Shoko Uetake, Tatsuki Kunoh, Masafumi Shionyu …

EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY 71 290-305 2014年1月査読有り
Structure of novel enzyme in mannan biodegradation process 4-O-β-D-mannosyl-D-glucose phosphorylase MGP.

Nakae S, Ito S, Higa M, Senoura T, Wasaki J, Hijikata A, Shionyu M, Ito S, Shirai T

Journal of Molecular Biology 425(22) 4468-4478 2013年11月査読有り
AS-EAST: a functional annotation tool for putative proteins encoded by alternatively spliced transcripts

Masafumi Shionyu, Ken-ichi Takahashi, Mitiko Go

BIOINFORMATICS 28(15) 2076-2077 2012年8月査読有り
DINE: A novel score function for modeling multidomain protein structures with domain linker and interface restraints

Satoru Hirako, Masafumi Shionyu

IPSJ Transactions on Bioinformatics 5 18-26 2012年査読有り
Chondroitin Sulfate Synthase-2/Chondroitin Polymerizing Factor Has Two Variants with Distinct Function

Hiroyasu Ogawa, Masafumi Shionyu, Nobuo Sugiura, Sonoko Hatano, Naoko Nagai, Yukihiko Kubota, Kiyoji Nishiwaki, Takashi Sato, Masanori Gotoh, Hisashi Narimatsu …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 285(44) 34155-34167 2010年10月査読有り
RESOPS: A Database for Analyzing the Correspondence of RNA Editing Sites to Protein Three-Dimensional Structures

Kei Yura, Sintawee Sulaiman, Yosuke Hatta, Masafumi Shionyu, Mitiko Go

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 50(11) 1865-1873 2009年11月査読有り

もっとみる

MISC

超分子グラフシステムによるGWAS解析の研究

土方敦司, 辻敏之, 塩生真史, 白井剛

月刊細胞 51(7) 348‐352 2019年6月30日
マベ真珠由来ジャカリン様レクチンのX線構造解析による立体構造と糖鎖認識能の解明

小川智久, 中江摂, LAKUDZALA Agness Ethel, 永沼孝子, 村本光二, 比江森恵子, 平林淳, 舘野浩章, 塩生真史, 白井剛

日本糖質学会年会要旨集 37th 108 2018年8月20日
Chondroitin sulfate synthase-2/chondroitin polymerizing factor: Characterization and impact on chondroitin sulfate biosynthesis

Hideto Watanabe, Hiroyasu Ogawa, Masafumi Shionyu, Nobuo Sugiura, Sonoko Hatano, Naoko Nagai, Takashi Sato, Hisashi Narimatsu, Katsuji Shimizu, Koji Kimata

GLYCOBIOLOGY 22(11) 1598-1599 2012年11月
Construction of a database to infer alternative splicing-induced diversification of protein structure and interaction

Masafumi Shionyu, Akihiro Yamaguchi, Ken-Ichi Takahashi, Mitiko Go

GENES & GENETIC SYSTEMS 83(6) 493-493 2008年12月
S08I6 選択的スプライシングがもたらすタンパク質構造への影響(構造プロテオミクスを推進するバイオインフォマティクス,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)

郷通子, 由良敬, 塩生真史

生物物理 47(1) S12 2007年11月20日
2SE02 選択的スプライシングによるタンパク質多様化(限られたゲノム情報からタンパク質の多様性はいかにして生み出されるのか? : 転写と翻訳後の多様化機構)

塩生真史, 由良敬, 土方敦司, 中原拓, 篠田和紀, 山口晶大, 高橋健一, 郷通子

生物物理 45(1) S23 2005年10月19日
3P283 選択的スプライシングによる蛋白質立体構造への影響(生命情報科学 B) 機能ゲノミクス)

塩生真史, 由良敬, 荻野圭, 土方敦司, 平島義紀, 中原拓, 江口達也, 篠田和紀, 山口晶大, 高橋健一 …

生物物理 44(1) S260 2004年11月10日
S3E03ミオグロビンのモジュール構造と起源

塩生真史, 由良敬, 郷通子

生物物理 41(1) S21 2001年9月10日
1P176巨大タンパク質のドメイン同定法の開発

塩生真史, 郷通子

生物物理 41(1) S76 2001年9月10日
3H1330 巨大タンパク質に適したドメイン自動同定法の開発

塩生真史, 郷通子

生物物理 40(1) S195 2000年8月5日
2PA119 TIMバレル融合型タンパク質におけるドメインの融合

塩生真史, 郷通子

生物物理 39(1) S130 1999年9月2日
4つの転写因子におけるモジュールとイントロンの相関

由良敬, 塩生真史, 橋本博之, 郷通子

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 280-280 1998年12月1日
モジュールを使った球状ドメイン同定法

塩生真史, 佐藤陽子, 友田志郎, 郷通子

生物物理 38(2) S150 1998年9月7日
ヘモグロビンの新しいモジュール構成

塩生真史, 深海-小林薫, 水谷正輝, 由良敬, 郷通子

生物物理 37(2) S59 1997年10月
ヘモグロビンの新しいモジュール構成に基づく立体構造の再構成

由良敬, 塩生真史, 郷通子

生物物理 37(2) S75 1997年10月
転写因子の塩基認識モジュールとリン酸基結合モジュール

由良敬, 塩生真史, 郷通子

生物物理 37(2) S162 1997年10月

書籍等出版物

-基礎と実習バイオインフォマティクス-

土方敦司, 塩生真史, 郷通子 (担当:分担執筆, 範囲:ホモロジーモデリングと機能予測)

共立出版 2004年
基礎と実習バイオインフォマティクス

高橋健一, 塩生真史 (担当:分担執筆, 範囲:UNIX・プログラミング基礎)

共立出版 2004年

講演・口頭発表等

アミノ酸残基相互作用統計に基づくタンパク質—タンパク質ドッキング法の開発

土方敦司, 塩生真史, 白井剛

jSBI 2015 2015年10月30日
機能未知スプライシングアイソフォームの機能予測

塩生真史

第53回日本生物物理学会年会 2015年9月14日
マルチドメインタンパク質の構造予測サーバの構築

塩生真史, 土方敦司, 白井剛

第15回日本蛋白質科学会年会 2015年6月26日
タンパク質相互作用統計に基づくタンパク質ータンパク質ドッキングポーズのスコアリング法の開発

土方敦司, 塩生真史, 白井剛

第15回日本蛋白質科学会年会 2015年6月26日
イントロンの起源をどう考えるかー発見から現在までー

郷通子, 塩生真史, 由良敬

第37回日本分子生物学会年会 2014年11月25日
タンパク質複合体立体構造の統計データに基づくタンパク質ドッキング法

土方敦司, 塩生真史, 白井剛

jSBI 2014 2014年10月3日
３つ以上のドメインからなるマルチドメインタンパク質の構造予測

塩生真史, 土方敦司, 白井剛

第52回日本生物物理学会年会 2014年9月26日
A protein-protein docking prediction method not relying on the shape complementarity

Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai

第52回日本生物物理学会年会 2014年9月26日
ノシルグルコース加リン酸分解酵素 MGP の基質複合体の構造解析

中江摂, 伊藤重陽, 川口和輝, 瀬野浦武志, 和崎淳, 土方敦司, 塩生真史, 伊藤進, 白井剛

第14回日本蛋白質科学会年会 2014年6月27日
タンパク質相互作用統計に基づくタンパク質―タンパク質ドッキングポーズ探索法の開発

土方敦司, 塩生真史, 白井剛

第14回日本蛋白質科学会年会 2014年6月27日
結合インターフェースにおけるアミノ酸残基出現頻度を用いた低分子リガンド推定法の開発

冨田竜平, 平子暁, 塩生真史

第14回日本蛋白質科学会年会 2014年6月27日
スプライシングアイソフォームの機能的有意性の評価

塩生真史, 池田志織, 高橋健一

第51回日本生物物理学会年会 2013年10月28日
新規タモキシフェン誘導体リダイフェン-Fに見出されたプロテアソーム阻害作用の構造活性相関研究

長谷川慎, 田中誠, 安田ゆかり, 塩生真史, 佐々木隆造, 水上民夫, 中田健也, 梅田絵梨, 王エンブン, 渡邊千尋, 植竹祥子, 椎名勇

日本ケミカルバイオロジー学会第8回年会 2013年6月21日
疎水性コア欠失型スプライシングアイソフォームの構造と機能の評価

池田志織, 高橋健一, 塩生真史

第13回日本蛋白質科学会年会 2013年6月14日
結合部位におけるアミノ酸残基使用傾向を用いた低分子リガンド結合残基の予測

冨田竜平, 平子暁, 塩生真史

第３５回日本分子生物学会年会 2012年12月14日
疎水性コアが欠失したスプライシングアイソフォームの保存と発現の解析

池田志織, 高橋健一, 塩生真史

第３５回日本分子生物学会年会 2012年12月14日
選択的スプライシングによる新規タンパク質アイソフォームの機能・構造予測情報を得るためのツールの開発と公開

塩生真史, 高橋健一, 郷通子

日本生物物理学会第５０回年会 2012年9月22日
保存された選択的スプライシングがタンパク質疎水性コアに与える影響の解析

池田志織, 高橋健一, 塩生真史

第12回日本蛋白質科学会年会 2012年6月22日
アミノ酸残基の結合傾向値を用いた機能未知タンパク質における低分子リガンド結合部位の予測

冨田竜平, 平子暁, 塩生真史

第12回日本蛋白質科学会年会 2012年6月22日
DINEスコアを用いたドメイン集合体構造のモデリング

平子暁, 塩生真史

第12回日本蛋白質科学会年会 2012年6月21日

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

補因子結合予測と実験検証の組み合わせにより未同定の酵素を明らかにできるか？

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

塩生真史, 向由起夫, 中村卓
実験的検証のフィードバックを活用した結合補酵素予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

塩生真史, 土方敦司, 向由起夫
機能未知スプライシングアイソフォームの機能部位予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

塩生真史, 土方敦司, 中田圭祐
スプライシングアイソフォーム間の機能部位の差異推定法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年 - 2012年

塩生真史
「ターゲットタンパクプログラムの情報解析支援」（ターゲットタンパク研究情報プラットフォームの構築運用）

2010年 - 2012年
選択的スプライシングを受けたタンパク質の立体構造モデリングによる機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2006年 - 2009年

郷通子, 塩生真史, 由良敬, 由良敬
タンパク質間相互作用の解析と予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2003年 - 2004年

塩生真史
タンパク質のドメイン自動同定法の開発とそのゲノム情報解析への適用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2001年 - 2001年

塩生真史

塩生真史

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧