蒔田由布子 (Yuko Makita) - マイポータル

基本情報

所属: 前橋工科大学工学部生命情報学科教授

学位: 工学(名古屋大学大学院)

J-GLOBAL ID: 201901000742053240
researchmap会員ID: B000349961

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

経歴

2022年4月 - 現在

前橋工科大学, 工学部生命情報学科, 教授

論文

Arabidopsis transcriptomic analysis reveals cesium inhibition of root growth involves abscisic acid signaling.

Wen-Dee Ong, Yuko Makita, Takae Miyazaki, Minami Matsui, Ryoung Shin

Planta 259(2) 36-36 2024年1月15日
The blue light signaling inhibitor 3-bromo-7-nitroindazole affects gene translation at the initial reception of blue light in young <i>Arabidopsis</i> seedlings

Yukio Kurihara, Chika Akagi, Yuko Makita, Masaharu Kawauchi, Emiko Okubo-Kurihara, Tomohiko Tsuge, Takashi Aoyama, Minami Matsui

Plant Biotechnology 2024年
Translational activation of ribosome-related genes at initial photoreception is dependent on signals derived from both the nucleus and the chloroplasts in Arabidopsis thaliana.

Chika Akagi, Yukio Kurihara, Yuko Makita, Masaharu Kawauchi, Tomohiko Tsuge, Takashi Aoyama, Minami Matsui

Journal of plant research 2023年1月20日
Intergenic splicing-stimulated transcriptional readthrough is suppressed by nonsense-mediated mRNA decay in Arabidopsis.

Yukio Kurihara, Yuko Makita, Masaharu Kawauchi, Ami Kageyama, Tomoko Kuriyama, Minami Matsui

Communications biology 5(1) 1390-1390 2022年12月20日
A collection of inducible transcription factor‐glucocorticoid receptor fusion lines for functional analyses in Arabidopsis thaliana

Setsuko Shimada, Yuki Yanagawa, Takachika Munesada, Yoko Horii, Tomoko Kuriyama, Mika Kawashima, Youichi Kondou, Takeshi Yoshizumi, Nobutaka Mitsuda, Masaru Ohme‐Takagi …

The Plant Journal 111(2) 595-607 2022年7月
Sequence-based evaluation of promoter context for prediction of transcription start sites in Arabidopsis and rice.

Tosei Hiratsuka, Yuko Makita, Yoshiharu Y. Yamamoto

Scientific reports 12 1976 2022年4月28日査読有り
Tracking metabolites at single-cell resolution reveals metabolic dynamics during plant mitosis

Emiko Okubo-Kurihara, Ahmed Ali, Mika Hiramoto, Yukio Kurihara, Yasmine Abouleila, Eman Muhammad Abdelazem, Takayuki Kawai, Yuko Makita, Mika Kawashima, Tsuyoshi Esaki …

Plant Physiology 2022年3月18日
Author Correction: Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton.

Yuko Makita, Shigekatsu Suzuki, Keiji Fushimi, Setsuko Shimada, Aya Suehisa, Manami Hirata, Tomoko Kuriyama, Yukio Kurihara, Hidefumi Hamasaki, Emiko Okubo-Kurihara …

Nature communications 12(1) 7356-7356 2021年12月16日
Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton

Yuko Makita, Shigekatsu Suzuki, Keiji Fushimi, Setsuko Shimada, Aya Suehisa, Manami Hirata, Tomoko Kuriyama, Yukio Kurihara, Hidefumi Hamasaki, Emiko Okubo-Kurihara …

Nature Communications 12(1) 3593-3593 2021年12月
Regulatory Potential of bHLH-Type Transcription Factors on the Road to Rubber Biosynthesis in Hevea brasiliensis.

Tomoko Yamaguchi, Yukio Kurihara, Yuko Makita, Emiko Okubo-Kurihara, Ami Kageyama, Emi Osada, Setsuko Shimada, Hiroko Tsuchida, Hiroaki Shimada, Minami Matsui

Plants (Basel, Switzerland) 9(6) 2020年5月26日査読有り
Time-Course Transcriptome Study Reveals Mode of bZIP Transcription Factors on Light Exposure in Arabidopsis.

Yukio Kurihara, Yuko Makita, Haruka Shimohira, Minami Matsui

International journal of molecular sciences 21(6) 2020年3月14日査読有り
Translational Landscape of Protein-Coding and Non-Protein-Coding RNAs upon Light Exposure in Arabidopsis.

Yukio Kurihara, Yuko Makita, Haruka Shimohira, Tomoya Fujita, Shintaro Iwasaki, Minami Matsui

Plant & cell physiology 61(3) 536-545 2020年3月1日査読有り
Transcripts from downstream alternative transcription start sites evade uORF-mediated inhibition of gene expression in Arabidopsis.

Yukio Kurihara, Yuko Makita, Mika Kawashima, Tomoya Fujita, Shintaro Iwasaki, Minami Matsui

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 115(30) 7831-7836 2018年7月24日査読有り
Identifying the target genes of SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1, a master transcription factor controlling DNA damage response in Arabidopsis.

Nobuo Ogita, Yoko Okushima, Mutsutomo Tokizawa, Yoshiharu Y Yamamoto, Maho Tanaka, Motoaki Seki, Yuko Makita, Minami Matsui, Kaoru Okamoto-Yoshiyama, Tomoaki Sakamoto …

The Plant journal : for cell and molecular biology 94(3) 439-453 2018年5月査読有り
Construction of Pará rubber tree genome and multi-transcriptome database accelerates rubber researches.

Makita Y, Kawashima M, Lau NS, Othman AS, Matsui M

BMC genomics 19(Suppl 1) 922 2018年1月19日査読有り
Screening of fungi for decomposition of lignin-derived products from Japanese cedar

Yohtaro Saito, Hiroko Tsuchida, Tomoko Matsumoto, Yuko Makita, Mika Kawashima, Jun Kikuchi, Minami Matsui

Journal of Bioscience and Bioengineering 126(5) 573-579 2018年査読有り
Large-scale collection of full-length cDNA and transcriptome analysis in Hevea brasiliensis

Yuko Makita, Kiaw Kiaw Ng, G. Veera Singham, Mika Kawashima, Hideki Hirakawa, Shusei Sato, Ahmad Sofiman Othman, Minami Matsui

DNA RESEARCH 24(2) 159-167 2017年4月査読有り
Chemical-Induced Inhibition of Blue Light-Mediated Seedling Development Caused by Disruption of Upstream Signal Transduction Involving Cryptochromes in Arabidopsis thaliana

Wen-Dee Ong, Emiko Okubo-Kurihara, Yukio Kurihara, Setsuko Shimada, Yuko Makita, Mika Kawashima, Kaori Honda, Yasumitsu Kondoh, Nobumoto Watanabe, Hiroyuki Osada …

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 58(1) 95-105 2017年1月査読有り
The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis

Nyok-Sean Lau, Yuko Makita, Mika Kawashima, Todd D. Taylor, Shinji Kondo, Ahmad Sofiman Othman, Alexander Chong Shu-Chien, Minami Matsui

SCIENTIFIC REPORTS 6 28594 2016年6月査読有り
Functional and expression analyses of transcripts based on full-length cDNAs of Sorghum bicolor

Setsuko Shimada, Yuko Makita, Tomoko Kuriyama-Kondou, Mika Kawashima, Yoshiki Mochizuki, Hideki Hirakawa, Shusei Sato, Tetsuro Toyoda, Minami Matsui

DNA RESEARCH 22(6) 485-493 2015年12月査読有り

もっとみる

MISC

海洋メタゲノムデータからの赤色光,遠赤色光,青色光を感知する融合型光受容体の発見

蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 平田愛実, 陶久あや, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
植物は光照射が起こす転写開始点の位置変化によってuORFによる遺伝子発現抑制を免れる

栗原志夫, 蒔田由布子, 川島美香, 藤田智也, 岩崎信太郎, 松井南

日本RNA学会年会要旨集 21st 55 2019年7月17日
天然ゴムの生合成に関連する転写因子及びその結合部位の同定

山口朋子, 山口朋子, 長田恵美, 長田恵美, 蔭山杏実, 蔭山杏実, 栗原志夫, 蒔田由布子, 嶋田勢津子, 栗原(大窪)恵美子 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
プラシノ藻のキメラPHY-CRY遺伝子のシロイヌナズナにおける機能解析

平田愛実, 平田愛実, 蒔田由布子, 嶋田勢津子, 陶久あや, 栗山朋子, 川島美香, 山口晴代, 鈴木重勝, 河内正伸 …

日本植物生理学会年会(Web) 60th 2019年
シロイヌナズナ幼苗の青色光への応答時におけるORFの翻訳変化の解明

栗原志夫, 蒔田由布子, 下平春花, 下平春花, 藤田智也, 岩崎信太郎, 松井南

日本植物学会大会研究発表記録 83rd 2019年
天然ゴムの生合成を制御する転写因子及びその結合部位の同定

山口朋子, 山口朋子, 栗原志夫, 蒔田由布子, 川島美香, 嶋田勢津子, 栗原恵美子, 土田博子, 島田浩章, 松井南

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 36th 2018年
植物は光受容によって起こる転写開始点の位置変化によってuORFによる遺伝子発現抑制を免れる

栗原志夫, 蒔田由布子, 川島美香, 藤田智也, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎, 松井南

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.2P‐0019 (WEB ONLY) 2018年
スギリグニンを分解する新規菌類の探索および,リグニン分解物の解析

土田博子, 齋藤洋太郎, 松本朋子, 蒔田由布子, 川島美香, 菊地淳, 菊地淳, 松井南

日本植物学会大会研究発表記録 81st 243 2017年9月1日
植物の有糸分裂の各期における1細胞を用いた高解像度なメタボローム解析

平元美佳, 平元美佳, 栗原(大窪)恵美子, 栗原志夫, 蒔田由布子, 桧垣匠, 馳澤盛一郎, 松井南

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
ソルガム,トランスクリプトームデータベースの更新

蒔田由布子, 嶋田勢津子, 川島美香, 栗山朋子, 平川英樹, 佐藤修正, 松井南

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 33rd 2015年
ソルガム完全長cDNAライブラリーの構築と新規転写単位の発現解析

嶋田勢津子, 蒔田由布子, 近藤(栗山)朋子, 川島美香, 望月芳樹, 下山紗代子, 平川英樹, 佐藤修正, 豊田哲郎, 松井南

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 32nd 2014年
ソルガム完全長cDNAの整備と,配列解析による新規転写単位の同定及びソルガムゲノムブラウザ(Sorgabase)の構築

嶋田勢津子, 近藤(栗山)朋子, 蒔田由布子, 望月芳樹, 下山紗代子, 平川英樹, 佐藤修正, 豊田哲郎, 松井南

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 31st 2013年
Semantic Web技術を利用した哺乳類バイオリソースのデータベース

MASUYA Hiroshi, TAKATSUKI Terue, SAITO Mikako, WAKI Kazunori, TANAKA Nobuhiko, MEKADA Kazuyuki, NAKATA Hatsumi, SAIJO Kaoru, YOSHIDA Yuko, MAKITA Yuko …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 34th 2011年
理研哺乳類統合データベース(The integrated database of mammals in RIKEN)

桝屋啓志, 蒔田由布子, 西方公郎, 吉田有子, 高月照江, 脇和規, 田中信彦, 望月芳樹, 小林紀郎, 溝口理一郎 …

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 83回・33回 4P-1205 2010年12月
意味論的ウェブに基づくインフラ構造システムにおける哺乳類の広範な情報のトップレベルオントロジーに基づく統合の実装

MASUYA Hiroshi, MAKITA Yuko, KOBAYASHI Norio, YOSHIDA Yuko, MOCHIZUKI Yoshiki, DOI Koji, TAKATSUKI Terue, WAKI Kazunori, TANAKA Nobuhiko, KOZAKI Koji …

Proceedings of Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics 2010 2010年
複数のアルゴリズム比較による転写因子結合部位予測支援ツールMelina IIの開発

奥村利幸, 牧口大旭, 蒔田由布子, 山下理宇, 中井謙太

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 349 2005年11月25日
ベイズ統計を用いた枯草菌転写制御予測とグラム陽性菌の制御配列比較

蒔田由布子, DE HOON M, 宮野悟, 小笠原直毅, 中井謙太

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 773 2004年11月25日
枯草菌転写データベースDBTBSに基づく真正細菌転写システムの系統的解析

蒔田由布子, 中井謙太

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 26th 423 2003年11月25日
枯草菌の転写因子結合配列と真性細菌のプロモータ領域との配列比較

蒔田由布子, 中井謙太

生物物理 43 S217 2003年
プロモーター領域の種間配列比較によるマイコプラズマ属の転写制御機構の解析

蒔田由布子, 寺井悟朗, 中井謙太

日本生物物理学会年会講演予稿集 40th(2) S111 2002年11月