石川雅人 (Masato Ishikawa) - マイポータル

基本情報

Inferring extrinsic factor-dependent single-cell transcriptome dynamics using a deep generative model

Yasuhiro Kojima, Yuko Arioka, Haruka Hirose, Shuto Hayashi, Yusuke Mizuno, Keiki Nagaharu, Hiroki Okumura, Masato Ishikawa, Kohshi Ohishi, Yutaka Suzuki …

2024年4月1日
Single-cell colocalization analysis using a deep generative model

Yasuhiro Kojima, Shinji Mii, Shuto Hayashi, Haruka Hirose, Masato Ishikawa, Masashi Akiyama, Atsushi Enomoto, Teppei Shimamura

Cell Systems 15(2) 180-192.e7 2024年2月査読有り
RENGE infers gene regulatory networks using time-series single-cell RNA-seq data with CRISPR perturbations

Masato Ishikawa, Seiichi Sugino, Yoshie Masuda, Yusuke Tarumoto, Yusuke Seto, Nobuko Taniyama, Fumi Wagai, Yuhei Yamauchi, Yasuhiro Kojima, Hisanori Kiryu …

Communications Biology 6(1) 2023年12月28日査読有り筆頭著者責任著者
Constrained vertebrate evolution by pleiotropic genes

Haiyang Hu, Masahiro Uesaka, Song Guo, Kotaro Shimai, Tsai-Ming Lu, Fang Li, Satoko Fujimoto, Masato Ishikawa, Shiping Liu, Yohei Sasagawa …

Nature Ecology & Evolution 1(11) 1722-1730 2017年9月25日査読有り

摂動後の発現ダイナミクスに基づく遺伝子制御ネットワーク推定

石川雅人, 杉野成一, 増田芳恵, 樽本雄介, 瀬戸裕介, 谷山暢子, 和穎文, 山内悠平, 小嶋泰弘, 木立尚孝 …

日本数理生物学会年会(Web) 2024 2024年
遺伝子制御ネットワークの動態の操作による細胞の運命制御

樽本雄介, 杉野成一, 山内悠平, 石川雅人, 和穎文, 永樂元次, 望月敦史, 遊佐宏介

日本ゲノム編集学会大会要旨集 9th 2024年

Inferring the regulatory function underlying gene expression dynamics by integrating gene regulatory networks

Masato Ishikawa, Atsushi Mochizuki

Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference (APBJC2024) 2024年10月
摂動後の発現ダイナミクスに基づく遺伝子制御ネットワーク推定

石川雅人

NGS EXPO 2024 2024年9月5日招待有り
情報科学と力学系理論に基づく遺伝子発現ダイナミクスのモデル推定

石川雅人

バイオインフォマティクス分野講演会 2024年1月招待有り
Inference of gene regulatory networks based on expression dynamics induced by gene perturbations

Masato Ishikawa

OKO International Symposium 2023 2023年8月招待有り
摂動後の発現時系列データを用いた遺伝子制御ネットワーク推定法

石川雅人, 永樂元次, 遊佐宏介, 山内悠平, 木立尚孝, 望月敦史

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月招待有り