中島芽梨 (Meri Nakajima) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 国立研究開発法人産業技術総合研究所バイオものづくり研究センター研究員

学位: 博士（工学）(2025年3月北海道大学)

研究者番号: 01020122
ORCID iD: https://orcid.org/0009-0005-4486-1974
J-GLOBAL ID: 202301016391069788
researchmap会員ID: R000057201

外部リンク: https://bpri.aist.go.jp/metr

・産総研プレスリリース（2025/2/11）：メタン生成アーキアに寄生するバクテリア / Novel Bacteria Parasitizing Archaea

研究キーワード

9

研究分野

3

経歴

3

2025年3月 - 現在

国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオものづくり研究センター, 研究員
2022年4月 - 2025年3月

日本学術振興会特別研究員（DC1）
2021年11月 - 2025年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門微生物生態工学研究グループ, 技術研修員

学歴

3

2022年4月 - 2025年3月

北海道大学, 大学院工学院, 環境創生工学専攻（博士後期課程）
2020年4月 - 2022年3月

北海道大学, 大学院工学院, 環境創生工学専攻（修士課程）
2016年4月 - 2020年3月

北海道大学, 工学部, 環境社会工学科環境工学コース

委員歴

1

2025年8月 - 現在

Japan-YWP, 運営委員

受賞

9

2025年3月

北海道大学博士後期課程修了者総代

中島芽梨
2025年3月

北海道大学大塚賞

中島芽梨
2022年12月

環境技術・プロジェクト賞, 金ナノ粒子プローブを用いた簡易核酸分析法の開発, 土木学会環境工学委員会

中島芽梨
2022年11月

優秀ポスター賞, 金ナノ粒子プローブを用いた環境中微生物の簡易核酸分析法の開発, 日本微生物生態学会

中島芽梨
2022年3月

年会優秀発表賞（クリタ賞）, 金ナノ粒子プローブを用いた環境中の病原体の検出, 日本水環境学会

中島芽梨
2021年3月

年会優秀発表賞（クリタ賞）, 光導波路分光装置を用いた下水処理プロセスの微生物モニタリング, 日本水環境学会

中島芽梨
2021年1月

Best Student Poster Presentation Award, Simple assay for spectroscopic quantification of 16S rRNA of ammonia oxidizing bacteria using DNA-modified gold nanoparticles, International Conference on the "Challenges in Environmental Science and Engineering"

Meri Nakajima
2020年1月

優秀講演賞（ポスター部門）, 金ナノ粒子を用いた細菌の16S rRNAの比色分析, 化学系学協会北海道支部

中島芽梨
2019年12月

優秀ポスター発表賞, 金ナノ粒子を用いた16S rRNAをターゲットとした細菌の比色分析, 土木学会環境工学委員会

中島芽梨

論文

9

Current Understanding of Taxonomy and Ecology of the Phylum <i>Minisyncoccota</i>

Naoki Fujii, Meri Nakajima, Takashi Narihiro, Kyohei Kuroda, Tomonori Kindaichi

Microbes and Environments 41(2) n/a-n/a 2026年
Minisyncoccus archaeiphilus gen. nov., sp. nov., a mesophilic, obligate parasitic bacterium and proposal of Minisyncoccaceae fam. nov., Minisyncoccales ord. nov., Minisyncoccia class. nov. and Minisyncoccota phyl. nov. formerly referred to as Candidatus Patescibacteria or candidate phyla radiation.

Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Kengo Kubota, Hisashi Satoh, Masaru K Nobu, Takashi Narihiro, Kyohei Kuroda

International journal of systematic and evolutionary microbiology 75(2) 2025年2月査読有り筆頭著者
Development of an internal two-stage upflow anaerobic reactor integrating biostimulation strategies to enhance the degradation of aromatic compounds in wastewater from purified terephthalic acid and dimethyl terephthalate manufacturing processes

Kyohei Kuroda, Maho Takai, Takeo Sekiguchi, Tomoya Ikarashi, Hazuki Kurashita, Meri Nakajima, Masaru K. Nobu, Masashi Hatamoto, Takashi Yamaguchi, Yuki Nakaya …

Water Research 121762-121762 2024年5月査読有り
Microscopic and metatranscriptomic analyses revealed unique cross-domain parasitism between phylum Candidatus Patescibacteria/candidate phyla radiation and methanogenic archaea in anaerobic ecosystems.

Kyohei Kuroda, Meri Nakajima, Ryosuke Nakai, Yuga Hirakata, Shuka Kagemasa, Kengo Kubota, Taro Q P Noguchi, Kyosuke Yamamoto, Hisashi Satoh, Masaru K Nobu …

mBio e0310223 2024年2月7日査読有り筆頭著者
Analysis of Unamplified 16S rRNA of Ammonia-Oxidizing Bacteria in Activated Sludge by Spectrophotometry Using Gold Nanoprobes

Meri Nakajima, Reiko Hirano, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh

ACS ES&T Water 2023年8月23日査読有り筆頭著者
Candidate phyla radiation (CPR)/Candidatus Patescibacteriaの実態を廃水処理システムの視点から理解する

黒田恭平, 成廣隆, 藤井直樹, 中島芽梨, 中島芽梨, 景政柊蘭, 景政柊蘭, 景政柊蘭, 中井亮佑, 佐藤久 …

日本微生物生態学会誌 38(1) 2023年査読有り
Highly sensitive and homogeneous detection of unamplified RNA based on the light scattering properties of gold nanoparticle probes

Hisashi Satoh, Meri Nakajima, Reiko Hirano, Yuki Nakaya

Biosensors and Bioelectronics: X 12 100249-100249 2022年12月査読有り
Simple assay for colorimetric quantification of unamplified bacterial 16S rRNA in activated sludge using gold nanoprobes.

Meri Nakajima, Reiko Hirano, Satoshi Okabe, Hisashi Satoh

Chemosphere 263 128331-128331 2021年1月査読有り筆頭著者
下水中の細菌の16S rRNA検出用ペーパー分析チップの開発

中島芽梨, 石田晃彦, 渡慶次学, 佐藤久

分析化学 69(12) 715-722 2020年12月5日査読有り筆頭著者

主要なMISC

19

博士課程，進学してみませんか？（特集：若手水環境人財が挑む水環境研究の未来とキャリア）

中島芽梨

水環境学会誌 47(A)(11) 2024年11月招待有り
Microscopic and metatranscriptomic analyses revealed unique cross-domain symbiosis betweenCandidatusPatescibacteria/candidate phyla radiation (CPR) and methanogenic archaea in anaerobic ecosystems

bioRxiv 2023年8月25日筆頭著者
特集:産業排水・下水向け生物処理技術の最新動向：簡易、迅速、低コスト微生物分析技術

佐藤久, 中島芽梨, 平野麗子

環境浄化技術 2021年7・8月号 20 1-7 2021年7月

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書籍等出版物

1

Urban Watershed Microbiology, Volume 2.

Kyohei Kuroda, Meri Nakajima. Rino Isshiki, Hisashi Satoh, Takashi Narihiro (担当:分担執筆, 範囲:Part VI Emerging Contaminants and Bioremediation Strategies, Chapter 37: Microbiology of Anaerobic Wastewater Treatment Processes Treating Purified Terephthalic Acid and Related Aromatic Compounds)

Springer Nature Switzerland 2025年10月査読有り

主要な講演・口頭発表等

39

Novel bacteria parasitizing archaea from wastewater treatment system

Meri Nakajima

VISTEC-AIST symposium 2026 2026年1月8日招待有り
培養とゲノム解析に基づき世界で初めて新種記載された極小寄生性細菌の生態と機能について

中島芽梨

水圏微生物ゲノムワークショップ 2025年12月16日招待有り
メタン生成アーキアに寄生するバクテリア Minisyncoccus archaeiphilus PMX.108T株の生態解明と新門Minisyncoccota（旧名：candidate phyla radiation; CPR）の提案

中島芽梨, 中井亮佑, 平片悠河, 久保田健吾, 佐藤久, Masaru. K. Nobu, 成廣隆, 黒田恭平

微生物生態学会第38回東京大会 2025年9月7日
環境サンプルを対象とした簡易で迅速な新規核酸分析法の開発

中島芽梨, 佐藤久

日本微生物生態学会第37回大会 2024年10月招待有り

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所属学協会

3

共同研究・競争的資金等の研究課題

4

アーキアに寄生する細菌Minisyncoccota門（旧名：candidate phyla radiation）の分離培養と生態解明

公益財団法人発酵研究所若手研究者助成 2026年4月 - 2028年3月

中島芽梨
嫌気性廃水処理システムの成否を左右する極小寄生微生物の全容解明と制御技術の創成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

黒田恭平, 成廣隆, 佐藤久, 久保田健吾, 山田真義, 野口太郎, 中島芽梨
高感度ハイスループット検出技術の開発を基盤とした廃水処理微生物ダークマターの制御

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2025年7月 - 2027年3月

中島芽梨
光導波路分光装置を用いた飲料水中の高感度病原微生物モニタリング法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2023年3月 - 2025年3月

中島芽梨

産業財産権

1

特許第7606183号(P7606183) 微生物の核酸検出方法、試薬組成物、試薬キット、測定システム、及びプログラム

佐藤久, 中屋佑紀, 中島芽梨, 半田久純, 佐成航太, 平野麗子, 土井和彦, 北條渉, 岩渕拓也, 酒井博則