
内藤 雄樹
ナイトウ ユウキ (Yuki Naito)
更新日: 02/20
基本情報
- 所属
- 東京科学大学 大学院医歯学総合研究科 特任准教授
- 学位
-
博士(理学)(東京大学)
- 研究者番号
- 60451829
- J-GLOBAL ID
- 201201071327312942
- researchmap会員ID
- B000222383
- 外部リンク
RNAiのメカニズムおよび応用技術に関する研究を、wetとdryの両方のアプローチから行ってきた。活性が高くオフターゲット作用(副作用)の少ないsiRNAの設計法を構築し、siRNA設計ウェブサーバ siDirect を公開。またこれを応用して、HIV-1のようなゲノム多様性の高いウィルスを標的とするRNAi法を構築した。2011年よりライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)に移り、おもに塩基配列データベースを対象とする大規模データの利用技術開発に取り組む。遺伝子をGoogleのように検索できる統合遺伝子検索エンジン GGRNA(ググルナ)、短い塩基配列を高速に検索する GGGenome(ゲゲゲノム)、ゲノム編集のためのガイドRNA設計ソフトウェア CRISPRdirect など、wetな現場で活用できるソフトウェアを開発。2023年より東京医科歯科大学 システム発生・再生医学分野に移り、これらのソフトウェアやデータベースの医療応用をめざしている。
経歴
5-
2024年10月 - 現在
-
2023年4月 - 現在
-
2023年4月 - 2024年9月
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2011年4月 - 2023年3月
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2007年4月 - 2011年3月
学歴
2-
2002年4月 - 2007年3月
-
1998年4月 - 2002年3月
委員歴
1-
2018年3月 - 現在
論文
37-
International Journal of Molecular Sciences 26(4) 1723-1723 2025年2月18日
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Bioinformatics 38(17) 4194-4199 2022年7月8日
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Nucleic Acids Research 50(13) 7224-7234 2022年7月8日
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Molecular ecology (30) 5923-5934 2021年8月25日 査読有り
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Authorea (preprint) 2021年1月
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Nature Communications 10(1) 5302 2019年12月 査読有り
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Genes to Cells 24(12) 827-835 2019年12月 査読有り
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Database 2019 bay132 2019年1月1日 査読有り
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Genes to Cells 23(6) 448-455 2018年6月 査読有り筆頭著者
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Bioinformatics 31(7) 1120-1123 2015年4月1日 査読有り筆頭著者責任著者
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Journal of Virology 88(17) 9864-9876 2014年9月1日 査読有り
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Methods in Molecular Biology 942 57-68 2012年10月 査読有り筆頭著者
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Nucleic Acids Research 40(Web Server Issue) W592-W596 2012年7月1日 査読有り筆頭著者
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Frontiers in Genetics 3 102 2012年6月 査読有り筆頭著者
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PLoS ONE 6(12) e28688-e28688 2011年12月21日 査読有り
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Gene Silencing: Theory, Techniques and Applications 287-319 2010年10月 査読有り
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BMC Bioinformatics 10(1) 392 2009年12月 査読有り筆頭著者責任著者
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Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009) 291-297 2009年11月 査読有り筆頭著者
-
Small Interfering RNA: New Research 185-194 2009年9月 査読有り筆頭著者
MISC
4-
実験医学 増刊「今日から使える!データベース・ウェブツール 達人になるための実践ガイド100」 32(20) 3275-3276 2014年12月 招待有り
-
ライフサイエンス 新着論文レビュー DBCLSからの成果発信 2012年5月
-
日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター 24 3-4 2012年3月
-
バイオテクノロジージャーナル 6(1) 23-28 2006年1月1日
書籍等出版物
13-
羊土社 2019年12月 (ISBN: 9784758122443)
-
羊土社 2019年1月 (ISBN: 9784758125154)
-
羊土社 2014年12月 (ISBN: 4758103437)
-
羊土社 2014年7月 (ISBN: 4758101299)
-
羊土社 2010年11月 (ISBN: 4758101779)
-
シーエムシー出版 2010年9月 (ISBN: 4781302661)
-
羊土社 2008年4月 (ISBN: 4758102902)
-
羊土社 2007年12月 (ISBN: 9784758101721)
-
シーエムシー出版 2006年1月 (ISBN: 488231519X)
-
エヌ・ティー・エス 2004年12月 (ISBN: 4860430670)
-
東京大学情報処理ナビゲーター編集委員会 2001年4月 (ISBN: 4925224034)
-
東京大学情報処理ナビゲーター編集委員会 2000年8月 (ISBN: 4925224026)
-
東京大学情報処理ナビゲーター編集委員会 1999年12月 (ISBN: 4925224018)
所属学協会
2Works(作品等)
9-
2020年3月 - 現在 Web Service
-
2014年1月 - 現在 Web Service
-
2013年9月 - 現在 Web Service
-
2012年7月 - 現在 Web Service
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2011年5月 - 現在 Web Service
-
2006年7月 - 現在 Web Service
-
2005年7月 - 現在 Web Service
-
2004年5月 - 現在 Web Service
-
2004年2月 - 現在 Web Service
共同研究・競争的資金等の研究課題
9-
AMED 医薬品等規制調和・評価研究事業 2019年 - 2022年
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AMED 医薬品等規制調和・評価研究事業 2016年 - 2019年
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文部科学省 科学研究費補助金 若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月
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大川情報通信基金 研究助成金 2014年 - 2015年
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日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2009年 - 2012年
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文部科学省 科学研究費補助金 若手研究(B) 若手研究(B) 2008年 - 2011年
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文部科学省 科学研究費補助金 特定領域研究 特定領域研究 2008年 - 2010年
-
持田記念医学薬学振興財団 研究助成金 2007年 - 2008年
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文部科学省 科学研究費補助金 特別研究員奨励費 2006年 - 2007年