荒木通啓 (Michihiro Araki) - マイポータル

基本情報

所属: 立命館大学薬学部教授

学位: 修士（薬学）(京都大学)
博士（薬学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201301073435598003
researchmap会員ID: 7000005691

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

立命館大学, 薬学部, 教授
- 2025年3月

国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 統括研究員
- 2020年3月

京都大学大学院, 医学研究科, 特定教授
- 2017年3月

神戸大学大学院, 大学院科学技術イノベーション研究科, 特命准教授
- 2013年2月

京都大学大学院, 薬学研究科, 特定准教授
- 2008年8月

東京大学, 医科学研究所, 助教
- 2003年10月

ボストン大学, 生物医工学部, Research Associate

学歴

論文

Effect of short-term dietary intervention on fecal serotonin, gut microbiome-derived tryptophanase, and energy absorption in a randomized crossover trial: an exploratory analysis.

Eiichi Yoshimura, Yuka Hamada, Yoichi Hatamoto, Takashi Nakagata, Hinako Nanri, Yui Nakayama, Chiharu Iwasaka, Takanori Hayashi, Ippei Suzuki, Takafumi Ando …

Gut microbes 17(1) 2514137-2514137 2025年12月
Thirty-Year Trends in the Prevalence and Severity of Diabetic Retinopathy at the First Visit in Patients with Untreated Type 2 Diabetes Mellitus.

Tetsuya Kubota, Kikue Todoroki-Mori, Masahiko Iwamoto, Toshiko Kobori, Takako Kikuchi, Tazu Tahara, Yukiko Onishi, Michihiro Araki, Masato Kasuga, Yoko Yoshida

Ophthalmic epidemiology 32(3) 301-308 2025年6月
Machine Learning Model for Predicting Coronary Heart Disease Risk: Development and Validation Using Insights From a Japanese Population-Based Study.

Thien Vu, Yoshihiro Kokubo, Mai Inoue, Masaki Yamamoto, Attayeb Mohsen, Agustin Martin-Morales, Research Dawadi, Takao Inoue, Jie Ting Tay, Mari Yoshizaki …

JMIR cardio 9 e68066 2025年5月12日
Disease Prediction Using Machine Learning on Smartphone-Based Eye, Skin, and Voice Data: Scoping Review

Research Dawadi, Mai Inoue, Jie Ting Tay, Agustin Martin-Morales, Thien Vu, Michihiro Araki

JMIR AI 4 e59094 2025年3月25日
Prediction of depressive disorder using machine learning approaches: findings from the NHANES.

Thien Vu, Research Dawadi, Masaki Yamamoto, Jie Ting Tay, Naoki Watanabe, Yuki Kuriya, Ai Oya, Phap Ngoc Hoang Tran, Michihiro Araki

BMC medical informatics and decision making 25(1) 83-83 2025年2月17日
Feature extraction contributing to risk-acceptance prediction by machine learning models in food benefit-risk communication in Japan

Nanae Tanemura, Yusuke Machii, Masako Kakizaki, Takashi Kusumi, Rie Onodera, Yoshiko Tominaga, Michihiro Araki

Food and Humanity 3 100427-100427 2024年12月
Machine Learning Approaches for Stroke Risk Prediction: Findings from the Suita Study

Thien Vu, Yoshihiro Kokubo, Mai Inoue, Masaki Yamamoto, Attayeb Mohsen, Agustin Martin-Morales, Takao Inoué, Research Dawadi, Michihiro Araki

Journal of Cardiovascular Development and Disease 11(7) 207 2024年7月1日
Integrated pathway mining and selection of an artificial CYP79-mediated bypass to improve benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis.

Musashi Takenaka, Kouhei Kamasaka, Kim Daryong, Keiko Tsuchikane, Seiha Miyazawa, Saeko Fujihana, Yoshimi Hori, Christopher J Vavricka, Akira Hosoyama, Hiroko Kawasaki …

Microbial cell factories 23(1) 178-178 2024年6月15日
A first survey of the public’s colour preferences for four processed foods as major sources of salt intake in Japan

Nanae Tanemura, Ikuko Kashino, Michihiro Araki

Food and Humanity 100330-100330 2024年6月
Disease Prediction Using Machine Learning on Smartphone-Based Eye, Skin, and Voice Data: Scoping Review (Preprint)

Research Dawadi, Mai Inoue, Jie Ting Tay, Agustin Martin-Morales, Thien Vu, Michihiro Araki

2024年4月7日
Unveiling Coronary Heart Disease Prediction through Machine Learning Techniques: Insights from the Suita Population-Based Cohort Study

Thien Vu, Yoshihiro Kokubo, Mai Inoue, Masaki Yamamoto, Attayeb Mohsen, Agustin Martin-Morales, Research Dawadi, Takao Inoue, Tay Jie Ting, Mari Yoshizaki …

2024年4月2日
Development of method using language processing techniques for extracting information on drug–health food product interactions

Mari Yoshizaki, Yuki Kuriya, Masaki Yamamoto, Naoki Watanabe, Michihiro Araki

British Journal of Clinical Pharmacology 90(6) 1514-1524 2024年3月20日
Development of a Machine Learning Model for Classifying Cooking Recipes According to Dietary Styles

Miwa Yamaguchi, Michihiro Araki, Kazuki Hamada, Tetsuya Nojiri, Nobuo Nishi

Foods 13(5) 2024年2月22日
Correction: Mangrove crab intestine and habitat sediment microbiomes cooperatively work on carbon and nitrogen cycling.

Prasert Tongnunui, Yuki Kuriya, Masahiro Murata, Hideki Sawada, Michihiro Araki, Mika Nomura, Katsuji Morioka, Tomoaki Ichie, Kou Ikejima, Kohsuke Adachi

PloS one 19(12) e0315952 2024年
EnzymeNet: Residual Neural Networks model for Enzyme Commission number prediction

Naoki Watanabe, Masaki Yamamoto, Masahiro Murata, Yuki Kuriya, Michihiro Araki

Bioinformatics Advances 3(1) vbad173 2023年11月24日
口語テキストに基づく認知症患者や介護者の潜在ニーズ自動抽出の検討-Zスコアを用いた特徴量選択によるモデル精度向上に向けた有用性評価-

種村菜奈枝, 佐々木剛, 宮本遼太郎, 渡辺仁, 佐藤淳子, 荒木通啓, 千葉剛

日本臨床精神神経薬理学会プログラム・抄録集 23(1) 203-203 2023年10月5日
Predicting Cardiovascular Disease Mortality: Leveraging Machine Learning for Comprehensive Assessment of Health and Nutrition Variables

Agustin Martin-Morales, Masaki Yamamoto, Mai Inoue, Thien Vu, Research Dawadi, Michihiro Araki

Nutrients 15(18) 2023年9月11日
Ramen Consumption and Gut Microbiota Diversity in Japanese Women: Cross-Sectional Data from the NEXIS Cohort Study

Jonguk Park, Hiroto Bushita, Ayatake Nakano, Ai Hara, Hiroshi M. Ueno, NAOKI OZATO, Koji Hosomi, Hitoshi Kawashima, Yi-An Chen, Attayeb Mohsen …

Microorganisms 11(8) 1892-1892 2023年7月
Using Explainable AI to understand frailty indicators

Attayeb Mohsen, Masaki Yamamoto, Agustin Martin-Morales, Daiki Watanabe, Nobuo Nishi, Takashi Nakagata, Tsukasa Yoshida, Motohiko Miyachi, Kenji Mizuguchi, Michihiro Araki

2023年6月5日
Information integration through benefit-risk messages on food with quality-adjusted life years from the public agency in Japan: a randomized control study

Nanae Tanemura, Masako Kakizaki, Takashi Kusumi, Rie Onodera, Yoshiko Tominaga, Michihiro Araki, Tsuyoshi Chiba

Nutrire 48(1) 2023年6月

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MISC

健康分野におけるAI活用の可能性

荒木通啓

日本老年医学会雑誌(Web) 61 2024年
精密栄養学を支える基盤技術 7.食・栄養の理解に向けた代謝インフォマティクス

荒木通啓

実験医学 41(10) 2023年
発話者の潜在ニーズ予測とその可視化Word2Vecモデルを用いた機械学習モデルの精度改善に関する検討

種村菜奈枝, 町井湧介, 佐々木剛, 荒木通啓, 佐藤淳子, 千葉剛

情報処理学会論文誌トランザクションデジタルプラクティス(Web) 4(3) 2023年
疾病リスク予測ツールの到達点と将来性 AI解析による未病の対策がもたらすもの疾患予測モデル開発に向けたデジタルヘルス推進の意義と期待される効果

荒木通啓, 伊藤眞里

月刊新医療 50(10) 83-87 2023年
「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究研究3)医薬品との相互作用検索システムの構築-HFNetにおける医薬品と健康食品との相互作用情報の充実-

千葉剛, 荒木通啓, 種村菜奈枝

「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究令和4年度総括・分担研究報告書(Web) 2023年
「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究研究3)医薬品との相互作用検索システムの構築

荒木通啓

「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究令和4年度総括・分担研究報告書(Web) 2023年
専門家と非専門家(消費者)のリスク認知の差に配慮した消費者の行動変容を促す効果的なベネフィットリスクコミュニケーション推進確保に関する研究消費者のリスク受容度の指標化の検討

種村菜奈枝, 楠見孝, 富永佳子, 荒木通啓, 小野寺理恵, 柿崎真沙子, 矢澤一良, 森田満樹, 在間稔充

専門家と非専門家(消費者)のリスク認知の差に配慮した消費者の行動変容を促す効果的なベネフィットリスクコミュニケーション推進確保に関する研究令和4年度総括研究報告書(Web) 2023年
食品オントロジーの構築

樋口千洋, 櫛田達矢, 畠中秀樹, 長尾知生子, 荒木通啓, 水口賢司

トーゴーの日2022 2022(SWO-058) 1 2022年10月5日
口語テキストでの発話者の潜在ニーズ予測とその可視化 Word2Vecモデルを用いた機械学習モデルの精度改善に関する検討

種村菜奈枝, 町井湧介, 佐々木剛, 荒木通啓, 佐藤淳子, 千葉剛

ヘルスコミュニケーションウィークプログラム・抄録集 2022 156-156 2022年9月
大腸菌によるルテイン高生産システムの開発

竹村美保, 久保亜希子, 渡邉あすか, 作野華誉, 美濃部侑香, 佐原健彦, 村田昌浩, 荒木通啓, 原田尚志, 寺田喜信 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022 2022年
代謝知識のデジタル化技術の進展

荒木通啓, 荒木通啓, 荒木通啓, 荒木通啓

日本生物工学会大会講演要旨集 74th 2022年
広範な酵素反応予測のための機械学習モデルの開発

渡邉直暉, 山本昌輝, 山本昌輝, 村田昌浩, 村田昌浩, VAVRICKA Christopher J., 荻野千秋, 近藤昭彦, 荒木通啓, 荒木通啓 …

日本生物工学会大会講演要旨集 74th 2022年
「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究研究3)医薬品との相互作用検索システムの構築

荒木通啓

「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究令和3年度総括・分担研究報告書(Web) 2022年
「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究研究3)医薬品との相互作用検索システムの構築-HFNetにおける医薬品と健康食品との相互作用情報の充実-

千葉剛, 荒木通啓, 種村菜奈枝, 西島千陽

「健康食品」の安全性・有効性情報データベースを活用した健康食品の安全性確保に関する研究令和3年度総括・分担研究報告書(Web) 2022年
専門家と非専門家(消費者)のリスク認知の差に配慮した消費者の行動変容を促す効果的なベネフィットリスクコミュニケーション推進確保に関する研究消費者のリスク受容度の指標化の検討

種村菜奈枝, 楠見孝, 富永佳子, 荒木通啓, 小野寺理恵, 柿崎真沙子, 矢澤一良, 森田満樹, 在間稔充

専門家と非専門家(消費者)のリスク認知の差に配慮した消費者の行動変容を促す効果的なベネフィットリスクコミュニケーション推進確保に関する研究令和3年度総括研究報告書(Web) 2022年
国民健康・栄養調査食品群のオントロジー構築

樋口千洋, 櫛田達矢, 八塚茂, 畠中秀樹, 長尾知生子, 荒木通啓, 水口賢司

トーゴーの日2021 1 2021年10月5日
食品オントロジーの製作

樋口千洋, 櫛田達矢, 八塚茂, 畠中秀樹, 長尾知生子, 荒木通啓, 水口賢司

人工知能学会第二種研究会資料 2021(SWO-054) 02 2021年8月4日
文献・公開データからの知識抽出によるスマートセル設計支援技術

伊藤潔人, 荒木通啓, 荒木通啓

日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 101st 2021年
料理レシピデータにおける人工知能(AI)・機械学習技術を用いた和食,中華,洋食の特徴解析

山口美輪, 荒木通啓, 野尻哲也, 花井章剛, 成澤翔大, 内山美弥, 各務恵理菜, 西信雄

栄養学雑誌 79(5 Supplement) 2021年
DBTLサイクル加速に向けた,設計履歴・文献情報による「次の一手」の遺伝子改変提案技術

中澤志織, 今一修, 小暮高久, 久保田健, 須田雅子, 豊田晃一, 乾将行, 伊藤潔人, 白井智量, 荒木通啓 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年

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講演・口頭発表等

大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路構築

江口晃一, 工藤基徳, 荒木通啓, 石井純, 山本浩明, 近藤昭彦

日本農芸化学会2016年度大会 2016年3月
代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定

荒木通啓, 牧口大旭, 小川哲平, 近藤昭彦

日本薬学会第135年会 2015年3月日本薬学会
M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築

牧口大旭, 小川哲平, 中津井雅彦, COX SIDNEY ROBERT, 近藤昭彦, 谷口岳志, 宮奥康平, 荒木通啓

第37回日本分子生物学会年会 2014年11月日本分子生物学会
時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発

NAKATSUI Masahiko, KONDO Akihiko, ARAKI Michihiro

第３回生命医薬情報学連合大会 2014年10月日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi)
バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築

小川哲平, 牧口大旭, 中津井雅彦, COX SIDNEY ROBERT, 近藤昭彦, 谷口岳志, 宮奥康平, 荒木通啓

第３回生命医薬情報学連合大会 2014年10月日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi)
バイオ医薬開発に有用なCHO 細胞の改良、培養状態解明につながるデータの構築

伊賀朋世, 蓮沼誠久, 荒木通啓, 近藤昭彦

第66回日本生物工学会大会 2014年9月日本生物工学会
Size Dependent Regulation of Apoptosis with a Series of Equilateral-Triangular Shaped RNA-protein Complexes

COX SIDNEY ROBERT, NAKATSUI Masahiko, MAKIGUCHI Hiroki, OGAWA Teppei, KONDO Akihiko, ARAKI Michihiro

The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming 2014年9月 DNA Computing and Molecular Programming 招待有り
Mpath: Computationally-aided design of synthetic metabolic pathways

COX SIDNEY ROBERT, NAKATSUI Masahiko, MAKIGUCHI Hiroki, OGAWA Teppei, KONDO Akihiko, ARAKI Michihiro

The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming 2014年9月 DNA Computing and Molecular Programming 招待有り
遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価

中津井雅彦, 近藤昭彦, 荒木通啓

生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー2014 2014年7月
Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways

COX SIDNEY ROBERT, NAKATSUI Masahiko, MAKIGUCHI Hiroki, OGAWA Teppei, KONDO Akihiko, ARAKI Michihiro

The Synthetic Biology: Engineering, Evolution & Design 2014 2014年7月 2014 American Institute of Chemical Engineers 招待有り
モデルベース機械学習による配合注射薬外観変化予測アルゴリズムの開発

中津井雅彦, 角山香織, 権丈紀子, 荒木通啓, 栄田敏之, 近藤昭彦, 奥野恭史

日本薬学会第134年会 2014年3月日本薬学会
バイオプロセスデザインプラットフォームを用いたアミノ酸のバイオプロセスデータベースの開発

牧口大旭, 小川哲平, 中津井雅彦, COX III Robert Sydney, 近藤昭彦, 荒木通啓

第36回日本分子生物学会年会 2013年12月日本分子生物学会
An approach for dynamical network reconstruction of simple network motifs

NAKATSUI Masahiko, ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko

The 24th International Conference on Genome Informatics 2013年12月招待有り
細胞内ダイナミクス解析ツールの設計・開発

中津井雅彦, 牧口大旭, 荒木通啓, 近藤昭彦

「細胞を創る」研究会6.0 2013年11月招待有り

共同研究・競争的資金等の研究課題

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

野田修平, 白井智量, 荒木通啓
代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

野田修平, 白井智量, 荒木通啓
酵素反応の選択性と多様性の情報解析

学術研究助成基金助成金／基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

荒木通啓
バイオ合成パスウェイデータベース

研究成果公開促進費／データベース 2015年4月 - 2016年3月

荒木通啓
人工代謝経路のスコープの拡張

科学研究費補助金／新学術領域研究 2014年4月 - 2016年3月

荒木通啓
人工代謝経路の設計基盤の構築

科学研究費補助金／新学術領域研究 2012年4月 - 2014年3月

荒木通啓
代謝ネットワークの再構築による天然化合物の設計原理の抽出

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2008年 - 2010年

荒木通啓

産業財産権

特許第7657588号計算機システム、及び、その方法

伊藤潔人, 中澤志織, 今一修, 荒木通啓
特許第7560827号 Δ15脂肪酸デサチュラーゼ発現カセットを含む酵母

矢追克郎, 荒木秀雄, 松沢智彦, 小笠原渉, 志田洋介, 荒木通啓, 高久洋暁
特許第7497047号ベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)産生用の組換え宿主細胞及びベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)の新規製造方法

ヴァヴリッカ・ジュニア,クリストファー・ジョン, 蓮沼誠久, 荒木通啓, 近藤昭彦
特許第7357336号情報解析システム、方法、およびプログラム

油谷幸代, 亀田倫史, 矢追克郎, 荒木通啓, 白井智量
特開2023-064384 Δ6デサチュラーゼ活性を有する脂肪酸不飽和化酵素

松沢智彦, 矢追克郎, 高久洋暁, 荒木通啓, 荒木秀雄, 荒学志
特許第7269582号機能性配列選択方法及び機能性配列選択システム

田邉麻衣子, 武田志津, 伊藤潔人, 今一修, 柘植謙爾, 荒木通啓
特開2022-103706 計算機システム、及び、その方法

伊藤潔人, 中澤志織, 今一修, 荒木通啓
特開2022-047741 Δ15脂肪酸デサチュラーゼ発現カセットを含む酵母

矢追克郎, 荒木秀雄, 松沢智彦, 小笠原渉, 志田洋介, 荒木通啓, 高久洋暁
特開2021-016325 情報解析システム、方法、およびプログラム

油谷幸代, 亀田倫史, 矢追克郎, 荒木通啓, 白井智量
特開2020-150919 機能性配列選択方法及び機能性配列選択システム

田邉麻衣子, 武田志津, 伊藤潔人, 今一修, 柘植謙爾, 荒木通啓
WO2020-090940 ベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)産生用の組換え宿主細胞及びベンジルイソキノリンアルカロイド(BIA)の新規製造方法

ヴァヴリッカ・ジュニア,クリストファー・ジョン, 蓮沼誠久, 荒木通啓, 近藤昭彦
特許第5907072号合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラム

荒木通啓, 宮奥康平, 谷口岳志
特開2013-128460 テレフタル酸の製造方法

荒木通啓, 宮奥康平, 谷口岳志, 依田尚文, 湯村秀一
WO2012-081723 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3-ヒドロキシプロピオン酸、クロトニルアルコールおよびブタジエンの製造方法

荒木通啓, 宮奥康平, 谷口岳志
WO2012-081723 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3−ヒドロキシプロピオン酸、クロトニルアルコールおよびブタジエンの製造方法

荒木通啓, 宮奥康平, 谷口岳志