共同研究・競争的資金等の研究課題

2011年 - 2012年

次世代シーケンサーを用いたパーキンソン病の遺伝因子に関する研究

日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

課題番号
23790384
体系的課題番号
JP23790384
担当区分
研究代表者
配分額
(総額)
3,770,000円
(直接経費)
2,900,000円
(間接経費)
870,000円
資金種別
競争的資金

疾患と関連する稀な変異を効率よく検出するため,DNAサンプルをプーリングしたうえで,次世代シーケンサーを用いて解析を行った.パーキンソン病患者のDNA64サンプルを8行8列のマトリックスに配置し,各行各列で8サンプルのプーリングを行い,計16セットのプーリングDNAを作成した.各セットについて候補遺伝子領域をPCRで増幅し,GAIIxを用いてシーケンスした.整数計画法を用いて各行各列で変異のアレル数の推定値を求めることで,候補となる新規変異を同定した.

リンク情報
URL
https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-23790384/23790384seika.pdf
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23790384
ID情報
  • 課題番号 : 23790384
  • 体系的課題番号 : JP23790384