中木戸誠 (Makoto Nakakido) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学工学系研究科バイオエンジニアリング専攻講師

学位: 博士（生命科学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201801010549650272
researchmap会員ID: B000304735

外部リンク: https://webpark1550.sakura.ne.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年11月 - 現在

東京大学工学系研究科バイオエンジニアリング専攻講師
2017年8月 - 2020年10月

東京大学, 工学系研究科バイオエンジニアリング専攻, 助教
2017年1月 - 2017年7月

東京大学, 工学系研究科バイオエンジニアリング専攻, 特任助教
2016年4月 - 2016年12月

東京大学, 工学系研究科バイオエンジニアリング専攻, 特任研究員
2013年1月 - 2015年12月

シカゴ大学, 医学部, Postdoctoral scholar
2011年4月 - 2012年12月

東京大学, 医科学研究所, 特任研究員

学歴

2006年4月 - 2011年3月

東京大学, 新領域創成科学研究科, メディカルゲノム専攻
2002年4月 - 2006年3月

東京大学, 工学部, 化学生命工学科

受賞

2019年10月

JB論文賞日本生化学会
2015年7月

JB論文賞, 日本生化学会
2011年3月

Excellent Research Award（博士）, 東京大学新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻
2009年3月

Excellent Research Award（修士）, 東京大学新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻

論文

Development of an inhibitory monoclonal nanobody targeting Streptococcus pyogenes siderophore binding protein FtsB

Jorge Fernandez-Perez, Susana de Vega, Jose M.M. Caaveiro, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Akinobu Senoo, Keitaro Tanoi, Takashi Nozawa, Ichiro Nakagawa, Kouhei Tsumoto

Journal of Biological Chemistry 111224-111224 2026年2月
myCRP, Cysteine-Rich Protein in the Yesso Scallop Mizuhopecten yessoensis, Is a Novel High-Molecular Weight Cd-Binding Protein

Zehua Zheng, Yuto Namikawa, Masahiko Awaji, Yugo Kato, Kurin Iimura, Makoto Nakakido, Kouhei Tsumoto, Lumi Negishi, Hitoshi Kurumizaka, Shino Homma-Takeda …

Marine Biotechnology 28(1) 2025年12月26日
Structural basis for heme binding by the Shr protein from Streptococcus pyogenes.

Kanta Seki, Akinobu Senoo, Satoru Nagatoishi, Saeko Yanaka, Makoto Nakakido, Kouhei Tsumoto, Jose M.M. Caaveiro

Journal of Biological Chemistry 111012-111012 2025年12月
PRELP functions via multiple interactions with intrinsically weak affinity relying on ECM anchoring and remodeling.

Hirofumi Kosuge, Makoto Nakakido, Susana de Vega, Shin-Ichi Ohnuma, Kouhei Tsumoto

Scientific reports 15(1) 24634-24634 2025年7月9日
Improving the solubility of single domain antibodies using VH-like hallmark residues.

Yuta Uto, Makoto Nakakido, Takanori Yokoo, Jorge Fernandez-Perez, Kevin Entzminger, Toshiaki Maruyama, C J Okumura, Daisuke Kuroda, Jose M M Caaveiro, Kouhei Tsumoto

Protein science : a publication of the Protein Society 34(7) e70189 2025年7月
Development of a small compound that regulates the function of a maltodextrin-binding protein of Streptococcus pyogenes by multifaceted screenings.

Tsukushi Yamawaki, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Jose M M Caaveiro, Daisuke Kuroda, Chihiro Aikawa, Ichiro Nakagawa, Kouhei Tsumoto

Scientific reports 15(1) 19341-19341 2025年6月2日
Supercharging design of an anti-lysozyme Fab antibody to regulate ligand-dependent reversible aggregation

Keisuke Kasahara, Makoto Nakakido, Daisuke Kuroda, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto

Polymer Journal 57(8) 923-930 2025年4月25日
Mitochondrial complexity is regulated at ER-mitochondria contact sites via PDZD8-FKBP8 tethering.

Koki Nakamura, Saeko Aoyama-Ishiwatari, Takahiro Nagao, Mohammadreza Paaran, Christopher J Obara, Yui Sakurai-Saito, Jake Johnston, Yudan Du, Shogo Suga, Masafumi Tsuboi …

Nature communications 16(1) 3401-3401 2025年4月17日
Affinity-stability trade-off mechanism of residue 35 in framework region 2 of VHH antibodies with β-hairpin CDR3.

Koichi Yamamoto, Satoru Nagatoishi, Ryo Matsunaga, Makoto Nakakido, Daisuke Kuroda, Kouhei Tsumoto

Protein science : a publication of the Protein Society 34(4) e70095 2025年4月
Specific recognition mechanism of an antibody to sulfated tyrosine and its potential use in biological research.

Kan Ujiie, Makoto Nakakido, Seisho Kinoshita, Jose M M Caaveiro, C Kevin Entzminger, Shigeru C J Okumura, Toshiaki Maruyama, Kosuke Miyauchi, Tetsuro Matano, Kouhei Tsumoto

The Journal of biological chemistry 301(2) 108176-108176 2025年1月10日
Antiviral potential of proton-type zeolite.

Yuka Kimura, Masanori Takemoto, Noriko Nakamura, Takeshi Ichinohe, Makoto Nakakido, Kenta Iyoki, Seiichi Ohta, Nobuhiro Miyamae, Yuki Egami, Koichi Sato …

PloS one 20(5) e0324484 2025年
Unveiling the structural mechanisms behind high affinity and selectivity in phosphorylated epitope-specific rabbit antibodies

Keisuke Kasahara, Raiji Kawade, Makoto Nakakido, Ryo Matsunaga, Hiroki Akiba, Kevin C. Entzminger, Toshiaki Maruyama, Shigeru C.J. Okumura, Jose M.M. Caaveiro, Daisuke Kuroda …

Journal of Biological Chemistry 300(12) 107989-107989 2024年11月
Structural basis for the ligand promiscuity of the hydroxamate siderophore binding protein FtsB from Streptococcus pyogenes

Jorge Fernandez-Perez, Akinobu Senoo, Jose M.M. Caaveiro, Makoto Nakakido, Susana de Vega, Ichiro Nakagawa, Kouhei Tsumoto

Structure 32(12) 2410-2421 2024年10月
Development of novel humanized VHH synthetic libraries based on physicochemical analyses

Makoto Nakakido, Seisho Kinoshita, Kouhei Tsumoto

Scientific Reports 14(1) 19533-19533 2024年8月22日
Triphenylphosphonium-modified catiomers enhance in vivo mRNA delivery through stabilized polyion complexation.

Jumpei Norimatsu, Hayato L Mizuno, Takayoshi Watanabe, Takumi Obara, Makoto Nakakido, Kouhei Tsumoto, Horacio Cabral, Daisuke Kuroda, Yasutaka Anraku

Materials horizons 11(19) 4711-4721 2024年7月11日
High-throughput system for the thermostability analysis of proteins.

Sae Ito, Ryo Matsunaga, Makoto Nakakido, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Shumpei Ishikawa, Kouhei Tsumoto

Protein science : a publication of the Protein Society 33(6) e5029 2024年6月
Characterization of a novel format scFv×VHH single-chain biparatopic antibody against metal binding protein MtsA.

Risa Asano, Miyu Takeuchi, Makoto Nakakido, Sho Ito, Chihiro Aikawa, Takeshi Yokoyama, Akinobu Senoo, Go Ueno, Satoru Nagatoishi, Yoshikazu Tanaka …

Protein science : a publication of the Protein Society 33(6) e5017 2024年6月
Crystal structures of human CD40 in complex with monoclonal antibodies dacetuzumab and bleselumab

Risa Asano, Makoto Nakakido, Jorge Fernández Pérez, Tomoko Ise, Jose M.M. Caaveiro, Satoshi Nagata, Kouhei Tsumoto

Biochemical and Biophysical Research Communications 714 149969-149969 2024年6月
Functional insights of Tyr37 in framework region 2 directly contributing to the binding affinities and dissociation kinetics in single-domain VHH antibodies

Koichi Yamamoto, Satoru Nagatoishi, Makoto Nakakido, Daisuke Kuroda, Kouhei Tsumoto

Biochemical and Biophysical Research Communications 709 149839-149839 2024年5月査読有り
Structural basis for the recognition of human hemoglobin by the heme-acquisition protein Shr from Streptococcus pyogenes.

Akinobu Senoo, Masato Hoshino, Toshiki Shiomi, Makoto Nakakido, Satoru Nagatoishi, Daisuke Kuroda, Ichiro Nakagawa, Jeremy R H Tame, Jose M M Caaveiro, Kouhei Tsumoto

Scientific reports 14(1) 5374-5374 2024年3月5日

もっとみる

MISC

炎症性腸疾患に関わるカドヘリン関連タンパク質の構造と機能に関する解析

藤島果琳, 妹尾暁暢, 谷中冴子, 長門石曉, 長門石曉, 中木戸誠, 中木戸誠, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平 …

日本蛋白質科学会年会(Web) 25th 2025年
Class I SLRPsファミリー蛋白質による多重特異的な標的分子認識機構の物理化学的解析

岡部航太, 小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平

日本蛋白質科学会年会(Web) 25th 2025年
コンフォメーション特異的抗体で明らかにする神経変性疾患関連タンパク質の異常構造

篠宥毅, 村木則文, 小畠結, 神志那弘明, 小菅啓史, 中木戸誠, 津本浩平, 古川良明

日本蛋白質科学会年会(Web) 25th 2025年
Development of an Antibody-Drug Conjugate Targeting CADM1 in Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma

Aki Tanabe, Yoshiaki Takahashi, Anna Yui, Makoto Nakakido, Tomohiro Nasu, Mami Uemura, Kenta Tezuka, Kaoru Uchimaru, Atae Utsunomiya, Tetsuro Matano …

BLOOD 144 1405-1406 2024年11月5日
Aβ oligomer特異的フラグメント抗体の投与による認知機能及び病態改善効果の検討

天野晶子, 三條伸夫, 荒木亘, 永田哲也, 永田哲也, 中木戸誠, 中木戸誠, 松原悦朗, 松原悦朗, 安楽泰孝 …

Dementia Japan 38(4) 2024年
腫瘍抑制蛋白質PRELPの疎水性駆動によるダイマー形成の機能的意義とその制御を指向した分子デザイン

小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平

日本蛋白質科学会年会(Web) 24th 2024年
がん抑制蛋白質PRELPの二量体形成の分子機構とその機能的意義の解明

小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平

日本生化学会大会(Web) 97th 2024年
遺伝子改変リンクモジュールのエンドトキシン除去法および抗炎症効果の検討

大川将志, 菅谷穂乃香, 稲垣奈都子, 中木戸誠, 長門石曉, 津本浩平, 伊藤大知

化学工学会年会研究発表講演要旨集(CD-ROM) 89th 2024年
微生物由来トランスグルタミナーゼ反応性リンクモジュールの抗炎症効果の検討

菅谷穂乃香, 大川将志, 稲垣奈都子, 中木戸誠, 長門石曉, 長門石曉, 津本浩平, 津本浩平, 伊藤大知, 伊藤大知

日本膜学会年会講演要旨集(CD-ROM) 46th 2024年
微生物由来トランスグルタミナーゼ反応性リンクモジュールの抗炎症効果の検討

菅谷穂乃香, 大川将志, 稲垣奈都子, 中木戸誠, 長門石曉, 長門石曉, 津本浩平, 津本浩平, 伊藤大知, 伊藤大知

日本生物工学会大会講演要旨集 76th 2024年
腫瘍抑制蛋白質PRELPのマルチバレント相互作用を介した機能制御

中木戸誠, 小菅啓史, 長門石曉, 福田哲也, 板東泰彦, VEGA Susana, 大沼信一, 津本浩平, 津本浩平

日本生化学会大会(Web) 96th 2023年
細胞外マトリクスへの局在を介した多重特異性蛋白質PRELPの低親和性相互作用の制御機構の解析

小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, DE VEGA Susana, 長門石曉, 福田哲也, 板東泰彦, 大沼信一, 津本浩平, 津本浩平 …

日本生化学会大会(Web) 96th 2023年
ECM局在化による固有の弱親和性を持つPRELPの多重特異的相互作用の調節系の特性化

KOSUGE Hirofumi, NAKAKIDO Makoto, DE VEGA Susana, NAGATOISHI Satoru, FUKUDA Tetsuya, BANDO Yasuhiko, OHNUMA Shin-ichi, TSUMOTO Kouhei, TSUMOTO Kouhei

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 23rd (CD-ROM) 2023年
癌抑制タンパク質PRELPの多重特異的相互作用の同定と検証

KOSUGE Hirofumi, KOSUGE Hirofumi, NAKAKIDO Makoto, NAKAKIDO Makoto, NAGATOISHI Satoru, FUKUDA Tetsuya, BANDO Yasuhiko, OHNUMA Shin-ichi, TSUMOTO Kouhei, TSUMOTO Kouhei

Program & Abstracts. International Symposium on Tumor Biology in Kanazawa 2022 (Web) 2022年
ナノミセル内包型抗Aβオリゴマー抗体によるアルツハイマー病態改善効果

天野晶子, 三條伸夫, 安楽泰孝, 中木戸誠, 松原悦朗, 永田哲也, 西田陽一郎, 荒木亘, 津本浩平, 片岡一則 …

Dementia Japan 35(4) 660-660 2021年10月
腫瘍抑制因子PRELPと成長因子受容体IGFI-Rおよびp75NTRの新規な相互作用のプロテオミクスによる同定と検証

KOSUGE Hirofumi, NAKAKIDO Makoto, NAGATOISHI Satoru, FUKUDA Tetsuya, BANDO Yasuhiko, OHNUMA Shin-ichi, TSUMOTO Kouhei

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 21st 2021年
プロテオーム解析に基づく腫瘍抑制蛋白質PRELPと膜蛋白質の新規相互作用探索と機能解析

小菅啓史, 中木戸誠, 中木戸誠, 長門石曉, 福田哲也, 板東泰彦, 大沼信一, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平

日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
新規腫瘍抑制因子PRELPと膜タンパク質との新たな相互作用のプロテオミクス同定と検証

KOSUGE Hirofumi, NAKAKIDO Makoto, NAGATOISHI Satoru, FUKUDA Tetsuya, BANDO Yasuhiko, OHNUMA Shin-ichi, TSUMOTO Kouhei

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 20th (Web) 2020年
化膿連鎖球菌の金属獲得蛋白質MtsAに対する機能阻害剤の探索

竹内美結, 中木戸誠, 長門石曉, 河出来時, 相川知宏, 中川一路, 津本浩平, 津本浩平, 津本浩平

日本生化学会大会(Web) 93rd 2020年
物理化学的アプローチによる低分子阻害剤の探索および抗体阻害剤の開発

中木戸誠, 相川知宏, 長門石曉, 妹尾暁暢, 竹内美結, 星野将人, 下村拓矢, CAAVEIRO Jose M. M., 中川一路, 津本浩平 …

日本細菌学雑誌(Web) 75(1) 2020年

もっとみる

書籍等出版物

AI・ナノ・量子による超高感度・迅速バイオセンシング

馬場嘉信, 柳田剛, 加地範匡 (担当:分担執筆, 範囲:第１編第１章バイオテクノロジーが実現する超高感度・迅速バイオセンシング・デバイス)

2021年8月
生命金属ダイナミクス : 生体内における金属の挙動と制御

古川, 良明, 神戸, 大朋, 城, 宜嗣, 津本, 浩平 (担当:分担執筆, 範囲:第8章第１節金属導体をターゲットにした抗菌薬)

エヌ・ティー・エス 2021年1月 (ISBN: 9784860437060)
機器分析ハンドブック

床波, 志保, 前田, 耕治, 安川, 智之 (担当:分担執筆, 範囲:９章表面プラズモン共鳴)

化学同人 2020年10月 (ISBN: 9784759820225)
細胞表層工学の進展 = Development of cell surface engineering

植田, 充美 (担当:分担執筆, 範囲:第２章８ファージディスプレイ法による抗体改変)

シーエムシー出版 2020年4月 (ISBN: 9784781314969)
神経難病と抗体医薬による分子標的治療

中木戸誠, 津本浩平

医薬ジャーナル Vol.54, No.7 2018年7月
バイオ医薬品の分析のコツ品質評価のための基礎と応用（第７回）タンパク質の分子間相互作用

津本浩平, 長門石曉, 中木戸誠, 黒田大祐

PHARM TECH JAPAN 34(2) 2018年2月
バイオ医薬品の分析のコツ品質評価のための基礎と応用（第２回）タンパク質科学の基礎と取扱い

津本浩平, 長門石曉, 中木戸誠

PHARM TECH JAPAN 33(11) 2017年9月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

A群レンサ球菌の金属輸送系を標的とした治療薬剤としての人工抗体の取得

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

相川知宏, 野澤孝志, 中木戸誠
脳分子を回収して帰還する「はやぶさ型ナノマシン」の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2021年8月 - 2024年3月

安楽泰孝, 中木戸誠
革新的ナノテクノロジーによる脳分子探査

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2021年8月 - 2024年3月

安楽泰孝, 川井隆之, 竹本さやか, 中木戸誠
生命金属動態の理解と制御のための分子認識素子の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

津本浩平, 中木戸誠
蛋白質エンジニアリングにおけるローカルフラクチュエーションの解明とその制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

津本浩平, 長門石曉, 黒田大祐, 中木戸誠
生命現象に迫るユニバーサルな蛍光偏光顕微観測法開発

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2023年3月

寺田純雄, 川岸将彦, 齊藤健太, 佐藤啓介, 中木戸誠
物理化学／計算科学を駆使したヒト化単ドメイン抗体取得系の高度化と汎用化

AMED 創薬基盤推進研究事業 2018年4月 - 2023年3月

中木戸誠
メチル基転移酵素の多重特異性創出機構の解明

JSPS 科学研究費補助金（研究活動スタート支援） 2016年9月 - 2017年3月

中木戸誠
天然変性蛋白質を用いた新規人工超分子の創製へ向けた基盤的研究

JSPS 科学研究費補助金（特別研究員奨励費） 2009年4月 - 2011年3月

中木戸誠

産業財産権

特願2013-238682 Robo1に対する親和性を向上させた抗体および高親和性抗体の分子設計方法

浜窪隆雄, 津本浩平, 藤谷秀章, 山下雄史, 岩成宏子, 中木戸誠, 井上豪, 溝端栄一, 中山泰亮
特願2013-198063 ROBO1タンパク質に対するダイアボディ型二重特異性抗体

浜窪隆雄, 津本浩平, 中木戸誠, 岩城宏子

中木戸誠

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

メニュー

共著者の一覧