森次圭 (Kei Moritsugu) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪公立大学理学研究科生物化学専攻教授

研究者番号: 80599506
J-GLOBAL ID: 202301017335301658
researchmap会員ID: R000059790

論文

A cutoff-based method with charge-distribution-data driven pair potentials for efficiently estimating electrostatic interactions in molecular systems.

Ikuo Fukuda, Kei Moritsugu, Junichi Higo, Yoshifumi Fukunishi

The Journal of chemical physics 159(23) 2023年12月21日
Binding and Unbinding Pathways of Peptide Substrates on the SARS-CoV-2 3CL Protease

Kei Moritsugu, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi, Akinori Kidera

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 63(1) 240-250 2023年1月
Functional dynamics of SARS-CoV-2 3C-like protease as a member of clan PA.

Akinori Kidera, Kei Moritsugu, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi

Biophysical reviews 14(6) 1473-1485 2022年12月査読有り
Binding and Unbinding Pathways of Peptide Substrates on the SARS-CoV-2 3CL Protease

Kei Moritsugu, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi, Akinori Kidera

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 2022年12月
Structures and mechanisms of actin ATP hydrolysis

Yusuke Kanematsu, Akihiro Narita, Toshiro Oda, Ryotaro Koike, Motonori Ota, Yu Takano, Kei Moritsugu, Ikuko Fujiwara, Kotaro Tanaka, Hideyuki Komatsu …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 119(43) 2022年10月
Allosteric Regulation of 3CL Protease of SARS-CoV-2 and SARS-CoV Observed in the Crystal Structure Ensemble

Akinori Kidera, Kei Moritsugu, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 433(24) 2021年12月
Molecular basis of ubiquitin-specific protease 8 autoinhibition by the WW-like domain

Keijun Kakihara, Kengo Asamizu, Kei Moritsugu, Masahide Kubo, Tetsuya Kitaguchi, Akinori Endo, Akinori Kidera, Mitsunori Ikeguchi, Akira Kato, Masayuki Komada …

COMMUNICATIONS BIOLOGY 4(1) 2021年11月
Multiscale Enhanced Sampling Using Machine Learning

Kei Moritsugu

LIFE-BASEL 11(10) 2021年10月
Path Ensembles for Pin1-Catalyzed Cis-Trans Isomerization of a Substrate Calculated by Weighted Ensemble Simulations

Kei Moritsugu, Norifumi Yamamoto, Yasushige Yonezawa, Shin-ichi Tate, Hiroshi Fujisaki

JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 17(4) 2522-2529 2021年4月
Flexibility and Cell Permeability of Cyclic Ras-Inhibitor Peptides Revealed by the Coupled Nose-Hoover Equation

Kei Moritsugu, Koh Takeuchi, Narutoshi Kamiya, Junichi Higo, Isao Yasumatsu, Yoshifumi Fukunishi, Ikuo Fukuda

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 61(4) 1921-1930 2021年4月
Weighted ensemble simulations for conformational changes of proteins

Hiroshi Fujisaki, Yasuhiro Matsunaga, Kei Moritsugu

INTERNATIONAL CONFERENCE OF COMPUTATIONAL METHODS IN SCIENCES AND ENGINEERING ICCMSE 2020 2021年3月査読有り招待有り
On Ergodicity for Multidimensional Harmonic Oscillator Systems with Nose - Hoover-type Thermostat

Ikuo Fukuda, Kei Moritsugu, Yoshifumi Fukunishi

REGULAR & CHAOTIC DYNAMICS 26(2) 183-204 2021年3月
Temperature-energy-space sampling molecular dynamics: deterministic and single-replica method utilizing continuous temperature system

Ikuo Fukuda, Kei Moritsugu

JOURNAL OF PHYSICS A-MATHEMATICAL AND THEORETICAL 53(37) 2020年9月
Inter-lobe Motions Allosterically Regulate the Structure and Function of EGFR Kinase

Kei Moritsugu, Yoshihiko Nishino, Akinori Kidera

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 432(16) 4561-4575 2020年7月
Allosteric response to ligand binding: Molecular dynamics study of the N-terminal domains in IP₃ receptor

Kei Moritsugu, Tsubasa Ito, Akinori Kidera

BIOPHYSICS AND PHYSICOBIOLOGY 16 232-239 2019年
Dynamic recognition and linkage specificity in K63 di-ubiquitin and TAB2 NZF domain complex

Kei Moritsugu, Hafumi Nishi, Keiichi Inariyama, Masanori Kobayashi, Akinori Kidera

SCIENTIFIC REPORTS 8 2018年11月
Conformational change of a biomolecule studied by the weighted ensemble method: Use of the diffusion map method to extract reaction coordinates

Hiroshi Fujisaki, Kei Moritsugu, Ayori Mitsutake, Hiromichi Suetani

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 149(13) 2018年10月
Exploring Configuration Space and Path Space of Biomolecules Using Enhanced Sampling TechniquesSearching for Mechanism and Kinetics of Biomolecular Functions

Hiroshi Fujisaki, Kei Moritsugu, Yasuhiro Matsunaga

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 19(10) 2018年10月
Multiscale enhanced sampling of glucokinase: Regulation of the enzymatic reaction via a large scale domain motion

Kei Moritsugu, Tohru Terada, Hironori Kokubo, Satoshi Endo, Toshimasa Tanaka, Akinori Kidera

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 149(7) 2018年8月
Energetics and conformational pathways of functional rotation in the multidrug transporter AcrB

Yasuhiro Matsunaga, Tsutomu Yamane, Tohru Terada, Kei Moritsugu, Hiroshi Fujisaki, Satoshi Murakami, Mitsunori Ikeguchi, Akinori Kidera

ELIFE 7 2018年3月

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共同研究・競争的資金等の研究課題

計算手法を駆使しアクチン構造変化が関わるフィラメント形成の不可逆性を明らかにする

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

森次圭
環境パラメタを分割変数型にした動力学と環境情報入力を最適化した分子相互作用計算

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

福田育夫, 森次圭
高次元生命ダイナミクス時系列の機械学習による低次元系への縮約と制御への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

藤崎弘士, 小田切健太, 末谷大道, 森次圭
タンパク質ダイナミクスの非マルコフ性: 状態遷移の履歴に関わる構造起源を探る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

森次圭
深層パラメタ変動ダイナミクスと電荷分布依存ポテンシャル関数を用いた分子動力学法

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

福田育夫, 森次圭
酵素反応のボトルネックを探る：反応経路サンプリングによる計算と実験による検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年7月 - 2021年3月

藤崎弘士, 楯真一, 山本典史, 森次圭
一般化カットオフ法と合成系密度力学による多様な分子動力学シミュレーションの実現

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2021年3月

福田育夫, 森次圭
細胞膜との相互作用によって制御される細胞内シグナル伝達の分子メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

木寺詔紀, 森次圭, 黄博
動的データに内在するレアイベント性の新規な特徴付けと生体時系列への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

藤崎弘士, 末谷大道, 光武亜代理, 森次圭, 松永康佑
アロステリック薬設計にむけた網羅的サンプリング

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2019年3月

木寺詔紀, 森次圭, 安藤美波, 西野圭彦
全原子構造探索によるリガンド結合過程の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

森次圭
分子動力学計算を速く正確に安定に実行するための基盤技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

福田育夫, 中村春木, 森次圭
全原子構造探索によるタンパク質相互作用過程の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2013年4月 - 2015年3月

森次圭
MSES法によるタンパク質相互作用の全原子構造サンプリング

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2012年4月 - 2013年3月

森次圭
MSES法による天然変性タンパク質の全原子構造サンプリング

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年4月 - 2012年3月

森次圭
機能に関わる蛋白質の運動を原子レベルで記述する-計算機と実験のハイブリッド

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2004年 - 2006年

森次圭