坂本美佳 (Mika Sakamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所大量遺伝情報研究室特任研究員

J-GLOBAL ID: 201901010486229870

研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

国立遺伝学研究所情報研究系大量遺伝情報研究室特任研究員
2017年7月 - 2019年3月

国立成育医療研究センター研究所メディカルゲノムセンター
2015年4月 - 2017年6月

（株）日本バイオデータ
2011年10月 - 2015年3月

中央大学理工学部生命科学科（原山研究室）技術員
2010年9月 - 2011年9月

日本大学医学部整形外科学系臨時職員（実験助手）

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学歴

2015年4月 - 2019年3月

お茶の水女子大学大学院人間文化創成科学研究科ライフサイエンス専攻疾患予防科学領域（博士）
2013年4月 - 2015年3月

放送大学大学院文化科学研究科自然環境科学プログラム（修士）
1987年4月 - 1991年3月

埼玉大学理学部生化学科

受賞

2017年

特定非営利活動法人並列生物情報処理イニシアティブ第4回IT創薬コンテスト学生奨励賞「Sirt1阻害剤（候補）の探索」

坂本美佳, 樋口明子, 三浦信明, 由良敬(TorIs

論文

Collection of 2429 constrained headshots of 277 volunteers for deep learning

Saki Aoto, Mayumi Hangai, Hitomi Ueno-Yokohata, Aki Ueda, Maki Igarashi, Yoshikazu Ito, Motoko Tsukamoto, Tomoko Jinno, Mika Sakamoto, Yuka Okazaki, Fuyuki Hasegawa, Hiroko Ogata-Kawata, Saki Namura, Kazuaki Kojima, Masao Kikuya, Keiko Matsubara, Kosuke Taniguchi, Kohji Okamura

bioRxiv 2020年10月15日
Robust classification of cell cycle phase and biological feature extraction by image-based deep learning.

Yukiko Nagao, Mika Sakamoto, Takumi Chinen, Yasushi Okada, Daisuke Takao

Molecular biology of the cell 31(13) 1346 - 1354 2020年6月15日査読有り
AnAms1.0: A high-quality chromosome-scale assembly of a domestic cat Felis catus of American Shorthair breed

Sachiko Isobe, Yuki Matsumoto, Claire Chung, Mika Sakamoto, Ting-Fung Chan, Hideki Hirakawa, Genki Ishihara, Hon-Ming Lam, Shinobu Nakayama, Shigemi Sasamoto, Yasuhiro Tanizawa, Akiko Watanabe, Kei Watanabe, Masaru Yagura, Yasukazu Nakamura

bioRxiv 2020年5月19日
A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 1

Shuntaro Chiba, Masahito Ohue, Anastasiia Gryniukova, Petro Borysko, Sergey Zozulya, Nobuaki Yasuo, Ryunosuke Yoshino, Kazuyoshi Ikeda, Woong-Hee Shin, Daisuke Kihara, Mitsuo Iwadate, Hideaki Umeyama, Takaaki Ichikawa, Reiji Teramoto, Kun-Yi Hsin, Vipul Gupta, Hiroaki Kitano, Mika Sakamoto, Akiko Higuchi, Nobuaki Miura, Kei Yura, Masahiro Mochizuki, Chandrasekaran Ramakrishnan, A. Mary Thangakani, D. Velmurugan, M. Michael Gromiha, Itsuo Nakane, Nanako Uchida, Hayase Hakariya, Modong Tan, Hironori K. Nakamura, Shogo D. Suzuki, Tomoki Ito, Masahiro Kawatani, Kentaroh Kudoh, Sakurako Takashina, Kazuki Z. Yamamoto, Yoshitaka Moriwaki, Keita Oda, Daisuke Kobayashi, Tatsuya Okuno, Shintaro Minami, George Chikenji, Philip Prathipati, Chioko Nagao, Attayeb Mohsen, Mari Ito, Kenji Mizuguchi, Teruki Honma, Takashi Ishida, Takatsugu Hirokawa, Yutaka Akiyama, Masakazu Sekijima

Scientific Reports 9(1) 19585 2019年12月査読有り
Relationship between conformation shift and disease related variation sites in ATP-binding cassette transporter proteins

Mika Sakamoto, Hirofumi Suzuki, Kei Yura

Biophysics and Physicobiology 16 68 - 79 2019年査読有り

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講演・口頭発表等

Genome Analysis of Eukaryotes: Chromosome-level assembly of domestic cat genome

Mika Sakamoto

Indonesia-Japan Bilateral Workshop on Bioinformatics and Bioresources 2020年10月22日招待有り
データサイエンティスト養成セッション：実践的次世代シークエンス解析「真核生物ゲノム解析」

坂本美佳

第9回生命医薬情報学連合大会 2020年9月2日招待有り
チャノコカクモンハマキddRAD-seq解析支援

坂本美佳, 矢倉勝, 谷澤靖洋, 嶋倉直也, 仲井まどか, 中村保一

「先進ゲノム支援」拡大班会議 2019年12月16日
珪藻のゲノム解析支援：ゲノムアセンブリからデータベース公開まで

坂本美佳, 望月孝子, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

第2回植物インフォマティクス研究会 2019年9月2日
珪藻のゲノム解析支援：ゲノムアセンブリからデータベース公開まで

坂本美佳, 望月孝子, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

「先進ゲノム支援」班員会議 2019年8月27日

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坂本美佳

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受賞

論文

講演・口頭発表等

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