若林真樹 (Masaki Wakabayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人国立循環器病研究センター創薬オミックス解析センター室長

学位: 博士（薬学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201401063955738063
researchmap会員ID: 7000009099

研究分野

ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学 /

経歴

2017年4月 - 現在

国立循環器病研究センター, 創薬オミックス解析センター, 室長
2015年10月 - 2019年3月

科学技術振興機構さきがけ研究員（兼任）
2011年10月 - 2017年3月

京都大学大学院, 薬学研究科, 助教
2013年8月 - 2014年11月

イリノイ大学, 化学科, 客員研究員（兼任）
2011年5月 - 2011年9月

京都大学大学院, 薬学研究科, 特定助教
2009年4月 - 2011年4月

国立循環器病センター研究所, 薬理部, 室員
2006年4月 - 2009年3月

日本学術振興会特別研究員（ＤＣ１）

論文

Expression of S100A8 protein on B cells is associated with disease activity in patients with systemic lupus erythematosus.

Koji Kitagori, Takuma Oku, Masaki Wakabayashi, Tomoya Nakajima, Ran Nakashima, Kosaku Murakami, Yoshitaka Hirayama, Yasushi Ishihama, Koichiro Ohmura, Akio Morinobu …

Arthritis research & therapy 25(1) 76-76 2023年5月10日
Maintenance of neural stem-progenitor cells by the lysosomal biosynthesis regulators TFEB and TFE3 in the embryonic mouse telencephalon

Naoya Yuizumi, Yujin Harada, Takaaki Kuniya, Takehiko Sunabori, Masato Koike, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama, Yutaka Suzuki, Daichi Kawaguchi, Yukiko Gotoh

STEM CELLS 39(7) 945-958 2021年7月
Comparative proteomics of Helicobacter pylori strains reveals geographical features rather than genomic variations.

Naoyuki Sugiyama, Satomi Miyake, Miao-Hsia Lin, Masaki Wakabayashi, Hiroyuki Marusawa, Shin Nishiumi, Masaru Yoshida, Yasushi Ishihama

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 24(2) 139-150 2019年2月査読有り
A conditional proteomics approach to identify proteins involved in zinc homeostasis.

Miki T, Awa M, Nishikawa Y, Kiyonaka S, Wakabayashi M, Ishihama Y, Hamachi I

Nature methods 13(11) 931-937 2016年11月査読有り
Extended Coverage of Singly and Multiply Phosphorylated Peptides from a Single Titanium Dioxide Microcolumn

Masaki Wakabayashi, Yutaka Kyono, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama

ANALYTICAL CHEMISTRY 87(20) 10213-10221 2015年10月査読有り
Large-Scale Identification of Phosphorylation Sites for Profiling Protein Kinase Selectivity

Haruna Imamura, Naoyuki Sugiyama, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 13(7) 3410-3419 2014年7月査読有り
Hydrophilic Interaction Chromatography Using a Meter-Scale Monolithic Silica Capillary Column for Proteomics LC-MS

Kanta Horie, Takeo Kamakura, Tohru Ikegami, Masaki Wakabayashi, Takashi Kato, Nobuo Tanaka, Yasushi Ishihama

ANALYTICAL CHEMISTRY 86(8) 3817-3824 2014年4月査読有り
Phosphoproteome Analysis of Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded Tissue Sections Mounted on Microscope Slides

Masaki Wakabayashi, Hiroki Yoshihara, Takeshi Masuda, Mai Tsukahara, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 13(2) 915-924 2014年2月査読有り
Rapid and Deep Profiling of Human Induced Pluripotent Stem Cell Proteome by One-shot NanoLC-MS/MS Analysis with Meter-scale Monolithic Silica Columns

Ryota Yamana, Mio Iwasaki, Masaki Wakabayashi, Masato Nakagawa, Shinya Yamanaka, Yasushi Ishihama

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 12(1) 214-221 2013年1月査読有り
Effects of Lipid Membrane Curvature on Lipid Packing State Evaluated by Isothermal Titration Calorimetry

Hirokazu Yokoyama, Keisuke Ikeda, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama, Minoru Nakano

LANGMUIR 29(3) 857-860 2013年1月査読有り
Temporal Profiling of Lapatinib-suppressed Phosphorylation Signals in EGFR/HER2 Pathways

Koshi Imami, Naoyuki Sugiyama, Haruna Imamura, Masaki Wakabayashi, Masaru Tomita, Masatoshi Taniguchi, Takayuki Ueno, Masakazu Toi, Yasushi Ishihama

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS 11(12) 1741-1757 2012年12月査読有り
Analytical strategies for shotgun phosphoproteomics: Status and prospects

Haruna Imamura, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama

SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY 23(8) 836-842 2012年10月査読有り
A Putative Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase/Williams-Beuren Syndrome Chromosome Region 17 (WBSCR17) Regulates Lamellipodium Formation and Macropinocytosis

Yoshiaki Nakayama, Naosuke Nakamura, Sayoko Oki, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama, Ayumi Miyake, Nobuyuki Itoh, Akira Kurosaka

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 287(38) 32222-32235 2012年9月査読有り
Short-chain fatty acid receptor GPR41-mediated activation of sympathetic neurons involves synapsin 2b phosphorylation

Daisuke Inoue, Ikuo Kimura, Masaki Wakabayashi, Hiroki Tsumoto, Kentaro Ozawa, Takafumi Hara, Yoshinori Takei, Akira Hirasawa, Yasushi Ishihama, Gozoh Tsujimoto

FEBS Letters 586(10) 1547-1554 2012年5月21日査読有り
Phosphoproteomics-based cancer molecular-targeting therapy and diagnostics

Yasushi Ishihama, Masaki Wakabayashi

Japanese Journal of Cancer and Chemotherapy 39(7) 1019-1025 2012年査読有り
2G1448 PI4Pと脂質膜曲率によるKes1ステロール輸送活性の制御(生体膜・人工膜,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Yokoyama Hirokazu, Wakabayashi Masaki, Ishihama Yasushi, Nakano Minoru

生物物理 52 S50 2012年
In vitro kinase taggingを利用した培養系におけるプロテオーム解析法の開発(Development of proteome mining by in vitro kinase tagging)

今村春菜, 高木俊輔, 杉山直幸, 若林真樹, 中野実, 石濱泰

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 84回 4T9p-5 2011年9月
Visualization of Amyloid Formation Processes on Cell Membranes: Gangliosides as Key Molecules for the Onset of Amyloidosis

Masaki Wakabayashi

YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN 130(10) 1295-1303 2010年10月査読有り
Ganglioside-induced amyloid formation by human islet amyloid polypeptide in lipid rafts

Masaki Wakabayashi, Katsumi Matsuzaki

FEBS LETTERS 583(17) 2854-2858 2009年9月査読有り
Formation of toxic A beta(1-40) fibrils on GM1 ganglioside-containing membranes mimicking lipid rafts: Polymorphisms in A beta(1-40) fibrils

Takuma Okada, Keisuke Ikeda, Masaki Wakabayashi, Mariko Ogawa, Katsumi Matsuzaki

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 382(4) 1066-1074 2008年10月査読有り

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MISC

117

プロテアーゼ固定化チップの開発とショットガンプロテオーム解析への応用

西田紘士, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

第25回クロマトグラフィーシンポジウム 2018年
プロテオミクス試料調製用タンパク質固定化StageTipの開発

西田紘士, 若林真樹, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 138th ROMBUNNO.28V‐pm07S 2018年
生体金属動態の分子科学-「生命金属科学」への展開コンディショナルプロテオミクスによる亜鉛関連タンパク質群の同定

田村朋則, 三木卓幸, 西川雄貴, 清中茂樹, 若林真樹, 石濱泰, 浜地格

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [1PW06-4] 2017年12月
Kinase activity profiling by motif-targeting phosphoproteome analysis

Chia-Feng Tsai, Masaki Wakabayashi, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama

65th ASMS 65th ThP560 2017年6月8日
キナーゼ阻害薬と定量的リン酸化プロテオミクスを用いたPKA基質探索

新苗智也, 小形公亮, 今村春菜, 今村春菜, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 65th 128 2017年5月1日
疾患モデルマウスのメタプロテオーム解析

坂本悠太, 伊藤麻里子, 柏木陽一郎, 野崎剛徳, 村上伸也, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 65th 104 2017年5月1日
コンディショナルプロテオミクスによる亜鉛関連タンパク質群の同定

田村朋則, 三木卓幸, 西川雄貴, 清中茂樹, 若林真樹, 石濱泰, 浜地格, 浜地格

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.1PW06‐4 (WEB ONLY) 2017年
マルチプレックス解析:深度とスループットの両立

小形公亮, TSAI Chia‐Feng, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2017 138 2017年
1細胞解析を指向した超高感度プロテオーム解析プラットフォームの開発

若林真樹, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 29th 34 2016年9月2日
リン酸化プロテオミクスを用いたプロテインキナーゼの構造と基質選択性の相関

敷田奈都紀, 佐藤綾香, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 29th 102 2016年9月2日
金属錯体生成を利用したリン酸化合物のポジティブイオンモードによる質量分析

小笠原実穂, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 29th 101 2016年9月2日
ヒトキノームの基質特異性および活性プロファイリング

杉山直幸, 坂本大, 今村春菜, TAECHAWATTANANANT Pasrawin, 石川奈津美, 若林真樹, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 29th 42 2016年9月2日
メタプロテオミクスによる腸内細菌叢分析システムの開発

伊藤麻里子, 若林真樹, 杉山直幸, 園村和弘, 松田文彦, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 29th 103 2016年9月2日
新規conditionalプロテオミクスによる亜鉛関連タンパク質群の同定

西川雄貴, 三木卓幸, 清中茂樹, 若林真樹, 石濱泰, 浜地格, 浜地格

日本生化学会大会(Web) 89th ROMBUNNO.3P‐382 (WEB ONLY)-382] 2016年9月
腸内細菌叢メタプロテオーム解析プラットフォームの開発

伊藤麻里子, 若林真樹, 杉山直幸, 園村和弘, 松田文彦, 石濱泰

日本生化学会大会(Web) 89th ROMBUNNO.3T05‐03(3P‐251) (WEB ONLY)-03(3P 2016年9月
金属錯体を用いたリン酸化合物の質量分析法の開発

小笠原実穂, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本生化学会大会(Web) 89th ROMBUNNO.3P‐384 (WEB ONLY)-384] 2016年9月
腸内細菌叢プロテオミクスに向けた分析システムの開発

伊藤麻里子, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 136th(2) ROMBUNNO.28AB‐AM337S-264 2016年3月
リジン脱アセチル化酵素を用いた新規アセチル化ペプチド濃縮技術の開発

津曲和哉, 橋本貴行, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 136th(2) ROMBUNNO.28AB‐AM335S-263 2016年3月
ポリマー多層被覆法を用いたHILIC用モノリス型シリカキャピラリーカラムの開発

阿知波弘憲, 鎌倉健雄, 市原駿, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 136th(2) ROMBUNNO.28AB‐AM302-258 2016年3月
キナーゼ特異的人工基質を用いた細胞内キノーム活性計測

坂本大, 石川菜津美, TAECHAWATTANANANT Pasrawin, 若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 136th(2) ROMBUNNO.27L‐PM14S-245 2016年3月

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書籍等出版物

リン酸化プロテオミクスを用いた分子標的薬プロファイリング. 遺伝子医学MOOK20「ナノバイオ技術と最新創薬応用研究」

若林真樹, 杉山直幸, 石濱泰 (担当:分担執筆)

メディカルドゥ 2012年
リン酸化ペプチド・タンパク質の濃縮法. 臨床プロテオミクス–バイオマーカー探索から個別化医療へ

若林真樹, 石濱泰 (担当:分担執筆)

金原出版 2012年
リン酸化プロテオミクスの確立と疾患シグナル分子標的の探索実験医学増刊

石濱泰, 若林真樹 (担当:分担執筆)

羊土社 2012年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

心筋細胞のheterogeneityとその特性解明に基づいた心疾患の包括的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

山口修, 莖田昌敬, 白井学, 若林真樹
心臓前駆細胞の発生を制御するエピジェネティック因子と転写因子のクロストーク

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

白井学, 奥崎大介, 劉祐誠, 若林真樹, 笹井紀明
心内膜心筋生検試料のプロテオーム解析手法の確立と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

若林真樹
心房性ナトリウム利尿ペプチドの異常生合成機序解明に基づく高精度心不全診断法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

南野直人, 海谷啓之, 白井学, 若林真樹
心筋細胞の老化を定義づけるエピジェネティック変動の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2022年3月

白井学, 若林真樹
鰓弓・側板中胚葉内の心臓前駆細胞発生を制御するエピジェネティック分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

白井学, 若林真樹, 笹井紀明
単一細胞プロテオミクスが拓く細胞証分析

科学技術振興機構さきがけ 2015年10月 - 2019年3月

若林真樹
トリプシン超越型新世代ショットガンプロテオミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

石濱泰, 杉山直幸, 若林真樹
FFPE臨床試料のプロテオーム解析プラットフォームの構築

文部科学省科学研究費助成事業基盤研究C 2014年4月 - 2017年3月

若林真樹
高深度プロテオミクスによるヒトプロテオーム完全解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

石濱泰, 杉山直幸, 若林真樹
分子標的創薬に向けたリン酸化ネットワーク基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

石濱泰, 杉山直幸, 豊島文子, 若林真樹
血漿中微量発現プロテオーム濃縮法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

石濱泰, 若林真樹
定量プロテオミクスに基づく心筋症発症を規定する分子ネットワークの網羅的解析

文部科学省科学研究費助成事業若手研究B 2011年4月 - 2013年3月

若林真樹
C末端アミド焦点化ペプチドーム解析に基づく新規生理活性ペプチドの同定と機能解析

文部科学省科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2009年4月 - 2011年3月

若林真樹

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論文

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