村上緑 (Midori Murakami) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学大学院理学研究科物質理学専攻生体物理学講師

J-GLOBAL ID: 201801014265212327
researchmap会員ID: B000336349

研究分野

経歴

2016年4月 - 現在

名古屋大学, 大学院理学研究科物質理学専攻生体物理学, 講師
2016年4月 - 2017年3月

ETH Zürich, Guest Professor
2016年4月 - 2017年3月

Paul Scherrer Institut, Guest Scientist
2007年4月 - 2016年3月

名古屋大学, 大学院理学研究科物質理学専攻, 助教
2000年4月 - 2007年3月

名古屋大学, 大学院理学研究科物質理学専攻, 助手

委員歴

2015年7月 - 現在

Biophysics and Physicobiology, Associate Editor
2017年3月

IGER International Symposium on Physics of Life, 実行委員長
2011年1月 - 2015年6月

Biophysics and Physicobiology, Editorial Board
2011年1月 - 2015年6月

日本生物物理学会, 運営委員/理事
2014年10月

16th International Conference on Retinal Proteins, 実行委員
2012年4月 - 2013年3月

日本生物物理学会中部支部, 会計幹事
2007年1月 - 2008年12月

日本生物物理学会, 会誌編集委員
2007年

日本比較生理生化学会, 会長選挙選挙管理委員
2005年4月 - 2006年3月

日本生物物理学会中部支部, 会計幹事
2001年

第 40 回日本生物物理学会年会, 実行委員
2000年1月 - 2000年12月

日本生物物理学会, 編集中部地区委員

論文

Crystal Structures of the Putative Isocitrate Dehydrogenase from Sulfolobus tokodaii Strain 7 in the Apo and NADP+-Bound Forms.

Hisanori Kondo, Midori Murakami

Archaea (Vancouver, B.C.) 2018 7571984-7571984 2018年査読有り
Crystal Structure of the 11-cis Isomer of Pharaonis Halorhodopsin: Structural Constraints on Interconversions among Different Isomeric States.

Siu Kit Chan, Haruki Kawaguchi, Hiroki Kubo, Midori Murakami, Kunio Ihara, Kosuke Maki, Tsutomu Kouyama

Biochemistry 55(29) 4092-104 2016年7月26日査読有り
Crystal Structures of Two Isozymes of Citrate Synthase from Sulfolobus tokodaii Strain 7.

Midori Murakami, Tsutomu Kouyama

Biochemistry research international 2016 7560919-7560919 2016年査読有り
Crystal structures of the L1, L2, N, and O states of pharaonis halorhodopsin.

Tsutomu Kouyama, Haruki Kawaguchi, Taichi Nakanishi, Hiroki Kubo, Midori Murakami

Biophysical journal 108(11) 2680-90 2015年6月2日査読有り
Structural comparison between the open and closed forms of citrate synthase from Thermus thermophilus HB8.

Eiji Kanamori, Shin-Ichi Kawaguchi, Seiki Kuramitsu, Tsutomu Kouyama, Midori Murakami

Biophysics and physicobiology 12 47-56 2015年査読有り
Crystallographic Study of the LUMI Intermediate of Squid Rhodopsin.

Midori Murakami, Tsutomu Kouyama

PloS one 10(5) e0126970 2015年査読有り
Structure of archaerhodopsin-2 at 1.8 Å resolution.

Kouyama T, Fujii R, Kanada S, Nakanishi T, Chan SK, Murakami M

Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography 70(Pt 10) 2692-701 2014年10月査読有り
Crystal structure of Cruxrhodopsin-3 from Haloarcula vallismortis.

Siu Kit Chan, Tomomi Kitajima-Ihara, Ryudoh Fujii, Toshiaki Gotoh, Midori Murakami, Kunio Ihara, Tsutomu Kouyama

PloS one 9(9) e108362 2014年査読有り
3P240 バクテリオロドプシン-ハロロドプシン-キメラ蛋白質の光反応サイクル(光生物 : 視覚・光受容,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Shinji Uyama, Tomomi Kitajima, Midori Murakami, Tsutomu Kouyama

生物物理 54(1) S288 2014年
3P253 New crystal forms of squid rhodopsin(光生物 : 視覚・光受容,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Midori Murakami, Tsutomu Kouyama

生物物理 54(1) S291 2014年
1P233 クラックスロドプシンの3量体構造と光安定性(18A. 光生物:視覚・光受容,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Chan Siu Kit, Kitajima Tomomi, Murakami Midori, Ihara Kunio, Kouyama Tsutomu

生物物理 54(1) S179 2014年
1P232 ファラオニス・ハロロドプシンのN中間体の結晶構造解析(18A. 光生物:視覚・光受容,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Kawaguchi Haruki, Nakanishi Taichi, Murakami Midori, Kouyama Tsutomu

生物物理 54(1) S179 2014年
Crystal structure of deltarhodopsin-3 from Haloterrigena thermotolerans.

Jin Zhang, Katsuhide Mizuno, Yuki Murata, Hideaki Koide, Midori Murakami, Kunio Ihara, Tsutomu Kouyama

Proteins 81(9) 1585-92 2013年9月査読有り
Large deformation of helix F during the photoreaction cycle of Pharaonis halorhodopsin in complex with azide.

Taichi Nakanishi, Soun Kanada, Midori Murakami, Kunio Ihara, Tsutomu Kouyama

Biophysical journal 104(2) 377-85 2013年1月22日査読有り
2P002 Crystal structure of cruxrhodopsin-3 from Haloarcula vallismortis(01A. Protein: Structure,Poster)

Chan Siu Kit, Kitajima Tomomi, Murakami Midori, Ihara Kunio, Kouyama Tsutomu

生物物理 53(1) S159 2013年
3P236 ハロロドプシン-臭素イオン複合体のN光反応中間体のX線結晶構造解析(18A.光生物:視覚・光受容,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Kawaguchi Haruki, Nakanishi Taichi, Kubo Hiroki, Ihara Kunio, Murakami Midori, Kouyama Tsutomu

生物物理 53(1) S251 2013年
3P237 Trapping the photoactive form of squid rhodopsin in the P62 crytal(18A. Photobiology: Vision & Photoreception,Poster)

Murakami Midori, Kouyama Tsutomu

生物物理 53(1) S251 2013年
Crystal structure of the O intermediate of the Leu93→Ala mutant of bacteriorhodopsin.

Jin Zhang, Yoshikazu Yamazaki, Masanori Hikake, Midori Murakami, Kunio Ihara, Tsutomu Kouyama

Proteins 80(10) 2384-96 2012年10月査読有り
1F1522 Large deformation of helix F upon formation of the M intermediate of the azide-bound purple form of pharaonis halorhodopsin(Photobiology: Vision & Photoreception I,Oral Presentation,The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Nakanishi Tichi, Kanada Soun, Murakami Midori, Ihara Kunio, Kouyama Tsutomu

生物物理 52 S30 2012年
1SH-06 イカロドプシンの光活性化機構(1SH レチナール蛋白質と光遺伝学,シンポジウム,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

村上緑, Kouyama Tsutomu

生物物理 52 S8 2012年

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MISC

イカロドプシンの光異性化‐熱的緩和反応の結晶構造解析

村上緑, 神山勉

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 70(1) ROMBUNNO.22PPSA-52 2015年3月24日
発色団を導入したイカロドプシン結晶の吸光特性

村上緑, 神山勉

日本物理学会講演概要集 69(1) 422 2014年3月5日
26aXZC-7 Crystal structure of cruxrhodopsin-3 from Haloarcula vallismortis

Chan Siu Kit, Kitajima Hideaki, Murakami Midori, Ihara Kunio, Kouyama Tsutomu

日本物理学会講演概要集 68(1) 418-418 2013年3月26日
X線結晶構造から観るイカロドプシンの光反応初期過程

村上緑, 神山勉

日本物理学会講演概要集 68(1) 447 2013年3月5日
イカロドプシンルミ中間体の結晶構造解析

村上緑, 神山勉

日本結晶学会年会講演要旨集 2011 94 2011年
無脊椎動物のロドプシン研究―津田基之先生に応えて―

村上緑

生物物理 50 274-275 2010年12月
イカロドプシン光反応初期中間体のX線結晶構造解析

村上緑, 神山勉

日本薬学会年会要旨集 130th(1) 341 2010年3月5日
イカロドプシンの結晶構造と無脊椎動物の視覚

村上緑

生物物理 49 15-16-16 2009年査読有り招待有り
スルメイカロドプシンのX線結晶構造解析

村上緑, 神山勉

実験医学 26 2237-2240 2008年招待有り
バクテリオロドプシンの光誘起構造変化に及ぼす結晶格子力の影響

山本昌孝, 早川直紀, 村上緑, 神山勉

日本結晶学会年会講演要旨集 2007 85 2007年
バクテリオロドプシンの光反応サイクルに及ぼすXeガスの影響

早川直紀, 笠原隆史, 長谷川大祐, 村上緑, 神山勉

日本結晶学会年会講演要旨集 2007 84 2007年
イカロドプシンの結晶構造

村上緑, 神山勉

日本結晶学会年会講演要旨集 2007 48 2007年
15pTA-4 アーキロドプシンとバクテリオロドプシンの構造比較(生物物理, 領域 12)

吉村恵子, 江波信生, 奥村英夫, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉

日本物理学会講演概要集 59(2) 312-312 2004年8月25日
29pWE-7 アーキロドプシン-2のX線結晶構造解析(タンパク質・核酸・生体膜)(領域12)

吉村恵子, 江波信生, 奥村英夫, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉

日本物理学会講演概要集 59(1) 376-376 2004年3月3日
29pWE-8 バクテリオロドプシンの光反応サイクルにおける水分子の移動(タンパク質・核酸・生体膜)(領域12)

神山勉, 奥村英夫, 村上緑

日本物理学会講演概要集 59(1) 376-376 2004年3月3日
低温顕微分光法によるバクテリオロドプシン反応中間体の構造解析

徳久武, 村上緑, 神山勉

日本生物物理学会年会講演予稿集 40th S170 2002年11月
7pQC-8 タンパク貫のX線結晶構造解析におけるX線損傷の影響(生体高分子の自己組織化,領域12)

西川太一, 坂井啓介, 村上縁, 神山勉

日本物理学会講演概要集 57(2) 301-301 2002年8月13日
高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来クエン酸シンターゼリガンド複合体のX線結晶構造解析

村上緑, 金森英司, 河口真一, 倉光成紀, 横山茂之, 神山勉

日本生物物理学会年会講演予稿集 39th S37 2001年10月
ニクバエ糖受容細胞味覚受容膜上に存在する蔗糖作動性イオンチャネルによる速い情報変換機構

村上緑

比較生理生化学 17 137-145 招待有り

書籍等出版物

「日本の結晶学（Ⅱ）―輝かしき発展―」・多様化するロドプシンの構造と機能,その応用

日本結晶学会, 日本の結晶学, I, 出版編集委員会 (担当:共著)

日本結晶学会 2014年7月31日

講演・口頭発表等

Structural basis of bistable photoreaction in invertebrate rhodopsin

MURAKAMI, Midori

16th Conference of the Asian Crystallographic Association 2019年12月19日招待有り
Structure of the photo-activated acid-meta state of squid rhodopsin

Murakami M

Asian Biophysics Association Symposium in conjunction with the Australian Society for Biophysics Meeting 2018年12月2日
Towards the structural study of large conformational changes of squid metarhodopsin

MURAKAMI, Midori

18th International Conference on Retinal Proteins 2018年9月24日招待有り
Crystallography of squid rhodopsin towards characterizing structural dynamics and bi-stability

MURAKAMI, Midori

IGER International Symposium on Physics of Life 2017年3月25日招待有り
Another world of Rhodopsin; Structure and Function of squid rhodopsin

村上緑

jLBR Seminar 2017年3月22日
Crystal structure of the LM intermediate of squid rhodopsin

村上緑

17th International Conference on Retinal Proteins 2016年10月2日招待有り
Crystallographic studies of squid rhodopsin

村上緑

Membrane Protein Meeting 2016年9月26日
Structural changes of squid rhodopsin during the thermal relaxation process in the P62 crystal

村上緑

The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015) 2015年12月15日招待有り
Crystal structure of the lumi intermediate of squid rhodopsin

村上緑

15th International Conference on Retinal Proteins 2012年9月30日招待有り
Photo-activation mechanism of squid rhodopsin

村上緑

日本生物物理学会第50回年会シンポジウム「レチナール蛋白質と光遺伝学」 2012年9月招待有り
X線結晶構造から観る無脊椎動物ロドプシンの光反応過程

村上緑

第45回生命情報科学研究セミナー 2012年3月22日招待有り
イカロドプシンルミ中間体の結晶構造解析

村上緑

蛋白研セミナー「結晶学でみるタンパク質の化学と物理」 2012年3月6日招待有り
Crystal structure of squid rhodopsin and its photoreaction

Murakami M

Physiology and Biophysics Department Seminar Series 2010年7月30日招待有り
イカロドプシンの結晶構造解析－X線でレチナールの光異性化反応を見る－

村上緑

第57回生命情報科学研究セミナー 2010年2月19日招待有り
イカロドプシンのX線結晶構造解析

村上緑

日本生物物理学会第46回年会シンポジウム「GPCR型受容体を介した生物機能の物理的理解」 2008年12月3日招待有り
X-ray structure of squid rhodopsin

Murakami M

International symposium on membrane proteins and high resolution X-ray structural analysis 2008年9月1日招待有り
スルメイカロドプシンのX線結晶構造解析

村上緑, 神山勉

第8回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「GPCR解析研究の新展開」 2008年6月招待有り
Crystal Structure of Squid Rhodopsin

Murakami M

Gordon Research Conference on "LIGAND RECOGNITION & MOLECULAR GATING" 2008年3月招待有り
Crystal structure of squid rhodopsin

Murakami M, Kouyama T

International Symposium on RETINAL PROTEINS: EXPERIMENTS AND THEORY 2007年9月 The Forschergruppe 490 "Molecular Mechanisms of Retinal Protein Action: A Combin 招待有り
膜タンパク質の立体構造解析

村上緑

第10回VBLシンポジウム「ナノマテリアルの創生、解析、機能 ―有機、無機、生体」 2006年10月招待有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

プラズマが誘発する膜輸送と元素動態

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

魚住信之, 村上緑
無脊椎動物ロドプシンの光活性構造変化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2020年3月

村上緑
無脊椎動物の視覚情報変換・伝達の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2016年3月

村上緑, 神山勉
レチナール蛋白質の高次構造と機能

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

神山勉, 村上緑, 井原邦夫, 岩佐達郎
無脊椎動物ロドプシンの光活性化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

村上緑
イカロドプシン反応中間体のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2010年 - 2011年

村上緑
ロドプシン群の構造と機能分化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

神山勉, 村上緑, 井原邦夫, 岩佐達郎
Gq型G蛋白質共役光受容体のX線構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

村上緑, 神山勉
イカロドプシンのX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2007年 - 2008年

村上緑
ロドプシン群の共通構造モチーフの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2008年

神山勉, 村上緑, 井原邦夫
イオン輸送蛋白質の4次元構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2005年 - 2006年

神山勉, 井原邦夫, 村上緑, 倭剛久, 奥村英夫
レチナール蛋白質のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2003年 - 2004年

神山勉, 村上緑, 井原邦夫, 足立伸一
生体イオンポンプの反応中間体のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2000年 - 2001年

神山勉, 倭剛久, 垣谷俊昭, 村上緑, 足立伸一, 神谷信夫, 井原邦夫

村上緑

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研究分野

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委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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