新学術領域「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」は各段階にある，‘運動超分子マシナリー研究’を推進し，最終的には原子レベルで解明することを目的としている．本領域の総括班は，「新学術領域」という研究費カテゴリーの存在意義を真摯に受けとめ，他の研究費では得られないシナジー効果を領域全体に与えることを目的とし，個々の研究班では対応しにくい活動，すなわち，(1) 議論の活性化，(2) 領域の発展に必要な技術の開発と提供，(3) アウトリーチ活動，を行なった．