Ogata Norichika - My portal - researchmap

Profile Information

Affiliation: CEO and Founder, メディカルメカニカ株式会社
: 代表取締役, 株式会社日本バイオデータ
: 顧問（ゲノム技術）, 事業部, 次世代バイオ医薬品製造技術研究組合
: 非常勤講師, 千葉大学
: 研究員, 東北大学

Degree: 博士（農学）(Mar, 2013, 東京農工大学大学院連合農学研究科)

Researcher number: 90747792
J-GLOBAL ID: 201801000417388468
researchmap Member ID: B000299495

1986年生、東京農工大学大学院博士課程在学中に次世代シークエンサーとバイオインフォマティクスに出会う。細胞の薬剤応答を調べるための理想的な薬剤濃度を定量的に求める方法を考案し、神奈川県の支援を受けて特許を取得、株式会社日本バイオデータを設立。現在に至るまで企業を中心に生物データ解析サービスを提供している。研究のフィールドを生物から情報にひろげ、2017 Thirteenth International Conference on Intelligent Computing にてBest Paper Award を受賞。現在は半導体製造技術を利用した医療機器の開発に取り組んでいる。

Research Interests

2

Research Areas

4

Research History

9

Mar, 2022 - Present

Tokyo University of Agriculture and Technology
Aug, 2018 - Present

CEO and Founder, Medicale Meccanica Inc.
Apr, 2018 - Present

顧問（ゲノム技術）, 事業部, 次世代バイオ医薬品製造技術研究組合
Apr, 2015 - Present

Chiba University
Apr, 2015 - Present

Tohoku University
Feb, 2013 - Present

代表取締役, 株式会社日本バイオデータ
Jul, 2015 - Mar, 2020

General Manager, Chitose Bio Evolution Pte. Ltd.
Jul, 2014 - Mar, 2018

顧問（ゲノム技術）, 事務局, 次世代バイオ医薬品製造技術研究組合
Apr, 2013 - Jun, 2015

開発研究員, 株式会社ネオ・モルガン研究所

Education

3

Apr, 2010 - Mar, 2013

Department of Biological Production Science, United Graduate School of Agricultural Science, Tokyo University of Agriculture and Technology
Apr, 2008 - Mar, 2010

Department of Bioregulation and Biointeraction, Graduate School of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology
Apr, 2004 - Mar, 2008

Department of Applied Biological Science, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology

Awards

3

Sep, 2019

Medal with Dark Blue Ribbon
Aug, 2017

Best Paper Award, Calculating Kolmogorv Complexity from the Transcriptome Data, International Conference on Intelligent Computing

Panpaki Seekaki, Ogata Norichika
Nov, 2011

学生奨励賞, S-PLUSを用いた次世代シーケンサーの実験デザインの最適化, 2011年度数理システムユーザコンファレンス

緒方法親

Papers

12

In vivo-like Culture of Monophagous Animal Organ using Dietary Components.

Norichika Ogata, Shogo Konishi, Takeshi Yokoyama

Journal of biotechnology and biomedicine, 6(1) 42-48, 2023
Whole-Genome Sequence of the Trypoxylus dichotomus Japanese rhinoceros beetle

Norichika Ogata

microPublication Biology., Oct, 2021 Peer-reviewedLead authorLast authorCorresponding author
Single‐cell transcriptome analyses reveal heterogeneity in suspension cultures and clonal markers of CHO‐K1 cells

Norichika Ogata, Akio Nishimura, Tomoko Matsuda, Michi Kubota, Takeshi Omasa

Biotechnology and Bioengineering, 118(2) 944-951, Feb, 2021
Characterization of Chinese hamster ovary cells with disparate chromosome numbers: Reduction of the amount of mRNA relative to total protein.

Noriko Yamano-Adachi, Norichika Ogata, Sho Tanaka, Masayoshi Onitsuka, Takeshi Omasa

Journal of bioscience and bioengineering, 129(1) 121-128, Jan, 2020 Peer-reviewed
An Electrical Impedance Biosensor Array for Tracking Moving Cells

Norichika Ogata, Akihisa Shina, Takayuki Komiya, Yoji Iizuka, Ken Matsuse, Fuminobu Imaizumi, Tomoyuki Suwa, Akinobu Teramoto

2018 IEEE SENSORS, Oct, 2018 Peer-reviewed
Physiological effects of a novel artificially synthesized antimalarial cyclic peptide: Mahafacyclin B

Yuko Fujita, Panpaki Seekaki, Norichika Ogata, Kazuhiro Chiba

PLOS ONE, 12(11) e0188415, Nov, 2017 Peer-reviewed
Relevant principal factors affecting the reproducibility of insect primary culture

Norichika Ogata, Kikuo Iwabuchi

IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY-ANIMAL, 53(6) 532-537, Jul, 2017 Peer-reviewed
A $4,000 Workstation for Mammalian Genome Assembly with Long Reads

Hikoyu Suzuki, Norichika Ogata

Mar 20, 2017
生物材料インデックス : 研究室の片隅で生き物への愛を語るカブトムシのイデア

緒方法親

生物工学会誌, 95(8) 498-502, 2017
Calculating kolmogorov complexity from the transcriptome data

Panpaki Seekaki, Norichika Ogata

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 10362 529-540, 2017 Peer-reviewed
Comparison between the Amount of Environmental Change and the Amount of Transcriptome Change

Norichika Ogata, Toshinori Kozaki, Takeshi Yokoyama, Tamako Hata, Kikuo Iwabuchi

PLOS ONE, 10(12) e0144822, Dec, 2015 Peer-reviewed
Transcriptome Responses of Insect Fat Body Cells to Tissue Culture Environment

Norichika Ogata, Takeshi Yokoyama, Kikuo Iwabuchi

PLOS ONE, 7(4) e34940, Apr, 2012 Peer-reviewed

Misc.

7

Phylogenetic analyses of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reflected the several routes of introduction to Taiwan, the United States, and Japan

Tomoko Matsuda, Hikoyu Suzuki, Norichika Ogata

Feb 20, 2020
Synergic Interaction between Permethrin and Bt toxins discovered using RNA-seq

Takuma Sakamoto, Toshinori Kozaki, Norichika Ogata

Jun 27, 2019 Corresponding author
Transcriptome Dedifferentiation Observed in Animal Primary Cultures is Essential to Plant Reprogramming

Norichika Ogata

Feb 6, 2019
Quantitative Measurement of Heritability in the Pre-RNA World

Norichika Ogata

Jan 22, 2019
An Enrichment Method for Obtaining Biologically Significant Genes from Statistically Significant Differentially Expressed Genes in Comparative Transcriptomics

Panpaki Seekaki, Norichika Ogata

May 9, 2017
Calculating kolmogorov complexity from the transcriptome data

Panpaki Seekaki, Norichika Ogata

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), 10362 529-540, 2017
G108 カブトムシ胚、脂肪体、血球由来の初代細胞培養

緒方法親, 平岡毅, 岩淵喜久男

日本応用動物昆虫学会大会講演要旨, (52), Mar 12, 2008

Books and Other Publications

2

理系のためのベンチャービジネス実践論

千葉大学ベンチャービジネスラボラトリー (Role: Contributor)

丸善出版, Mar, 2019 (ISBN: 9784621303788)
バイオインフォマティクスを用いた研究開発のポイントと実例～基礎から実際に解析を進めるための勘所、データ判断基準、バイオインフォマティクス研究管理上での留意点まで～

緒方法親

情報機構, Aug, 2018 (ISBN: 9784865021561)

Presentations

23

Tissue culture condition setting for drug-resistant genetic studies

Ogata Norichika

World Congress On Pharmacology And Chemistry of Natural Compounds, Oct, 2017, innovinc Invited
NGSデータから当たりを引き出す

緒方法親

第6回生命医薬情報学連合大会, Sep, 2017
統計上の有意差と工学上意味のある因子

緒方法親

化学工学会秋季大会, Sep, 2017
カブトムシ血球の１細胞トランスクリプトーム解析

緒方法親

第61回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2017
トランスクリプトーム解析に基づいた染色体異数性を持つ抗体生産CHO細胞の特徴的なシグナル伝達経路

田中翔, 山野範子, 緒方法親, 大政健史

化学工学会, 2017
バイオ産業におけるメタボロームデータの利活用

緒方法親

第68回日本生物工学会大会, Sep, 2016 Invited
Tissue culture condition setting for drug-resistant genetic studies

Ogata Norichika

100th Annual Meeting of the Pacific Branch, Entomological Society of America, Apr, 2016 Invited
細胞の短期記憶

緒方法親, 古崎利紀, 秦珠子, 横山岳, 岩淵喜久男

第60回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2016
桑の葉を用いたカイコ脂肪体の生体内的培養

緒方法親

第59回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2015
A method to determine the Drug Concentration in in vitro preclinical testing using Shannon entropy of Transcriptome data

Ogata Norichika

The RIKEN GSC Tanabata Meeting, Jul, 2014 Invited
眠っている代謝系を呼び起こす統合オミックス解析

緒方法親

日本農芸化学会大会, Mar, 2014 Invited
セイヨウミツバチ働きバチの脳におけるDNAメチル化解析

坂本洋典, 緒方法親, 佐々木哲彦

第58回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2014
トランスクリプトーム解析からはじめる研究機関開発

緒方法親

理研バイオインフォマティクスセミナー, Feb, 2014
ウェット研究者がバイオインフォマティクスをやった結果

緒方法親

東京農業大学バイオサイエンス専攻・農芸化学専攻「分子細胞生物学」、東京農業大学バイオサイエンス専攻「細胞分子機能科学特論Ⅱ」, Dec, 2013 Invited
トランスクリプトームデータを用いた細胞-アッセイ適合性評価

緒方法親

細胞アッセイシンポジウム, Nov, 2013 Invited
培養蚕脂肪体のフェノバルビタール及びペルメトリン処理による遺伝子発現変動

緒方法親, 古崎利紀, 秦珠子, 横山岳, 岩淵喜久男

第57回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2013
カイコガ脂肪体初代培養組織のトランスクリプトーム解析

緒方法親, 横山岳, 石井一夫, 松下保彦, 岩淵喜久男

第56回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2012
カイコガ脂肪体の初代培養組織における発現遺伝子の網羅的解析

緒方法親, 岩淵喜久男

第55回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2011
カブトムシ脂肪体初代移植培養における性差の影響

緒方法親, 岩淵喜久男

第54回日本応用動物昆虫学会大会, Mar, 2010
実験動物の個体差が移植片初代培養の初期過程に影響する

緒方法親, 岩淵喜久男

JAACTつくば2009(日本動物細胞工学会), Jul, 2009

More

Teaching Experience

1

ベンチャービジネス論 (千葉大学)

Research Projects

3

CHO細胞をデザインする：合理的・迅速・ロバストなセルエンジニアリング・プラットフォームに基づいた、向上型バイオプロセスのための細胞開発

バイオ医薬品の高度製造技術の開発（平成30年度公募）, 国立研究開発法人日本医療研究開発機構, 2018 - 2020

鬼塚正義
エネルギー関連等ベンチャー事業化促進事業

神奈川県, Jul, 2014 - Mar, 2016

緒方法親
次世代を担うかながわベンチャー

新産業ベンチャー支援事業, 神奈川県, Jul, 2012 - Mar, 2013

緒方法親

Industrial Property Rights

7

特開2018-042515 トランスクリプトームデータの正規化方法

緒方法親, 巌倉正寛, 野田尚宏, 本田真也
特開2017-091277 細胞を分類可能な遺伝子の選出方法

緒方法親
特開2017-079800 トランスクリプトームを用いた、発現変動遺伝子抽出又はパスウェイ解析にかける実験区の選定方法

緒方法親, 古崎利紀, 岩淵喜久男
特開2016-013102 細胞を安定させる条件を定量評価する方法

緒方法親
特開2015-167528 肌分析用プライマーセット及び肌の検査方法

緒方法親, 藤田朋宏
特許第5595612号肌分析用プライマーセット及び肌の検査方法

緒方法親, 藤田朋宏
特開2014-075995 トランスクリプトームを用いた、発現変動遺伝子抽出又はパスウェイ解析にかける実験区の選定方法

緒方法親, 古崎利紀, 岩淵喜久男

Social Activities

2

Donation

Other

Sep, 2018
Donation

Other

Feb, 2018