長岐清孝 (Kiyotaka Nagaki) - マイポータル

基本情報

所属: 岡山大学資源植物科学研究所准教授

学位: 博士（理学）(横浜市立大学)

J-GLOBAL ID: 200901095246836549
researchmap会員ID: 5000076709

外部リンク: https://www.rib.okayama-u.ac.jp/nucleus/IGBj/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 遺伝学 /

委員歴

2016年 - 現在

財団法人染色体学会, 理事
2023年 - 2024年

日本遺伝学会, 評議員
2017年 - 2019年

日本遺伝学会, 評議員
2007年 - 2016年

染色体学会, 評議員

受賞

主要な論文

Pancentromere analysis of Allium species reveals diverse centromere positions in onion and gigantic centromeres in garlic.

Kiyotaka Nagaki, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi

The Plant cell 2025年6月10日査読有り筆頭著者責任著者
Elucidation of the phylogenetic relationships among Alpinia species native to the Nansei Islands, Japan

Kiyotaka Nagaki, Mari Narusaka, Yoshihiro Narusaka

CYTOLOGIA 90(1) 29-36 2025年3月25日査読有り筆頭著者責任著者
Rapid and dynamic evolution of a giant Y chromosome in Silene latifolia.

Takashi Akagi, Naoko Fujita, Kenta Shirasawa, Hiroyuki Tanaka, Kiyotaka Nagaki, Kanae Masuda, Ayano Horiuchi, Eriko Kuwada, Kanta Kawai, Riko Kunou …

Science (New York, N.Y.) 387(6734) 637-643 2025年2月7日査読有り
Centrophilic retrotransposon integration via CENH3 chromatin in Arabidopsis.

Sayuri Tsukahara, Alexandros Bousios, Estela Perez-Roman, Sota Yamaguchi, Basile Leduque, Aimi Nakano, Matthew Naish, Akihisa Osakabe, Atsushi Toyoda, Hidetaka Ito …

Nature 637(8046) 744-748 2025年1月査読有り
Chromosome-specific barcode system with centromeric repeat in cultivated soybean and wild progenitor.

Ahmet L Tek, Kiyotaka Nagaki, Hümeyra Yıldız Akkamış, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi

Life science alliance 7(12) 2024年12月査読有り筆頭著者責任著者
Effectiveness of Create ML in microscopy image classifications: a simple and inexpensive deep learning pipeline for non-data scientists

Kiyotaka Nagaki, Tomoyuki Furuta, Naoki Yamaji, Daichi Kuniyoshi, Megumi Ishihara, Yuji Kishima, Minoru Murata, Atsushi Hoshino, Hirotomo Takatsuka

Chromosome Research 29(3-4) 361-371 2021年10月14日査読有り筆頭著者責任著者
Decrosslinking enables visualization of RNA-guided endonuclease–in situ labeling signals for DNA sequences in plant tissues

K Nagaki, N Yamaji

Journal of Experimental Botany 71(6) 1792-1800 2020年3月25日査読有り筆頭著者責任著者
ePro-ClearSee: a simple immunohistochemical method that does not require sectioning of plant samples

Kiyotaka Nagaki, Naoki Yamaji, Minoru Murata

Scientific Reports 7 42203-14 2017年2月査読有り筆頭著者責任著者
Sunflower centromeres consist of a centromere-specific LINE and a chromosome-specific tandem repeat.

Kiyotaka Nagaki, Keisuke Tanaka, Naoki Yamaji, Hisato Kobayashi and Minoru Murata.

Frontiers in Plant Science 6(OCTOBER) 912 2015年10月31日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Identification and characterization of functional centromeres of common bean.

Aiko Iwata, Ahmet L. Tek, Manon M.S. Richard, Brian Abernathy, Artur Fonseca, Jeremy Schmutz, Nicolas W.G. Chen, Vincent Thareau, Ghislaine Magdelenat, Yupeng Li, Minoru Murata, Andrea Pedrosa-Harand, Valerie Geffroy, Kiyotaka Nagaki and Scott A. Jackson

Plant Journal 76(1) 47-60 2013年10月査読有り責任著者
Chromosome dynamics visualized with an anti-centromeric histone H3 antibody in Allium.

Kiyotaka Nagaki, Maki Yamamoto, Naoki Yamaji, Yasuhiko Mukai and Minoru Murata

PLOS ONE 7(12) e51315 2012年12月査読有り筆頭著者責任著者
Nondisjunction in Favor of a Chromosome: The Mechanism of Rye B Chromosome Drive during Pollen Mitosis

Ali M. Banaei-Moghaddam, Veit Schubert, Katrin Kumke, Oda Weiβ, Sonja Klemme, Kiyotaka Nagaki, Jiří Macas, Mónica González-Sánchez, Victoria Heredia, Diana Gómez-Revilla …

The Plant Cell 24(10) 4124-4134 2012年10月26日査読有り
Isolation of centromeric-tandem repetitive DNA sequences by chromatin affinity purification using a HaloTag7-fused centromere-specific histone H3 in tobacco.

Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara and Minoru Murata.

Plant Cell Reports 31(4) 771-779 2012年4月査読有り筆頭著者責任著者
Functional centromeres in Astragalus sinicus include a compact centromere-specific histone H3 and a 20-bp tandem repeat.

Ahmet L. Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata and Kiyotaka Nagaki.

Chromosome Research 19(8) 969-978 2011年11月査読有り責任著者
Coexistence of NtCENH3 and two retrotransposons in tobacco centromeres

Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Go Suzuki, Asaka Kanatani, Souichi Ozaki, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, and Minoru Murata.

Chromosome Research 19(5) 591-605 2011年7月査読有り筆頭著者責任著者
Meiosis-specific loading of the centromere-specific histone CENH3 in Arabidopsis thaliana

Maruthachalam Ravi, Fukashi Shibata, Joseph S. Ramahi, *Kiyotaka Nagaki, Changbin Chen, Minoru Murata, and Simon W. L. Chan.

PLOS Genetics 7(6) e1002121 2011年6月査読有り
Functional centromeres in soybean include two distinct tandem repeats and a retrotransposon

Ahmet L. Tek, Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Mminoru Murata

Chromosome Research 18(3) 337-347 2010年4月査読有り責任著者
Characterization of the two centromeric proteins CENP-C and MIS12 in Nicotiana species

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara and Mminoru Murata

Chromosome Research 17(6) 719-726 2009年8月査読有り筆頭著者責任著者
A centromeric DNA sequence colocalized with a centromere-specific histone H3 in tobacco.

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara and Mminoru Murata.

Chromosoma 118(2) 249-257 2009年4月査読有り筆頭著者責任著者
Characterization of two centromere-specific histone H3 homologues from tobacco

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

CHROMOSOME RESEARCH 15 60-61 2007年査読有り筆頭著者責任著者
Transcription and histone modifications in the recombination-free region spanning a rice centromere

Huihuang Yan, Weiwei Jin, Kiyotaka Nagaki, Shulan Tian, Shu Ouyang, C. Robin Buell, Paul B. Talbert, Steven Henikoff, and Jiming Jiang

The Plant Cell 17(12) 3227-3238 2005年12月査読有り
Visualization of Diffuse Centromeres with Centromere-Specific Histone H3 in the Holocentric Plant Luzula nivea.

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

The Plant Cell 17(7) 1886-1893 2005年7月査読有り筆頭著者責任著者
Structure, divergence, and distribution of the CRR centromeric retrotransposon family in rice

Kiyotaka Nagaki, Pavel Neumann, Dongfen Zhang, Shu Ouyang, C. Robin Buell, Zhukuan Cheng, Jiming Jiang

Molecular Biology and Evolution 22(4) 845-855 2005年4月査読有り筆頭著者
Characterization of CENH3 and centromere-associated DNA sequences in sugarcane

Kiyotaka Nagaki and Minoru Murata

Chromosome Research 13(2) 195-203 2005年1月査読有り筆頭著者責任著者
Maize Centromeres: Organization and Functional Adaptation in the Genetic Background of Oat

Weiwei Jin, Juliana R. Melo, *Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talbert, Steven Henikoff, R. Kelly Dawe, and Jiming Jiang

The Plant Cell 16(3) 571-581 2004年3月査読有り
Sequencing of a rice centromere uncovers active genes

Kiyotaka Nagaki, Zhukuan Cheng, Shu Ouyang, Paul B. Talbert, Mary Kim, Kristine M. Jones, Steven Henikoff, C. Robin Buell, and Jiming Jiang

Nature Genetics 36(2) 138-145 2004年2月査読有り筆頭著者
Chromatin immunoprecipitation reveals that the 180-bp satellite repeat is the key functional DNA element of Arabidopsis thaliana centromeres

Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talbert, Cathy Xiaoyan Zhong, R. Kelly Dawe, Steven Henikoff, and Jiming Jiang

Genetics 163(3) 1221-1225 2003年3月査読有り筆頭著者
Molecular and cytological analyses of large tracks of centromeric DNA reveal the structure and evolutionary dynamics of maize centromeres

Kiyotaka Nagaki, Junqi Song, Robert M. Stupar, Alexander S. Parokonny, Qiaoping Yuan, Shu Ouyang, Jia Liu, Joseph Hsiao, Kristine M. Jones, R. Kelly Dawe, C. Robin Buell, and Jiming Jiang

Genetics 163(2) 759-770 2003年2月筆頭著者
Centromeric Retroelements and Satellites Interact with Maize Kinetochore Protein CENH3

Cathy Xiaoyan Zhong, Joshua B. Marshall, Christopher Topp, Rebecca Mroczek, Akio Kato, *Kiyotaka Nagaki, James A. Birchler, Jiming Jiang, and R. Kelly Dawe

The Plant Cell 14(11) 2825-2836 2002年11月査読有り

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MISC

南西諸島に自生するゲットウ種の分子同定

鳴坂真理, 長岐清孝, 関根健太郎, 鳴坂義弘

琉球大学農学部学術報告 (71) 35-38 2024年12月31日
細胞遺伝学の新潮流-より速く、より広く、より細かく、そして創出へ、古くて新しいゲノムの見える化技術

石井孝佳, 長岐清孝, 菊池真司

化学と生物 (58) 606-613 2020年11月招待有り
植物透明化によるエピジェネティック修飾の解析

長岐清孝

月刊バイオインダストリー (7) 1-8 2017年7月招待有り筆頭著者責任著者
受精後雑種障壁研究の育種利用に向けて (2016年第58回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告)

石井孝佳, 岡本龍史, 殿崎薫, 長岐清孝, 木下哲

育種学研究 = Breeding research : 日本育種学会和文誌 19(1) 35-40 2017年3月
Transmission control of plant artificial ring chromosome in Arabidopsis thaliana

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 342-342 2016年12月
コムギ花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御に及ぼすミトコンドリアゲノムの効果

村井耕二, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes -from micro to macro-

Kiyotaka Nagaki, Naoki Yamaji, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 374-374 2015年12月
Attempts to generate artificial ring chromosomes in rice

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 402-402 2015年12月
Generation of a stable 1-Mb-sized artificial ring chromosome in Arabidopsis

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Akiko Hironaka, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 304-304 2014年12月
Development of a novel method for identifying centromeric DNA sequences

Kiyotaka Nagaki, Keisuke Tanaka, Ryo Matsushima, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 304-304 2014年12月
Analyses of kinetochore components of legume species

Ahmet Latif Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 88(6) 388-388 2013年12月
Stability of artificial ring chromosomes in Arabidopsis thaliana

Fukashi Shibata, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 88(6) 388-388 2013年12月
Induction of chromosomal rearrangements and genome stability in Arabidopsis

Minoru Murata, Fukashi Shibata, Satoru Fujimoto, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 394-394 2012年12月
Utilization of centromeric histone H3 for chromosome observation in Allium species

Kiyotaka Nagaki, Maki Yamamoto, Yasuhiko Mukai, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 409-409 2012年12月
Karyotyping of tobacco by immnunolabeling and FISH, and a discovery of mini B-chromosome

Fukashi Shibata, Etsuko Yokota, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 434-434 2011年12月
A mosaic structure of centromeric DNA in tobacco

Kiyotaka Nagaki, Fukasi Shibata, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 434-434 2011年12月
Mega-base scale chromosomal rearrangements induced by Cre/LoxP-mediated recombinations in Arabidopsis

Minoru Murata, Fukashi Shibata, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 434-434 2011年12月
Evolutionally close alien CENH3s are able to target centromeres in Arabidopsis and tobacco cells

Kiyotaka Nagaki, Kaori Terada, Munenori Wakimoto, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 418-418 2010年12月
Gene expression on induced partial genome duplications in Arabidopsis thaliana

Minoru Murata, Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 418-418 2010年12月
Chromatin modification controls segregation distortion

Yoshiki Habu, Tsuyu Ando, Sachie Ito, Kiyotaka Nagaki, Fumio Taguchi-Shiobara, Masahiro Yano

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 417-417 2010年12月