永田崇 (Takashi Nagata) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学エネルギー理工学研究所エネルギー利用過程研究部門生体エネルギー研究分野准教授
: (兼任)大学院エネルギー科学研究科エネルギー基礎科学専攻准教授
: (兼任)附属カーボンネガティブ・エネルギー研究センター准教授

学位: 博士（工学）(1999年3月横浜国立大学大学院工学研究科)

通称等の別名: nagatat81
J-GLOBAL ID: 201201058893463242
researchmap会員ID: 7000000379

持続可能な開発目標(SDGs)を達成するため、構造生命科学的アプローチにより貢献したいと考えています。２つのテーマを設定しています。脱炭素社会実現に向けたテーマでは、草木バイオマスを分解または変換する酵素の探索と構造機能相関解析、酵素の機能高度化、草木バイオマス由来の基幹物質の探索、それらを効率良く得るための手法開発及び分子基盤の確立を目指しています。生命医科学のテーマでは、癌、神経疾患やウィルス病などに関わるタンパク質および核酸の構造機能相関解析を行い、疾病発症の分子機構の解明、さらには創薬開発に向けた分子基盤の確立を目指しています。研究生活の中で、NMR実験と立体構造及び分子運動の解析は、特に楽しんで取り組んでいます。最近では、in-cell NMRを応用して生きた細胞内における核酸の分子運動解析を行なっています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2013年6月 - 現在

京都大学エネルギー理工学研究所准教授
2011年9月 - 2013年5月

京都大学エネルギー理工学研究所助教
2009年4月 - 2011年8月

横浜市立大学生命ナノシステム科学研究科助教
2008年4月 - 2009年3月

横浜市立大学国際総合科学部助教
2006年4月 - 2008年3月

横浜市立大学国際総合科学部助手
2004年4月 - 2006年3月

理化学研究所ゲノム科学研究センター研究員
2002年8月 - 2004年3月

理化学研究所ゲノム科学研究センターリサーチアソシエイト
1998年8月 - 2002年7月

米ロックフェラー大学生物物理学研究室リサーチアソシエイト
1992年4月 - 1994年3月

三菱化学生命科学研究所生物工学研究部門特別研究生

学歴

1994年4月 - 1999年3月

横浜国立大学大学院工学研究科物質工学専攻後期課程
1992年4月 - 1994年3月

横浜国立大学大学院工学研究科物質工学専攻前期課程

委員歴

2016年4月 - 現在

日本分光学会編集委員

受賞

2023年3月

2022年度研究所長賞核酸塩基対の開閉運動を生きた細胞内で観測することに成功京都大学エネルギー理工学研究所

永田崇
2002年

博士研究員奨学金米国白血病研究基金

永田崇
2001年

博士研究員奨学金米国白血病研究基金

永田崇
2001年

米国エネルギー省奨学金（ポスター賞）米国エネルギー省

永田崇
2000年

学長賞ロックフェラー大学

永田崇

主要な論文

Complex Formation of an RNA Aptamer with a Part of HIV-1 Tat through Induction of Base Triples in Living Human Cells Proven by In-Cell NMR

Omar Eladl, Yudai Yamaoki, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira

International Journal of Molecular Sciences 24(10) 9069-9069 2023年5月22日査読有り
Detection of interaction between an RNA aptamer and its target compound in living human cells using 2D in-cell NMR

Eladl, O, Yamaoki, Y, Kondo, K, Nagata, T, Katahira, M

Chemical Communications 59(1) 102-105 2023年査読有り責任著者
Shedding light on the base-pair opening dynamics of nucleic acids in living human cells

Yamaoki, Y, Nagata, T, Kondo, K, Sakamoto, T, Takami, S, Katahira, M

Nature Communications 13(1) 7143 2022年11月29日査読有り責任著者
Chemical shift assignments of a fusion protein comprising the C-terminal-deleted hepatitis B virus X protein BH3-like motif peptide and Bcl-xL

Hideki Kusunoki, Isao Hamaguchi, Naohiro Kobayashi, Takashi Nagata

Biomolecular NMR Assignments 16(2) 357-361 2022年8月31日査読有り責任著者
Degradation of Lignin by Infrared Free Electron Laser

Takayasu Kawasaki, Heishun Zen, Takeshi Sakai, Yoske Sumitomo, Kyoko Nogami, Ken Hayakawa, Toyonari Yaji, Toshiaki Ohta, Takashi Nagata, Yasushi Hayakawa

Polymers 14(12) 2401-2401 2022年6月14日査読有り
1H, 13C, and 15N resonance assignments and solution structures of the KH domain of human ribosome binding factor A, mtRbfA, involved in mitochondrial ribosome biogenesis

Kanako Kuwasako, Sakura Suzuki, Nobukazu Nameki, Masayuki Takizawa, Mari Takahashi, Kengo Tsuda, Takashi Nagata, Satoru Watanabe, Akiko Tanaka, Naohiro Kobayashi, Takanori Kigawa, Peter Güntert, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Yutaka Muto

Biomolecular NMR Assignments 16(2) 297-303 2022年6月6日査読有り
Functional and Structural Characterizations of Lytic Polysaccharide Monooxygenase, Which Cooperates Synergistically with Cellulases, from Ceriporiopsis subvermispora

Huyen Nguyen, Keiko Kondo, Yusei Yagi, Yu Iseki, Nagi Okuoka, Takashi Watanabe, Bunzo Mikami, Takashi Nagata, Masato Katahira

ACS Sustainable Chemistry & Engineering 10(2) 923-934 2022年1月4日査読有り責任著者
1H, 13C and 15N resonance assignments and solution structures of the two RRM domains of Matrin-3

Fahu He, Kanako Kuwasako, Masayuki Takizawa, Mari Takahashi, Kengo Tsuda, Takashi Nagata, Satoru Watanabe, Akiko Tanaka, Naohiro Kobayashi, Takanori Kigawa, Peter Güntert, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Yutaka Muto

Biomolecular NMR Assignments 16(1) 41-49 2021年11月16日査読有り
Detection of parallel and antiparallel DNA triplex structures in living human cells using in-cell NMR

Sakamoto T, Yamaoki Y, Nagata T, Katahira M

Chemical Communications 57 6364-6367 2021年6月17日査読有り
Non-coding RNA suppresses FUS aggregation caused by mechanistic shear stress on pipetting in a sequence-dependent manner

Nesreen Hamad, Ryoma Yoneda, Masatomo So, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira

Scientific Reports 11(1) 9523-9523 2021年5月4日査読有り
Investigation of the Interaction of Human Origin Recognition Complex Subunit 1 with G-Quadruplex DNAs of Human c-myc Promoter and Telomere Regions

Afaf Eladl, Yudai Yamaoki, Shoko Hoshina, Haruka Horinouchi, Keiko Kondo, Shou Waga, Takashi Nagata, Masato Katahira

International Journal of Molecular Sciences 22(7) 3481-3481 2021年3月27日査読有り
Nucleus accumbens-associated protein 1 binds DNA directly through the BEN domain in a sequence-specific manner

Nakayama N, Sakashita G, Nagata T, Kobayashi N, Yoshida H, Park SY, Nariai Y, Kato H, Obayashi E, Nakayama K, Kyo S, Urano T

Biomedicine, doi:10.3390/biomedicines8120608 8(12) 608-608 2020年12月14日査読有り
Development and structural determination of an anti-PrPC aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein

Tsukasa Mashima, Joon-Hwa Lee, Yuji O. Kamatari, Tomohiko Hayashi, Takashi Nagata, Fumiko Nishikawa, Satoshi Nishikawa, Masahiro Kinoshita, Kazuo Kuwata, Masato Katahira

Scientific Reports 10(1) 4943 2020年12月査読有り
NMR Elucidation of Nonproductive Binding Sites of Lignin Models with Carbohydrate-Binding Module of Cellobiohydrolase I

Tokunga Y, Nagata T, Kondo K, Katahira M, Watanabe T

Biotechnology for Biofuels 13 164 2020年10月7日査読有り
1H, 13C and 15N resonance assignment of the YTH domain of YTHDC2

Fahu He, Ryuta Endo, Kanako Kuwasako, Mari Takahashi, Kengo Tsuda, Takashi Nagata, Satoru Watanabe, Akiko Tanaka, Naohiro Kobayashi, Takanori Kigawa, Peter Güntert, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Yutaka Muto

Biomolecular NMR Assignments, in press 15(1) 1-7 2020年9月15日査読有り
Complete NMR assignment and analysis of molecular structural changes of β-O-4 lignin oligomer model compounds in organic media with different water content

Tokunaga Y, Nagata T, Kondo K, Katahira M, Watanabe T

HOLZFORSCHUNG, in press 2020年8月査読有り
Direct visualization of the conformational change of FUS/TLS upon binding to promoter-associated non-coding RNA

Hamad N, Watanabe H, Uchihashi T, Kurokawa R, Nagata T, Katahira M

Chemical Communications 56 9134-9137 2020年7月査読有り
RNA sequence and length contribute to RNA-induced conformational change of TLS/FUS

Hamad N, Mashima T, Yamaoki Y, Kondo K, Yoneda R, Oyoshi T, Kurokawa R, Nagata T, Katahira M

Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-020-59496-0 10 2629 2020年2月14日査読有り
How Does the Recently Discovered Peptide MIP Exhibit Much Higher Binding Affinity than an Anticancer Protein p53 for an Oncoprotein MDM2?

Tatsuya Yamada, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Naohiro Kobayashi, Hiroshi Yanagawa, Mitsunori Ikeguchi, Masato Katahira, Takashi Nagata, Masahiro Kinoshita

Journal of Chemical Information and Modeling 59(8) 3533-3544 2019年8月26日査読有り
An insight into the dependence of the deaminase rate of human APOBEC3F on the length of single-stranded DNA, which is affected by the concentrations of APOBEC3F and single-stranded DNA

L. Wan, K. Kamba, T. Nagata, M. Katahira

Biochimica et Biophysica Acta 1864 129346 2019年4月査読有り招待有り責任著者
Identification of key residues for activities of atypical glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora, a selective degrader of lignin in woody biomass, by crystallography and functional mutagenesis

O.W.H. Wan, B. Mikami, N. Saka, K. Kondo, M.I. Lin, T. Nagata, M. Katahira

International Journal of Biological Macromolecules 132 222-229 2019年3月査読有り責任著者
The anti-prion RNA aptamer R12 disrupts the Alzheimer’s disease-related complex between prion and amyloid β

M. Iida, T. Mashima, Y. Yamaoki, M. So, T. Nagata, M. Katahira

FEBS J, doi: 10.1111/febs.14819 2019年3月査読有り
Structure of a serine-type glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora and identification of the enzymatically important non-canonical residues by functional mutagenesis

O.W.H. Wan, B. Mikami, N. Saka, K. Kondo, T. Nagata, M. Katahira

Biochem. Biophys. Res. Commun., doi: 10.1016/j.bbrc.2019.01.076. 510(1) 177-183 2019年2月査読有り責任著者
NMR Analysis on Molecular Interaction of Lignin with Amino Acid Residues of Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A

Tokunaga, T, Nagata, T, Suetomi, T, Oshiro, S, Kondo, K, Katahira, M, Watanabe, T

Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-018-38410-9. 9(1) 1977 2019年2月査読有り
Noise peak filtering in multi-dimensional NMR spectra using convolutional neural networks.

Naohiro Kobayashi, Yoshikazu Hattori, Takashi Nagata, Shoko Shinya, Peter Güntert, Chojiro Kojima, Toshimichi Fujiwara

Bioinformatics (Oxford, England) 34(24) 4300-4301 2018年12月15日査読有り
Classification of fungal glucuronoyl esterases (FGEs), and characterization of two new FGEs from Ceriporiopsis subvermispora and Pleurotus eryngii

M.I. Lin, A. Hiyama, K. Kondo, T. Nagata, M. Katahira

Applied Microbiology and Biotechnology 102(22) 9635-9645 2018年11月査読有り責任著者
Characterization of the glutathione S-transferases that belong to the GSTFuA class in Ceriporiopsis subvermispora: Implications in intracellular detoxification and metabolism of wood-derived compounds

Wan Hasnidah Wan Osman, Meng-I Lin, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira

International Journal of Biological Macromolecules 113 1158-1166 2018年7月1日査読有り責任著者
High yield production of fungal manganese peroxidases by E. coli through soluble expression, and examination of the activities

Meng-I Lin, Takashi Nagata, Masato Katahira

Protein Expression and Purification 145 45-52 2018年5月1日査読有り責任著者
Direct evidence for α ether linkage between lignin and carbohydrates in wood cell walls

H. Nishimura, A. Kamiya, T. Nagata, M. Katahira, T. Watanabe

Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-018-24328-9. 8(1) 6538 2018年4月査読有り
The first successful observation of in-cell NMR signals of DNA and RNA in living human cells

Yudai Yamaoki, Ayaka Kiyoishi, Masayuki Miyake, Fumi Kano, Masayuki Murata, Takashi Nagata, Masato Katahira

Physical Chemistry Chemical Physics 20(5) 2982-2985 2018年2月7日査読有り
The C-terminal cytidine deaminase domain of APOBEC3G itself undergoes intersegmental transfer for a target search, as revealed by real-time NMR monitoring

Keisuke Kamba, Takashi Nagata, Masato Katahira

Physical Chemistry Chemical Physics 20(5) 2976-2981 2018年2月7日査読有り責任著者
Influence of the DNA sequence/length and pH on deaminase activity, as well as the roles of the amino acid residues around the catalytic center of APOBEC3F

Li Wan, Takashi Nagata, Masato Katahira

Physical Chemistry Chemical Physics 20(5) 3109-3117 2018年2月7日査読有り
Plastic roles of phenylalanine and tyrosine residues of TLS/FUS in complex formation with the G-quadruplexes of telomeric DNA and TERRA

Keiko Kondo, Tsukasa Mashima, Takanori Oyoshi, Ryota Yagi, Riki Kurokawa, Naohiro Kobayashi, Takashi Nagata, Masato Katahira

SCIENTIFIC REPORTS 8(1) 2864 2018年2月査読有り
Characterisation of an aptamer against Runt domain of AML1 (RUNX1) by NMR and mutational analyses

K. Takada, R. Amano, Y. Nomura, Y. Tanaka, S. Sugiyama, T. Nagata, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu, T. Sakamoto

FEBS Open Bio 8(2) 264-270 2018年1月査読有り
Mechanism of protein-RNA recognition: Analysis based on the statistical mechanics of hydration

Tomohiko Hayashi, Tomoaki Matsuda, Takashi Nagata, Masato Katahira, Masahiro Kinoshita

Physical Chemistry Chemical Physics 20(14) 9167-9180 2018年査読有り
Conjugation of two RNA aptamers improves binding affinity to AML1 Runt domain

Yusuke Nomura, Kaori Yamazaki, Ryo Amano, Kenta Takada, Takashi Nagata, Naohiro Kobayashi, Yoichiro Tanaka, Junichi Fukunaga, Masato Katahira, Tomoko Kozu, Yoshikazu Nakamura, Yuji Haishima, Hidetaka Torigoe, Taiichi Sakamoto

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 162(6) 431-436 2017年12月査読有り
Observation by real-time NMR, and interpretation of length- and location-dependent deamination activity of APOBEC3B

L. Wan, T. Nagata, R. Morishita, A. Takaori-Kondo, M. Katahira

ACS Chemical Biology, DOI: 10.1021/acschembio.7b00662 12(11) 2704-2708 2017年11月17日査読有り
Backbone and side chain assignments of the second RNA-binding domain of Musashi-1 in its free form and in complex with 5-mer RNA

Ryo Iwaoka, Takashi Nagata, Kengo Tsuda, Takao Imai, Hideyuki Okano, Naohiro Kobayashi, Masato Katahira

BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS 11(2) 265-268 2017年10月査読有り責任著者
Structural Insight into the Recognition of r(UAG) by Musashi-1 RBD2, and Construction of a Model of Musashi-1 RBD1-2 Bound to the Minimum Target RNA

Ryo Iwaoka, Takashi Nagata, Kengo Tsuda, Takao Imai, Hideyuki Okano, Naohiro Kobayashi, Masato Katahira

MOLECULES 22(7) E1207 2017年7月査読有り責任著者
Development of an RNA aptamer that acquires binding capacity against HIV-1 Tat protein via G-quadruplex formation in response to potassium ions

Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Tsukasa Mashima, Masato Katahira

CHEMICAL COMMUNICATIONS 53(52) 7056-7059 2017年7月査読有り責任著者
Molecular Landscape of the Ribosome Pre-initiation Complex during mRNA Scanning: Structural Role for eIF3c and Its Control by eIF5

Eiji Obayashi, Rafael E. Luna, Takashi Nagata, Pilar Martin-Marcos, Hiroyuki Hiraishi, Chingakham Ranjit Singh, Jan Peter Erzberger, Fan Zhang, Haribabu Arthanari, Jacob Morris, Riccardo Pellarin, Chelsea Moore, Ian Harmon, Evangelos Papadopoulos, Hisashi Yoshida, Mahmoud L. Nasr, Satoru Unzai, Brytteny Thompson, Eric Aube, Samantha Hustak, Florian Stengel, Eddie Dagraca, Asokan Ananbandam, Philip Gao, Takeshi Urano, Alan G. Hinnebusch, Gerhard Wagner, Katsura Asano

CELL REPORTS 18(11) 2651-2663 2017年3月査読有り筆頭著者
Structure, Dynamics, and Interaction of p54(nrb)/NonO RRM1 with 5 ' Splice Site RNA Sequence

Jean-Baptiste Duvignaud, Mikael Bedard, Takashi Nagata, Yutaka Muto, Shigeyuki Yokoyama, Stephane M. Gagne, Michel Vincent

BIOCHEMISTRY 55(18) 2553-2566 2016年5月査読有り
Characterization of the Deamination Coupled with Sliding along DNA of Anti-HIV Factor APOBEC3G on the Basis of the pH-Dependence of Deamination Revealed by Real-Time NMR Monitoring

Keisuke Kamba, Takashi Nagata, Masato Katahira

FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 7 587 2016年4月査読有り責任著者
Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution

Hideyasu Okamura, Hiroshi Nishimura, Takashi Nagata, Takanori Kigawa, Takashi Watanabe, Masato Katahira

SCIENTIFIC REPORTS 6(21742) 1-12 2016年2月査読有り
The binding specificity of Translocated in LipoSarcoma/FUsed in Sarcoma with lncRNA transcribed from the promoter region of cyclin D1

Ryoma Yoneda, Shiho Suzuki, Tsukasa Mashima, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira, Riki Kurokawa

CELL AND BIOSCIENCE 6(4) 1-12 2016年1月査読有り
K+-responsive off-to-on switching of hammerhead ribozyme through dual G-quadruplex formation requiring no heating and cooling treatment

Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Tsukasa Mashima, Masato Katahira

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 468(1-2) 27-31 2015年12月査読有り責任著者
Catalytic Analysis of APOBEC3G Involving Real-Time NMR Spectroscopy Reveals Nucleic Acid Determinants for Deamination

Keisuke Kamba, Takashi Nagata, Masato Katahira

PLOS ONE 10(4) e0124142 2015年4月査読有り責任著者
Augmentation of multiple protein kinase activities associated with secondary imatinib resistance in gastrointestinal stromal tumors as revealed by quantitative phosphoproteome analysis

Kayoko Nagata, Takao Kawakami, Yoichi Kurata, Yayoi Kimura, Yusuke Suzuki, Takashi Nagata, Yuji Sakuma, Yohei Miyagi, Hisashi Hirano

JOURNAL OF PROTEOMICS 115 132-142 2015年2月査読有り
Boosting of activity enhancement of K+-responsive quadruplex hammerhead ribozyme

Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira

CHEMICAL COMMUNICATIONS 51(27) 5898-5901 2015年査読有り責任著者
Novel RNA recognition motif domain in the cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3

Kengo Tsuda, Kanako Kuwasako, Takashi Nagata, Mari Takahashi, Takanori Kigawa, Naohiro Kobayashi, Peter Guentert, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Yutaka Muto

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 82(10) 2879-2886 2014年10月査読有り

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MISC

397

ヒト生細胞内におけるDNA三重鎖構造形成の初観測および分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対開閉ダイナミクスの解析

阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人

第103回日本化学会2023,東京理科大学野田キャンパス, 2023.3.22-25 2023年3月
The molecular level elucidation of a Ceriporiopsis subvermispora manganese peroxidase-catalyzed conversion of a phenolic lignin dimer

Kenneth Sze Kai Teo, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira

第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス 2023年3月
Ceriporiopsis subvermispora 由来溶解性多糖モノオキシゲナーゼのセルロース解重合反応の解析

井関優侑, 奥岡奈宜, 橋爪知弘, 近藤敬子, 永田崇, 片平正人, 渡辺隆司

第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス 2023年3月
Trichoderma reesei Cel7Aのセルラーゼ糖質結合モジュールと人工リグニンの相互作用解析

内田貴己, 徳永有希, 永田崇, 近藤敬子, 片平正人, 渡辺隆司

第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス 2023年3月
Co-displaying of xylanase and feruloyl esterase on the Pichia pastoris cell surface

Apisan Phienluphon, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira

第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス 2023年3月
核酸から成る液滴のNMR法を用いた物理化学的解析

川上愛加, 山置佑大, 近藤敬子, 阪本知樹, 永田崇, 片平正人

第45回日本分子生物学会年会日本生物物理学会共催, 幕張メッセ, 2022.11.30-12.2 2022年12月
In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸構造の塩基対開閉ダイナミクスの解析

山置佑大, 永田崇, 阪本知樹, Eladl Omar, 川上愛加, 近藤敬子, 片平正人

第45回日本分子生物学会年会日本生物物理学会共催, 幕張メッセ, 2022.11.30-12.2 2022年12月
Base-pair opening dynamics and interactions with ligands of nucleic acids in living human cells studied by in-cell NMR

Yudai Yamaoki, Omar Eladl, Keiko Kondo, Tomoki Sakamoto, Takashi Nagata, Masato Katahira

ISNAC 2022, Tokyo Univ. Sci., 2022.11.2-4 2022年11月2日査読有り
分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対の開閉ダイナミクスの緩和分散法を用いた解析

阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人

第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10 2022年11月査読有り
B型肝炎ウイルスX蛋白質（HBx）のC末側欠失変異体ペプチドと抗アポトーシス蛋白質Bcl-xLの相互作用のNMR解析

楠英樹, 坂本泰一, 河野俊之, 若松馨, 浜口功, 永田崇

第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10 2022年11月査読有り
In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸の塩基対開閉ダイナミクスの解析

山置佑大, 永田崇, 近藤敬子, 阪本知樹, Eladl Omar, 片平正人

第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10 2022年11月査読有り
ヒト生細胞内環境における三重鎖DNA分子の構造及びダイナミクスの解析

阪本知樹, 山置佑大, 永田崇, 片平正人

第60回日本生物物理学会年会,2022.9.28-30, 函館アリーナ・函館市民会館、ハイブリッド 2022年9月28日
In silicoアプローチによるアプタマー-IgG結合の熱力学的プロファイルの解析

山崎凌司, 伊藤愛純, 阪本知樹, 古峰真樹, 石川岳志, 片平正人, 永田崇, 坂本泰一, 山岸賢司

第60回日本生物物理学会年会,2022.9.28-30, 函館アリーナ・函館市民会館、ハイブリッド 2022年9月27日
結晶性セルロースの分解におけるセルラーゼと選択的白色腐朽菌由来LPMO9のシナジー効果

八木勇成, 近藤敬子, Huyen Nguyen, 井関侑, 奥岡奈宜, 渡辺隆司, 三上文三, 永田崇, 片平正人

The 5th International Cellulose Conference [ICC2022+1](1st CIRCULAR),International Conference Center Hiroshima, Hiroshima, 2022.9.26-29 2022年9月
Vif複合体に結合するRNAアプタマーの開発

熊谷紀志, 鈴木拓也, 関川湧斗, 神庭圭佑, 万里, 永田佳代子, 高折晃史, 片平正人, 永田崇, 坂本泰一

日本核酸医薬学会第7回年会,2022.07.31-08.03,御茶ノ水ソラシティカンファレンスセンター 2022年7月31日
結晶性セルロースの分解におけるセルラーゼと選択的白色腐朽菌由来LPMO9のシナジー効果

八木勇成, 近藤敬子, Huyen Nguyen, 井関優侑, 奥岡奈宜, 渡辺隆司, 三上文三, 永田崇, 片平正人

セルロース学会第 29 回年次大会, 2022.7.20-22, 金沢市文化ホール 2022年7月
Investigation of the structural dynamics and interactions of RNAs in living human cells by in-cell NMR

Yudai Yamaoki, Omar Eladl, Keiko Kondo, Tomoki Sakamoto, Takashi Nagata, Masato Katahira

第23回日本RNA学会,みやこめっせ,京都, 2022.7.20-22 2022年7月
HIV-1 Vifと宿主タンパク質の五者複合体による抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化活性阻害の分子機構の解明

神庭圭佑, 雲財悟, 森下了, 高折晃史, 永田崇, 片平正人

第22回日本蛋白質科学会年会,2022.06.07-09, つくば国際会議場 22nd (Web) 2022年6月7日
Effect of site-directed mutagenesis of Aspergillus sydowii feruloyl esterase on substrate preference

Apisan Phienluphon, Keiko Kondo, Takashi Nagata, Masato Katahira

日本農芸化学会2022年度京都大会, 2022.3.15-18, on-line 2022年3月18日
レーザーによるリグノセルロース分解への挑戦

川崎平康, 境武志, 住友洋介, 野上杏子, 早川建, 宍倉文夫, 永田崇, 全炳俊, 早川恭史

日本農芸化学会2022年度京都大会, 2022.3.15-18, on-line 2022年3月15日

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書籍等出版物

生命金属ダイナミクス～生体内における金属の挙動と制御～

山置佑大, 永田崇, 片平正人 (担当:分担執筆, 範囲:金属原子によるRNAの立体構造形成とその生理活性スイッチングへの応用, pp198-204)

NTS 2021年1月15日
Observation of nucleic acids inside living human cells by in-cell NMR spectroscopy

Yamaoki Y, Nagata T, Sakamoto T, Katahira M (担当:共著)

Biophysics and Physicobiology, 13, 164, 2020 2020年5月26日
Recent progress of in-cell NMR of nucleic acids in living human cells

Yamaoki Y, Nagata T, Sakamoto T, Katahira M (担当:共著)

Biophysical Reviews, 12, 411, 2020 2020年3月6日
ヒト生細胞中における核酸NMRシグナルの初計測

山置佑大, 永田崇, 片平正人 (担当:共著)

生物物理誌 2019年1月
単独ドメインから成るタンパク質APOBEC3GC端ドメインはストランド間移動する能力を有する～実時間NMR計測法を用いた酵素活性測定の応用

神庭圭佑, 永田崇, 片平正人 (担当:共著)

新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54 2018年2月
ヒト生細胞中のDNAおよびRNAのNMRシグナル観測に初めて成功

山置佑大, 永田崇, 片平正人 (担当:共著)

新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54 2018年2月
APOBEC3Fの触媒中心近傍アミノ酸残基の役割と、DNA配列・長さ及びpHが脱アミノ化活性に及ぼす影響

永田崇, 片平正人 (担当:共著)

新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54 2018年2月
随想：杉とオークのバイオマス ~週末版~

永田崇

京都大学エネルギー理工学研究所ニュースレター第61号（平成28年7月号）, 61, 9 2016年7月
Uniform 13C/15N-labeling of DNA by tandem repeat amplification

Werner, M. H, Gupta, V, Lambert, L. J, Nagata, T (担当:共著)

Methods Enzymol., 338: 283-304 2001年

講演・口頭発表等

タンパク質のNMRシグナルの帰属・構造解析の基礎 ~自動化の時代~

永田崇

第22回若手NMR研究会 NMRによる多彩な生体試料へのアプローチ 2022年9月12日招待有り
Analysis of Structure and Dynamics of Oligonucleotides in Living Human Cells

Takashi Nagata

Joint conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, 2021.8.23-27. 2021年8月26日
天然変性領域を含むタンパク質のNMR解析

永田崇

蛋白研セミナー生体系NMR法の最前線基礎から学ぶ最新 NMR解析法（第一回）ー構造解析の自動化 2020年11月6日招待有り
Structural and functional study of the G-quadruplex anti-prion RNA aptamer and in-cell NMR of nucleic acids

Takashi NAGATA

International IPR Seminar, Open up a new era of structural biology with advanced NMR study, Osaka Univ., 2019.11.19-20 2019年11月19日招待有り
Development of anti-prion RNA aptamers and destruction of the Alzheimer's disease-related complex

Takashi NAGATA

The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, The 3rd Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry, Koganei Civic Center (Tokyo), 2019.10.29-31 2019年10月31日
草木バイオマス有効利用と創薬開発に向けた構造生物学的アプローチ

永田崇

第32回京都大学宇治キャンパス産学交流会. 京都大学(宇治) 2019.6.27 2019年6月27日招待有り
Evaluation of the structural stability and dynamics of nucleic acids inside the living cells by using in-cell NMR spectroscopy

Nagata T, Yamaoki Y, Katahira M

The 18th Annual Meeting of the Protein Society of Japan, 2018.6.26-28, Toki messe (Niigata) 2018年6月28日招待有り
機能性核酸の細胞内動的構造解析とDNA変換酵素のスライディングの活写

永田崇

新学術領域「動的構造生命」平成30年度第4回領域会議.ザ・ルイガンズ（福岡） 2018.6.12-14 2018年6月12日招待有り
DNA変換酵素のスライディングと核酸の細胞内動的構造のNMRによる研究

永田崇

生物機能化学シンポジウムエネルギー理工学研究所主催エネルギー複合機構研究センター、国際・産学連携支援推進事業支援. 京都大学（宇治）2018.03.26 2018年3月26日招待有り
木材分解酵素の構造機能相関研究～木質バイオマスの有効活用に向けた取り組み～

永田崇

京都大学エネルギー理工学研究所第8回センター談話会、2018.01.05 2018年1月5日
機能性核酸の細胞内動的構造解析とDNA変換酵素のスライディングの活写

永田崇

新学術領域「動的構造生命」平成29年度第3回領域会議.ザ・ルイガンズ（福岡） 2017.6.5-7 2017年6月5日招待有り
Structural study of RNA aptamer and peptide that potently perturb the function of intrinsically disordered proteins related to disease

永田崇

The 5th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR, 理化学研究所横浜キャンパス（横浜市）, 2016.8.29-30 2016年8月29日招待有り
DNA変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

永田崇

新学術領域「動的構造生命」平成28年度第2回領域会議.クロスウェーブ幕張（千葉） 2016.4.18-20 2016年4月18日招待有り
疾患に関わる天然変性蛋白質の機能を阻害するRNAアプタマーと高親和性ペプチドのNMRによる構造機能相関解析

永田崇

第4回ネオバイオ分子研究会, 大阪府立大学 (大阪) 2016年1月29日招待有り
DNA変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

永田崇

新学術領域「動的構造生命」平成27年度第1回領域会議.ザ・ルイガンズ(福岡) 2015.6.1-3 2015年6月1日招待有り
タンパク質の構造、相互作用、酵素反応のNMRによる解析

永田崇

第56回日本生化学会中国-四国支部例会.島根大学大学会館 (松江) 2015年5月29日招待有り
構造生命科学で挑むエネルギー問題

永田崇

京都大学第19回エネルギー理工学研究所公開講演会「宇治で発見？未来のエネルギー」 2014年5月10日招待有り
脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明

永田崇

新学術領域「天然変性蛋白質」平成25年度第4回領域会議.ひだホテルプラザ（岐阜） 2013.9.3-5 2013年9月3日招待有り
脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明

永田崇

新学術領域「天然変性蛋白質」平成24年度第3回領域会議.北広島クラッセホテル（北海道）2012.5.30-6.1 2012年5月30日招待有り
酵素活性の実時間追跡と構造解析による抗HIV治療薬の開発型研究

永田崇

第7回先端医科学研究センタープロジェクト報告会.横浜 2012年1月招待有り

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

データサイエンスを導入した原子間力顕微鏡による四重鎖DNA検出法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

田中陽一郎, 永田崇, 杉本千佳, 荻野俊郎
核酸とペプチドツールを用いたアルツハイマー病関連複合体の形成原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

永田崇
中分子アゴニスト創薬のロジカルデザイン〜ＯＸ４０アゴニスト開発を実施例として〜

日本医療研究開発機構 2018年4月 - 2023年3月

永田崇
人工マルチドメイン酵素固定化シートを用いた低コストなアゾ染料分解法の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2021年3月

堀内正隆, 永田崇
癌・幹細胞増殖性維持に関わる翻訳抑制複合体の形成原理と創薬に向けた分子基盤の構築

日本学術振興会基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

永田崇
機能性核酸の細胞内動的構造解析とＤＮＡ変換酵素のスライディングの活写

日本学術振興会新学術領域(公募研究) 2017年4月 - 2019年3月

永田崇
ＤＮＡ変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

日本学術振興会新学術領域(公募研究) 2015年4月 - 2017年3月

永田崇
ウィルスによるヒト抗ウィルス酵素の作用阻止機構の解明と創薬に向けた分子基盤の構築

日本学術振興会基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

永田崇
脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明

日本学術振興会新学術領域(公募研究) 2012年4月 - 2014年3月

永田崇
ＴＡＭ受容体チロシンキナーゼのリガンド認識機構の解明と創薬に向けた分子基盤（平成26年度分）

日本学術振興会基盤研究(C) 2011年4月 - 2014年3月

永田崇
分化制御の鍵をにぎる翻訳抑制複合体の構築原理

日本学術振興会基盤研究(C) 2008年4月 - 2011年3月

永田崇

産業財産権

特願2009-072932 Hsp70を有効成分として含有するHIV-1感染症治療剤

永田崇

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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