内藤久志 (hisashi naitow) - マイポータル

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所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所

researchmap会員ID: R000025873

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構造ウイルス学

研究分野

論文

High throughput protein serial crystallography using a grease matrix and a large-area support film

Michihiro Sugahara, Saori Maki-Yonekura, Ichiro Inoue, Kiyofumi Takaba, Shun Narai, Hisashi Naitow, Jungmin Kang, Kensuke Tono, Keiji Numata, Tetsuya Ishikawa …

2025年1月31日
Time-resolved serial crystallography to track the dynamics of carbon monoxide in the active site of cytochrome c oxidase.

Cecilia Safari, Swagatha Ghosh, Rebecka Andersson, Jonatan Johannesson, Petra Båth, Owens Uwangue, Peter Dahl, Doris Zoric, Emil Sandelin, Adams Vallejos …

Science advances 9(49) eadh4179 2023年12月8日
Ambient temperature structure of phosphoketolase from Bifidobacterium longum determined by serial femtosecond X-ray crystallography

Kunio Nakata, Tatsuki Kashiwagi, Naoki Kunishima, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Hiroshi Miyano, Toshimi Mizukoshi, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Eriko Nango …

Acta Crystallographica Section D Structural Biology 79(4) 290-303 2023年3月28日
Structural resolution of a small organic molecule by serial X-ray free-electron laser and electron crystallography

Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Ichiro Inoue, Kensuke Tono, Tasuku Hamaguchi, Keisuke Kawakami, Hisashi Naitow, Tetsuya Ishikawa, Makina Yabashi, Koji Yonekura

Nature Chemistry 2023年3月20日
Conformational alterations in unidirectional ion transport of a light-driven chloride pump revealed using X-ray free electron lasers.

Toshiaki Hosaka, Takashi Nomura, Minoru Kubo, Takanori Nakane, Luo Fangjia, Shun-Ichi Sekine, Takuhiro Ito, Kazutaka Murayama, Kentaro Ihara, Haruhiko Ehara …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(9) 2022年3月1日
Machine learning-based real-time object locator/evaluator for cryo-EM data collection.

Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Hisashi Naitow, Tasuku Hamaguchi, Kiyofumi Takaba

Communications biology 4(1) 1044-1044 2021年9月7日
Complementary use of high-resolution and high-precision cryo-ED and EM

Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Kiyofumi Takaba, Tasuku Hamaguchi, Hisashi Naitow, Keisuke Kawakami

Microscopy and Microanalysis 27(S1) 204-206 2021年8月
Capturing structural changes of the S1 to S2 transition of photosystem II using time-resolved serial femtosecond crystallography.

Hongjie Li, Yoshiki Nakajima, Takashi Nomura, Michihiro Sugahara, Shinichiro Yonekura, Siu Kit Chan, Takanori Nakane, Takahiro Yamane, Yasufumi Umena, Mamoru Suzuki …

IUCrJ 8(Pt 3) 431-443 2021年5月1日
Advances in cryo-EM and ED with a cold-field emission beam and energy filtration -Refinements of the CRYO ARM 300 system in RIKEN SPring-8 center.

Saori Maki-Yonekura, Tasuku Hamaguchi, Hisashi Naitow, Kiyofumi Takaba, Koji Yonekura

Microscopy (Oxford, England) 70(2) 232-240 2021年3月24日
Further thermo-stabilization of thermophilic rhodopsin from Thermus thermophilus JL-18 through engineering in extramembrane regions.

Tomoki Akiyama, Naoki Kunishima, Sayaka Nemoto, Kazuki Kazama, Masako Hirose, Yuki Sudo, Yoshinori Matsuura, Hisashi Naitow, Takeshi Murata

Proteins 89(3) 301-310 2021年3月
Cryo-EM and ED with a Cold-Field Emission Beam and Energy Filtration

Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Tasuku Hamaguchi, Hisashi Naitow, Kiyofumi Takaba, Keisuke Kawakami

Applications of Microscopy in Materials and Life Sciences 233-241 2021年
Apple latent spherical virus structure with stable capsid frame supports quasi-stable protrusions expediting genome release.

Hisashi Naitow, Tasuku Hamaguchi, Saori Maki-Yonekura, Masamichi Isogai, Nobuyuki Yoshikawa, Koji Yonekura

Communications biology 3(1) 488-488 2020年9月4日
Erratum to "A new cryo-EM system for single particle analysis" [J. Struct. Biol. 207 (1) (2019) 40-48].

Tasuku Hamaguchi, Saori Maki-Yonekura, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Tetsuya Ishikawa, Koji Yonekura

Journal of structural biology 211(3) 107558-107558 2020年9月1日
A new cryo-EM system for single particle analysis.

Tasuku Hamaguchi, Saori Maki-Yonekura, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Tetsuya Ishikawa, Koji Yonekura

Journal of structural biology 207(1) 40-48 2019年7月1日
Structural and functional characterization of thermostable biocatalysts for the synthesis of 6-aminopurine nucleoside-5'-monophospate analogues.

Jon Del Arco, Elena Pérez, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Naoki Kunishima, Jesús Fernández-Lucas

Bioresource technology 276 244-252 2019年3月
Availability of NHS-biotin labeling to identify free protein lysine revealed by experiment and MD simulation.

Aiichiro Muraoka, Yoshinori Matsuura, Hisashi Naitow, Makoto Ihara, Naoki Kunishima

Analytical biochemistry 557 46-58 2018年9月15日
Ion-ion interactions in the denatured state contribute to the stabilization of CutA1 proteins.

Katsuhide Yutani, Yoshinori Matsuura, Hisashi Naitow, Yasumasa Joti

Scientific reports 8(1) 7613-7613 2018年5月16日
Strategy for Stabilization of CutA1 Proteins Due to Ion-Ion Interactions at Temperatures of over 100 °C.

Yoshinori Matsuura, Michiyo Takehira, George I Makhatadze, Yasumasa Joti, Hisashi Naitow, Naoki Kunishima, Katsuhide Yutani

Biochemistry 57(18) 2649-2656 2018年5月8日
Designing better diffracting crystals of biotin carboxyl carrier protein from Pyrococcus horikoshii by a mutation based on the crystal-packing propensity of amino acids.

Kazunori D Yamada, Naoki Kunishima, Yoshinori Matsuura, Koshiro Nakai, Hisashi Naitow, Yoshinori Fukasawa, Kentaro Tomii

Acta crystallographica. Section D, Structural biology 73(Pt 9) 757-766 2017年9月1日
Protein-ligand complex structure from serial femtosecond crystallography using soaked thermolysin microcrystals and comparison with structures from synchrotron radiation.

Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Kensuke Tono, Yasumasa Joti, Takashi Kameshima, Takaki Hatsui, Makina Yabashi, Rie Tanaka, Tomoyuki Tanaka, Michihiro Sugahara …

Acta crystallographica. Section D, Structural biology 73(Pt 8) 702-709 2017年8月1日

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MISC

タンパク質分子表面リジン残基のNHS-ビオチン修飾による実験的検出法とその有効性評価

村岡愛一郎, 松浦祥悟, 内藤久志, 伊原誠, 伊原誠, 国島直樹, 国島直樹

日本生化学会大会(Web) 91st 2018年
蛋白質の変性状態における荷電性残基の特徴:高温でのMD simulation

油谷克英, 松浦祥悟, 内藤久志, 城地保昌

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
結晶パッキング傾向に基づくタンパク質結晶の合理設計

国島直樹, 山田和範, 松浦祥悟, 仲井光四郎, 内藤久志, 深沢嘉紀, 富井健太郎

日本結晶学会年会講演要旨集 2017 2017年
荷電性残基の挙動をMD simulationにより評価することで明らかになった蛋白質の熱安定化に果たす静電相互作用の役割

松浦祥悟, 竹平美千代, 城地保昌, 内藤久志, 小野直子, 国島直樹, 油谷克英

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
ヒト由来Keap1と低分子化合物の複合体の結晶構造および分子動力学シミュレーションによる構造評価

佐藤幹也, 佐藤幹也, 佐分元, 佐分元, 田中智之, 松浦祥悟, 内藤久志, 下薗利恵子, 山本尚義, 井上秀樹 …

日本生化学会大会(Web) 88th 2015年
放射光生命科学を加速するタンパク質構造研究基盤

国島直樹, 油谷克英, 堀哲哉, 菅原道泰, 内藤久志, 田中智之, 松浦祥悟, 村岡愛一郎, 山本雅貴, 石川哲也

日本生化学会大会(Web) 85th 2012年
タンパク質X線結晶構造解析における結晶化支援ツール

田中智之, 国島直樹, 油谷克英, 内藤久志, 松浦祥悟, 村岡愛一郎, 菅原道泰

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
Crystal structural analysis of photosystem II with the novel method to reduce X-ray radiation damage

Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Akio Ohkuma, Shinya Saijyou, Hisashi Naitow, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 64 C293-C293 2008年
Current status and prospects of PSII structure analysis

Shen, JR, H Naitow, M Furuse, S Saijo, A Ohkuma, K Kawakami, T Henmi, N Kamiya

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 47 S9-S9 2006年
(404)イネ萎縮ウイルスの主要構成蛋白質の自己組織化機構(平成16年度日本植物病理学会大会講演要旨)

宮崎直幸, 内藤久志, 高潤一郎, 中川敦史, 月原冨武, 藤本瑞, 水野洋, 萩原恭二, 東貴彦, 渡邊康雄 …

日本植物病理學會報 70(3) 300 2004年8月25日
Crystallization and preliminary X-ray analysis of a bacterial lysozyme produced by Streptomyces globisporus

T Shiba, S Harada, H Sugawara, H Naitow, Y Kai, Y Satow

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 56 1462-1463 2000年11月
A low-resolution structure of rice dwarf virus determined by ab initio phasing

H Naitow, Y Morimoto, H Mizuno, H Kano, T Omura, M Koizumi, T Tsukihara

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 55 77-84 1999年1月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

X線結晶構造解析法による光合成系II膜蛋白質複合体の機能制御機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2009年

神谷信夫, 沈建仁, 池内昌彦, 中里勝芳, 梅名泰史, 宮原郁子, 逸見隆博, 内藤久志, 古瀬宗則

内藤久志

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