中村真也 (Shinya Nakamura) - マイポータル

基本情報

所属: 近畿大学薬学部創薬科学科講師

学位: 博士（薬学）(近畿大学)

J-GLOBAL ID: 201401038022008582
researchmap会員ID: B000235339

外部リンク: http://kaken.nii.ac.jp/d/r/10510109.ja.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学 / 計算化学

経歴

2018年4月 - 現在

近畿大学, 薬学部, 講師
2013年4月 - 2018年3月

近畿大学, 薬学部, 助教
2008年4月 - 2013年3月

近畿大学, 薬学部, 助手
2007年4月 - 2008年3月

株式会社菱化システム, 計算科学部

受賞

2017年11月

サラシア属植物普及協会会長賞, サラシア属植物由来化合物を起源とする計算化学による高活性化合物探索研究, サラシア属植物普及協会

中村真也
2016年9月

Journal of Computer Aided Chemistry論文賞, A Mini-review on Chemoinformatics Approaches for Drug Discovery, 日本化学会情報化学部会

川下理日人, 山崎広之, 宮尾知幸, 河合健太, 榮慶丈, 石川岳志, 森健一, 中村真也, 金子弘昌
2005年9月

SAR Promotion Award, 日本薬学会構造活性相関部会

中村真也

論文

Enhanced inhibitory activity of compounds containing purine scaffolds compared to protein kinase CK2α considering crystalline water

Keiji Nishiwaki, Shiori Nakatani, Shinya Nakamura, Kenji Yoshioka, Eri Nakagawa, Masato Tsuyuguchi, Takayoshi Kinoshita, Isao Nakanishi

RSC Medicinal Chemistry 2024年
Role of the thiosugar ring in the inhibitory activity of salacinol, a potent natural α-glucosidase inhibitor

Katsuki Takashima, Shinya Nakamura, Maiko Nagayama, Shinsuke Marumoto, Fumihiro Ishikawa, Weijia Xie, Isao Nakanishi, Osamu Muraoka, Toshio Morikawa, Genzoh Tanabe

RSC Advances 14(7) 4471-4481 2024年
Design, Synthesis and Structure–Activity Relationship Studies of Protein Kinase CK2 Inhibitors Containing a Purine Scaffold

Keiji Nishiwaki, Shinya Nakamura, Kenji Yoshioka, Eri Nakagawa, Shiori Nakatani, Masato Tsuyuguchi, Takayoshi Kinoshita, Isao Nakanishi

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 71(7) 558-565 2023年7月1日査読有り
Fragment Molecular Orbital based affinity prediction toward pyruvate dehydrogenase kinases: Insights into the charge transfer in hydrogen bond networks

Tatsuo Akaki, Shinya Nakamura, Keiji Nishiwaki, Isao Nakanishi

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 71(4) 299-306 2023年2月査読有り
System truncation accelerates binding affinity calculations with the fragment molecular orbital method: A benchmark study

Shinya Nakamura, Tatsuo Akaki, Keiji Nishiwaki, Midori Nakatani, Yuji Kawase, Yuki Takahashi, Isao Nakanishi

Journal of Computational Chemistry 44(7) 824-831 2022年11月29日査読有り筆頭著者
Bivalent binding mode of an amino-pyrazole inhibitor indicates the potentials for CK2α1-selective inhibitors.

Asaka Ikeda, Masato Tsuyuguchi, Daisuke Kitagawa, Masaaki Sawa, Shinya Nakamura, Isao Nakanishi, Takayoshi Kinoshita

Biochemical and biophysical research communications 630 30-35 2022年11月19日
Elongation of the side chain by linear alkyl groups increases the potency of salacinol, a potent α-glucosidase inhibitor from the Ayurvedic traditional medicine "Salacia," against human intestinal maltase.

Katsuki Takashima, Mika Sakano, Eri Kinouchi, Shinya Nakamura, Shinsuke Marumoto, Fumihiro Ishikawa, Kiyofumi Ninomiya, Isao Nakanishi, Toshio Morikawa, Genzoh Tanabe

Bioorganic & medicinal chemistry letters 33 127751-127751 2021年2月1日
Ligand compatibility of salacinol-type α-glucosidase inhibitors toward the GH31 family

Fumihiro Ishikawa, Aiko Hirano, Yuuto Yoshimori, Kana Nishida, Shinya Nakamura, Katsuki Takashima, Shinsuke Marumoto, Kiyofumi Ninomiya, Isao Nakanishi, Weijia Xie …

RSC Advances 11(6) 3221-3225 2021年
Activity, Binding, and Modeling Studies of a Reprogrammed Aryl Acid Adenylation Domain with an Enlarged Substrate Binding Pocket.

Fumihiro Ishikawa, Hinano Kitayama, Shinya Nakamura, Katsuki Takashima, Isao Nakanishi, Genzoh Tanabe

Chemical & pharmaceutical bulletin 69(2) 222-225 2021年
Precise Probing of Residue Roles by NRPS Code Swapping: Mutation, Enzymatic Characterization, Modeling, and Substrate Promiscuity of Aryl Acid Adenylation Domains

Fumihiro Ishikawa, Maya Nohara, Shinya Nakamura, Isao Nakanishi, Genzoh Tanabe

Biochemistry DOI: 10.1021/acs.biochem.9b00748 59(4) 351-363 2020年1月査読有り
An Engineered Aryl Acid Adenylation Domain with an Enlarged Substrate Binding Pocket

Fumihiro Ishikawa, Akimasa Miyanaga, Hinano Kitayama, Shinya Nakamura, Isao Nakanishi, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi, Genzoh Tanabe

Angewandte Chemie 131(21) 6980 2019年5月査読有り
An engineered aryl acid adenylation domain with a capacious active site microenvironment.

Ishikawa F, Miyanaga A, Kitayama H, Nakamura S, Nakanishi I, Kudo F, Eguchi T, Tanabe G

Angewandte Chemie (International ed. in English) 58(21) 6906-6910 2019年4月査読有り
Structure-Activity Relationships and Docking Studies of Hydroxychavicol and Its Analogs as Xanthine Oxidase Inhibitors.

Nishiwaki K, Ohigashi K, Deguchi T, Murata K, Nakamura S, Matsuda H, Nakanishi I

Chemical & pharmaceutical bulletin 66(7) 741-747 2018年7月査読有り
Synthesis of jaspine B regioisomers through palladium-catalyzed stereoselective tetrahydrofuran formation: Insight into the ligand recognition of sphingosine kinases

Miyagawa Takashi, Inuki Shinsuke, Honda Maho, Nakamura Shinya, Nakanishi Isao, Fujii Nobutaka, Oishi Shinya, Ohno Hiroaki

TETRAHEDRON 74(15) 1802-1809 2018年4月12日査読有り
Improvement of Pseudo-molecule Generation on Solvent Dipole Ordering Virtual Screening (SDO-VS)

Nakamura S, Kitayoshi H, Nakanishi I

Journal of Computer Aided Chemistry 18 149-158 2017年10月査読有り
An interaction-based approach for affinity prediction between antigen peptide and human leukocyte antigen using COMBINE analysis

Shinya Nakamura, Rie Ohmura, Isao Nakanishi

Chem-Bio Informatics Journal 17 93-102 2017年9月6日査読有り
Computational Study on the Comparative Differences in the Activity of Inhibitors of Human versus Rat Alpha-Glucosidase

Nakamura S, Shimada K, Tanabe G, Muraoka O, Nakanishi I

Open Journal of Medicinal Chemistry 7(2) 19-28 2017年6月査読有り
Identification of selective inhibitors of sphingosine kinases 1 and 2 through a structure-activity relationship study of 4-epi-jaspine B

Hiroaki Ohno, Maho Honda, Naoka Hamada, Jun Miyagaki, Akira Iwata, Kazuhiro Otsuki, Toru Maruyama, Shinya Nakamura, Isao Nakanishi, Shinsuke Inuki …

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 25(12) 3046-3052 2017年6月査読有り
Synthesis and Functional Characterization of Novel Sialyl LewisX Mimic-Decorated Liposomes for E-selectin-Mediated Targeting to Inflamed Endothelial Cells

Chanikarn Chantarasrivong, Akiharu Ueki, Ryutaro Ohyama, Johan Unga, Shinya Nakamura, Isao Nakanishi, Yuriko Higuchi, Shigeru Kawakami, Hiromune Ando, Akihiro Imamura …

MOLECULAR PHARMACEUTICS 14(5) 1528-1537 2017年5月査読有り
Hydrophobic substituents increase the potency of salacinol, a potent α-glucosidase inhibitor from Ayurvedic traditional medicine 'Salacia'.

Tanabe G, Xie W, Balakishan G, Amer MF, Tsutsui N, Takemura H, Nakamura S, Akaki J, Ninomiya K, Morikawa T …

Bioorganic & medicinal chemistry 24(16) 3705-3715 2016年8月査読有り

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MISC

Pyrazole骨格を有するCK2阻害剤の窒素スキャンによる構造活性・物性相関研究

奥村政輝, 中西伸介, 栗本泰奈, 西脇敬二, 中村真也, 大石真也, 大野浩章, 仲西功

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th 2020年
Pyrazole骨格を有するCK2阻害剤の構造活性相関研究~窒素置換による物性・活性改善の検討~

奥村政輝, 中西伸介, 栗本泰奈, 西脇敬二, 中村真也, 大石真也, 大野浩章, 仲西功

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 47th (CD-ROM) 2019年
RAGEを標的とした化学療法誘起末梢神経障害治療薬の探索 in silicoドラッグ・リプロファイリング/リポジショニングからのアプローチ

脇谷航平, 関口富美子, 坪田真帆, 中村真也, 仲西功, 川畑篤史

PAIN RESEARCH 33(2) 157-157 2018年6月
AzelastineはRAGEが関与する化学療法誘起末梢神経障害の発症を抑制する―ドラッグ・リプロファイリング/リポジショニング研究からの知見

脇谷航平, 関口富美子, 坪田真帆, 中村真也, 仲西功, 川畑篤史

日本薬理学会近畿部会プログラム・要旨集 133rd 44 2018年
プリン骨格を有する新規CK2阻害剤の構造活性相関研究

中川愛理, 吉岡賢司, 露口正人, 木下誉富, 中村真也, 西脇敬二, 仲西功

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 138th ROMBUNNO.27PA‐pm097 2018年
HydroxychavicolをシードとしたXO阻害化合物の探索研究

西脇敬二, 出口貴浩, 大東可苗, 畑悠佑, 中村真也, 村田和也, 松田秀秋, 仲西功

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 137th ROMBUNNO.27PA‐am038 2017年
クロスメタセシス反応を利用したスフィンゴシンキナーゼ阻害剤の創製研究

本田真歩, 宮垣潤, 吉光佑二, 岩田顕, 大槻和裕, 丸山透, 中村真也, 仲西功, 大石真也, 大野浩章 …

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 135th ROMBUNNO.28S-AM13 2015年
スフィンゴシンキナーゼ阻害活性を有するJaspine B誘導体の構造活性相関研究

本田真歩, 宮垣潤, 吉光佑二, 岩田顕, 大槻和裕, 丸山透, 中村真也, 仲西功, 大石真也, 大野浩章 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 32nd 119 2014年11月7日
サラシア属植物含有α‐グルコシダーゼ阻害活性成分salacinolおよびその類縁体の食後過血糖改善作用

森川敏生, 赤木淳二, 二宮清文, 木内恵里, 田邉元三, 仲西功, 中村真也, 吉川雅之, 村岡修

天然薬物の開発と応用シンポジウム講演要旨集 20th 75-77 2014年11月1日
アーユルベーダ天然薬物“サラシア”由来salacinolをシードとするα‐グルコシダーゼ阻害剤のin silico設計,合成及びin vivo評価

田邉元三, 松田侑也, 筒井望, 森川敏生, 赤木淳二, 二宮清文, 仲西功, 中村真也, 吉川雅之, 村岡修

天然薬物の開発と応用シンポジウム講演要旨集 20th 72-74 2014年11月1日
α‐グルコシダーゼ阻害活性物質salacinolおよびその誘導体の血糖値上昇抑制活性

森川敏生, 木内恵里, 赤木淳二, 二宮清文, 田邉元三, 仲西功, 中村真也, 吉川雅之, 村岡修

日本生薬学会年会講演要旨集 61st 235-235 2014年8月27日
結合自由エネルギーを指標としたProtein kinase CK2阻害剤のデザインと構造活性相関

中西伸介, 岡田裕規, 森脇寛智, 西脇敬二, 中村真也, 木下誉富, 大石真也, 大野浩章, 藤井信孝, 仲西功

ケモインフォマティクス討論会予稿集 2014 P08-P08 2014年
連続縮環型分子の修飾によるKSP阻害剤の溶解性改善

竹内智起, 大石真也, 金田雅仁, 大野浩章, 中村真也, 仲西功, 山根正敏, 澤田潤一, 浅井章良, 藤井信孝

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 31st 167 2013年11月1日
α‐グルコシダーゼ阻害剤,Salacinolの構造活性相関研究―トルイル酸型置換基による3’位疎水化の効果―

田邉元三, 中村真也, 筒井望, 赤木淳二, 森川敏生, 二宮清文, 仲西功, 吉川雅之, 村岡修

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 31st 112 2013年11月1日
α‐グルコシダーゼ阻害剤の酵素阻害活性におけるヒトとラットの種差の計算化学的解析

島田和子, 中村真也, 田邉元三, 村岡修, 仲西功

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 31st 84 2013年11月1日
サラシノールを基点とする新規α‐グルコシダーゼ阻害剤の構造活性相関および創出研究

中村真也, 高平和典, 島田和子, 田邉元三, 村岡修, 仲西功

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 41st 33-34 2013年10月21日
α‐Glucosidase阻害剤,Salacinolの構造活性相関研究:3’位脂溶性化が活性に及ぼす効果

田邉元三, 中村真也, 筒井望, 赤木淳二, 森川敏生, 二宮清文, 仲西功, 吉川雅之, 村岡修

食品薬学シンポジウム講演要旨集 5th 178-180 2013年10月1日
ヒトとラットにおけるα‐グルコシダーゼ阻害剤アカルボースの酵素阻害活性の種差の検討

島田和子, 中村真也, 高平和典, 田邉元三, 村岡修, 仲西功

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 133rd(2) ROMBUNNO.29AMB-164S-310 2013年3月
ヒトα‐グルコシダーゼ触媒ドメイン群と阻害剤の横断的構造活性相関

中村真也, 高平和典, 田邉元三, 村岡修, 仲西功

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 133rd(2) ROMBUNNO.29AMB-162-309 2013年3月
Salacinolをシードとするスルホニウム塩型α‐グルコシダーゼ阻害剤のin silico設計,合成及び評価:3’位アルキル化の効果

田邉元三, 國方雄介, 中村真也, 筒井望, 赤木淳二, 森川敏生, 二宮清文, 仲西功, 吉川雅之, 村岡修

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 133rd ROMBUNNO.29K-AM06S 2013年

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書籍等出版物

タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例

技術情報協会 (担当:分担執筆, 範囲:第６章第1節)

技術情報協会 2023年9月 (ISBN: 9784861049958)
大地からの贈り物サラシア

サラシア属植物普及協会 (担当:分担執筆, 範囲:第6章)

メディカルレビュー社 2018年2月 (ISBN: 9784779220104)

講演・口頭発表等

Improvement of Pseudo-molecule Generation on Solvent Dipole Ordering Virtual Screening (SDO-VS)

中村真也

第11回薬物の分子設計と開発に関する日中合同シンポジウム 2018年6月23日
計算化学初心者のための分子動力学計算講習会～WindowsPCで行うMD計算の環境作りと失敗しないための考え方～

中村真也

第8回ケモインフォマティクス入門講座 2017年11月11日招待有り
Solvent Dipole Ordering の創薬への応用研究

中村真也, 木村翔拓, 北吉駿, 仲西功

第10回分子科学討論会2016神戸 2016年9月15日
計算化学初心者のための分子動力学計算講習会～計算環境の構築と失敗しないための考え方～

中村真也

第3回ケモインフォマティクス入門講座 2016年5月21日招待有り
サラシア属植物由来化合物を起源とする計算化学による高活性化合物探索研究

中村真也

第6回サラシア属植物シンポジウム 2013年9月招待有り
サラシノール由来新規α-グルコシダーゼ阻害剤創出のためのMOEを用いたドラッグデザイン

中村真也

MOEフォーラム2013 2013年9月招待有り
COMBINE解析法の応用とその可能性

中村真也

2010年度第２回ＣＡＣフォーラムセミナー 2011年3月招待有り
MOEによるフラグメント分子軌道計算支援環境の開発

中村真也, 仲西功

日本コンピュータ化学会年会：2010秋季年会 2010年10月日本コンピュータ化学会年会：2010秋季年会
Binding mode prediction and analysis for salacinol derivatives as alpha-glucosidase inhibitors.

中村真也, 仲西功, 田邉元三, 森川敏生, 二宮清文, 村岡修, 高平和典, 坂野実加, 吉川雅之

18th European QSAR symposium 2010 2010年9月 18th European QSAR symposium 2010
MOEを用いたGAMESS/FMO解析支援ツールの開発

中村真也, 仲西功

MOEフォーラム2010 2010年7月 MOEフォーラム2010 招待有り
CK2阻害剤結合時の熱力学的プロファイル差に関する計算化学的考察

中村真也, 仲西功, 金光政幸, 仲庭哲津子, 木下誉富, 深田はるみ, 北浦和夫, 大野浩章, 鈴木大和, 平澤明, 辻本豪三

日本薬学会第130年会 2010年3月日本薬学会第130年会
salacia 属植物有効成分のα グルコシダーゼ結合様式の推定

高平和典, 中村真也, 田邉元三, 村岡修, 仲西功

日本薬学会第130年会 2010年3月日本薬学会第130年会
サラシア属植物含有成分salacinolのαグルコシダーゼへの結合シミュレーション

仲西功, 中村真也, 高平和典

第3回食品薬学シンポジウム 2009年11月第3回食品薬学シンポジウム
新規αグルコシダーゼ阻害剤探索へ向けたsalacinolの結合様式推定

仲西功, 中村真也, 高平和典

第59回日本薬学会近畿支部大会 2009年10月第59回日本薬学会近畿支部大会
α-グルコシダーゼと阻害剤との複合体の結晶化

仲西功, 中村真也, 大迫久晃, 山口亜佐子, 木下誉富, 多田俊治

第3回食品薬学シンポジウム 2009年10月第3回食品薬学シンポジウム
An approach for producing a CK2alpha inhibitor using X-ray, calculation and ITC.

関口雄介, 深田はるみ, 仲庭哲津子, 木下誉富, 多田俊治, 仲西功, 中村真也, 北浦和夫, 大野浩明, 鈴木大和, 平澤明, 辻本豪三

25th European Crystallographic Meeting 2009年8月 25th European Crystallographic Meeting
フラグメントMO法による構造最適化に対する電子相関の影響

井上雄貴, 中村真也, 仲西功, 北浦和夫

日本薬学会第129年会 2009年3月日本薬学会第129年会
An approach for producing a potent CK2？ inhibitor using X-ray and calorimetry analyses.

関口雄介, 深田はるみ, 仲庭哲津子, 木下誉富, 多田俊治, 仲西功, 中村真也, 北浦和夫, 大野浩明, 鈴木大和, 平澤明, 辻本豪三

第38回構造活性相関シンポジウム 2008年11月第38回構造活性相関シンポジウム
Docking-pose prediction by a receptor-based tailor-made scoring function

中村真也, 仲西功, 北浦和夫

8th China-Japan symposium on drug design and development 2008年10月 8th China-Japan symposium on drug design and development

共同研究・競争的資金等の研究課題

バーチャルスクリーニングの高精度化へ向けたCOMBINEスコア関数の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(スタートアップ) 2008年 - 2010年

中村真也

中村真也

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研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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