Nakata, Eiji

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Name
Nakata, Eiji
E-mail
nakataiae.kyoto-u.ac.jp
Affiliation
Kyoto University
Section
Institute of Advanced Energy
ORCID ID
0000-0001-9564-6805

Research Interests

 
 

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
May 2017
 - 
Today
Associate Professor, Institute of Advanced Energy, Kyoto University
 
Oct 2010
 - 
Apr 2017
Junior Associate Professor, Institute of Advanced Energy, Kyoto University
 

Awards & Honors

 
Nov 2013
Best Poster Award, 7th ISNM 2013
 
2010
第10回エンジニアリングフェスティバル優秀賞
 
2003
10. 生体機能関連部会若手の会最優秀ポスター賞
 
2003
International Symposium on Biomolecular Chemistry (ISBC) 2003 Poster Award
 

Published Papers

 
E. Nakata, H. Dinh, T.M. Nguyen, T. Morii
Methods in Enzymology   617 287-322   Mar 2019   [Refereed]
Furubayashi T, Ishida K, Kashida H, Nakata E, Morii T, Matsushita M, Fujiyoshi S
The journal of physical chemistry letters   10(19) 5841-5846   Oct 2019   [Refereed]
Ngo TA, Dinh H, Nguyen TM, Liew FF, Nakata E, Morii T
Chemical communications (Cambridge, England)   55(83) 12428-12446   Oct 2019   [Refereed]
Rational design of a DNA sequence-specific modular protein tag by tuning the alkylation kinetics
Nguyen, T.M.; Nakata, E.; Zhang, Z.; Saimura, M.; Dinh, H.; Morii, T.
Chem. Sci.   10 9315-9325   2019   [Refereed]
Dinh, H; Nakata, E.; Lin, P.; Saimura, M.; Ashida, H.; Morii, T.
Bioorg. Med. Chem.   27(22) 115120   Nov 2019   [Refereed]
Kurokawa T, Kiyonaka S, Nakata E, Endo M, Koyama S, Mori E, Tran NH, Dinh H, Suzuki Y, Hidaka K, Kawata M, Sato C, Sugiyama H, Morii T, Mori Y
Angewandte Chemie (International ed. in English)   57(10) 2586-2591   Mar 2018   [Refereed]
Covalent Bond Formation by Modular Adaptors to Locate Multiple Enzymes on a DNA Scaffold
Eiji Nakata, Shun Nakano, Arivazhagan Rajendran, Takashi Morii
Kinetic Control in Synthesis and Self-Assembly   163-183   Jan 2019   [Refereed]
Syntheses, X-ray crystal structures, emission properties and DFT calculations of monoprotonated polypyridines
N. Yoshikawa, S. Yamazaki, N. Kato, A. Kubota, M. Sawai, K. Noda, N. Kanehisa, T. Inoue, E. Nakata, H. Takashima
ChemistrySelect   4(1) 59-65   Jan 2019   [Refereed]
Nakano S, Tamura T, Das RK, Nakata E, Chang YT, Morii T
Chembiochem : a European journal of chemical biology   18(22) 2212-2216   Nov 2017   [Refereed]
Nguyen TM, Nakata E, Saimura M, Dinh H, Morii T
Journal of the American Chemical Society   139(25) 8487-8496   May 2017   [Refereed]
Nguyen TM, Nakata E, Saimura M, Dinh H, Morii T, Journal of the American Chemical Society, 2017, vol. 139, no. 25, pp. 8487-8496, 2017
Inaba Y, Watanabe K, Kitamatsu M, Nakata E, Harada A, Ohtsuki T,
Bioorganic, medicinal chemistry   25(15) 4212-4217   Aug 2017   [Refereed]
Inaba Y, Watanabe K, Kitamatsu M, Nakata E, Harada A, Ohtsuki T, Bioorganic & medicinal chemistry, 2017, vol. 25, no. 15, pp. 4212-4217, 2017
Yoshikawa, N. ;Yamazaki, S. ;Kato, N. ;Kanehisa, N. ;Inoue, T. ;Nakata, E. ;Takashima, H.
Journal of Molecular Structure   (1164) 164-171   2018   [Refereed]
Rajendran A, Nakata E, Nakano S, Morii T
Chembiochem : a European journal of chemical biology   18(8) 696-716   Feb 2017   [Refereed]
Tamura T, Nakano S, Nakata E, Morii T
Bioorganic & medicinal chemistry   25(6) 1881-1888   Mar 2017   [Refereed]
Tamura T, Nakano S, Nakata E, Morii T, Bioorganic & medicinal chemistry, 2017, vol. 25, no. 6, pp. 1881-1888, 2017
Nakata E, Yukimachi Y, Uto Y, Hori H, Morii T
Science and technology of advanced materials   17(Aug) 436-436   Aug 2016   [Refereed]
Ohtsuki T, Miki S, Kobayashi S, Haraguchi T, Nakata E, Hirakawa K, Sumita K, Watanabe K, Okazaki S
Scientific reports   5 18577   Dec 2015   [Refereed]
Ngo TA, Nakata E, Saimura M, Morii T
Journal of the American Chemical Society   138(9) 3021-3021   Feb 2016   [Refereed]
Ngo TA, Nakata E, Saimura M, Kodaki T, Morii T
Methods (San Diego, Calif.)   67(2) 142-150   May 2014   [Refereed]
A neutron dynamic therapy with a boron tracedrug UTX-51 using a compact neutron generator.
Hori H, Tada R, Uto Y, Nakata E, Morii T, Masuda K
Anticancer research   34(8) 4557-4560   Aug 2014   [Refereed]
Inoue M, Kaida S, Nakano S, Annoni C, Nakata E, Konno T, Morii T
Bioorganic & medicinal chemistry   22(22) 6471-6480   Nov 2014   [Refereed]
Nakata Eiji, Nazumi Yoshijiro, Yukimachi Yoshihiro, Uto Yoshihiro, Hori Hitoshi, Morii Takashi
Bull. Chem. Soc. Jpn.   88(2) 327-329   2015   [Refereed]
A fluorescent nanoprobe was designed based on self-assembled seminaphthorhodafluor (SNARF) derivatives (SNARF-OTBDPS) to detect the fluoride ions present in aqueous solutions. The tert-butyldiphenylsilyl (TBDPS) group in SNARF-OTBDPS showed good s...
Nakata E, Dinh H, Ngo TA, Saimura M, Morii T
Chemical communications (Cambridge, England)   51(6) 1016-1019   Jan 2015   [Refereed]
K. Matsumoto; E. Nakata; T. Tamura; I. Saito; Y. Aizawa; T. Morii
Chemistry - A European Journal   19(16) 5034-5040   Apr 2013   [Refereed]
S. Nakano; M. Fukuda; T. Tamura; R. Sakaguchi; E. Nakata; T. Morii
Journal of the American Chemical Society   135(9) 3465-3473   Mar 2013   [Refereed]
E. Nakata; Y. Yukimachi; Y. Nazumi; M. Uwate; H. Maseda; Y. Uto; T. Hashimoto; Y. Okamoto; H. Hori; T. Morii
RSC Advances   4(1) 348-357   Mar 2014   [Refereed]
M. Inoue; T. Konno; K. Tainaka; E. Nakata; H.-O. Yoshida; T. Morii
Biochemistry   51(7) 1396-1406   Feb 2012   [Refereed]
C. Annoni; E. Nakata; T. Tamura; F.F. Liew; S. Nakano; M.L. Gelmi; T. Morii
Organic and Biomolecular Chemistry   10(44) 8767-8769   Nov 2012   [Refereed]
E. Nakata; M. Koizumi; Y. Yamashita; Y. Uto; H. Hori
Advances in Experimental Medicine and Biology   737 301-306   2012   [Refereed]
E. Nakata; F.F. Liew; C. Uwatoko; S. Kiyonaka; Y. Mori; Y. Katsuda; M. Endo; H. Sugiyama; T. Morii
Angewandte Chemie - International Edition   51(10) 2421-2424   Mar 2012   [Refereed]
R. Tanaka; Y. Uto; K. Ohnaka; Y. Ohta; K. Yazaki; N. Umemoto; E. Nakata; H. Hori
Advances in Experimental Medicine and Biology   737 251-256   2012   [Refereed]
Boron tracedrugs challenge for neutron dynamic therapy
H. Hori; Y. Uto; E. Nakata
Anticancer Research   32(6) 2235-2239   Jun 2012   [Refereed]
F.F. Liew; H. Hayashi; S. Nakano; E. Nakata; T. Morii
Bioorganic and Medicinal Chemistry   19(19) 5771-5775   Oct 2011   [Refereed]
F.F. Liew; T. Hasegawa; M. Fukuda; E. Nakata; T. Morii
Bioorganic and Medicinal Chemistry   19(15) 4473-4481   Aug 2011   [Refereed]
S. Nakano; E. Nakata; T. Morii
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters   21(15) 4503-4506   Aug 2011   [Refereed]
Ngo Anh Tien Nakata, Eiji Morii, Takashi
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS   31 86-86   2012
Design, synthesis and destructive dynamic effects of BODIPY-containing and curcuminoid boron tracedrugs for neutron dynamic therapy
E. Nakata; M. Koizumi; Y. Yamashita; K. Onaka; Y. Sakurai; N. Kondo; O.N.O. Koji; U.T.O. Yoshihiro; H. Hori
Anticancer Research   31(7) 2477-2481   Jul 2011   [Refereed]
Effect of the Gc-derived macrophage-activating factor precursor (preGcMAF) on phagocytic activation of mouse peritoneal macrophages
Y. Uto; S. Yamamoto; R. Takeuchi; Y. Nakagawa; K. Hirota; H. Terada; S. Onizuka; E. Nakata; H. Hori
Anticancer Research   31(7) 2489-2492   Jul 2011   [Refereed]
E. Nakata; Y. Nazumi; Y. Yukimachi; Y. Uto; H. Maezawa; T. Hashimoto; Y. Okamoto; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters   21(6) 1663-1666   Mar 2011   [Refereed]
A. Ikeda; Y. Kawai; J.-I. Kikuchi; M. Akiyama; E. Nakata; Y. Uto; H. Hori
Organic and Biomolecular Chemistry   9(8) 2622-2627   Apr 2011   [Refereed]
C. Abe; Y. Uto; T. Nakae; Y. Shinmoto; K. Sano; H. Nakata; M. Teraoka; Y. Endo; H. Maezawa; S.-I. Masunaga; E. Nakata; H. Hori
Journal of Radiation Research   52(2) 208-214   2011   [Refereed]
Medicinal electronomics bricolage design of hypoxia-targeting antineoplastic drugs and invention of boron tracedrugs as innovative future-architectural drugs
H. Hori; Y. Uto; E. Nakata
Anticancer Research   30(9) 3233-3242   Sep 2010   [Refereed]
K. Yoshida, T. Sonobe, M. Bakr, T. Sakka, T. Sagawa, E. Nakata, T. Morii, T. Kii, K. Masuda, H. Ohgaki,
Kyoto University,Energy Procedia,9,483-490,2011      2011   [Refereed]
H. Nakashima; K. Ikkyu; K. Nakashima; K. Sano; Y. Uto; E. Nakata; H. Nagasawa; H. Sugimoto; Y. Shiro; Y. Nakagawa; H. Hori
Advances in Experimental Medicine and Biology   662 415-421   2010   [Refereed]
E. Nakata; Y. Yukimachi; Y. Nazumi; Y. Uto; H. Maezawa; T. Hashimoto; Y. Okamoto; H. Hori
Chemical Communications   46(20) 3526-3528   May 2010   [Refereed]
E. Nakata; Y. Yukimachi; Y. Nazumi; Y. Uto; T. Hashimoto; Y. Okamoto; H. Hori
Chemistry Letters   39(7) 734-735   Jul 2010   [Refereed]
A. Gautier; E. Nakata; G. Lukinavičius; K.-T. Tan; K. Johnsson
Journal of the American Chemical Society   131(49) 17954-17962   Dec 2009   [Refereed]
Recent progress in the construction methodology of fluorescent biosensors based on biomolecules (review)
Eiji Nakata, FongFong Liew, Shun Nakano and Takashi Morii
"Biosensors for Health, Environment and Biosecurity / Book 1", ISBN 978-953-307-155-8      2010   [Refereed]
E. Nakata; Y. Yukimachi; H. Kariyazono; S. Im; C. Abe; Y. Uto; H. Maezawa; T. Hashimoto; Y. Okamoto; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry   17(19) 6952-6958   Oct 2009   [Refereed]
H. Wang; E. Nakata; I. Hamachi
ChemBioChem   10(16) 2560-2577   Nov 2009   [Refereed]
Nakata, Eiji Yukimachi, Yoshihiro Nazumi, Yoshijiro Uto, Yoshihiro Hashimoto, Toshihiro Okamoto, Yasuko Hori, Hitoshi
CHEMISTRY LETTERS   39(7) 734-735   2010
M.A. Brun; K.-T. Tan; E. Nakata; M.J. Hinner; K. Johnsson
Journal of the American Chemical Society   131(16) 5873-5884   Apr 2009   [Refereed]
Y. Uto; D. Koyama; M. Otsuki; N. Otomo; T. Shirai; C. Abe; E. Nakata; H. Nagasawa; H. Hori
Advances in Experimental Medicine and Biology   645 109-114   2009   [Refereed]
S. Nakayama; Y. Uto; K. Tanimoto; Y. Okuno; Y. Sasaki; H. Nagasawa; E. Nakata; K. Arai; K. Momose; T. Fujita; T. Hashimoto; Y. Okamoto; Y. Asakawa; S. Goto; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry   16(16) 7705-7714   Aug 2008   [Refereed]
H. Nakashima; Y. Uto; E. Nakata; H. Nagasawa; K. Ikkyu; N. Hiraoka; K. Nakashima; Y. Sasaki; H. Sugimoto; Y. Shiro; T. Hashimoto; Y. Okamoto; Y. Asakawa; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry   16(18) 8661-8669   Sep 2008   [Refereed]
Constructuin of Tumor Implant Chick Embryo Model as a Next-generation Animal Model and the Evaluation of Tumor-growth Inhibitory Activity by x-ray Irradiation Using the Model
C. Abe, Y. Uto, Y. Endo, Y. Shinmoto, K. Nakashima, K Sano, Y. Sasaki, K. Minami, H. Maezawa, S. Masunaga, E. Nakata and H. Hori
Radiat Biol.Res.Commun、   44 233-241   2009   [Refereed]
Y. Uto; H. Nagasawa; C.-Z. Jin; S. Nakayama; A. Tanaka; S. Kiyoi; H. Nakashima; M. Shimamura; S. Inayama; T. Fujiwara; Y. Takeuchi; Y. Uehara; K.L. Kirk; E. Nakata; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry   16(11) 6042-6053   Jun 2008   [Refereed]
T. Nakae; Y. Uto; M. Tanaka; H. Shibata; E. Nakata; M. Tominaga; H. Maezawa; T. Hashimoto; K.L. Kirk; H. Nagasawa; H. Hori
Bioorganic and Medicinal Chemistry   16(2) 675-682   Jan 2008   [Refereed]
Y. Koshi; E. Nakata; M. Miyagawa; S. Tsukiji; T. Ogawa; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   130(1) 245-251   Jan 2008   [Refereed]
E. Nakata; H. Wang; I. Hamachi
ChemBioChem   9(1) 25-28   Jan 2008   [Refereed]
T. Anai; E. Nakata; Y. Koshi; A. Ojida; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   129(19) 6232-6239   May 2007   [Refereed]
E. Nakata; S. Tsukiji; I. Hamachi
Bulletin of the Chemical Society of Japan   80(7) 1268-1279   Jul 2007   [Refereed]
Effect of metal ions on the radical-scavenging rates of hydroquinones
Nakanishi Ikuo, Uto Yoshihiro, Ohkubo Kei, Shirai Seiji, Nakata Eiji, Manda Sushma, Nagasawa Hideko, Hori Hitoshi, Fukuhara Kiyoshi, Okuda Haruhiro, Ikota Nobuo, Fukuzumi Shunichi, Anzai Kazunori, Ozawa Toshihiko
YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN   128 69   2008   [Refereed]
Y. Koshi; E. Nakata; H. Yamane; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   128(32) 10413-10422   Aug 2006   [Refereed]
Y. Koshi; E. Nakata; I. Hamachi
Trends in Glycoscience and Glycotechnology   19(107) 121-131   May 2007   [Refereed]
Y. Takaoka; H. Tsutsumi; N. Kasagi; E. Nakata; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   128(10) 3273-3280   Mar 2006   [Refereed]
K. Honda; E. Nakata; A. Ojida; I. Hamachi
Chemical Communications   (38) 4024-4026   Oct 2006   [Refereed]
E. Nakata; Y. Koshi; E. Koga; Y. Katayama; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   127(38) 13253-13261   Sep 2005   [Refereed]
Y. Koshi; E. Nakata; I. Hamachi
ChemBioChem   6(8) 1349-1352   Aug 2005   [Refereed]
Lectin functionalization by organic chemistry - Development of glycol-biosensor using P-PALM -
Y. Koshi; E. Nakata; M. Miyagawa; I. Hamachi
Polymer Preprints, Japan   55(2) 5276-5277   2006   [Refereed]
E. Nakata; T. Nagase; S. Shinkai; I. Hamachi
Journal of the American Chemical Society   126(2) 490-495   Jan 2004   [Refereed]
T. Nagase; E. Nakata; S. Shinkai; I. Hamachi
Chemistry - A European Journal   9(15) 3660-3669   Aug 2003   [Refereed]
Photoinduced elecron-transfer reactions of tris(2,2’-bipyridine)ruthenium(II)-based carbonic anhydrase inhibitors tethering plural binding sites
M. Suwa, N. Imamura, P. Awano, E. Nakata, H. Takashima
Journal of Physical Organic Chemistry   31(9)    Apr 2018   [Refereed]

Misc

 
小西宏明, DINH Huyen, 脇阪智彦, 中田栄司, 仲野瞬, 森井孝
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   99th ROMBUNNO.4G4‐08   Mar 2019
中田栄司, 森井孝
日本物理学会講演概要集(CD-ROM)   73(1) ROMBUNNO.24pK605‐4-3048   Mar 2018
中田栄司, 森井孝
バイオサイエンスとインダストリー   76(1) 46‐48-48   Jan 2018
Bakr Mahmoud, 増田 開, 高橋 佳之, 中田 栄司, 宇都 義浩, 中村 教泰, Taleyarkhan Rusi P.
RUDGS : 研究成果報告書   61-64   2018
中田栄司
バイオマテリアル   34(3) 198‐203-203   Jul 2016
蛍光プローブは、現在の生物学的研究において欠かすことのできないツールとなっている。有機小分子の蛍光プローブは、一分子の蛍光プローブが、標的と反応することを前提に設計されてきており、望みの機能を実現する蛍光プローブの論理的な設計法が確立されてきている。一方、近年蛍光色素の集合状態と分散状態の変化を利用した蛍光プローブが新たなる蛍光制御方法として注目を集めてきている。本稿では、これについて概説した上で、我々が見出した自己集合化を利用した蛍光プローブの制御方法とその活用法について紹介する。(著者抄録)
田嶋竣介, 中田栄司, 才村正幸, 森井孝
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   97th ROMBUNNO.3C3‐35   Mar 2017
小西宏明, 中田栄司, 仲野瞬, 森井孝
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   97th ROMBUNNO.4C4‐45   Mar 2017
音増感剤を用いた超音波依存的なペプチドの細胞質内導入法
大槻 高史, 稲葉 優樹, 北松 瑞生, 中田 栄司, 原田 敦史, 渡邉 和則
日本DDS学会学術集会プログラム予稿集   33回 172-172   Jun 2017
中田 栄司
バイオマテリアル = Journal of Japanese Society for Biomaterials : 生体材料   34(3) 198-203   Jul 2016
堀 均, 宇都 義浩, 中田 栄司
京都大学原子炉実験所学術講演会報文集   46(0) 37-39   Jan 2012
Novel strategy to control fluorescent property of asymmetric xanthene scaffold toward rationally designable fluorescent probe
E. Nakata, T. Morii
ISBC2012,Kanagawa,2012.11.28-30      2012   [Refereed]
堀 均, 宇都 義浩, 中田 栄司
四国医学雑誌   67(1) 7-14   Apr 2011
Hypoxia is now considered a fundamentally important characteristic of the tumor microenvironment. A discovery of the hypoxia inducible factor(HIF)has led to a rapidly increasing understanding of the molecular mechanisms involved in tumor hypoxia. ...
堀 均, 宇都 義浩, 中田 栄司
Shikoku acta medica   67(1) 7-14   Apr 2011
生体の低酸素応答と疾患治療への応用 低酸素標的薬剤のメディシナル・ブリコラージュと次世代医薬品ボロントレースドラッグの創生
堀 均, 宇都 義浩, 中田 栄司
四国医学雑誌   67(1-2) 86-86   Apr 2011
【がん放射線治療の現状と今後に向けて:総説】 がんの特異的な検出を目指した蛍光イメージング法の最近の展開
中田 栄司, 森井 孝, 宇都 義浩, 堀 均
放射線生物研究   46(3) 234-246   Sep 2011
蛍光プローブを用いたイメージング法では、癌特異的なトリガーによりシグナル変化が誘起されるようデザインすることで、癌組織と正常組織の質的な違いをイメージングすることが可能である。癌の蛍光イメージングとして、癌特有のバイオマーカーを標的とした分子標的イメージング、癌特有の代謝を指標とした代謝活性イメージング、癌に特有な環境で活性化される代謝を利用した低酸素環境イメージングについて概説した。
【21世紀の放射線による先端医療と研究のさらなる発展を目指して】 追い風の臨床放射線、向かい風の基礎放射線 クリーンベンチの風はベッドサイドに届くのか? トランスレーショナル研究 メディシナル・ブリコラージュ ハイポキシアを標的とした制がん剤の分子設計
堀 均, 宇都 義浩, 中田 栄司
癌の臨床   55(12) 865-873   Aug 2010
実験技術講座 次世代動物実験系としての腫瘍移植鶏卵の構築と放射線照射による腫瘍成長阻害活性
安部 千秋, 宇都 義浩, 遠藤 良夫, 新元 優也, 中島 宏一郎, 佐野 圭一郎, 佐々木 有紀, 皆巳 和賢, 前澤 博, 増永 慎一郎, 中田 栄司, 堀 均
放射線生物研究   44(2) 233-241   Jun 2009
【病態の理解と治療をめざす 癌と微小環境 癌幹細胞、浸潤・転移、血管新生のメカニズムと環境応答を標的とした治療・創薬の新展開】 微小環境応答と癌治療 ハイポキシアを標的とした抗癌剤
宇都 義浩, 中田 栄司, 永澤 秀子, 堀 均
実験医学   27(2) 305-311   Feb 2009
HIF-1による癌細胞の低酸素適応機構、すなわち血管新生、転移・浸潤、解糖系代謝亢進、増殖因子産生、薬剤耐性などが分子レベルで解明されるにつれ、低酸素が癌の基本環境であるだけでなく、癌の難治化の一因であることは疑う余地がなくなっている。こうした背景からこの癌のサバイバル戦略を標的とした薬剤の開発が目下、精力的に進められている。そこで本稿では、低酸素環境における癌の適応応答に対して抗腫瘍効果を発揮する分子標的薬剤や、低酸素環境特異的に抗腫瘍効果を発揮する低酸素増感剤についてメディシナルケミス...
解糖系代謝のエネルギー源となる単糖に対するがん細胞特異性 糖ハイブリッド低酸素細胞放射線増感剤/制癌剤の分子設計 Pharmacokinetic drug designのすすめ
宇都 義浩, 中江 崇, 永澤 秀子, 中田 栄司, 堀 均
放射線生物研究   43(1) 68-79   Mar 2008
ZHOU Shanlai, 山根裕樹, 中田栄司, 浜地格
日本化学会講演予稿集   85th(2) 1251   Mar 2005
中田栄司, 古志洋一郎, 古賀絵里奈, 片山佳樹, 浜地格
日本化学会講演予稿集   85th(2) 1213   Mar 2005
穴井孝浩, 笠置典之, 中田栄司, 浜地格
日本化学会講演予稿集   85th(2) 1214   Mar 2005
古志洋一郎, 竹本洋己, 中田栄司, 穴井孝浩, 浜地格
日本化学会講演予稿集   85th(2) 1213   Mar 2005
古志洋一郎, 中田栄司, 浜地格
現代化学   (407) 55-60   Feb 2005
中田栄司, 古志洋一郎, 竹本洋己, 浜地格
バイオ・高分子シンポジウム講演要旨集   14th 37-38   Jul 2004
古志洋一郎, 中田栄司, 竹本洋己, 浜地格
日本化学会講演予稿集   84th(2) 1077   Mar 2004
中田栄司, 古志洋一郎, 浜地格
日本化学会講演予稿集   84th(2) 1078   Mar 2004
古志洋一郎, 中田栄司, 竹本洋己, 浜地格
生体機能関連化学シンポジウム講演要旨集   18th 510-511   Oct 2003
中田栄司, 浜地格
工業材料   51(6) 61-64   Jun 2003
竹本洋己, 清中茂樹, 中田栄司, 浜地格
日本化学会講演予稿集   83rd(2) 979   Mar 2003
中田栄司, 長瀬剛, 新海征治, 浜地格
日本化学会講演予稿集   83rd(2) 979   Mar 2003
1.\tEquipment of Artificial Receptor with a Lectin by P-PALM for Construction of Fluorescent Oligosaccharide –Biosensors
Eiji Nakata, Tsuyoshi Nagase, Seiji Shinkai, Itaru Hamachi
Biomolecular Chemistry Proc. ISBC 2003, pp. 288-289, 2003.      2003   [Refereed]
中田栄司, 長瀬剛, 新海征治, 浜地格
日本化学会講演予稿集   82nd 67   Sep 2002
中田栄司, 長瀬剛, 浜地格, 新海征治
生体機能関連化学シンポジウム講演要旨集   16th 138-139   Sep 2001
笠置典之, 清中茂樹, 中田栄司, 浜地格, 新海征治
生体機能関連化学シンポジウム講演要旨集   15th 308-309   Sep 2000
中田栄司, 山田康弘, 浜地格, 新海征治
日本化学会講演予稿集   78th(2) 766   Mar 2000
中田栄司, 浜地格, 新海征治
日本化学会講演予稿集   78th(2) 766   Mar 2000
中田栄司, 築地真也, 浜地格, 新海征治
日本化学会講演予稿集   76th(2) 1250   Mar 1999

Books etc

 
酵素を“1分子ずつ”狙った場所に配置する -多段階反応を効率的に進行させる分子コンビナートをつくる
Eiji Nakata, Takashi Morii
Academist Journal   2018   

Conference Activities & Talks

 
DNAオリガミを鋳型にしたリポソームの形成
小西宏明・DINH Huyen・脇坂智彦・中田栄司・仲野瞬・森井 孝
日本化学会第99春季年会   2019   日本化学会
Design of fluorescent sensor detecting nitric oxide using autofluorescent protein
TAJIMA, Shunsuke; NAKATA, Eiji; SAKAGUCHI, Reiko; SAIMURA, Masayuki; MORI, Yasuo; MORII, Takashi
日本化学会第99春季年会   2019   日本化学会
Reaction of enzyme cascades assembled in 3D DNA nanostructure
LIN, Peng; DINH, Huyen; THANG, Minh Nguyen; NAKATA, Eiji; MORII, Takashi
日本化学会第99春季年会   2019   日本化学会
Enhanced enzymatic activity with a packed assembling of enzyme
DINH, Huyen; NAKATA, Eiji; KINOSHITA, Masahiro; MORII, Takashi
日本化学会第99春季年会   2019   日本化学会
Tuning the reactivity of crosslink formation for sequence-selective DNA-protein conjugation
ZHANG, Zhengxiao; NAKATA, Eiji; THANG, Nguyen Minh; MORII, Takashi
日本化学会第99春季年会   2019   日本化学会
酵素を“1分子ずつ”狙った場所に配置する―生物から学んだ分子コンビナートへの挑戦― [Invited]
中田栄司・森井 孝
東京農業大学セミナー   2019   東京農業大学
Construction of nitric oxide sensor based on fluorescent protein
Shunsuke Tajima, Eiji Nakata, Reiko Sakaguchi, Masayuki Saimura, Yasuo Mori, Takashi Morii
1st Japan-India Bilateral Symposium on Energy and Environmental Science   2019   Indian Institute of Science, Bangalore, India
DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on DNA scaffold [Invited]
Eiji Nakata, Takashi Morii
理研・CSRS融合研究セミナー   2019   理化学研究所
Dual sensing of ATP and ADP by fluorescent ribonucleopeptide sensors
Shun Nakano, Musashi Shimizu, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
Design of sequence specific modular adaptors by tuning the reactivity of protein-tag substrates
Zhengxiao Zhang, Eiji Nakata, Thang Minh Nguyen, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
DNA Catenane and Rotaxane Inside a DNA Origami Frame
Arivazhagan Rajendran, Seo-jeong Park, Eiji Nakata, Youngjoo Kwon, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
Nanoliposome enclosing proteins on DNA scaffold
Hiroaki Konishi, Huyen Dinh, Tomohiko Wakisaka, Eiji Nakata, Shun Nakano, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
Assembling cascade enzymes on a 3D DNA nanostructure
Peng LIN, Huyen Dinh, Nguyen Minh Thang, Eiji Nakata, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
DNA Binding Adaptors for Locating Multiple Enzymes on DNA scaffold
Eiji Nakata, Thang Minh Nguyen, Zhengxiao Zhang, Huyen Dinh, Peng Lin, Masayuki Saimura, Takashi Morii
ISNAC2018   2019   日本核酸化学会
Integration of Topologically-Interlocked Functional Structures With a DNA Nanostructure
Arivazhagan Rajendran・Seo-jeong Park・Eiji Nakata・Youngjoo Kwon・Takashi Morii
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
Construction of a 3D DNA nanostructure for assembling enzyme cascade reaction
LIN Peng・Dinh Huyen・ Thang Minh Nguyen・Nakata Eiji・Morii Takashi
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
DNAナノ構造体を鋳型にしたリポソーム形成
小西 宏明・DINH Huyen・中田 栄司・仲野 瞬・森井 孝
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
等温滴定カロリメトリーによるハロ酸脱ハロゲン化酵素の酵素反応機構解析
小澤 拓実・中村 卓・森井 孝・中田 栄司
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
Design of sequence specific modular adaptors by tuning the reactivity of protein-tag substrate
張 正宵・中田 栄司・Thang Minh Nguyen・森井 孝
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
蛍光タンパク質を用いた一酸化窒素センサーの機能評価
田嶋 竣介・坂口 怜子・才村 正幸・中田 栄司・森 泰生・森井 孝
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
ATPとADPを高選択的に検出する蛍光性リボヌクレオペプチドセンサー
仲野 瞬・森井 孝
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2019   日本化学会―生体機能関連化学部会、バイオテクノロジー部会
Assembly of Protein of Interest on DNA Origami scaffold
ASIF, Mashal; DINH, Huyen; NAKATA, Eiji and MORII, Takashi
2018アムジェン・スカラーズ・ジャパン・シンポジウム   2019   アムジェン・スカラーズ・ジャパン
DNAナノ構造体上に複数種類の酵素を配置した分子コンビナート [Invited]
中田栄司・森井 孝
講演会#121   2019   東京大学
酵素連続反応の効率化へ向けたナノ空間区画化技術の開発
仲野瞬、小西宏明、Dinh Huyen、中田栄司、森井孝
2018年度微細構造解析プラットフォームシンポジウム   2019   国立研究開発法人 物質・材料研究機構 微細構造解析プラットフォーム推進室
The rational design of latent ratiometric fluorescent pH probes based on self-assembled SNARF derivatives
E. Nakata
7th Japan-taiwan nanomedicine symposium   2016   
Expansion of modular adaptors for covalently locating a number of proteins on DNA nanostructure
E. Nakata, T.M. Nguyen, M. Saimura, T. Morii
ICIRS16   2016   
高効率な多段階酵素反応を実現するDNAナノリアクターの創製 [Invited]
中田栄司
新化学技術研究奨励賞受賞講演会   2016   
DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on DNA Scaffold [Invited]
E. Nakata, T. Morii
ISBC2017, The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry   2017   
Construction of Topologically Interlocked DNAs Inside a DNA Scaffold
A. Rajendran, S.-J. Park, E. Nakata, Y. Kwon, T. Morii
The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry /The 1st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry   2017   
Assembling enzymes on a DNA scaffold
E. Nakata, T. Morii
Asian 3 Roundtable on Nucleic Acids and Chemical Probe Research Hub   2016   
Evaluation of orthogonal modular adaptors for assembling proteins on DNA scaff old
T.M. Nguyen, E. Nakata, M. Saimura, T. Morii
The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry   2016   
Activity of the assembled enzyme on DNA scaff old
H.T.T. Dinh, E. Nakata, T.A. Ngo, T. Morii
The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry   2016   
The efficiency of cascade reactions by spatially organized enzymes on DNA scaffold
E. Nakata, T.A. Ngo, M. Saimura, T. Morii
The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry   2016   
DNAナノ構造体上で実現した高効率な多段階物質変換システム [Invited]
中田栄司
2016年度化学,生物素材研究開発奨励賞受賞講演   2016   
Orthogonal Modular Adaptors to Locate Three Enzymes for Cascade Reaction on DNA Scaffold
T. M. Nguyen, E. Nakata, M. Saimura, H. Dinh, T. Morii
The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry /The 1st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry   2017   
Selection of biosensors from a library of fluorescent ribonucleopeptide receptors constructed from a synthetic fluorophore library
S. Nakano, T. Tamura, Das Raj Kumar,E. Nakata, Y.T. Chang, T. Morii
The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry /The 1st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry   2017   
Reaction of enzymes in the ordered assembly states on DNA nanostructures
H. Dinh, E. Nakata, T. Morii
The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry /The 1st Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry   2017   
Assembly of multiple enzymes on a DNA scaffold
T.M. Nguyen, E. Nakata, M. Saimura, H. Dinh, T. Morii
ISBC2017, The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry   2017   
DNA rotaxane and catenane inside a DNA nanostructure
A. Rajendran, S-J. Park, E. Nakata, Y. Kwon, T. Morii
ISBC2017, The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry   2017   
The rational design strategy for latent ratiometric fluorescent pH probes based on the self-assembled SNARF derivatives
E. Nakata
10th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2016)   2016   
The rational design strategy for latent ratiometric fluorescent pH probe [Invited]
E. Nakata
ISAMR   2015   
Orthogonal assembly of RuBisCO and carbonic anhydrase on a DNA nanoscaffold
H. Dinh, E. Nakata, T.A. Ngo, T. Morii
2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2015)   2015   
Construction of DNA nanotubes toward the three-dimensionally constrained assembly of enzymes
K. Nishida, H. Dinh, E. Nakata, T. Morii
ISNAC2015   2015   
Expansion of modular adaptors for covalently locating multiple enzymes on DNA nanoscaffold
T.M. Nguyen, E. Nakata, M. Saimura, T. Morii
ISNAC2015   2015   
Site-specific covalent modification of individual protein molecule on DNA nanoscaffold
E. Nakata, H. Dinh, T.M. Nguyen, T.A. Ngo, M. Saimura, T. Morii
ISNAC2015   2015   
The rational design of latent ratiometric fluorescent pH probes based on self-assembled SNARF derivatives [Invited]
E. Nakata
3nd International Symposium on Nanomedicine Molecular Science Toward Medical Biophysics   2015   
Rational design of latent ratiometric fluorescent pH probes based on self-assembled SNARF derivatives
Eiji Nakata, Takashi Morii
2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2015)   2015   
Development of various types of protein adaptors to locate a single molecule of functional protein on molecular switchboard
Tien Anh Ngo, Eiji Nakata, Huyen Dinh, Thang Minh Nguyen, Masayuki Saimura, Takashi Morii
2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2015)   2015   
Development of modular adaptors to covalently locate multiple enzymes on DNA nanoscaffold
Thang Minh Nguyen, Eiji Nakata, Huyen Dinh,Tien Anh Ngo, Masayuki Saimura, Takashi Morii
2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2015)   2015   
FUJI KOSHIN, TADA RYU, NAKATA EIJI, MASUDA KAI, MORII TAKASHI, UTO YOSHIHIRO
日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)   2015   
Development of self-assembled fluorescent nano probe based on asymmetric xanthene scaffold for detecting enzymatic activity [Invited]
E. Nakata, T. Morii
The 4th Taiwan-Japan Symposium on Nanomedicine,Taiwan,2013.1.13-14   2013   
Enzymatic activatable fluorescent nano-probe [Invited]
E. Nakata, T. Morii
Internaitonal Symposium on Nanomedicine Molecular Science,Kobe,2013.3.10   2013   
Deverlopment of an Adaptor for Locating Functional Proteins on DNA Nanoarchitechtures
T.A. Ngo, E. Nakata, T. Morii
The 4th International Symposium of Kyoto University Global COE Program,Thailand,2012.5.22-23   2012   
DNA-binding Proteins as the Adaptor for Locating Functional Proteins on DNA Nanostructure
T.A. Ngo,中田栄司,森井孝
第59回日本生化学会近畿支部例会,京都大学宇治キャンパス,2012.5.19   2012   
Development of the attachment technology of functional proteins on DNA origami
.A. Ngo, E. Nakata, F.F. Liew, Y. Nishiguchi, T. Morii
11th iCeMS International Symposium,Kyoto,2011.12.6   2011   
Development of the immobilization technology of functional proteins on DNA origami
E. Nakata, C. Uwatoko, F.F. Liew, S. Kiyonaka, Y. Mori, Y. Katsuta, M. Endo, H. Sugiyama, T. Morii
The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry,Hokkaido,2011.11.9-11   2011   
Facile conversion of RNA aptamers to modular fluorescent sensors
T. Tamura, S. Nakano E. Nakata, T. Morii
The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry,Hokkaido,2011.11.9-11   2011   
Sequence selective RNA detection by metastable PNA/RNA fluorescence probe
K. Matsumoto, E. Nakata, I. Saito, T. Morii
The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry,Hokkaido,2011.11.9-11   2011   

Research Grants & Projects

 
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: Grants-in-Aid for Scientific Research(若手研究(B))
Project Year: 2009 - 2011    Investigator(s): Eiji NAKATA
Rational design methodology of the novel fluorescent probe to detect the enzymatic activity not only in test tube but also in cell was developed. For example, the fluorescent probe which could be activated in the bioreductive condition can detect ...