中村直俊 (Naotoshi Nakamura) - マイポータル

基本情報

所属: 横浜市立大学データサイエンス学部教授

研究者番号: 30554472
J-GLOBAL ID: 201801017354963947
researchmap会員ID: B000306357

「細胞の不均一性」「個体の不均一性」をキーワードとして、生命科学・医学のさまざまな階層にわたる現象の解明、およびそのための手法開発に取り組んでいます。機械学習をはじめとするデータ駆動型解析の強力さに日々感心させられていますが、現代数学の知見や生物学・医学のドメイン知識をそこにうまく取り込むことで研究が飛躍的に進展すると考えており、そのような研究を目指しています。

経歴

2025年4月 - 現在

横浜市立大学, データサイエンス学部, 教授

論文

Prediction of graft loss in living donor liver transplantation during the early postoperative period.

Raiki Yoshimura, Naotoshi Nakamura, Takeru Matsuura, Takeo Toshima, Takasuke Fukuhara, Kazuyuki Aihara, Katsuhito Fujiu, Shingo Iwami, Tomoharu Yoshizumi

PLoS computational biology 21(11) e1013734 2025年11月24日
Longitudinal antibody titers measured after COVID-19 mRNA vaccination can identify individuals at risk for subsequent infection.

Hyeongki Park, Naotoshi Nakamura, Sho Miyamoto, Yoshitaka Sato, Kwang Su Kim, Kosaku Kitagawa, Yurie Kobashi, Yuta Tani, Yuzo Shimazu, Tianchen Zhao …

Science translational medicine 17(816) eadv4214 2025年9月17日
Modeling lesion transition dynamics to clinically characterize patients with clade I mpox in the Democratic Republic of the Congo.

Takara Nishiyama, Fuminari Miura, Yong Dam Jeong, Naotoshi Nakamura, Hyeongki Park, Masahiro Ishikane, Shotaro Yamamoto, Noriko Iwamoto, Michiyo Suzuki, Ayana Sakurai …

Science translational medicine 17(805) eads4773 2025年7月2日
Stratifying and predicting progression to acute liver failure during the early phase of acute liver injury.

Raiki Yoshimura, Masatake Tanaka, Miho Kurokawa, Naotoshi Nakamura, Takeshi Goya, Koji Imoto, Motoyuki Kohjima, Katsuhito Fujiu, Shingo Iwami, Yoshihiro Ogawa

PNAS nexus 4(2) pgaf004 2025年2月
Prediction of cccDNA dynamics in hepatitis B patients by a combination of serum surrogate markers.

Kwang Su Kim, Masashi Iwamoto, Kosaku Kitagawa, Hyeongki Park, Sanae Hayashi, Senko Tsukuda, Takeshi Matsui, Masanori Atsukawa, Kentaro Matsuura, Natthaya Chuaypen …

PLoS computational biology 21(1) e1012615 2025年1月
Gravitational change-induced alteration of the vestibular function and gene expression in the vestibular ganglion of mice.

Murat Bazek, Motoya Sawa, Kazuhiro Horii, Naotoshi Nakamura, Shingo Iwami, Chia-Hsien Wu, Tsuyoshi Inoue, Fumiaki Nin, Chikara Abe

The journal of physiological sciences : JPS 74(1) 44-44 2024年9月18日
Modeling and predicting individual variation in COVID-19 vaccine-elicited antibody response in the general population.

Naotoshi Nakamura, Yurie Kobashi, Kwang Su Kim, Hyeongki Park, Yuta Tani, Yuzo Shimazu, Tianchen Zhao, Yoshitaka Nishikawa, Fumiya Omata, Moe Kawashima …

PLOS digital health 3(5) e0000497 2024年5月
Genetic intratumour heterogeneity and clonal evolution in extramammary Paget's disease.

Kenichiro Tanaka, Ikko Kajihara, Kazuro Shimokawa, Naotoshi Nakamura, Yudo Kusaba, Ryoko Sakamoto, Saki Maeda-Otsuka, Saori Yamada-Kanazawa, Soichiro Sawamura, Hisashi Kanemaru …

European journal of dermatology : EJD 34(2) 182-192 2024年4月1日
Multiscale modeling of HBV infection integrating intra- and intercellular viral propagation to analyze extracellular viral markers.

Kosaku Kitagawa, Kwang Su Kim, Masashi Iwamoto, Sanae Hayashi, Hyeongki Park, Takara Nishiyama, Naotoshi Nakamura, Yasuhisa Fujita, Shinji Nakaoka, Kazuyuki Aihara …

PLoS computational biology 20(3) e1011238 2024年3月
Infectious virus shedding duration reflects secretory IgA antibody response latency after SARS-CoV-2 infection.

Sho Miyamoto, Takara Nishiyama, Akira Ueno, Hyeongki Park, Takayuki Kanno, Naotoshi Nakamura, Seiya Ozono, Kazuyuki Aihara, Kenichiro Takahashi, Yuuki Tsuchihashi …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(52) e2314808120 2023年12月26日
Modeling COVID-19 vaccine booster-elicited antibody response and impact of infection history.

Takara Nishiyama, Yuichiro Miyamatsu, Hyeongki Park, Naotoshi Nakamura, Risa Yokokawa Shibata, Shingo Iwami, Yoji Nagasaki

Vaccine 41(52) 7655-7662 2023年12月18日
Antibody Profiling of Microbial Antigens in the Blood of COVID-19 mRNA Vaccine Recipients Using Microbial Protein Microarrays.

Hiroaki Saito, Hiroki Yoshimura, Makoto Yoshida, Yuta Tani, Moe Kawashima, Taiga Uchiyama, Tianchen Zhao, Chika Yamamoto, Yurie Kobashi, Toyoaki Sawano …

Vaccines 11(11) 2023年11月7日
Hematopoietic cell-derived IL-15 supports NK cell development in scattered and clustered localization within the bone marrow.

Shinya Abe, Takuma Asahi, Takahiro Hara, Guangwei Cui, Akihiro Shimba, Shizue Tani-Ichi, Kohei Yamada, Kazuko Miyazaki, Hitoshi Miyachi, Satsuki Kitano …

Cell reports 42(9) 113127-113127 2023年9月26日
Blood flow kinetic energy is a novel marker for right ventricular global systolic function in patients with left ventricular assist device therapy

Koichi Akiyama, Paolo C. Colombo, Eric J. Stöhr, Ruiping Ji, Isaac Y. Wu, Keiichi Itatani, Shohei Miyazaki, Teruyasu Nishino, Naotoshi Nakamura, Yasufumi Nakajima …

Frontier's in Cardiovascular Medicine 10 1093576-1093576 2023年5月16日査読有り
Lifestyle changes during the coronavirus disease 2019 pandemic impact metabolic dysfunction-associated fatty liver disease.

Hideki Fujii, Naotoshi Nakamura, Shinya Fukumoto, Tatsuo Kimura, Akemi Nakano, Yuji Nadatani, Yukie Tauchi, Yuuko Nishii, Shingo Takashima, Yoshihiro Kamada …

Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver 42(5) 995-1004 2022年5月
Preoperative Left Ventricular Energy Loss in the Operating Theater Reflects Subjective Symptoms in Chronic Aortic Regurgitation

Atsushi Kainuma, Keiichi Itatani, Koichi Akiyama, Yoshifumi Naito, Maki Ishii, Masaru Shimizu, Junya Ohara, Naotoshi Nakamura, Yasufumi Nakajima, Satoshi Numata …

Frontiers in Surgery 9 739743-739743 2022年2月14日査読有り
Expression of Cancer Stem Cell Markers EpCAM and CD90 Is Correlated with Anti- and Pro-Oncogenic EphA2 Signaling in Hepatocellular Carcinoma.

Nobuhiko Asakura, Naotoshi Nakamura, Atsushi Muroi, Yosui Nojima, Taro Yamashita, Shuichi Kaneko, Kazuki Ikeda, Naohiko Koshikawa, Takashi Suzuki

International journal of molecular sciences 22(16) 2021年8月11日
Publisher Correction: Genome-wide association study of individual differences of human lymphocyte profiles using large-scale cytometry data.

Daigo Okada, Naotoshi Nakamura, Kazuya Setoh, Takahisa Kawaguchi, Koichiro Higasa, Yasuharu Tabara, Fumihiko Matsuda, Ryo Yamada

Journal of human genetics 66(6) 643-643 2021年6月
細胞生物学の数理(4): 不完全な情報に対処する

中村直俊

応用数理 31(4) 28-33 2021年査読有り招待有り筆頭著者
細胞生物学の数理(3): 動く細胞

中村直俊

応用数理 31(3) 28-33 2021年査読有り招待有り筆頭著者

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MISC

Genome-wide association study of individual differences of human lymphocyte profiles using large-scale cytometry data (vol 71, pg 613, 2021)

Daigo Okada, Naotoshi Nakamura, Kazuya Setoh, Takahisa Kawaguchi, Koichiro Higasa, Yasuharu Tabara, Fumihiko Matsuda, Ryo Yamada

JOURNAL OF HUMAN GENETICS 66(6) 643-643 2021年6月
大阪市での市民救助者への口頭指導と院外心停止後の神経学的予後

畠山稔弘, 畠山稔弘, 木口雄之, 小林大介, 中村直俊, 西山知佳, 林田純人, 清原康介, 北村哲久, 川村孝 …

日本救急医学会雑誌 30(9 (Web)) 2019年
真核細胞の走化性を生み出す自己組織化シグナルシステムの分岐解析 (第12回生物数学の理論とその応用 : 遷移過程に現れるパターンの解明に向けて)

中村直俊

数理解析研究所講究録 1994 88-93 2016年4月
喫煙をめぐる人口動態の数理的解析 : 感染症モデルの応用 (生物現象に対するモデリングの数理)

高科直, 浅尾晃央, 中村直俊

数理解析研究所講究録 1706 35-40 2010年8月

書籍等出版物

理論生物学事典

巌佐, 庸, 大槻, 久, 佐竹, 暁子, 望月, 敦史

朝倉書店 2025年11月 (ISBN: 9784254172034)
論文に出る遺伝子デルジーン300〜PubMed論文の登場回数順にヒト遺伝子のエッセンスを一望 (実験医学別冊)

坊農, 秀雅 (担当:分担執筆)

羊土社 2024年12月6日 (ISBN: 4758122776)
高度情報リテラシー : 情報科学・データ科学への入門

中村, 直俊

学術図書出版社 2020年3月 (ISBN: 9784780608052)

中村直俊

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