金孝竜 (Koryu Kin) - マイポータル

基本情報

所属: 順天堂大学大学院医学研究科生化学・生体システム医科学（医学部生化学第二講座）助教

学位: 博士（生態学・進化生物学）(2015年5月イェール大学)

研究者番号: 70993864
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-2409-7276
J-GLOBAL ID: 202401001688229113
researchmap会員ID: R000067129

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

順天堂大学, 大学院医学研究科生化学・生体システム医科学（医学部生化学第二講座）, 助教
2023年12月 - 2024年3月

CSIC・ポンペウファブラ大学進化生物学研究所, 進化・機能ゲノム部門, 博士研究員
2020年9月 - 2023年9月

CSIC・ポンペウファブラ大学進化生物学研究所, 進化・機能ゲノム部門, ラ・カイシャ財団博士研究員ジュニアリーダー
2019年2月 - 2020年9月

ダンディー大学, 生命科学研究科, 細胞・発生生物学部門, 博士研究員
2017年2月 - 2019年2月

ダンディー大学, 生命科学研究科, 細胞・発生生物学部門, 日本学術振興会海外特別研究員
2015年9月 - 2017年2月

ダンディー大学, 生命科学研究科, 細胞・発生生物学部門, EMBO長期フェロー
2015年6月 - 2015年10月

ダンディー大学, 生命科学研究科, 細胞・発生生物学部門, 博士研究員

学歴

2008年8月 - 2015年5月

イェール大学, 文理大学院, 生態・進化生物学科
2006年4月 - 2008年3月

筑波大学, 生命環境科学研究科, 生物科学専攻
2004年4月 - 2006年3月

東京大学, 医学部, 健康科学・看護学科
2001年4月 - 2004年3月

東京大学, 教養学部, 理科II類

受賞

2020年10月

博士研究員ジュニアリーダーフェローシップ, ラ・カイシャ財団
2017年2月

海外特別研究員, 日本学術振興会
2015年10月

EMBO長期フェローシップ, 欧州分子生物学機構 (EMBO)
2013年6月

Travel Fellowship, 理化学研究所発生・再生科学総合研究センター
2008年4月

日本人海外派遣奨学金, 国際文化教育交流財団
2008年3月

第１種奨学金返還全額免除, 日本学生支援機構
2008年3月

生命環境科学研究科長表彰, 筑波大学

論文

A novel model system to address the relevance of aggregation in animal origins

Gonzalo Bercedo-Saborido, Daria Stepanova, Iñaki Ruiz-Trillo, Tomas Alarcon, Koryu Kin

2025年5月15日責任著者
Multimerization of HIF enhances transcription of target genes containing the hypoxia ancillary sequence.

Tamara Rosell-Garcia, Sergio Rivas-Muñoz, Koryu Kin, Verónica Romero-Albillo, Silvia Alcaraz, Carlos Fernandez-Tornero, Fernando Rodriguez-Pascual

Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms 1866(4) 194963-194963 2023年12月筆頭著者
Emerging roles for diguanylate cyclase during the evolution of soma in dictyostelia.

Yoshinori Kawabe, Qingyou Du, Takaaki B Narita, Craig Bell, Christina Schilde, Koryu Kin, Pauline Schaap

BMC ecology and evolution 23(1) 60-60 2023年10月6日
The Origin of Metazoan Multicellularity: A Potential Microbial Black Swan Event.

Iñaki Ruiz-Trillo, Koryu Kin, Elena Casacuberta

Annual review of microbiology 77 499-516 2023年9月15日
The protein kinases of Dictyostelia and their incorporation into a signalome.

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Gillian Forbes, Hajara Lawal, Christina Schilde, Reema Singh, Christian Cole, Geoffrey J Barton, Pauline Schaap

Cellular signalling 108 110714-110714 2023年8月筆頭著者
Unusual occurrence of domestication syndrome amongst African mole-rats: Is the naked mole-rat a domestic animal?

Guillermo Serrano Nájera, Koryu Kin

Frontiers in Ecology and Evolution 10 2022年11月28日
Evolution of a novel cell type in Dictyostelia required gene duplication of a cudA-like transcription factor.

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Gillian Forbes, Pauline Schaap

Current biology : CB 32(2) 428-437 2022年1月24日筆頭著者
Interactome and evolutionary conservation of Dictyostelid small GTPases and their direct regulators.

Gillian Forbes, Christina Schilde, Hajara Lawal, Koryu Kin, Qingyou Du, Zhi-Hui Chen, Francisco Rivero, Pauline Schaap

Small GTPases 13(1) 239-254 2022年1月
Novel RNAseq-Informed Cell-type Markers and Their Regulation Alter Paradigms of Dictyostelium Developmental Control.

Gillian Forbes, Zhi-Hui Chen, Koryu Kin, Pauline Schaap

Frontiers in cell and developmental biology 10 899316-899316 2022年
Evolution of Multicellular Complexity in The Dictyostelid Social Amoebas.

Koryu Kin, Pauline Schaap

Genes 12(4) 2021年3月27日筆頭著者
Cold climate adaptation is a plausible cause for evolution of multicellular sporulation in Dictyostelia.

Hajara M Lawal, Christina Schilde, Koryu Kin, Matthew W Brown, John James, Alan R Prescott, Pauline Schaap

Scientific reports 10(1) 8797-8797 2020年5月29日
Loss of the Polyketide Synthase StlB Results in Stalk Cell Overproduction in Polysphondylium violaceum.

Takaaki B Narita, Yoshinori Kawabe, Koryu Kin, Richard A Gibbs, Adam Kuspa, Donna M Muzny, Stephen Richards, Joan E Strassmann, Richard Sucgang, Kim C Worley …

Genome biology and evolution 12(5) 674-683 2020年5月1日
Phylogeny-wide conservation and change in developmental expression, cell-type specificity and functional domains of the transcriptional regulators of social amoebas.

Gillian Forbes, Zhi-Hui Chen, Koryu Kin, Hajara M Lawal, Christina Schilde, Yoko Yamada, Pauline Schaap

BMC genomics 20(1) 890-890 2019年11月21日
A well supported multi gene phylogeny of 52 dictyostelia.

Christina Schilde, Hajara M Lawal, Koryu Kin, Ikumi Shibano-Hayakawa, Kei Inouye, Pauline Schaap

Molecular phylogenetics and evolution 134 66-73 2019年5月
Cell-type specific RNA-Seq reveals novel roles and regulatory programs for terminally differentiated Dictyostelium cells.

Koryu Kin, Gillian Forbes, Andrew Cassidy, Pauline Schaap

BMC genomics 19(1) 764-764 2018年10月22日筆頭著者
The Transcriptomic Evolution of Mammalian Pregnancy: Gene Expression Innovations in Endometrial Stromal Fibroblasts.

Koryu Kin, Jamie Maziarz, Arun R Chavan, Manasi Kamat, Sreelakshmi Vasudevan, Alyssa Birt, Deena Emera, Vincent J Lynch, Troy L Ott, Mihaela Pavlicev …

Genome biology and evolution 8(8) 2459-73 2016年8月25日筆頭著者
Inferring cell type innovations by phylogenetic methods-concepts, methods, and limitations.

Koryu Kin

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 324(8) 653-61 2015年12月筆頭著者責任著者
Cell-type phylogenetics and the origin of endometrial stromal cells.

Koryu Kin, Mauris C Nnamani, Vincent J Lynch, Elias Michaelides, Günter P Wagner

Cell reports 10(8) 1398-409 2015年3月3日筆頭著者
Molecular evolution of HoxA13 and the multiple origins of limbless morphologies in amphibians and reptiles.

Marina E Singarete, Mariana B Grizante, Sarah R Milograna, Mariana F Nery, Koryu Kin, Günter P Wagner, Tiana Kohlsdorf

Genetics and molecular biology 38(3) 255-62 2015年
Immunohistological study of the endometrial stromal fibroblasts in the opossum, Monodelphis domestica: evidence for homology with eutherian stromal fibroblasts.

Koryu Kin, Jamie Maziarz, Günter P Wagner

Biology of reproduction 90(5) 111-111 2014年5月筆頭著者

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MISC

第14 回海外研究室だより―イェール大学生態・進化生物学科

金孝竜

日本進化学会ニュース 13(2) 38-43 2012年招待有り筆頭著者
書評：生命最初の30億年

金孝竜

生物科学 57(2) 118 2006年筆頭著者

書籍等出版物

海洋の生命史: 生命は海でどう進化したか

西田睦, 編, 金孝竜, 和田洋 (担当:分担執筆)

2009年6月

講演・口頭発表等

動物の進化を再現する―実験進化学からのアプローチ

金孝竜

第77回日本細胞生物学会・第58回発生生物学会合同大会 2025年7月18日招待有り
Pushing the boundary of premetazoan multicellularity: exploring the multicellular evolvability of a unicellular relative of animals through experimental evolution

Koryu Kin, Gonzalo Bercedo Saborido, Eva Marković, Iñaki Ruiz-Trillo

10th “Choanoflagellates and Friends” Conference 2025年5月21日
後生動物に近縁な原生生物Capsaspora owczarzakiにおける多細胞性について

金孝竜

第14回日本細胞性粘菌学会例会 2024年10月5日招待有り
動物に近縁な単細胞生物の多細胞進化可能性を実験進化によって解明する

第57回日本発生生物学会年会 2024年6月19日
Size, complexity, and oxygen: exploring the multicellular evolvability of a unicellular relative of animals through experimental evolution

Koryu Kin, Gonzalo Bercedo Saborido, Eva Marković, Iñaki Ruiz-Trillo

Sociedad Española de Biología Evolutiva (SESBE) IX Meeting 2024年1月17日
多細胞システムの複雑性の進化 ―細胞性粘菌とCapsasporaにおける研究

金孝竜

順天堂大学DBSBセミナー 2023年8月7日招待有り
Evolution of multicellular complexity in Dictyostelid social amoebas

Koryu Kin

The Instituto Gulbenkian de Ciência Seminar 2019年12月16日招待有り
A parallel world of complex multicellularity: elucidating cell type evolution in social amoeba

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Pauline Schaap

EMBL symposium “The Identity and Evolution of Cell Types” 2019年5月19日
Transcriptomic characterization of cup cells, an evolutionary novel cell type in Dictyostelid cellular slime molds

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Pauline Schaap

7th Euro Evo Devo Meeting 2018年6月27日
RNA-Seq reveals cell-type specific regulatory programs in the late stage of cellular slime mold development

Koryu Kin

EMBO Fellows Meeting 2018 2018年6月14日招待有り
Exploring the nature of “late cup cells” in Dictyostleium discoideum using RNA-Seq

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Pauline Schaap

Dicty 2017 2017年8月22日
RNA-Seq reveals cell-type specific regulatory programs in the late stage of cellular slime mold development

Koryu Kin, Zhi-Hui Chen, Pauline Schaap

Dicty 2018 2017年8月12日
Building cell-type trees from RNA-seq data to find biologically meaningful patterns of gene expression

Koryu Kin

The 24th CDB Meeting – Genomics and Epigenomics with Deep Sequencing 2013年6月13日
One the evolutionary origin of endometrial stromal cells

Koryu Kin, Vincent J. Lynch, Günter P Wagner

Society for Integrative and Comparative Biology Annual Meeting 2013, 2013年1月5日
Transcriptomic and immunohistochemical evidence on the evolutionary origin of endometrial stromal cells

Koryu Kin, Vincent J. Lynch, Günter P. Wagner

4th Euro Evo-Devo Meeting 2012年7月13日
Exploring the sister cell type of endometrial stromal cells using RNA-seq data

Koryu Kin, Vincent J. Lynch, Günter P. Wagner

Society for Molecular Biology and Evolution 2011 Annual Meeting 2011年7月28日
二枚貝の遺伝子発現と卵割パターン：どのような発生学的変更が進化的新奇形質を生み出したのか？

金孝竜, 栫昭太, 和田洋

第78回日本動物学会年会 2007年9月21日
二枚貝胚の卵割パターンと遺伝子発現

金孝竜, 栫昭太, 和田洋

第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会合同年会 2007年5月30日
二枚貝胚の卵割パターンと遺伝子発現：進化的新奇形質の発生学的起源は？

金孝竜, 栫昭太, 和田洋

第9回日本進化学会年会 2007年8月31日

所属学協会

2024年9月 - 現在

日本細胞性粘菌学会
2024年4月 - 現在

日本進化学会
2024年4月 - 現在

日本発生生物学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞性粘菌における新規細胞分化制御ネットワークの進化過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2024年7月 - 2026年3月

金孝竜
サイズ制御と細胞分化との進化的起源を後生動物以前の多細胞性に探る

ラ・カイシャ財団ラ・カイシャ財団博士研究員ジュニアリーダーフェローシップ 2020年9月 - 2023年9月
ゲノムから細胞型へ：細胞型進化の分子的基盤を探る

日本学術振興会海外特別研究員特別研究員奨励費 2017年2月 - 2019年2月
ゲノムから細胞型へ：細胞型進化の分子基盤を探る

ヨーロッパ分子生物学機構 EMBO長期フェローシップ 2015年10月 - 2017年2月