仁田亮 (Ryo Nitta) - マイポータル

基本情報

所属: 神戸大学医学研究科教授
: 特定国立研究開発法人理化学研究所客員研究員

学位: 博士（医学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201401058125079055
researchmap会員ID: B000243345

外部リンク: http://structure.med.kobe-u.ac.jp

細胞骨格（特に微小管）およびその関連タンパク質の生理機能・構造を、クライオ電子顕微鏡構造解析およびX線結晶構造解析を主な手法として利用し研究しています。タンパク質およびその複合体の「かたち」から機能を推測し、そこから発想した機能解析からまた「かたち」の理解へとフィードバックするという姿勢で進めています。最近は、細胞レベルのクライオ電子顕微鏡構造解析への展開も開始し、生理機構解明から疾患(循環器疾患・神経変性疾患など)発症の分子機構解明までを目指しています。

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2018年4月 - 現在

横浜市立大学大学院医学研究科, 客員教授
2017年6月 - 現在

神戸大学大学院医学研究科, 生理学・細胞生物学講座生体構造解剖学分野, 教授
2017年6月 - 現在

理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 客員研究員
2014年4月 - 2017年5月

理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 上級研究員
2012年10月 - 2014年3月

東京大学医学部, 細胞生物学・解剖学講座／MD研究者育成プログラム室, 特任講師
2007年4月 - 2012年9月

東京大学医学部, 細胞生物学・解剖学講座, 助教
2001年10月 - 2007年3月

東京大学医学部, 細胞生物学・解剖学講座, 助手
1997年4月 - 2000年3月

東京女子医科大学, 循環器内科, 医師
神戸大学医学研究科, 教授

論文

CD47 promotes peripheral T cell survival by preventing dendritic cell–mediated T cell necroptosis

Satomi Komori, Yasuyuki Saito, Taichi Nishimura, Datu Respatika, Hiromi Endoh, Hiroki Yoshida, Risa Sugihara, Rie Iida-Norita, Tania Afroj, Tomoko Takai, Okechi S. Oduori, Eriko Nitta, Takenori Kotani, Yoji Murata, Yoriaki Kaneko, Ryo Nitta, Hiroshi Ohnishi, Takashi Matozaki

Proceedings of the National Academy of Sciences 120(33) 2023年8月7日
TEAD1 trapping by the Q353R–Lamin A/C causes dilated cardiomyopathy

Shintaro Yamada, Toshiyuki Ko, Masamichi Ito, Tatsuro Sassa, Seitaro Nomura, Hiromichi Okuma, Mayuko Sato, Tsuyoshi Imasaki, Satoshi Kikkawa, Bo Zhang, Takanobu Yamada, Yuka Seki, Kanna Fujita, Manami Katoh, Masayuki Kubota, Satoshi Hatsuse, Mikako Katagiri, Hiromu Hayashi, Momoko Hamano, Norifumi Takeda, Hiroyuki Morita, Shuji Takada, Masashi Toyoda, Masanobu Uchiyama, Masashi Ikeuchi, Kiminori Toyooka, Akihiro Umezawa, Yoshihiro Yamanishi, Ryo Nitta, Hiroyuki Aburatani, Issei Komuro

Science Advances 9(15) 2023年4月14日
Recruitment of Irgb6 to the membrane is a direct trigger for membrane deformation

Hiroshi Yamada, Tadashi Abe, Hikaru Nagaoka, Eizo Takashima, Ryo Nitta, Masahiro Yamamoto, Kohji Takei

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 12 992198-992198 2022年9月9日
Structural model of microtubule dynamics inhibition by kinesin-4 from the crystal structure of KLP-12 –tubulin complex

Shinya Taguchi, Juri Nakano, Tsuyoshi Imasaki, Tomoki Kita, Yumiko Saijo-Hamano, Naoki Sakai, Hideki Shigematsu, Hiromichi Okuma, Takahiro Shimizu, Eriko Nitta, Satoshi Kikkawa, Satoshi Mizobuchi, Shinsuke Niwa, Ryo Nitta

eLife 11 2022年9月6日
CAMSAP2 organizes a γ-tubulin-independent microtubule nucleation centre through phase separation

Tsuyoshi Imasaki, Satoshi Kikkawa, Shinsuke Niwa, Yumiko Saijo-Hamano, Hideki Shigematsu, Kazuhiro Aoyama, Kaoru Mitsuoka, Takahiro Shimizu, Mari Aoki, Ayako Sakamoto, Yuri Tomabechi, Naoki Sakai, Mikako Shirouzu, Shinya Taguchi, Yosuke Yamagishi, Tomiyoshi Setsu, Yoshiaki Sakihama, Eriko Nitta, Masatoshi Takeichi, Ryo Nitta

eLife 11 2022年6月28日
Structural basis of membrane recognition of Toxoplasma gondii vacuole by Irgb6

Yumiko Saijo-Hamano, Aalaa Alrahman Sherif, Ariel Pradipta, Miwa Sasai, Naoki Sakai, Yoshiaki Sakihama, Masahiro Yamamoto, Daron M Standley, Ryo Nitta

Life Science Alliance 5(1) e202101149-e202101149 2022年1月
【細胞機能の構造生物学】細胞骨格の構造生物学微小管結合タンパク質

吉川知志, 仁田英里子, 今崎剛, 仁田亮

生体の科学 71(4) 298-303 2020年8月
Kinesin-binding-triggered conformation switching of microtubules contributes to polarized transport.

Tomohiro Shima, Manatsu Morikawa, Junichi Kaneshiro, Taketoshi Kambara, Shinji Kamimura, Toshiki Yagi, Hiroyuki Iwamoto, Sotaro Uemura, Hideki Shigematsu, Mikako Shirouzu, Taro Ichimura, Tomonobu M Watanabe, Ryo Nitta, Yasushi Okada, Nobutaka Hirokawa

The Journal of cell biology 217(12) 4164-4183 2018年12月3日査読有り
Structural insight into microtubule stabilization and kinesin inhibition by Tau family MAPs.

Hideki Shigematsu, Tsuyoshi Imasaki, Chihiro Doki, Takuya Sumi, Mari Aoki, Tomomi Uchikubo-Kamo, Ayako Sakamoto, Kiyotaka Tokuraku, Mikako Shirouzu, Ryo Nitta

The Journal of cell biology 217(12) 4155-4163 2018年12月3日査読有り
Recent progress in structural biology: lessons from our research history.

Nitta R, Imasaki T, Nitta E

Microscopy (Oxford, England) 2018年5月査読有り
Structural insights into the altering function of CRMP2 by phosphorylation

Takuya Sumi, Tsuyoshi Imasaki, Mari Aoki, Naoki Sakai, Eriko Nitta, Mikako Shirouzu, Ryo Nitta

Cell Structure and Function 43(1) 15-23 2018年2月23日査読有り
キネシン型分子モーターの多彩な機能を支える分子構造基盤

仁田亮

顕微鏡 53(2) 2018年査読有り招待有り
Structural basis for CRMP2-induced axonal microtubule formation

Shinsuke Niwa, Fumio Nakamura, Yuri Tomabechi, Mari Aoki, Hideki Shigematsu, Takashi Matsumoto, Atsushi Yamagata, Shuya Fukai, Nobutaka Hirokawa, Yoshio Goshima, Mikako Shirouzu, Ryo Nitta

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 10681 2017年9月査読有り
分子モーター研究の新しい方向キネシンによる微小管の構造変化

島知弘, 森川真夏, 金城純一, 神原丈敏, 上村慎治, 八木俊樹, 岩本裕之, 市村垂生, 渡邉朋信, 上村想太郎, 仁田亮, 岡田康志, 廣川信隆

日本細胞生物学会大会講演要旨集 69回 39-39 2017年5月査読有り
Motility and microtubule depolymerization mechanisms of the Kinesin-8 motor, KIF19A

Doudou Wang, Ryo Nitta, Manatsu Morikawa, Hiroaki Yajima, Shigeyuki Inoue, Hideki Shigematsu, Masahide Kikkawa, Nobutaka Hirokawa

ELIFE 5 2016年9月査読有り
Structural Basis of Backwards Motion in Kinesin-1-Kinesin-14 Chimera: Implication for Kinesin-14 Motility

Masahiko Yamagishi, Hideki Shigematsu, Takeshi Yokoyama, Masahide Kikkawa, Mitsuhiro Sugawa, Mari Aoki, Mikako Shirouzu, Junichiro Yajima, Ryo Nitta

STRUCTURE 24(8) 1322-1334 2016年8月査読有り
Motility and Microtubule Depolymerization Mechanisms of the Kinesin-8 motor, KIF19A.

D. Wang, R. Nitta, M. Morikawa, H. Yajima, S. Inoue, H. Shigematsu, M. Kikkawa, N. Hirokawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 27 2016年査読有り
X-ray and Cryo-EM structures reveal mutual conformational changes of Kinesin and GTP-state microtubules upon binding

Manatsu Morikawa, Hiroaki Yajima, Ryo Nitta, Shigeyuki Inoue, Toshihiko Ogura, Chikara Sato, Nobutaka Hirokawa

EMBO JOURNAL 34(9) 1270-1286 2015年5月査読有り
New simulated annealing approach considering helix bending applied to determine the 8.8Å structure of 15-protofilament microtubules.

Ogura T, Yajima H, Nitta R, Hirokawa N, Sato C

Journal of structural biology 188(2) 165-176 2014年11月査読有り
キネシン型分子モーターの構造変化と動作機構

仁田亮

生物物理 (解説) 54(3) 2014年査読有り招待有り

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MISC

細胞機能の構造生物学 I.細胞骨格の構造生物学微小管結合タンパク質

吉川知志, 仁田英里子, 今崎剛, 仁田亮

生体の科学 71(4) 2020年
Mutual conformational changes of kinesin and GTP microtubule upon their binding.

M. Morikawa, H. Yajima, R. Nitta, S. Inoue, T. Ogura, C. Sato, N. Hirokawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 25 2014年12月
クライオ電顕を用いたGTP型/GDP-taxol型微小管におけるtubulinの構造変化

矢島孔明, 小椋俊彦, 仁田亮, 岡田康志, 佐藤主税, 廣川信隆

日本解剖学会総会・全国学術集会講演プログラム・抄録集 118th 2013年
Conformational Changes in Tubulin in GMPCPP and GDP-taxol Microtubules Observed by Cryo Electron Microscopy

H. Yajima, T. Ogura, R. Nitta, Y. Okada, C. Sato, N. Hirokawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 23 2012年
A common mechanism for microtubule destabilizers-M-Type kinesins stabilize curling of the protofilament using the class-specific neck and loops.

T Ogawa, R Nitta, Y Okada, N Hirokawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 15 36A-36A 2004年11月
KIF1A alternately uses two loops to bind microtubules

R Nitta, M Kikkawa, Y Okada, N Hirokawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 15 278A-279A 2004年11月
A common mechanism for microtubule destabilizers-M-type kinesins stabilize curling of the protofilament using the class-specific neck and loops

Tadayuki Ogawa, Ryo Nitta, Yasushi Okada, Nobutaka Hirokawa

CELL STRUCTURE AND FUNCTION 29 37-37 2004年5月
Swinging movement of the back door of kinesin generates the alternating use of its two microtubule-binding loops

Nitta R, M. Kikkawa, Y. Okada, N. Hirokawa

Science 305 678-683 2004年

書籍等出版物

微小管結合タンパク質

吉川知志, 仁田英里子, 今崎剛, 仁田亮 (担当:分担執筆)

2020年8月
イメージング時代の構造生命科学

仁田亮, 今崎剛 (担当:分担執筆, 範囲:細胞骨格が制御する細胞内の営みをトランススケールに理解する)

羊土社 2020年3月
新しい臨床を開拓するための分子循環器病学

今崎剛, 仁田英里子, 仁田亮 (担当:分担執筆, 範囲:分子構造解析で何が見えるか)

南山堂 2019年4月
実験医学（2018年5月号）クライオ電子顕微鏡による構造解析が拓く次世代の生命科学・創薬

仁田亮 (担当:分担執筆, 範囲:X線とクライオ電顕で微小管モーターの動きに迫る)

羊土社 2018年5月
Encyclopedia of Biophysics

Ryo Nitta, Nobutaka Hirokawa (担当:分担執筆, 範囲:Fundamental Properties and Structure of Kinesin)

Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2012年
入門構造生物学

廣川信隆, 仁田亮 (担当:分担執筆, 範囲:生体分子モーター)

共立出版 2010年4月

共同研究・競争的資金等の研究課題

クロススケール細胞内分子構造動態解析が解明する細胞骨格ネットワーク構築とその破綻

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

仁田亮
細胞の極性を担う非中心体性微小管ネットワーク形成機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

仁田亮
臓器連関の包括的理解に基づく認知症関連疾患の克服

内閣府ムーンショット型研究開発制度 2020年 - 2024年

高橋良輔
クライオ電子顕微鏡による細胞内分子構造解析法：微小管形成の場を原子レベルで捉える

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

仁田亮
心筋メカノバイオロジー機構の解明による心不全治療法の開発

日本医療研究開発機構 AMED-CREST 2017年10月 - 2023年3月

小室一成
細胞の形態・極性制御を司る微小管ネットワーク形成の構造基盤

文部科学省：科学研究費補助金(基盤研究(B)) 2019年 - 2021年

仁田亮
クライオ電子顕微鏡を用いた心筋リモデリングの分子基盤の解明

文部科学省挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2020年3月

仁田亮
CAMSAPファミリータンパク質に着目した微小管重合制御の分子機構の解明

ひょうご科学技術協会学術研究助成 2019年

仁田亮
クライオ電子顕微鏡を用いた心不全病態解明の新たなアプローチの構築

ブリストル・マイヤーズスクイブ株式会社研究助成 2018年

仁田亮
CRMP2による微小管ダイナミクス制御の相関構造解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2015年 - 2017年

仁田亮
CRMP2 による軸索誘導・反発の分子構造基盤の解明

上原記念生命科学財団研究助成 2017年

仁田亮
微小管結合タンパク質 CRMP2 の軸索微小管誘導・反発の分子機構

武田科学振興財団医学系研究奨励継続助成 2017年

仁田亮
クライオ電子顕微鏡による心筋リモデリングの病理構造基盤の解明と新規治療法開発に向けたシーズの創出

持田記念医学薬学振興財団研究助成 2016年

仁田亮
微小管結合タンパク質 CRMP2 の軸索微小管誘導・反発の分子機構

武田科学振興財団医学系研究奨励 2015年

仁田亮
キネシンモーター分子群による細胞内物質輸送の分子機構:構造、機能、動態及び制御

文部科学省科学研究費補助金(特別推進研究) 特別推進研究 2006年 - 2010年

廣川信隆, 中田隆夫, 金井克光, 野田泰子, 武井陽介, 岡田康志, 中田隆夫, 野田泰子, 金井克光, 武井陽介, 岡田康志, 田中庸介, 仁田亮, 本間典子, 三木玄方, 小川覚之, 矢島孔明
細胞内物質輸送の分子機構;分子細胞生物学、構造生物学および分子遺伝学的研究

文部科学省科学研究費補助金(COE形成基礎研究費, 特別推進研究(COE)) COE形成基礎研究費, 特別推進研究(COE) 2001年 - 2006年

廣川信隆, 岡田康志, 寺田純雄, 瀬藤光利, 中田隆夫, 金井克光, 竹田扇, 野田泰子, 武井陽介, 川岸将彦, 岡田康志, 仁田亮, 寺田純雄, 田中庸介, 中田隆夫, 野田泰子, 武井陽介

仁田亮