赤木謙一 (Ken'ichi AKAGI) - マイポータル

基本情報

所属: 藤田医科大学オープンファシリティセンター特任准教授

学位: 博士（理学）(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 201801016710348148
researchmap会員ID: B000308041

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研究分野

経歴

2025年6月 - 現在

大阪大学蛋白質研究所, 高磁場NMR研究室, 招へい准教授
2025年4月 - 現在

藤田医科大学, オープンファシリティセンター構造解析室, 特任准教授
2023年6月 - 2025年3月

大阪大学蛋白質研究所, 高磁場NMR研究室, 特任研究員
2020年4月 - 2023年5月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 研究員
2006年4月 - 2020年3月

国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 研究員

学歴

1998年4月 - 2006年3月

大阪大学, 理学研究科, 生物科学専攻後期課程
1996年4月 - 1998年3月

大阪大学, 理学研究科, 生物化学専攻前期課程
1992年4月 - 1996年3月

神戸大学, 理学部, 化学科

論文

Analysis of the High-Order Conformational Changes in Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase Induced by Nicotinamide Adenine Dinucleotide, Adenosine Triphosphate, and Oxidants.

Himari Suzuki, Yuki Nicole Makiyama, Yuta Watanabe, Hideo Akutsu, Michiko Tajiri, Yoko Motoda, Ken-Ichi Akagi, Tsuyoshi Konuma, Satoko Akashi, Takahisa Ikegami

Biochemistry 64(9) 1916-1932 2025年5月6日
Interaction modes of human orexin 2 receptor with selective and nonselective antagonists studied by NMR spectroscopy

Kayo Imamura, Ken-Ichi Akagi, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Tsujimoto, Takatsugu Hirokawa, Hideo Ashida, Kaori Murakami, Asuka Inoue, Ryoji Suno, Takahisa Ikegami …

Structure 2024年1月
NMR analysis of the homodimeric structure of a D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria

Tsuyoshi Konuma, Tomoyo Takai, Chieko Tsuchiya, Masayuki Nishida, Miyu Hashiba, Yudai Yamada, Haruka Shirai, Aritaka Nagadoi, Eriko Chikaishi, Ken-ichi Akagi …

2023年10月13日
Volatile Organic Compound Detection by Graphene Field-Effect Transistors Functionalized with Fly Olfactory Receptor Mimetic Peptides.

Tharatorn Rungreungthanapol, Chishu Homma, Ken-Ichi Akagi, Masayoshi Tanaka, Jun Kikuchi, Hideyuki Tomizawa, Yoshiaki Sugizaki, Atsunobu Isobayashi, Yuhei Hayamizu, Mina Okochi

Analytical chemistry 95(9) 4556-4563 2023年3月7日
ALS mutations in the TIA-1 prion-like domain trigger highly condensed pathogenic structures

Naotaka Sekiyama, Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Ken-ichi Akagi, Yasuko Ohtani, Kayo Imamura, Tsuyoshi Terakawa, Keitaro Yamashita, Daigo Inaoka, Koji Yonekura …

Proceedings of the National Academy of Sciences 119(38) 2022年9月20日
¹⁹F chemical library and ¹⁹F-NMR for a weakly bound complex structure

Shoko Shinya, Ritsuko Katahira, Kyoko Furuita, Toshihiko Sugiki, Young-Ho Lee, Yoshikazu Hattori, Kohei Takeshita, Atsushi Nakagawa, Aoi Kokago, Ken-ichi Akagi …

RSC Medicinal Chemistry 2022年
Conformational Space Sampled by Domain Reorientation of Linear Diubiquitin Reflected in Its Binding Mode for Target Proteins

Xue-Ni Hou, Naotaka Sekiyama, Yasuko Ohtani, Feng Yang, Yohei Miyanoiri, Ken-ichi Akagi, Xun-Cheng Su, Hidehito Tochio

ChemPhysChem 22(14) 1505-1517 2021年7月16日
Subcellular localization of glypican-5 is associated with dynamic motility of the human mesenchymal stem cell line U3DT

Masao Takeuchi, Kikuko Takeuchi, Tomoyo Takai, Ritsuko Yamaguchi, Tetsushi Furukawa, Ken-Ichi Akagi, Jun K. Takeuchi

PLoS ONE 16(2) 2021年2月1日
Design and synthesis of beta-strand-fixed peptides inhibiting aggregation of amyloid beta-protein

Fumiya Tanaka, Kana Shibata, Yoko Monobe, Ken-ichi Akagi, Yuichi Masuda

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 28(18) 2020年9月
Synthetic and biochemical studies on the effect of persulfidation on disulfide dimer models of amyloid β42 at position 35 in Alzheimer's etiology

Kazuma Murakami, Haruka Kato, Mizuho Hanaki, Yoko Monobe, Ken-ichi Akagi, Taiji Kawase, Kenji Hirose, Kazuhiro Irie

RSC Advances 10(33) 19506-19512 2020年
Synthesis and biochemical characterization of quasi-stable trimer models of full-length amyloid β40 with a toxic conformation

Yumi Irie, Mizuho Hanaki, Kazuma Murakami, Tsuneo Imamoto, Takumi Furuta, Takeo Kawabata, Taiji Kawase, Kenji Hirose, Yoko Monobe, Ken-ichi Akagi …

Chem. Commun. 55(2) 182-185 2019年1月査読有り
Intramolecular interaction suggests an autosuppression mechanism for the innate immune adaptor protein MyD88.

Uno M, Watanabe-Nakayama T, Konno H, Akagi KI, Tsutsumi N, Fukao T, Shirakawa M, Ohnishi H, Tochio H

Chemical communications (Cambridge, England) 54(87) 12318-12321 2018年10月査読有り
Mechanistic analyses of the suppression of amyloid β42 aggregation by apomorphine.

Hanaki M, Murakami K, Katayama S, Akagi KI, Irie K

Bioorganic & medicinal chemistry 26(8) 1538-1546 2018年5月1日査読有り
Role of the carboxy groups of triterpenoids in their inhibition of the nucleation of amyloid β42 required for forming toxic oligomers.

Murakami K, Yoshioka T, Horii S, Hanaki M, Midorikawa S, Taniwaki S, Gunji H, Akagi KI, Kawase T, Hirose K …

Chemical communications (Cambridge, England) 54(49) 6272-6275 2018年査読有り
Sensitivity enhancement by chromatographic peak concentration with ultra-high performance liquid chromatography-nuclear magnetic resonance spectroscopy for minor impurity analysis

Takashi Tokunaga, Ken-ichi Akagi, Masahiko Okamoto

JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A 1508 163-168 2017年7月査読有り
Synthetic Models of Quasi-Stable Amyloid β40 Oligomers with Significant Neurotoxicity.

Irie Y, Murakami K, Hanaki M, Hanaki Y, Suzuki T, Monobe Y, Takai T, Akagi KI, Kawase T, Hirose K …

ACS chemical neuroscience 8(4) 807-816 2017年4月査読有り
Monoclonal antibody with conformational specificity for a toxic conformer of amyloid β42 and its application toward the Alzheimer's disease diagnosis.

Murakami K, Tokuda M, Suzuki T, Irie Y, Hanaki M, Izuo N, Monobe Y, Akagi K, Ishii R, Tatebe H …

Scientific reports 6 29038-29038 2016年7月4日査読有り
Tensin2-deficient mice on FVB/N background develop severe glomerular disease

Kozue Uchio-Yamada, Yoko Monobe, Ken-ichi Akagi, Yoshie Yamamoto, Atsuo Ogura, Noboru Manabe

JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE 78(5) 811-818 2016年5月査読有り
UCP3 is associated with Hax-1 in mitochondria in the presence of calcium ion

Katsuya Hirasaka, Edward M. Mills, Marie Haruna, Aki Bando, Chika Ikeda, Tomoki Abe, Shohei Kohno, Sara M. Nowinski, Cory U. Lago, Ken-ichi Akagi …

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 472(1) 108-113 2016年3月査読有り
Structural insights into mechanisms for inhibiting amyloid β42 aggregation by non-catechol-type flavonoids.

Hanaki M, Murakami K, Akagi K, Irie K

Bioorganic & medicinal chemistry 24(2) 304-313 2016年1月査読有り

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MISC

Tensin2 is important for podocyte-glomerular basement membrane interaction and integrity of glomerular filtration barrier.

Kozue Uchio-Yamada, Keiko Yasuda, Yoko Monobe, Ken-Ichi Akagi, Osamu Suzuki, Noboru Manabe

American journal of physiology. Renal physiology 2020年5月11日
進歩総説 LC-NMR

赤木謙一

ぶんせき 2018(3) 102-109 2018年3月
Transcriptional Dynamics of Immortalized Human Mesenchymal Stem Cells during Transformation (vol 10, e0126562, 2015)

Masao Takeuchi, Atsunori Higashino, Kikuko Takeuchi, Yutaro Hori, Kazuko Koshiba-Takeuchi, Hatsune Makino, Yoko Monobe, Marina Kishida, Jun Adachi, Jun Takeuchi …

PLOS ONE 10(6) 2015年6月
C末端SrcキナーゼのSH2ドメインとCsk‐binding protein(Cbp)/phosphoprotein associated with glycosphingolipid microdomains(PAG)との間の新しい相互作用様式の発見

田中宏明, 赤木謙一, 小根山千歳, 田中雅千, 佐々木優一, 狩野孝, LEE Young‐Ho, 横川大輔, DOBENECKER Marc‐Werner, 中川敦史 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 1P-0078 (WEB ONLY) 2013年
カテコール系フラボノイド類によるアミロイド β の凝集抑制機構

村上一馬, 佐藤瑞穂, 井久保遥子, 宇野真弓, 中川優, 片山寿美枝, 赤木謙一, 増田裕一, 竹腰清乃理, 入江一浩

第54回天然有機化合物討論会 2012年9月査読有り
青ジソ抽出物からのＮｒｆ 2-ＡＲＥ経路活性化成分の単離および同定

泉安彦, 松村敦子, 脇田誓子, 福田宏之, 赤木謙一, 久米利明, 入江一浩, 橋本正, 赤池昭紀

日本薬学会第 132年会 2012年3月
LC-NMR/MSを用いた生薬の品質評価法に関する研究(1) : 生薬ゴシツの栽培および加工調製法について

渕野裕之, 菱田敦之, 赤木謙一, 木内文之, 川原信夫

生薬學雜誌 : shoyakugaku zasshi : the Japanese journal of pharmacognosy 66(1) 1-16 2012年2月20日
Nrf2-ARE経路活性化作用を有する食品由来成分の探索

松村敦子, 泉安彦, 脇田誓子, 赤木謙一, 入江一浩, 久米利明, 橋本正, 赤池昭紀

第120回日本薬理学会近畿部会 2011年11月
アミロイドβ凝集体におけるクルクミンの相互作用部位の固体NMRによる解析

増田裕一, 福地将志, 谷田川達也, 多田雅斗, 武田和行, 入江一浩, 赤木謙一, 物部容子, 今澤孝喜, 竹腰清乃理

化学系学協会東北大会プログラムおよび講演予稿集 2011 170 2011年9月17日
癌細胞浸潤阻害剤の標的に成り得るAMAP1/コータクチンのインタフェイスの構造

廣瀬まゆみ, 橋本茂, 橋本あり, 森重真毅, 山田敦子, 保坂晴美, 赤木謙一, 小川栄治, 池上貴久, 中川敦史 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 6th 67 2006年3月31日
1C1630 SMN(Survival Motor Neuron)蛋白質Tudor domainの構造解析

赤木謙一, 児玉高志, 辻本賀英, 京極好正, 阿久津秀雄

生物物理 40 S24 2000年
NMRによるSigma 70-subunit-region 4の構造解析

赤木謙一, 山崎俊夫, 藤田信之, 石浜明, 京極好正

生物物理 37 S166 1997年10月

所属学協会

日本核磁気共鳴学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

生物活性環状ペプチドPF1171類の生体内における立体配座解明と標的分子同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

増田裕一, 赤木謙一

赤木謙一

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経歴

学歴

論文

MISC

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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