岡崎伸生 (Nobuo Okazaki) - マイポータル

基本情報

所属: 一般財団法人総合科学研究機構中性子科学センター
: 国立研究開発法人日本原子力研究開発機構

学位: 工学(大阪大学)

研究者番号: 60391900
J-GLOBAL ID: 201501005238944269
researchmap会員ID: B000248255

外部リンク

J-PARC MLFで計算環境の開発および構築を行っています。
施設利用者の利便性向上のためユーザーフレンドリーな環境を追い求める開発をはじめ、利用者向け情報のWebサイト構築などを手がけています。あわせて、Web広報および成果分析なども行っています。
ごくたまにタンパク質X線/中性子結晶構造解析をすることもあります。

AWS認定ソリューションアーキテクト-アソシエイト
AWS認定SysOpsアドミニストレーター-アソシエイト
AWS認定デベロッパー-アソシエイト
応用情報技術者
情報処理安全確保支援士(登録情報セキュリティスペシャリスト)

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

一般財団法人総合科学研究機構, 中性子科学センター, 副主任技師解析情報チームリーダー
2016年4月 - 2020年3月

一般財団法人総合科学研究機構, 研究開発部, 技師
2013年5月 - 2016年3月

一般財団法人総合科学研究機構, 利用研究促進部, 技師
2013年2月 - 2013年3月

茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター
2008年2月 - 2013年3月

株式会社創晶
2008年2月 - 2013年1月

独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 技術開発協力員
2005年10月 - 2008年1月

財団法人高輝度光科学研究センター, 利用研究促進部門, 研究協力員
2003年5月 - 2005年9月

独立行政法人理化学研究所, 播磨研究所, リサーチアシスタント
2000年4月 - 2003年4月

株式会社上野製薬, 化学薬品研究所

学歴

1998年4月 - 2000年3月

大阪大学大学院, 工学研究科, 物質化学専攻博士前期課程
1994年4月 - 1998年3月

大阪大学, 工学部, 応用精密化学科
1991年4月 - 1994年3月

大阪府立北野高等学校

委員歴

2022年4月 - 現在

日本結晶学会, 情報委員
2019年4月 - 現在

日本中性子科学会, 交流委員
2018年4月 - 2022年3月

日本結晶学会, 情報幹事
2016年4月 - 2018年3月

日本結晶学会, 情報委員
2016年1月 - 2016年11月

日本結晶学会平成28年度年会, 実行委員
2014年4月 - 2014年9月

The 10th NOBUGS, 実行委員

受賞

2019年10月

中性子科学センター長表彰, 新MLFウェブサイト構築と論文分析システムの開発, 一般財団法人総合科学研究機構

岡崎伸生

論文

Development of a technique for high pressure neutron diffraction at 40 GPa with a Paris-Edinburgh press

High Pressure Research 39(3) 417-425 2019年査読有り
Crystal structure of glycosyltrehalose synthase from Sulfolobus shibatae DSM5389.

Nobuo Okazaki, Michael Blaber, Ryota Kuroki, Taro Tamada

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 74(Pt 11) 741-746 2018年11月1日査読有り
Materials and Life Science Experimental Facility at the Japan Proton Accelerator Research Complex III: Neutron Devices and Computational and Sample Environments

Kaoru Sakasai, Setsuo Satoh, Tomohiro Seya, Tatsuya Nakamura, Kentaro Toh, Hideshi Yamagishi, Kazuhiko Soyama, Dai Yamazaki, Ryuji Maruyama, Takayuki Oku …

QUANTUM BEAM SCIENCE 1(2) 10 2017年9月査読有り
Structure of a highly acidic beta-lactamase from the moderate halophile Chromohalobacter sp 560 and the discovery of a Cs+-selective binding site

Shigeki Arai, Yasushi Yonezawa, Nobuo Okazaki, Fumiko Matsumoto, Chie Shibazaki, Rumi Shimizu, Mitsugu Yamada, Motoyasu Adachi, Taro Tamada, Masahide Kawamoto …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY 71 541-554 2015年3月査読有り
Structure of a highly acidic β-lactamase from the moderate halophile Chromohalobacter sp. 560 and the discovery of a Cs(+)-selective binding site.

Arai S, Yonezawa Y, Okazaki N, Matsumoto F, Shibazaki C, Shimizu R, Yamada M, Adachi M, Tamada T, Kawamoto M …

Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography 71(Pt 3) 541-54 2015年3月査読有り
Crystal structures of the catalytic domain of a novel glycohydrolase family 23 chitinase from Ralstonia sp. A-471 reveals a unique arrangement of the catalytic residues for inverting chitin hydrolysis

Takao Arimori, Noriko Kawamoto, Shoko Shinya, Nobuo Okazaki, Masami Nakazawa, Kazutaka Miyatake, Tamo Fukamizo, Mitsuhiro Ueda, Taro Tamada

Journal of Biological Chemistry 288(26) 18696-18706 2013年6月28日査読有り
新たなX線回析測定システムを利用した耐熱性タンパク質の構造学的研究

岡崎伸生

大阪大学 2013年3月査読有り
A structural mechanism for dimeric to tetrameric oligomer conversion in Halomonas sp nucleoside diphosphate kinase

Shigeki Arai, Yasushi Yonezawa, Nobuo Okazaki, Fumiko Matsumoto, Taro Tamada, Hiroko Tokunaga, Matsujiro Ishibashi, Michael Blaber, Masao Tokunaga, Ryota Kuroki

PROTEIN SCIENCE 21(4) 498-510 2012年4月査読有り
Substrate recognition mechanism of a glycosyltrehalose trehalohydrolase from Sulfolobus solfataricus KM1

Nobuo Okazaki, Taro Tamada, Michael D. Feese, Masaru Kato, Yutaka Miura, Toshihiro Komeda, Kazuo Kobayashi, Keiji Kondo, Michael Blaber, Ryota Kuroki

PROTEIN SCIENCE 21(4) 539-552 2012年4月査読有り
Human hematopoietic prostaglandin D synthase inhibitor complex structures

Yuji Kado, Kosuke Aritake, Nobuko Uodome, Yousuke Okano, Nobuo Okazaki, Hiroyoshi Matsumura, Yoshihiro Urade, Tsuyoshi Inoue

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 151(4) 447-455 2012年4月査読有り
Crystallization and preliminary neutron diffraction studies of ADP-ribose pyrophosphatase-I from Thermus thermophilus HB8

Nobuo Okazaki, Motoyasu Adachi, Taro Tamada, Kazuo Kurihara, Takushi Ooga, Nobuo Kamiya, Seiki Kuramitsu, Ryota Kuroki

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 68(Pt 1) 49-52 2012年1月査読有り
Implication of Molecular Diversity and Functional Conservation of Erythropoietin Based on a Comparison of Tertiary Structures of Humans and Frogs

Meguro Mizue, Adachi Motoyasu, Nagasawa Kazumichi, Beppu Miho, Okazaki Nobuo, Nogawa-Kosaka Nami, Tamada Taro, Kuroki Ryota, Kato Takashi

BLOOD 118(21) 1455 2011年11月18日査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the catalytic domain of a novel chitinase, a member of GH family 23, from the moderately thermophilic bacterium Ralstonia sp A-471

Nobuo Okazaki, Takao Arimori, Masami Nakazawa, Kazutaka Miyatake, Mitsuhiro Ueda, Taro Tamada

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 67(Pt 4) 494-497 2011年4月査読有り
Towards investigation of the inhibitor-recognition mechanisms of drug-target proteins by neutron crystallography

Ryota Kuroki, Nobuo Okazaki, Motoyasu Adachi, Takashi Ohhara, Kazuo Kurihara, Taro Tamada

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 66(Pt 11) 1126-1130 2010年11月査読有り
2P009 Halomonas sp.593由来ヌクレオシドニリン酸キナーゼ(HaNDK)の多量体構造(蛋白質-構造,第48回日本生物物理学会年会)

Arai Shigeki, Yonezawa Yasushi, Okazaki Nobuo, Tamada Taro, Tokunaga Hiroko, Ishibashi Matsujiro, Tokunaga Masao, Kuroki Ryota

生物物理 50(2) S83 2010年
Structure of HIV-1 protease in complex with potent inhibitor KNI-272 determined by high-resolution X-ray and neutron crystallography

Motoyasu Adachi, Takashi Ohhara, Kazuo Kurihara, Taro Tamada, Eijiro Honjo, Nobuo Okazaki, Shigeki Arai, Yoshinari Shoyama, Kaname Kimura, Hiroyoshi Matsumura …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 106(12) 4641-4646 2009年3月査読有り
Mail-in data collection at SPring-8 protein crystallography beamlines

Nobuo Okazaki, Kazuya Hasegawa, Go Ueno, Hironori Murakami, Takashi Kumasaka, Masaki Yamamoto

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 15(Pt 3) 288-291 2008年5月査読有り
Development of hydrogen and hydration database for biomolecules (HHDB)

Okazaki Nobuo, Ohhara Takashi, Umino Hisao, Chatake Toshiyuki, Kurihara Kazuo, Cachau Raul E, Blaber Michael, Niimura Nobuo, Kuroki Ryota

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 64 C627 2008年査読有り
Structure of a UPF0150-family protein from Thermus thermophilus HB8

Nobuo Okazaki, Maki Kumei, Miho Manzoku, Seiki Kuramitsu, Mikako Shirouzu, Akeo Shinkai, Shigeyuki Yokoyama

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 63(Pt 3) 173-177 2007年3月査読有り
Structure of the stand-alone RAM-domain protein from Thermus thermophilus HB8

Noboru Nakano, Nobuo Okazaki, Shinya Satoh, Koji Takio, Seiki Kuramitsu, Akeo Shinkai, Shigeyuki Yokoyama

Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications 62(9) 855-860 2006年9月査読有り

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MISC

ハイブリッドクラウド環境を活用したMLF内外に向けたサービス,広報環境の構築と運用

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 森山健太郎, 永井佑樹, 鈴木次郎, 鈴木次郎, 鬼柳亮嗣, 五十嵐美穂, 大内薫 …

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
オンプレミスとクラウドサービスを組み合わせたMLF向けサービス,広報環境の構築と運用

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎, 鈴木次郎, 森山健太郎, 山田悟史, 山田悟史, 五十嵐美穂 …

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2021 2022年
J-PARC MLFにおける研究成果解析のシステム開発とWeb公開

山田悟史, 伊藤崇芳, 岡崎伸生, 五十嵐美穂

波紋 31(4) 2021年
商用クラウドサービスを利用したJ‐PARC MLF計算環境の改良

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎, 森山健太郎, 大友季哉

日本結晶学会年会講演要旨集 2017 97 2017年11月23日
超高圧中性子回折装置PLANETで何ができるか？

服部高典, 佐野亜沙美, 町田真一, 阿部淳, 舟越賢一, 岡崎伸生

日本結晶学会誌 59(6) 301-308 2017年
J‐PARC MLFにおけるリモート解析環境の構築と運用

岡崎伸生, 稲村泰弘, 中谷健, 伊藤崇芳, 鈴木次郎, 大友季哉

日本結晶学会年会講演要旨集 2016 115 2016年11月17日
高圧中性子ビームラインPLANETの概要と中性子回折実験の実際

服部高典, 佐野亜沙美, 有馬寛, 舟越賢一, 阿部淳, 町田真一, 岡崎伸生, 大内啓一, 稲村泰弘

高圧力の科学と技術 26(2) 89-98 2016年
J‐PARC MLFにおけるリモート解析環境

岡崎伸生, 伊藤崇芳, 稲村泰弘, 中谷健, 鈴木次郎, 大友季哉

日本中性子科学会年会講演概要集 16th 91 2016年
中性子回折によるSiO₂ガラスの高温高圧下での相転移/緩和の検証

服部高典, 佐野亜沙美, 稲村泰弘, YAGAFAROV O, 片山芳則, 千葉文野, 大友季哉, 舟越賢一, 阿部淳, 町田真一 …

日本中性子科学会年会講演概要集 16th 58 2016年
J‐PARC MLFにおける利便性の高いデータ処理システムの開発

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎, 大友季哉

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 99 2015年10月17日
難結晶性蛋白質の結晶化に向けた結晶化タグの開発と評価

小坂恵, 直井里美, 松下里美, 山田秀徳, 二見淳一郎, 多田宏子, 安達基泰, 岡崎伸生, 玉田太郎, 黒木良太

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 125 2014年5月26日
世界結晶年（IYCr2014）対称性・群論トレーニングコース

岡﨑伸生

日本結晶学会誌 56(6) 372-373 2014年
J‐PARC MLFにおけるWeb経由でのデータ処理システムの開発

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎

日本結晶学会年会講演要旨集 2014 129 2014年
J‐PARC MLFにおけるWeb経由でのデータ処理システムの開発

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎

物構研サイエンスフェスタ要旨集 2013 83 2014年
J‐PARC MLFにおけるWeb経由でのデータ処理システムの開発

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎

日本中性子科学会年会講演概要集 14th 14 2014年
J‐PARC超高圧中性子回折装置PLANETの現状と液体構造解析への応用

服部高典, 佐野亜沙美, 鈴谷賢太郎, 舟越賢一, 阿部淳, 町田真一, 大内啓一, 岡崎伸生, 亀田恭男, 大友季哉

日本中性子科学会年会講演概要集 14th 17 2014年
J‐PARC超高圧中性子回折装置PLANETの現状と石英ガラス研究への応用

服部高典, 佐野亜沙美, 稲村泰弘, 舟越賢一, 阿部淳, 町田真一, 岡崎伸生, 片山芳則, YAGAFAROV Oscar, 千葉文野

高圧討論会講演要旨集 54th 257 2013年10月30日
テトラチオン酸加水分解酵素(tetrathionate hydrolase)の精製と結晶化

小坂恵, 金尾忠芳, 中山久之, 吉田京矢, 上村一雄, 高田潤, 山田秀徳, 玉田太郎, 足立基泰, 岡崎伸生 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 13th 124 2013年5月31日
J‐PARC MLFにおけるWeb経由でのデータ処理システムの開発

岡崎伸生, 稲村泰弘, 伊藤崇芳, 中谷健, 鈴木次郎

日本中性子科学会年会講演概要集 13th 89 2013年
中性子およびX線を相補的に利用した水和水の詳細構造の同定法

岡崎伸生, 大原高志, 栗原和男, 玉田太郎, 黒木良太

日本結晶学会年会講演要旨集 2012 102 2012年10月25日

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講演・口頭発表等

光合成蛋白質の構造情報利用講習会

岡崎伸生

大阪大学蛋白質研究所講堂 2017年7月8日招待有り

Works(作品等)

MLF VR

2019年7月22日 - 現在 Web Service
J-PARC MLF利用者情報サイト

岡崎伸生

2015年9月 - 現在 Web Service
Simple Web UI for Docker Registry

岡崎伸生

2017年2月コンピュータソフト
平成28年度日本結晶学会年会Webページ

岡崎伸生

2016年3月 - 2016年11月 Web Service
NOBUGS2014 Gallery

岡崎伸生

2014年10月 Web Service
NOBUGS2014 Announcement

岡崎伸生

2014年4月 Web Service
Python ORM Macaron

岡崎伸生

2012年2月コンピュータソフト
BioKids Wiki

岡崎伸生

2008年5月 Web Service
SPring-8メールインデータ測定システム D-Cha

岡崎伸生

2005年 Web Service

共同研究・競争的資金等の研究課題

J-PARC MLFにおけるクラウド解析環境構築のための負荷性能実験

国立情報学研究所クラウド利活用実証実験 2017年10月 - 2018年3月

大友季哉
蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2009年

黒木良太, 玉田太郎, 安達基泰, 城所俊一, 斎藤稔, 海野久雄, 大原高志, 岡崎伸生, 栗原和男
遠隔測定法開発による次世代の放射光施設利用システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2008年 - 2008年

岡崎伸生

産業財産権

特開2007-033046 タンパク質の結晶化実験における観測データの処理システム

岡崎伸生, 仲村勇樹, 粂井麻希, 田中智之, 菅原光明, 石本光史, 野々村健司
特許第3906424号薬液等の分注方法

田中智之, 仲村勇樹, 粂井麻希, 岡崎伸生, 菅原光明
特開2007-010374 タンパク質の結晶化状態表示システム

岡崎伸生
特開2006-090854 薬液等の分注装置

田中智之, 仲村勇樹, 粂井麻希, 岡崎伸生, 菅原光明
特開2006-083126 タンパク質の結晶化試薬キット及び試薬キットを利用した結晶化スクリーニング方法

田中智之, 仲村勇樹, 粂井麻希, 岡崎伸生, 菅原光明

岡崎伸生

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