能代大輔 (Daisuke Noshiro) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学遺伝子病制御研究所助教

学位: 博士（薬学）(2012年3月京都大学)

研究者番号: 90751107
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7024-2054
J-GLOBAL ID: 201801014910663266
researchmap会員ID: B000325437

主要な研究キーワード

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研究分野

ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学 / イメージング

経歴

2023年4月 - 現在

北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 助教
2022年4月 - 2023年3月

北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 特任助教
2018年4月 - 2022年3月

公益財団法人微生物化学研究会微生物化学研究所, 博士研究員
2017年10月 - 2018年3月

金沢大学ナノ生命科学研究所, 博士研究員
2013年10月 - 2017年9月

金沢大学バイオAFM先端研究センター, 博士研究員
2012年10月 - 2013年9月

オックスフォード大学, 博士研究員
2012年4月 - 2012年9月

京都大学化学研究所, 博士研究員

学歴

2009年4月 - 2012年3月

京都大学大学院, 薬学研究科, 生命薬科学
2007年4月 - 2009年3月

京都大学大学院, 薬学研究科, 生命薬科学
2003年4月 - 2007年3月

京都大学, 薬学部, 総合薬学科

論文

Complete set of the Atg8-E1-E2-E3 conjugation machinery forms an interaction web that mediates membrane shaping.

Jahangir Md Alam, Tatsuro Maruyama, Daisuke Noshiro, Chika Kakuta, Tetsuya Kotani, Hitoshi Nakatogawa, Nobuo N Noda

Nature structural & molecular biology 31(1) 170-178 2024年1月査読有り
Immobilization of lipid nanorods onto two-dimensional crystals of protein tamavidin 2 for high-speed atomic force microscopy.

Daisuke Noshiro, Nobuo N Noda

STAR protocols 4(4) 102633-102633 2023年12月2日査読有り筆頭著者
Phosphorylation of phase-separated p62 bodies by ULK1 activates a redox-independent stress response.

Ryo Ikeda, Daisuke Noshiro, Hideaki Morishita, Shuhei Takada, Shun Kageyama, Yuko Fujioka, Tomoko Funakoshi, Satoko Komatsu-Hirota, Ritsuko Arai, Elena Ryzhii …

The EMBO journal 42(14) e113349 2023年7月17日査読有り
Integrated proteomics identifies p62-dependent selective autophagy of the supramolecular vault complex

Reo Kurusu, Yuki Fujimoto, Hideaki Morishita, Daisuke Noshiro, Shuhei Takada, Koji Yamano, Hideaki Tanaka, Ritsuko Arai, Shun Kageyama, Tomoko Funakoshi …

Developmental Cell 58(13) 1189-1205.e11 2023年7月査読有り
The mitochondrial intermembrane space protein mitofissin drives mitochondrial fission required for mitophagy.

Tomoyuki Fukuda, Kentaro Furukawa, Tatsuro Maruyama, Shun-Ichi Yamashita, Daisuke Noshiro, Chihong Song, Yuta Ogasawara, Kentaro Okuyama, Jahangir Md Alam, Manabu Hayatsu …

Molecular cell 83(12) 2045-2058 2023年6月15日査読有り
Development of hidden Markov modeling method for molecular orientations and structure estimation from high-speed atomic force microscopy time-series images.

Tomonori Ogane, Daisuke Noshiro, Toshio Ando, Atsuko Yamashita, Yuji Sugita, Yasuhiro Matsunaga

PLoS computational biology 18(12) e1010384 2022年12月29日査読有り
The UFM1 system regulates ER-phagy through the ufmylation of CYB5R3.

Ryosuke Ishimura, Afnan H El-Gowily, Daisuke Noshiro, Satoko Komatsu-Hirota, Yasuko Ono, Mayumi Shindo, Tomohisa Hatta, Manabu Abe, Takefumi Uemura, Hyeon-Cheol Lee-Okada …

Nature communications 13(1) 7857-7857 2022年12月21日査読有り
A glutamine sensor that directly activates TORC1

Mirai Tanigawa, Katsuyoshi Yamamoto, Satoru Nagatoishi, Koji Nagata, Daisuke Noshiro, Nobuo N. Noda, Kouhei Tsumoto, Tatsuya Maeda

Communications Biology 4(1) 2021年9月査読有り
Structural and dynamics analysis of intrinsically disordered proteins by high-speed atomic force microscopy

Noriyuki Kodera, Daisuke Noshiro, Sujit K. Dora, Tetsuya Mori, Johnny Habchi, David Blocquel, Antoine Gruet, Marion Dosnon, Edoardo Salladini, Christophe Bignon …

Nature Nanotechnology 16(2) 181-189 2021年2月査読有り筆頭著者
p62/SQSTM1-droplet serves as a platform for autophagosome formation and anti-oxidative stress response

Shun Kageyama, Sigurdur Runar Gudmundsson, Yu-Shin Sou, Yoshinobu Ichimura, Naoki Tamura, Saiko Kazuno, Takashi Ueno, Yoshiki Miura, Daisuke Noshiro, Manabu Abe …

Nature Communications 12(1) 2021年1月査読有り
Author Correction: Atg9 is a lipid scramblase that mediates autophagosomal membrane expansion.

Kazuaki Matoba, Tetsuya Kotani, Akihisa Tsutsumi, Takuma Tsuji, Takaharu Mori, Daisuke Noshiro, Yuji Sugita, Norimichi Nomura, So Iwata, Yoshinori Ohsumi …

Nature structural & molecular biology 27(12) 1209-1209 2020年12月
Atg9 is a lipid scramblase that mediates autophagosomal membrane expansion.

Kazuaki Matoba, Tetsuya Kotani, Akihisa Tsutsumi, Takuma Tsuji, Takaharu Mori, Daisuke Noshiro, Yuji Sugita, Norimichi Nomura, So Iwata, Yoshinori Ohsumi …

Nature structural & molecular biology 27(12) 1185-1193 2020年12月査読有り
Two-State Exchange Dynamics in Membrane-Embedded Oligosaccharyltransferase Observed in Real-Time by High-Speed AFM

Yuki Kawasaki, Hirotaka Ariyama, Hajime Motomura, Daisuke Fujinami, Daisuke Noshiro, Toshio Ando, Daisuke Kohda

Journal of Molecular Biology 432(22) 5951-5965 2020年11月査読有り
Liquidity Is a Critical Determinant for Selective Autophagy of Protein Condensates.

Akinori Yamasaki, Jahangir Md Alam, Daisuke Noshiro, Eri Hirata, Yuko Fujioka, Kuninori Suzuki, Yoshinori Ohsumi, Nobuo N Noda

Molecular cell 77(6) 1163-1175 2020年3月19日査読有り
Phase separation organizes the site of autophagosome formation.

Yuko Fujioka, Jahangir Md Alam, Daisuke Noshiro, Kazunari Mouri, Toshio Ando, Yasushi Okada, Alexander I May, Roland L Knorr, Kuninori Suzuki, Yoshinori Ohsumi …

Nature 578(7794) 301-305 2020年2月査読有り
The induction of RANKL molecule clustering could stimulate early osteoblast differentiation.

Sone E, Noshiro D, Ikebuchi Y, Nakagawa M, Khan M, Tamura Y, Ikeda M, Oki M, Murali R, Fujimori T …

Biochemical and biophysical research communications 509(2) 435-440 2019年2月査読有り
Substrate protein dependence of GroEL–GroES interaction cycle revealed by high-speed atomic force microscopy imaging

Daisuke Noshiro, Toshio Ando

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 373(1749) 2018年6月19日査読有り筆頭著者
Calmodulin EF-hand peptides as Ca2+-switchable recognition tags

Akihiko Oku, Miki Imanishi, Daisuke Noshiro, Tomo Murayama, Toshihide Takeuchi, Ikuhiko Nakase, Shiroh Futaki

BIOPOLYMERS 108(1) 2017年1月査読有り
The Intrinsically Disordered Protein Atg13 Mediates Supramolecular Assembly of Autophagy Initiation Complexes

Hayashi Yamamoto, Yuko Fujioka, Sho W. Suzuki, Daisuke Noshiro, Hironori Suzuki, Chika Kondo-Kakuta, Yayoi Kimura, Hisashi Hirano, Toshio Ando, Nobuo N. Noda …

DEVELOPMENTAL CELL 38(1) 86-99 2016年7月査読有り
Extramembrane control of ion channel peptide assemblies, using alamethicin as an example

Shiroh Futaki, Daisuke Noshiro, Tatsuto Kiwada, Koji Asami

Accounts of Chemical Research 46(12) 2924-2933 2013年12月17日査読有り

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MISC

オートファジー研究から拡大する細胞質ゾーニングの世界液-液相分離で形成される"p62 body"の新規構成成分の同定とその選択的オートファジーによる分解意義の解明

森下英晃, 来栖玲央, 藤本侑生, 能代大輔, 高田周平, 山野晃史, 田中秀明, 荒井律子, 蔭山俊, 船越智子 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 96回 [3S01m-03] 2023年10月
相分離したp62bodyのULK1によるリン酸化は,酸化還元非依存的なストレス応答を活性化する

一村義信, 池田良, 池田良, 能代大輔, 森下英晃, 森下英晃, 高田周平, 蔭山俊, 藤岡優子, 船越智子 …

日本生化学会大会(Web) 96th 2023年
ULK1キナーゼによるp62の液-液相分離制御

池田良, 一村義信, 森下英晃, 能代大輔, 船越智子, 小松聡子, 蔭山俊, 野田展生, 小松雅明

日本Cell Death学会学術集会プログラム抄録集 30th 2022年
UFM1システム:Alphafold2構造予測からわかったUFM1システムの作動原理

石村亮輔, 能代大輔, 植村武文, 和栗聡, 野田展生, 小松雅明

日本Cell Death学会学術集会プログラム抄録集 30th 2022年
【どうして自分だけ狙われる?選択的オートファジー既成概念を覆す分子機構と生理作用】液-液相分離と選択的オートファジー

能代大輔, 野田展生

実験医学 39(13) 2046-2051 2021年8月
カーゴの流動性が選択的オートファジーでの分解を左右する

山崎章徳, 山崎章徳, ALAM Jahangir MD., 能代大輔, 平田恵理, 藤岡優子, MAY Alexander I., 鈴木邦律, 鈴木邦律, 鈴木邦律 …

日本細胞生物学会大会(Web) 73rd 2021年
Pib2はTORC1を直接活性化する細胞内グルタミンセンサーである

谷川美頼, 山本勝良, 長門石曉, 津本浩平, 能代大輔, 野田展生, 永田宏次, 前田達哉, 前田達哉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2021 2021年
p62顆粒はオートファゴソーム形成とストレス応答の足場として働く機能的液滴である

蔭山俊, GUDMUNDSSON Sigurdur, SOU Yu-Shin, 一村義信, 田村直輝, 數野彩子, 上野隆, 三浦芳樹, 能代大輔, 阿部学 …

日本細胞生物学会大会(Web) 73rd 2021年
マルチモードオートファジーカーゴの液体度が選択的オートファジーでの取り込みを左右する(Liquidty is a critical determinant for selective autophagy of protein condensates)

山崎章徳, Alam Jahangir, 能代大輔, 平田恵理, 藤岡優子, 鈴木邦律, 大隅良典, 野田展生

日本細胞生物学会大会講演要旨集 72回 S9-4 2020年6月
【イメージング時代の構造生命科学細胞の動態、膜のないオルガネラ、分子の構造変化をトランススケールに観る】(第2章)構造生命科学からトランススケール・イメージングによる細胞動態学へトランススケールな解析が待たれる生命科学の未解決課題柔らかい構造の可視化 LLPSと膜動態を例に

能代大輔, 野田展生

実験医学 38(5) 750-755 2020年3月
Pib2はTORC1を直接活性化する細胞内グルタミンセンサーである

谷川美頼, 山本勝良, 長門石曉, 永田宏次, 能代大輔, 野田展生, 津本浩平, 津本浩平, 前田達哉, 前田達哉

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
統合的なAFM,NMR,電顕単粒子解析により明らかにされたオリゴ糖転移酵素の動的構造

川崎由貴, 有山弘高, 藤浪大輔, 本村肇, SRIVASTAVA Ashutosh, TAMA Florence, 能代大輔, 安藤敏夫, 真柳浩太, 神田大輔

日本糖質学会年会要旨集 38th 2019年
相分離したタンパク質の選択的オートファジーの試験管内再構成

山崎章徳, ALAM Jahangir Md., 能代大輔, 野田展生

日本細胞生物学会大会(Web) 71st 2019年
細胞膜上RANKL分子のクラスター化誘導による骨芽細胞分化促進作用

曽根絵梨, 田村幸彦, 菅森泰隆, 依田哲也, 青木和広, 能代大輔, 本間雅, 池淵祐樹

Journal of Oral Biosciences Supplement 2018 340-340 2018年9月
オートファジーの足場タンパク質Atg17-Atg29-Atg31複合体の高速AFM観察

能代大輔, 藤岡優子, 野田展生, 安藤敏夫

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2P-003] 2018年9月
RANKL結合ペプチドによる骨形成促進メカニズムの検討

曽根絵梨, MASUD Khan, 能代大輔, 池淵祐樹, 本間雅, 田村幸彦, 菅森泰隆, 鈴木洋史, 宇田川信之, 青木和広

日本骨形態計測学会雑誌 28(2) 2018年
実験・シミュレーション・データ科学の融合による遺伝情報分子システムの生物物理高速AFMによる天然変性タンパク質の構造動態解析(Biophysics of genetic information molecules and systems: Integrated approach of experiments, simulations, and data science Structural dynamics analysis of intrinsically disordered proteins by high-speed AFM)

Kodera Noriyuki, Noshiro Daisuke, Dora Sujit, Ando Toshio

生物物理 57(Suppl.1-2) S191-S191 2017年8月
ビオチン化した生体分子の迅速簡便な固定化法のための、タマビジン2の二次元結晶(Two-dimensional crystals of tamavidin 2 for a quick and easy method of immobilization of biotinylated biomolecules)

Noshiro Daisuke, Kodera Noriyuki, Ando Toshio

生物物理 57(Suppl.1-2) S268-S268 2017年8月
味覚受容体細胞外領域ヘテロ二量体の発現・精製および性状解析(Expression, purification, and characterization of the entire heterodimeric extracellular regions of fish taste receptor)

Maruhashi Hiroki, Noshiro Daisuke, Yasui Norihisa, Ando Toshio, Yamashita Atsuko

生物物理 57(Suppl.1-2) S313-S313 2017年8月
高速AFMによる古細菌S.solfataricus由来ミニ染色体維持(ssoMCM)タンパク質複合体の観察(Observation of S. solfataricus archaeal minichromosome maintenance(ssoMCM) protein complex by high-speed AFM)

Noshiro Daisuke, Kodera Noriyuki, Ando Toshio

生物物理 56(Suppl.1-2) S276-S276 2016年10月

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

相分離液滴のオートファジー分解効率を規定する構造基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2027年3月

能代大輔
液－液相分離によって生じるオートファゴソーム形成場の高速AFMによる観察

日本学術振興会若手研究若手研究 2019年4月 - 2023年3月

能代大輔
高速AFMによる古細菌由来MCMタンパク質複合体の観察

日本学術振興会若手研究（B） 2017年4月 - 2019年3月

能代大輔
センサー機能を有する人工イオンチャネルタンパク質の創製と展開

日本学術振興会特別研究員（DC1）特別研究員奨励費 2009年4月 - 2012年3月

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