藥師寺那由他 (Nayuta Yakushiji-Kaminatsui) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター研究員

学位: 博士（生命科学）(東北大学)

研究者番号: 70565316
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7324-1161
J-GLOBAL ID: 201801006798255459
researchmap会員ID: B000305507

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 発生生物学 /

経歴

2019年7月 - 現在

理化学研究所生命医科学研究センター, 免疫器官形成研究チーム, 研究員
2018年8月 - 2019年6月

東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 助教
2013年11月 - 2018年7月

スイス連邦工科大学ローザンヌ校（EPFL）, 研究員
2009年4月 - 2013年10月

理化学研究所免疫・アレルギー科学総合研究センター／統合生命医科学研究センター, 免疫器官形成研究グループ, 研究員

学歴

2006年4月 - 2009年3月

東北大学大学院生命科学研究科生命機能科学専攻博士課程

受賞

2009年3月

生命科学研究科長賞, 東北大学大学院生命科学研究科

藥師寺那由他
2008年3月

黒田チカ賞, 東北大学青葉理学振興会

藥師寺那由他

論文

The shh limb enhancer is activated in patterned limb regeneration but not in hypomorphic limb regeneration in Xenopus laevis.

Reimi Tada, Takuya Higashidate, Takanori Amano, Shoma Ishikawa, Chifuyu Yokoyama, Suzu Kobari, Saki Nara, Koshiro Ishida, Akane Kawaguchi, Haruki Ochi …

Developmental biology 2023年5月27日
The histone H3K36 demethylase Fbxl11 plays pivotal roles in the development of retinal late-born cell types.

Toshiro Iwagawa, Masaya Fukushima, Shigeru Takeuchi, Yuichi Kawamura, Yuko Aihara, Manabu Ozawa, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Makoto Aihara, Haruhiko Koseki, Yutaka Suzuki …

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 2023年4月19日
Genetic, Genomic, and Imaging Approaches to Dissect the Role of Polycomb Group Epigenetic Regulators in Mice.

Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Takashi Kondo, Yasuhide Ohinata, Junichiro Takano, Haruhiko Koseki

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2529 207-228 2022年
Variant PCGF1-PRC1 links PRC2 recruitment with differentiation-associated transcriptional inactivation at target genes.

Hiroki Sugishita, Takashi Kondo, Shinsuke Ito, Manabu Nakayama, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Eiryo Kawakami, Yoko Koseki, Yasuhide Ohinata, Jafar Sharif, Mio Harachi …

Nature communications 12(1) 5341-5341 2021年9月9日
Mammalian-specific ectodermal enhancers control the expression of Hoxc genes in developing nails and hair follicles.

Marc Fernandez-Guerrero, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Lucille Lopez-Delisle, Sofía Zdral, Fabrice Darbellay, Rocío Perez-Gomez, Christopher Chase Bolt, Manuel A Sanchez-Martin, Denis Duboule, Marian A Ros

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2020年11月16日査読有り
The Polycomb group protein Ring1 regulates dorsoventral patterning of the mouse telencephalon.

Hikaru Eto, Yusuke Kishi, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Hiroki Sugishita, Shun Utsunomiya, Haruhiko Koseki, Yukiko Gotoh

Nature communications 11(1) 5709-5709 2020年11月11日査読有り
Impact of genome architecture on the functional activation and repression of Hox regulatory landscapes.

Nayuta Yakushiji-Kaminatsui

BMC biology 17(1) 55 2019年7月12日査読有り
Hoxa13 regulates expression of common Hox target genes involved in cartilage development to coordinate the expansion of the autopodal anlage.

Yamamoto S, Uchida Y, Ohtani T, Nozaki E, Yin C, Gotoh Y, Yakushiji-Kaminatsui N, Higashiyama T, Suzuki T, Takemoto T …

Development, growth & differentiation 61(3) 228-251 2019年3月査読有り
Similarities and differences in the regulation of HoxD genes during chick and mouse limb development

Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Lucille Lopez-Delisle, Christopher Chase Bolt, Guillaume Andrey, Leonardo Beccari, Denis Duboule

PLOS Biology 16(11) e3000004 2018年11月26日査読有り
Variant PRC1 competes with retinoic acid-related signals to repress Meis2 in distal forelimb bud.

Yakushiji-Kaminatsui N, Kondo T, Hironaka KI, Sharif J, Endo TA, Nakayama M, Masui O, Koseki Y, Kondo K, Ohara O …

Development (Cambridge, England) 145(19) 2018年10月査読有り
Role of Hoxc genes in the development of the limb integumentary organ (nail, claw, or hoof).

Lasierra MAR, Fernández-Guerrero M, Delisle L, Yakushiji-Kaminatsui N, Darbellay F, Pérez-Gómez R, Duboule D

FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology 32(1_supplement) 201 2018年4月査読有り
Integration of Shh and Fgf signaling in controlling Hox gene expression in cultured limb cells

Alan R. Rodrigues, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Yuji Atsuta, Guillaume Andrey, Patrick Schorderet, Denis Duboule, Clifford J. Tabin

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 114(12) 3139-3144 2017年3月査読有り
A role for HOX13 proteins in the regulatory switch between TADs at the HoxD locus

Leonardo Beccari, Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Joost M. Woltering, Anamaria Necsulea, Nicolas Lonfat, Eddie Rodriguez-Carballo, Benedicte Mascrez, Shiori Yamamoto, Atsushi Kuroiwa, Denis Duboule

GENES & DEVELOPMENT 30(10) 1172-1186 2016年5月査読有り
RING1 proteins contribute to early proximal-distal specification of the forelimb bud by restricting Meis2 expression

Nayuta Yakushiji-Kaminatsui, Takashi Kondo, Takaho A. Endo, Yoko Koseki, Kaori Kondo, Osamu Ohara, Miguel Vidal, Haruhiko Koseki

DEVELOPMENT 143(2) 276-285 2016年1月査読有り
Effects of Activation of Hedgehog Signaling on Patterning, Growth, and Differentiation in Xenopus Froglet Limb Regeneration

Nayuta Yakushiji, Makoto Suzuki, Akira Satoh, Hiroyuki Ide, Koji Tamura

DEVELOPMENTAL DYNAMICS 238(8) 1887-1896 2009年8月査読有り
Repatterning in amphibian limb regeneration: A model for study of genetic and epigenetic control of organ regeneration

Nayuta Yakushiji, Hitoshi Yokoyama, Koji Tamura

SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY 20(5) 565-574 2009年7月査読有り
Correlation between Shh expression and DNA methylation status of the limb-specific Shh enhancer region during limb regeneration in amphibians.

Yakushiji N, Suzuki M, Satoh A, Sagai T, Shiroishi T, Kobayashi H, Sasaki H, Ide H, Tamura K

Developmental biology 312 171-182 2007年12月査読有り
Limb regeneration in Xenopus laevis froglet

Makoto Suzuki, Nayuta Yakushiji, Yasuaki Nakada, Akira Satoh, Hiroyuki Ide, Koji Tamura

THESCIENTIFICWORLDJOURNAL 6 26-37 2006年12月査読有り
Characterization of Xenopus digits and regenerated limbs of the froglet

Akira Satoh, Tetsuya Endo, Masahiro Abe, Nayuta Yakushiji, Shiro Ohgo, Koji Tamura, Hiroyuki Ide

DEVELOPMENTAL DYNAMICS 235(12) 3316-3326 2006年12月査読有り

書籍等出版物

エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール : ChIP-seq、ATAC-seq、Hi-C、smFISH、空間オミクス…クロマチンの修飾から構造まで、絶対使える18選!

藥師寺那由他 (担当:分担執筆, 範囲:Capture Hi-C法)

羊土社 2021年1月 (ISBN: 9784758122481)
エピジェネティクス

藥師寺, 上夏井, 那由他, 古関明彦 (担当:分担執筆, 範囲:Part I: エピジェネティクスの基礎第7章ポリコーム群タンパク質)

化学同人 2013年11月 (ISBN: 9784759815122)
生物機能モデルと新しいリソース・リサーチツール

藥師寺, 上夏井, 那由他, 古関明彦 (担当:分担執筆, 範囲:第I部第1章第3節エピジェネティクス)

エル・アイ・シー 2011年2月 (ISBN: 9784900487482)
エピジェネティクスと疾患

藥師寺, 上夏井, 那由他, 古関明彦 (担当:分担執筆, 範囲:第1章エピジェネティックな制御機構 3. ポリコーム群タンパク質複合体が関与する遺伝子発現抑制)

実験医学（羊土社） 2010年

講演・口頭発表等

A role for CtBP1/2 proteins during cell differentiation and limb organogenesis

Yakushiji-Kaminatsui N

第56回日本発生生物学会 2023年7月
CtBP1/2による合指症発症機構の解明

藥師寺那由他

第45回日本分子生物学会年会 2022年11月
Hoxd遺伝子群とそのエンハンサー領域が織りなす手足の形態形成

藥師寺那由他

第45回日本分子生物学会年会 2022年11月招待有り
四足動物におけるHoxD遺伝子群制御機構の保存性と多様性

Yakushiji-Kaminatsui N

第52回日本発生生物学会 2019年5月招待有り
HoxD遺伝子群制御機構の保存性と多様性

藥師寺那由他, Bolt CC, Lopez-Delisle L, Andrey G, Beccari L, Duboule D

第41回日本分子生物学会年会 2018年11月
四肢形成過程におけるHoxD遺伝子群の制御機構

藥師寺那由他

平成29年度大学院特別講義（歯学系分野主催） 2018年3月招待有り
四肢形成過程におけるHox制御機構:手足の形態の差はどのようにして作り出されるのか?

藥師寺那由他, Duboule D

第123回日本解剖学会総会・全国学術集会、シンポジウム「発生過程の細胞集団からみる解剖学」 2018年3月招待有り
鳥類四肢のHoxD遺伝子群制御におけるクロマチン相互作用とヒストン修飾のダイナミックな変化

藥師寺那由他, Andrey G, Duboule D

第39回日本分子生物学会年会 2016年11月
Dynamic change of histone modifications during the regulatory switch between TADs at the HoxD locus in avian limbs

Yakushiji-Kaminatsui N, Andrey G, Duboule D

12th EMBL Conference ‘Transcription and Chromatin’ 2016年8月
Gene regulation by Polycomb group proteins and Retinoic acid signalling is required for distal limb development

Yakushiji-Kaminatsui N, Endo T. A, Koseki H

CDB Symposium 2013 2013年3月
Repression of Meis2 by Polycomb group proteins Ring1A/B is required for proximo-distal limb bud development

Yakushiji-Kaminatsui N, Endo T. A, Toyoda T, Koseki H

12th International Conference on Limb Development and Regeneration 2012年6月
Repression of proximal genes by Ring1A/B is required for proximo-distal limb bud development

Yakushiji-Kaminatsui N, Endo T. A, Toyoda T, Koseki H

Mouse Molecular Genetics 2011年9月
The functional role of Polycomb group proteins Ring1A/B during mammalian limb development

藥師寺那由他, 遠藤高帆, 豊田哲郎, 古関明彦

第44回日本発生生物学会 2011年5月
Reactivation of SHH signaling is a key to anterior-posterior (AP) repatterning during Xenopus froglet limb regeneration

Yakushiji N, Ide H, Tamura K

The EMBO Conference on the Molecular and Cellular Basis of Regeneration and Tissue Repair 2008年10月
四肢再生過程におけるShhの発現を制御するエピジェネティクス機構

藥師寺那由他, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 井出宏之, 田村宏治

第2回日本エピジェネティクス研究会年会 2008年5月
Reactivation of SHH signaling is a key to anterior-posterior (AP) repatterning during Xenopus froglet limb regeneration

藥師寺那由他, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 井出宏之, 田村宏治

第41回日本発生生物学会 2008年5月
両生類における四肢再生の鍵となるShh発現のエピジェネティクス制御

藥師寺那由他, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 井出宏之, 田村宏治

日本動物学会第78回大会 2007年9月
両生類における四肢再生の鍵となるShh発現のエピジェネティクス制御

藥師寺那由他, 鈴木誠, 佐藤伸, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 井出宏之, 田村宏治

第1回日本エピジェネティクス研究会年会 2007年6月
Epigenetic regulation plays a key role in gene re-expression during Xenopus limb regeneration

藥師寺那由他, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 井出宏之, 田村宏治

第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会合同大会 2007年5月
Epigenetic and genetic cascades in incomplete anterior-posterior axis formation during Xenopus froglet limb regeneration

藥師寺那由他, 鈴木誠, 佐藤伸, 嵯峨井知子, 城石俊彦, 小林久人, 佐々木裕之, 竹島一仁, 井出宏之, 田村宏治

第39回日本発生生物学会 2006年5月

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

CtBPが司る遺伝子制御ネットワークの解明：合指症治療標的の同定を目指して

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

藥師寺那由他
合指症モデルマウスを用いた胎児期治療標的の探索と同定

かなえ医薬振興財団第50回研究助成金 2021年11月 - 2023年3月
細胞系譜追跡によるNKT特異的エンハンサーの探索

アステラス病態代謝研究会 2020年度研究助成金 2020年11月 - 2022年
ポリコム複合体による合指症の発症機構の解明

武田科学振興財団 2019年度医学系研究助成（基礎） 2019年 - 2022年

藥師寺那由他
エピゲノム異常が合指症を引き起こすメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2021年3月

藥師寺那由他
1細胞レベルでの分化系譜追跡によるヒトiPS細胞からNKT細胞への分化制御機構の解明

持田記念医学薬学振興財団 2020年度研究助成金 2020年11月 - 2021年
オープンクロマチン領域解析によるB細胞特異的エンハンサーの同定とその制御機構の解明

ノバルティス科学振興財団 2018年度研究奨励金 2019年

藥師寺那由他
エンハンサーが制御するB細胞への分化運命決定機構

上原記念生命科学財団平成30年度研究奨励金 2019年

藥師寺那由他
B細胞への分化運命を決定するエンハンサー制御機構の解明

ホクト生物科学振興財団平成30年度研究奨励金 2019年

藥師寺那由他
四肢を形造るHox遺伝子群の制御機構の解明：クロマチン高次構造解析からのアプローチ

内藤記念科学振興財団内藤記念海外研究留学助成金 2013年11月 - 2018年7月

藥師寺, 上夏井, 那由他
器官構築における細胞の位置情報の形成と維持に関与するエピジェネティクス機構の解明

理化学研究所基礎科学特別研究員 2009年4月 - 2012年3月

藥師寺那由他

藥師寺那由他

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