黒谷篤之 (Atsushi Kurotani) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-0993-9770
J-GLOBAL ID: 202301013407411903
researchmap会員ID: R000053107

研究キーワード

情報科学、一次産業、環境科学、バイオ、産業財産権法、弁理士

経歴

2024年2月 - 現在

国立大学法人東京農工大学, 客員準教授
2022年7月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 基盤技術研究本部農業情報研究センター
2021年4月 - 2022年6月

国立研究開発法人理化学研究所, 計算科学研究センター
2021年4月 - 2022年6月

国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部
2007年5月 - 2022年6月

国立研究開発法人理化学研究所, 環境科学資源研究センター
2002年10月 - 2007年4月

国立研究開発法人理化学研究所, ゲノムサイエンスセンター

学歴

東京農工大学, 工学府

論文

Causal estimation of the relationship between reproductive performance and the fecal bacteriome in cattle

Yutaka Taguchi, Haruki Yamano, Yudai Inabu, Hirokuni Miyamoto, Koki Hayasaki, Noriyuki Maeda, Yoshiro Kanmera, Seiji Yamasaki, Noboru Ota, Kenji Mukawa …

Animal Microbiome 7(33) 2-15 2025年4月
健康社会におけるデジタルヘルスケアシステムの今後の課題と展望

黒谷篤之, 伊藤直仁, 權娟大, 小林暁雄, 桂樹哲雄, 西平順

情報の科学と技術 74(9) 388-392 2024年9月査読有り筆頭著者責任著者
Causal estimation of maternal-offspring gut commensal bacterial associations under livestock grazing management conditions

Yutaka Taguchi*, Atsushi Kurotani*, Haruki Yamano, Hirokuni Miyamoto, Tamotsu Kato, Naoko Tsuji, Makiko Matsuura, Teruno Nakaguma, Tetsuji Etoh, Yuji Shiotsuka …

Computational and Structural Biotechnology Reports 100012-100012 2024年8月査読有り筆頭著者
農林水産データ事業に向けた知財保護戦略への観点

黒谷篤之, 川村隆浩

Patent 77(2) 74-82 2024年2月査読有り
A thermoprotective probiotic function by thermostable lactic acid bacteria and its causal structure

Kayo Ito, Hirokuni Miyamoto, Makiko Matsuura, Chitose Ishii, Yumiko Nakanishi, Wataru Suda, Takashi Satoh, Fuyuko Honda, Atsushi Kurotani, Naoko Tsuji …

Journal of Functional Foods 113 106001-106001 2024年1月査読有り
Validation of causal inference data using DirectLiNGAM in an environmental small-scale model and calculation settings

Atsushi Kurotani, Hirokuni Miyamoto, Jun Kikuchi

MethodsX 102528-102528 2024年1月査読有り
Weizmannia coagulans functions as a heat-stress protective probiotic via modulation of the pyridoxal-oxalate interaction

Hirokuni Miyamoto, Kayo Ito, Fuyuko Honda, Makiko Matsuura, Chitose Ishii, Naoko Tsuji, Teruno Nakaguma, Toshiyuki Ito, Wataru Suda, Chie Shindo …

Research Square 2023年5月
Estimation of silent phenotypes of calf antibiotic dysbiosis

Shunnosuke Okada, Yudai Inabu, Hirokuni Miyamoto, Kenta Suzuki, Tamotsu Kato, Atsushi Kurotani, Yutaka Taguchi, Ryoichi Fujino, Yuji Shiotsuka, Tetsuji Etoh …

Scientific Reports 13(1) 2023年4月19日査読有り
An agroecological structure model of compost—soil—plant interactions for sustainable organic farming

Hirokuni Miyamoto, Katsumi Shigeta, Wataru Suda, Yasunori Ichihashi, Naoto Nihei, Makiko Matsuura, Arisa Tsuboi, Naoki Tominaga, Masahiko Aono, Muneo Sato …

ISME Communications 3(1) 2023年3月31日査読有り
Computational estimation of sediment symbiotic bacterial structures of seagrasses overgrowing downstream of onshore aquaculture

Hirokuni Miyamoto, Nobuhiro Kawachi, Atsushi Kurotani, Shigeharu Moriya, Wataru Suda, Kenta Suzuki, Makiko Matsuura, Naoko Tsuji, Teruno Nakaguma, Chitose Ishii …

Environmental Research 219 115130-115130 2023年2月査読有り
A Potential Symbiotic Sediment Bacterial Structure That Contributes to Seagrass Growth Downstream of Onshore Aquaculture

Miyamoto Hirokuni, Kawachi Nobuhiro, Kurotani Atsushi, Moriya Shigeharu, Suda Wataru, Suzuki Kenta, Matsuura Makiko, Tsuji Naoko, Nakaguma Teruno, Ishii Chitose …

SSRN (Cell Press) 2022年9月
A potential network structure of symbiotic bacteria involved in carbon and nitrogen metabolism of wood-utilizing insect larvae

Hirokuni Miyamoto, Futo Asano, Koutarou Ishizawa, Wataru Suda, Hisashi Miyamoto, Naoko Tsuji, Makiko Matsuura, Arisa Tsuboi, Chitose Ishii, Teruno Nakaguma …

Science of The Total Environment 836 155520-155520 2022年8月査読有り
Materials informatics approach using domain modelling for exploring structure–property relationships of polymers

Koki Hara, Shunji Yamada, Atsushi Kurotani, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

Scientific Reports 12(1) 2022年6月22日査読有り
MINORITY REPORT: FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF A SUBSET OF EXTREMELY ALKALINE PROTEINS IN THE HUMAN PROTEOME

Tokmakov Alexander A, Kurotani Atsushi

Memoirs of Institute of Advanced Technology, Kindai University (27) 1-6 2022年3月31日査読有り
Protein pI and Intracellular Localization

Alexander A. Tokmakov, Atsushi Kurotani, Ken-Ichi Sato

Frontiers in Molecular Biosciences 8 2021年11月29日査読有り
Solubility Prediction from Molecular Properties and Analytical Data Using an In-phase Deep Neural Network (Ip-DNN)

Atsushi Kurotani, Toshifumi Kakiuchi, Jun Kikuchi

ACS Omega 6(22) 14278-14287 2021年5月17日査読有り
Signal Deconvolution and Noise Factor Analysis Based on a Combination of Time–Frequency Analysis and Probabilistic Sparse Matrix Factorization

Shunji Yamada, Atsushi Kurotani, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

International Journal of Molecular Sciences 21(8) 2978-2978 2020年4月23日査読有り
Localization-specific distributions of protein pI in human proteome are governed by local pH and membrane charge

Atsushi Kurotani, Alexander A. Tokmakov, Ken-Ichi Sato, Vasily E. Stefanov, Yutaka Yamada, Tetsuya Sakurai

BMC Molecular and Cell Biology 20(1) 2019年8月20日査読有り
InterSpin: Integrated Supportive Webtools for Low- and High-Field NMR Analyses Toward Molecular Complexity

Shunji Yamada, Kengo Ito, Atsushi Kurotani, Yutaka Yamada, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

ACS Omega 4(2) 3361-3369 2019年2月28日査読有り
Identification of Arabidopsis genic and non‐genic promoters by paired‐end sequencing of TSS tags

Mutsutomo Tokizawa, Kazutaka Kusunoki, Hiroyuki Koyama, Atsushi Kurotani, Tetsuya Sakurai, Yutaka Suzuki, Tomoaki Sakamoto, Tetsuya Kurata, Yoshiharu Y. Yamamoto

The Plant Journal 90(3) 587-605 2017年4月4日査読有り

もっとみる

MISC

生活習慣と食嗜好がもたらす食事栄養素の傾向

權娟大, 桂樹哲雄, 小林暁雄, 黒谷篤之, 川村隆浩

第38回人工知能学会全国大会, 3Xin2-96 2024年5月
Antibiotic-dependent instability of homeostatic plasticity for growth and environmental load

Shunnosuke Okada, Yudai Inabu, Hirokuni Miyamoto, Kenta Suzuki, Tamotsu Kato, Atsushi Kurotani, Yutaka Taguchi, Ryoichi Fujino, Yuji Shiotsuka, Tetsuji Etoh …

2022年11月27日
Estimation of symbiotic bacterial structure in a sustainable seagrass ecosystem on recycled management

Hirokuni Miyamoto, Nobuhiro Kawachi, Atsushi Kurotani, Shigeharu Moriya, Wataru Suda, Kenta Suzuki, Makiko Matsuura, Naoko Tsuji, Teruno Nakaguma, Chitose Ishii …

2022年2月13日
Agricultural quality matrix-based multiomics structural analysis of carrots in soils fertilized with thermophile-fermented compost

Hirokuni Miyamoto, Katsumi Shigeta, Wataru Suda, Yasunori Ichihashi, Naoto Nihei, Makiko Matsuura, Arisa Tsuboi, Naoki Tominaga, Masahiko Aono, Muneo Sato …

2022年2月7日
A novel sustainable role of compost as a universal protective substitute for fish, chicken, pig, and cattle, and its estimation by structural equation modeling

Hirokuni Miyamoto, Wataru Suda, Hiroaki Kodama, Hideyuki Takahashi, Yumiko Nakanishi, Shigeharu Moriya, Kana Adachi, Nao Kiriyama, Masaya Wada, Daisuke Sudo …

2022年1月26日
Symbiotic bacterial network structure involved in carbon and nitrogen metabolism of wood-utilizing insect larvae

Hirokuni Miyamoto, Futo Asano, Koutarou Ishizawa, Wataru Suda, Hisashi Miyamoto, Naoko Tsuji, Makiko Matsuura, Arisa Tsuboi, Chitose Ishii, Teruno Nakaguma …

2022年1月24日

担当経験のある科目(授業)

バイオ系知的財産権、バイオ系データサイエンス、バイオインフォマティクス、蛋白質科学・核酸科学

所属学協会

2023年7月 - 現在

IEEE-SA Membership
2019年8月 - 現在

日本生物工学会
2018年6月 - 現在

日本弁理士会
2005年8月 - 2017年11月

日本植物生理学会
2005年8月 - 2017年7月

日本分子生物学会

Works(作品等)

ACS Omega, second cover picture

2021年6月

産業財産権

特願2024-055701 飲食物のレビュー情報に基づくレシピ評価装置及び方法

黒谷篤之、小林暁雄、桂樹哲雄、川村隆浩
特願2024-055700 レシピ情報に基づくレシピ評価装置及び方法

黒谷篤之、小林暁雄、桂樹哲雄、川村隆浩
特願2022-082681 環境因子予測装置、方法、プログラム、学習済モデルおよび記憶媒体

伊藤研吾, 菊地淳, 松本朋子, 朝倉大河, 黒谷篤之
特願2020-178381, PCT/JP2021/39305 ろ過膜のファウリングの重要因子算出装置、ファウリング発生予測装置、重要因子算出方法、ファウリング発生予測方法、プログラム、学習済モデル、記憶媒体および学習済モデルの作成方法

横山大稀、菊地淳、朝倉大河、黒谷篤之
特願2020-217774 ポリマー物性推定装置および学習方法

坂田研二、黒谷篤之、菊地淳、伊藤研吾、坪井裕理、松本朋子、鄭章代
特許7109123 環境因子予測装置、方法、プログラム、学習済モデルおよび記憶媒体

伊藤研吾、菊地淳、松本朋子、朝倉大河、黒谷篤之