岡橋伸幸 (Nobuyuki Okahashi) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学大学院情報科学研究科准教授
: 特定国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター客員研究員

学位: 博士（情報科学）(2017年3月大阪大学)
修士（情報科学）(2014年3月大阪大学)
学士（工学）(2012年3月大阪大学)

研究者番号: 30802748
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-9582-355X
J-GLOBAL ID: 202001014442288795
researchmap会員ID: R000003764

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年12月 - 現在

大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻准教授
2018年4月 - 現在

特定国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター客員研究員
2018年4月 - 2019年11月

大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻助教
2017年4月 - 2018年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センター特別研究員
2015年4月 - 2017年3月

独立行政法人日本学術振興会特別研究員DC2

学歴

2014年4月 - 2017年3月

大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
2012年4月 - 2014年3月

大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
2008年4月 - 2012年3月

大阪大学工学部応用自然科学科

委員歴

受賞

2016年3月

第81年会本部大会学生賞最優秀学生賞化学工学会

岡橋伸幸
2015年6月

第63回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞ポスター発表部門優秀賞日本質量分析学会

岡橋伸幸
2015年3月

第80年会本部大会学生賞特別賞化学工学会

岡橋伸幸
2014年10月

第3回飛翔賞日本生物工学会

岡橋伸幸
2014年5月

第62回質量分析総合討論会ベストプレゼンテーション賞優秀賞日本質量分析学会

岡橋伸幸

論文

Simple and Rapid Non-ribosomal Peptide Synthetase Gene Assembly Using the SEAM–OGAB Method

Varada Jagadeesh, Takanobu Yoshida, Misugi Uraji, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Christopher J. Vavricka, Kenji Tsuge, Akihiko Kondo

ACS Synthetic Biology 2022年12月23日査読有り
Data Processing of Product Ion Spectra: Quality Improvement by Averaging Multiple Similar Spectra of Small Molecules

Fumio Matsuda, Shuka Komori, Yuki Yamada, Daiki Hara, Nobuyuki Okahashi

Mass Spectrometry 11(1) A0106-A0106 2022年12月15日査読有り
Lipidome variation of industrial Saccharomyces cerevisiae strains analyzed by LC-QTOF/MS-based untargeted lipidomics

Shuka Komori, Nobuyuki Okahashi, Junko Iida, Fumio Matsuda

Journal of Bioscience and Bioengineering 2022年12月査読有り責任著者
Isotope Calculation Gadgets: A Series of Software for Isotope-Tracing Experiments in Garuda Platform

Nobuyuki Okahashi, Yuki Yamada, Junko Iida, Fumio Matsuda

Metabolites 12(7) 646-646 2022年7月14日査読有り筆頭著者
Structures and functions of the gut microbial lipidome

Satoshi Morozumi, Masahiro Ueda, Nobuyuki Okahashi, Makoto Arita

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids 1867(3) 159110-159110 2022年3月査読有り招待有り
Comparative Evaluation of Plasma Metabolomic Data from Multiple Laboratories

Shin Nishiumi, Yoshihiro Izumi, Akiyoshi Hirayama, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Kosuke Hata, Daisuke Saigusa, Eiji Hishinuma, Naomi Matsukawa, Suzumi M. Tokuoka, Yoshihiro Kita, Fumie Hamano, Nobuyuki Okahashi, Kazutaka Ikeda, Hiroki Nakanishi, Kosuke Saito, Masami Yokota Hirai, Masaru Yoshida, Yoshiya Oda, Fumio Matsuda, Takeshi Bamba

Metabolites 12(2) 135-135 2022年2月1日査読有り
mfapy: An open-source Python package for 13C-based metabolic flux analysis

Fumio Matsuda, Kousuke Maeda, Takeo Taniguchi, Yuya Kondo, Futa Yatabe, Nobuyuki Okahashi, Hiroshi Shimizu

Metabolic Engineering Communications 13 e00177-e00177 2021年12月査読有り
Global profiling of gut microbiota-associated lipid metabolites in antibiotic-treated mice by LC-MS/MS-based analyses

Nobuyuki Okahashi, Masahiro Ueda, Shu Yasuda, Hiroshi Tsugawa, Makoto Arita

STAR Protocols 2(2) 100492-100492 2021年6月査読有り招待有り筆頭著者
Comparative 13 C‐metabolic flux analysis indicate elevation of ATP regeneration, carbon dioxide, and heat production in industrial Saccharomyces cerevisiae strains

Futa Yatabe, Nobuyuki Okahashi, Taisuke Seike, Fumio Matsuda

Biotechnology Journal 2000438-2000438 2021年5月査読有り
Staphylococcus cohnii is a potentially biotherapeutic skin commensal alleviating skin inflammation

Yoshihiro Ito, Takashi Sasaki, Youxian Li, Takeshi Tanoue, Yuki Sugiura, Ashwin N. Skelly, Wataru Suda, Yusuke Kawashima, Nobuyuki Okahashi, Eiichiro Watanabe, Hiroto Horikawa, Aiko Shiohama, Rina Kurokawa, Eiryo Kawakami, Hachiro Iseki, Hiroshi Kawasaki, Yoichiro Iwakura, Atsushi Shiota, Liansheng Yu, Junzo Hisatsune, Haruhiko Koseki, Motoyuki Sugai, Makoto Arita, Osamu Ohara, Takeshi Matsui, Makoto Suematsu, Masahira Hattori, Koji Atarashi, Masayuki Amagai, Kenya Honda

Cell Reports 35(4) 109052-109052 2021年4月査読有り
Treatment of RB1‐intact hepatocellular carcinoma with CDK4/6 inhibitor combination therapy

Jindan Sheng, Susumu Kohno, Nobuhiro Okada, Nobuyuki Okahashi, Kana Teranishi, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu, Paing Linn, Naoko Nagatani, Minako Yamamura, Kenichi Harada, Shin‐ichi Horike, Hiroshi Inoue, Seiji Yano, Sharad Kumar, Shunsuke Kitajima, Itsuki Ajioka, Chiaki Takahashi

Hepatology 74(4) 1971-1993 2021年4月査読有り
Analyses of Lipid A Diversity in Gram-Negative Intestinal Bacteria Using Liquid Chromatography–Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry

Nobuyuki Okahashi, Masahiro Ueda, Fumio Matsuda, Makoto Arita

Metabolites 11(4) 197-197 2021年3月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Synthetic production of prenylated naringenins in yeast using promiscuous microbial prenyltransferases

Shota Isogai, Nobuyuki Okahashi, Ririka Asama, Tomomi Nakamura, Tomohisa Hasunuma, Fumio Matsuda, Jun Ishii, Akihiko Kondo

Metabolic Engineering Communications 12 e00169-e00169 2021年3月査読有り
Senolysis by glutaminolysis inhibition ameliorates various age-associated disorders.

Yoshikazu Johmura, Takehiro Yamanaka, Satotaka Omori, Teh-Wei Wang, Yuki Sugiura, Masaki Matsumoto, Narumi Suzuki, Soichiro Kumamoto, Kiyoshi Yamaguchi, Seira Hatakeyama, Tomoyo Takami, Rui Yamaguchi, Eigo Shimizu, Kazutaka Ikeda, Nobuyuki Okahashi, Ryuta Mikawa, Makoto Suematsu, Makoto Arita, Masataka Sugimoto, Keiichi I Nakayama, Yoichi Furukawa, Seiya Imoto, Makoto Nakanishi

Science (New York, N.Y.) 371(6526) 265-270 2021年1月15日査読有り
Helicobacter pylori metabolites exacerbate gastritis through C-type lectin receptors

Masahiro Nagata, Kenji Toyonaga, Eri Ishikawa, Shojiro Haji, Nobuyuki Okahashi, Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Akihiro Imamura, Koichi Takato, Hideharu Ishida, Shigenori Nagai, Petr Illarionov, Bridget L. Stocker, Mattie S.M. Timmer, Dylan G.M. Smith, Spencer J. Williams, Takeshi Bamba, Tomofumi Miyamoto, Makoto Arita, Ben J. Appelmelk, Sho Yamasaki

Journal of Experimental Medicine 218(1) 2021年1月4日査読有り
Elucidation of Gut Microbiota-Associated Lipids Using LC-MS/MS and 16S rRNA Sequence Analyses

Shu Yasuda, Nobuyuki Okahashi, Hiroshi Tsugawa, Yusuke Ogata, Kazutaka Ikeda, Wataru Suda, Hiroyuki Arai, Masahira Hattori, Makoto Arita

iScience 23(12) 101841-101841 2020年12月査読有り筆頭著者
A lipidome atlas in MS-DIAL 4.

Hiroshi Tsugawa, Kazutaka Ikeda, Mikiko Takahashi, Aya Satoh, Yoshifumi Mori, Haruki Uchino, Nobuyuki Okahashi, Yutaka Yamada, Ipputa Tada, Paolo Bonini, Yasuhiro Higashi, Yozo Okazaki, Zhiwei Zhou, Zheng-Jiang Zhu, Jeremy Koelmel, Tomas Cajka, Oliver Fiehn, Kazuki Saito, Masanori Arita, Makoto Arita

Nature biotechnology 38(10) 1159-1163 2020年6月15日査読有り
Computational data mining method for isotopomer analysis in the quantitative assessment of metabolic reprogramming

Fumio Matsuda, Kousuke Maeda, Nobuyuki Okahashi

Scientific Reports 10(1) 2020年1月14日査読有り
Inter-laboratory comparison of metabolite measurements for metabolomics data integration

Yoshihiro Izumi, Fumio Matsuda, Akiyoshi Hirayama, Kazutaka Ikeda, Yoshihiro Kita, Kanta Horie, Daisuke Saigusa, Kosuke Saito, Yuji Sawada, Hiroki Nakanishi, Nobuyuki Okahashi, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Kosuke Hata, Yutaro Hoshi, Motohiko Morihara, Kazuhiro Tanabe, Takeshi Bamba, Yoshiya Oda

Metabolites 9(11) 2019年10月31日査読有り
Time-resolved analysis of short term metabolic adaptation at dark transition in Synechocystis sp. PCC 6803

Masaharu Maruyama, Hiroki Nishiguchi, Masakazu Toyoshima, Nobuyuki Okahashi, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu

Journal of Bioscience and Bioengineering 128(4) 424-428 2019年10月査読有り

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MISC

LC-QTOF/MSを用いたリン脂質の13Cトレーサー解析

70(4) 241-244 2022年12月1日招待有り
腸内細菌が生成する脂質代謝物の構造と機能

岡橋伸幸, 有田誠

肥満研究 28(1) 10-15 2022年7月招待有り筆頭著者
質量分析を用いた細菌のリピドミクス

上田政宏, 岡橋伸幸, 有田誠

JSBMS Letters 46(3) 38-42 2021年11月招待有り
微生物資源の活用に向けたノンターゲットメタボロミクス

岡橋伸幸

酵素工学ニュース 86 13-16 2021年10月招待有り筆頭著者責任著者
質量分析法を使った未知代謝物の計測と同定

岡橋伸幸, 松田史生, 有田誠

生物工学会誌 99(5) 233-236 2021年5月招待有り筆頭著者
時系列メタボローム解析を用いたがん細胞薬剤応答の解明

68(6) 90-92 2020年12月1日
腸内細菌のリポクオリティと生体制御

安田柊, 岡橋伸幸, 上田政宏, 有田誠

30(4) 51-57 2019年10月招待有り
糖リン酸の精密計測が明らかにする中心代謝フラックス

岡橋伸幸, 松田史生

バイオサイエンスとインダストリー 77(2) 116-118 2019年招待有り
Metabolic rewiring in Rb deficient cells during cancer progression

Susumu Kohno, Nobuyuki Okahashi, Shunsuke Kitajima, Sawako Suzuki, Tomoaki Tanaka, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu, Chiaki Takahashi

CANCER RESEARCH 76 2016年7月

書籍等出版物

Mass Spectrometry for Lipidomics: Methods and Applications

(担当:分担執筆)

Wiley-VCH 2023年2月13日 (ISBN: 3527350152)
メタボロミクス実践ガイド

岡橋, 伸幸, 津川, 裕司 (担当:分担執筆, 範囲:LC-MS/MSノンターゲットリピドミクスのデータ処理プロトコール)

羊土社 2021年4月 (ISBN: 9784758122511)
メタボロミクス実践ガイド

岡橋, 伸幸, 松田, 史生 (担当:分担執筆, 範囲:13C標識トレーサー解析)

羊土社 2021年4月 (ISBN: 9784758122511)
ヒトマイクロバイオーム Vol.2 解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線

岡橋伸幸, 上田政宏, 有田誠 (担当:分担執筆, 範囲:第1編第2章第2節マイクロバイオームのリピドミクス)

NTS(エヌ・ティー・エス) 2020年6月 (ISBN: 9784860436599)
代謝センシング : 健康, 食, 美容, 薬, そして脳の代謝を知る

岡橋伸幸, 松田史生, 清水浩 (担当:分担執筆, 範囲:第25章動物培養細胞の13C代謝フラックス解析)

シーエムシー出版 2018年 (ISBN: 9784781313504)

講演・口頭発表等

多階層データを用いたヒト乳がん由来細胞株のサブタイプ間代謝解析

岡橋伸幸, 西本和生, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生

第16回メタボロームシンポジウム 2022年9月15日
時系列メタボロミクスを用いたタモキシフェン処理後の乳がん細胞株MCF-7における代謝応答解析

岡橋伸幸

第70回質量分析総合討論会 2022年6月24日招待有り
微生物の新規代謝物－酵素遺伝子の統合オミクス推定法の開発

岡橋伸幸

ACT-X 「環境とバイオテクノロジー」は地球環境の危機を救う！Ⅱ 2022年4月11日招待有り
食品産業酵母の形質に関与する脂質分子の網羅解析

小森柊花, 岡橋伸幸, 遠山敦彦, 飯田順子, 松田史生

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月16日
代謝フラックス解析から見えてきた好気的解糖のメリット

岡橋伸幸

令和3年度金沢大学がん進展制御研究所共同利用・共同研究拠点研究成果報告会 2022年2月17日招待有り
同位体標識を用いた代謝トレーシング解析のためのソフトウェア開発

岡橋伸幸, 松田史生

第44回日本分子生物学会年会 2021年12月2日
ノンターゲットリピドミクスを用いた腸内細菌脂質の計測と同定

岡橋伸幸, 安田柊, 津川裕司, 池田和貴, 有田誠

第73回日本生物工学会大会 2021年10月29日
13C代謝フラックス解析法を用いた好中球の中心炭素代謝の解析

岡橋伸幸, 谷口赳夫, 松田史生

第15回メタボロームシンポジウム 2021年10月15日招待有り
OT-2を用いたHPLCサンプル調製の自動化

岡橋伸幸

Laboratory Automation月例勉強会/2021.08 2021年8月20日招待有り
LC-QTOF/MSを用いたグラム陰性腸内細菌のLipid Aの解析

岡橋伸幸, 上田政宏, 松田史生, 有田誠

第69回質量分析総合討論会 2021年5月19日
未知代謝物の計測と同定

岡橋伸幸

バイオ計測サイエンス研究部会2020シンポジウム 2020年8月24日
質量分析で中心炭素代謝の流れを見る

岡橋伸幸松田史生

日本農芸化学会2020年度福岡大会 2020年3月招待有り
腸内細菌叢の網羅的代謝物解析

岡橋伸幸

バイオインフォマティクス相談部会第三回講演会～大規模計測技術とインフォマティクスと自動化 2019年11月20日招待有り
代謝フラックス解析

岡橋伸幸

日本プロテオーム学会2019年大会第70回日本電気泳動学会総会 2019年7月招待有り

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

Isotope Calculation Gadgets

2021年7月コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

13C代謝フラックス解析を用いた分化細胞の代謝計測と運命制御

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2020年4月 - 2023年3月

岡橋伸幸
微生物の新規代謝物－酵素遺伝子の統合オミクス推定法の開発

国立研究開発法人科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業 ACT-X 2020年12月 - 2023年3月
代謝フラックス解析を用いたがん幹細胞特異的代謝の解明

金沢大学がん進展制御研究所若手奨励研究 2021年4月
好酸球の中心代謝と12/15-リポキシゲナーゼを介した炎症収束メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2017年8月 - 2019年3月

岡橋伸幸
遊離代謝物を用いた１３Ｃ代謝フラックス解析法の構築と動物細胞代謝プロセスへの応用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2015年4月 - 2017年3月

岡橋伸幸

産業財産権

特願2021-027052 同位体分布データ作成方法

岡橋伸幸, 松田史生, 岡本真美, 山田洋平

学術貢献活動

Metabolites誌 Reviewer board

査読

MDPI 2021年4月1日 - 現在

メディア報道

腸内細菌叢の複雑な脂質多様性を解明する手法を開発（理化学研究所プレスリリース）

理化学研究所プレスリリース 2021年4月その他
生命の脂質多様性を解明（理化学研究所プレスリリース）

理化学研究所プレスリリース 2020年6月その他
世界初！代謝を正確に計測する新技術を開発（大阪大学プレスリリース）

大阪大学プレスリリース 2018年9月その他
がん細胞代謝物感度10倍で解析

日本経済新聞 2018年9月新聞・雑誌

岡橋伸幸

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

学術貢献活動

メディア報道

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