岡村容伸 (Yasunobu Okamura) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学未来型医療創成センター助教

学位: 博士（情報科学）(東北大学)

J-GLOBAL ID: 201801019937188804
researchmap会員ID: B000295405

研究キーワード

バイオインフォマティクス

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

経歴

2018年4月 - 現在

東北大学, 未来型医療創成センター, 助教

学歴

2011年4月 - 2016年3月

東北大学, 情報科学研究科, 応用情報科学専攻

論文

Next-generation sequencing analysis with a population-specific human reference genome.

Tomohisa Suzuki, Kota Ninomiya, Takamitsu Funayama, Yasunobu Okamura, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Shigeo Kure, Atsuo Kikuchi, Gen Tamiya …

Genes & genetic systems 2024年10月28日
Two-stage strategy using denoising autoencoders for robust reference-free genotype imputation with missing input genotypes

Kaname Kojima, Shu Tadaka, Yasunobu Okamura, Kengo Kinoshita

Journal of Human Genetics 69(10) 511-518 2024年6月25日
Molecular pathological demonstration of an unusual angiosarcoma-like dedifferentiation pattern in hepatocellular carcinoma.

Keigo Murakami, Taito Itoh, Yasunobu Okamura, Kengo Kinoshita, Hideki Ota, Michiaki Unno, Takashi Kamei, Toru Furukawa

Pathology international 74(3) 157-159 2024年2月6日
Next-generation sequencing analysis with a population-specific human reference genome

Tomohisa Suzuki, Kota Ninomiya, Takamitsu Funayama, Yasunobu Okamura, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Shigeo Kure, Atsuo Kikuchi, Gen Tamiya …

Genes & Genetic Systems 2024年
jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023.

Shu Tadaka, Junko Kawashima, Eiji Hishinuma, Sakae Saito, Yasunobu Okamura, Akihito Otsuki, Kaname Kojima, Shohei Komaki, Yuichi Aoki, Takanari Kanno …

Nucleic acids research 2023年11月1日
Gene rearrangement and expression of PRKACA and PRKACB governs morpho-biology of pancreatobiliary oncocytic neoplasms

Taito Itoh, Yuko Omori, Mitsuru Seino, Katsuya Hirose, Fumiko Date, Yusuke Ono, Yusuke Mizukami, Shuichi Aoki, Masaharu Ishida, Masamichi Mizuma …

Modern Pathology 100358-100358 2023年10月
Salivary gland cancer organoids are valid for preclinical genotype-oriented medical precision trials.

Tomohiko Ishikawa, Takenori Ogawa, Masahiro Shiihara, Hajime Usubuchi, Yuko Omori, Katsuya Hirose, Taito Itoh, Takuya Yoshida, Ayako Nakanome, Akira Okoshi …

iScience 26(5) 106695-106695 2023年5月19日査読有り
Morphometric analysis of nuclear shape irregularity as a novel predictor of programmed death-ligand 1 expression in lung squamous cell carcinoma.

Ryoko Saito-Koyama, Keiichi Tamai, Jun Yasuda, Yasunobu Okamura, Yuto Yamazaki, Chihiro Inoue, Yasuhiro Miki, Jiro Abe, Hisashi Oishi, Ikuro Sato …

Virchows Archiv : an international journal of pathology 2023年5月12日
Plasma metabolic disturbances during pregnancy and postpartum in women with depression.

Zhiqian Yu, Naomi Matsukawa, Daisuke Saigusa, Ikuko N Motoike, Chiaki Ono, Yasunobu Okamura, Tomomi Onuma, Yuta Takahashi, Mai Sakai, Hisaaki Kudo …

iScience 25(12) 105666-105666 2022年12月22日査読有り
jMorp: Japanese Multi Omics Reference Panel

田高周, 菱沼英史, 井上仁, 青木裕一, 岡村容伸, 川嶋順子, 大槻晃史, 田口恵子, 菅野貴成, 元池育子 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
Construction of a trio-based structural variation panel utilizing activated T lymphocytes and long-read sequencing technology.

Akihito Otsuki, Yasunobu Okamura, Noriko Ishida, Shu Tadaka, Jun Takayama, Kazuki Kumada, Junko Kawashima, Keiko Taguchi, Naoko Minegishi, Shinichi Kuriyama …

Communications biology 5(1) 991-991 2022年9月20日
X chromosome aneuploidies and schizophrenia: association analysis and phenotypic characterization

Itaru Kushima, Branko Aleksic, Hiroki Kimura, Masahiro Nakatochi, Tzuyao Lo, Masashi Ikeda, Makoto Arai, Ryota Hashimoto, Shusuke Numata, Yasunobu Okamura …

Psychiatry and Clinical Neurosciences 2022年9月8日
患者由来がんオルガノイドの増殖と粘液分泌の特徴からみたIPMNの浸潤性表現型の立証(Characteristics of growth and mucus secretion of patient-derived organoids may substantiate invasive phenotypes of IPMN)

Shiihara Masahiro, Ishikawa Tomohiko, Yoshida Takuya, Omori Yuko, Hirose Katsuya, Morikawa Takanori, Nakagawa Kei, Mizuma Masamichi, Otsuka Hideo, Motoi Fuyuhiko …

膵臓 37(3) A391-A392 2022年9月
The association between ERK inhibitor sensitivity and molecular characteristics in colorectal cancer.

Hodaka Tayama, Hideaki Karasawa, Akihiro Yamamura, Yasunobu Okamura, Fumiki Katsuoka, Hideyuki Suzuki, Taiki Kajiwara, Minoru Kobayashi, Yuuri Hatsuzawa, Masahiro Shiihara …

Biochemical and biophysical research communications 560 59-65 2021年6月30日
Development of a system combining comprehensive genotyping and organoid cultures for identifying and testing genotype-oriented personalised medicine for pancreatobiliary cancers

Masahiro Shiihara, Tomohiko Ishikawa, Yuriko Saiki, Yuko Omori, Katsuya Hirose, Shinichi Fukushige, Naoki Ikari, Ryota Higuchi, Masakazu Yamamoto, Takanori Morikawa …

European Journal of Cancer 148 239-250 2021年5月
jMorp updates in 2020: large enhancement of multi-omics data resources on the general Japanese population.

Shu Tadaka, Eiji Hishinuma, Shohei Komaki, Ikuko N Motoike, Junko Kawashima, Daisuke Saigusa, Jin Inoue, Jun Takayama, Yasunobu Okamura, Yuichi Aoki …

Nucleic acids research 49(D1) D536-D544 2021年1月8日
Whole exome sequencing and establishment of an organoid culture of the carcinoma showing thymus-like differentiation (CASTLE) of the parotid gland

Tomohiko Ishikawa, Takenori Ogawa, Ayako Nakanome, Yasunari Yamauchi, Hajime Usubuchi, Masahiro Shiihara, Takuya Yoshida, Yasunobu Okamura, Kengo Kinoshita, Yukio Katori …

Virchows Archiv 2021年1月7日
Identification of dominant transcripts in oxidative stress response by a full-length transcriptome analysis

Akihito Otsuki, Yasunobu Okamura, Yuichi Aoki, Noriko Ishida, Kazuki Kumada, Naoko Minegishi, Fumiki Katsuoka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto

Molecular and Cellular Biology 2020年11月9日
Construction and Integration of Three De Novo Japanese Human Genome Assemblies toward a Population-Specific Reference

Jun Takayama, Shu Tadaka, Kenji Yano, Fumiki Katsuoka, Chinatsu Gocho, Takamitsu Funayama, Satoshi Makino, Yasunobu Okamura, Atsuo Kikuchi, Junko Kawashima …

2019年12月2日査読有り
A 12-kb structural variation in progressive myoclonic epilepsy was newly identified by long-read whole-genome sequencing

Mizuguchi Takeshi, Suzuki Takeshi, Abe Chihiro, Umemura Ayako, Tokunaga Katsushi, Kawai Yosuke, Nakamura Minoru, Nagasaki Masao, Kinoshita Kengo, Okamura Yasunobu …

JOURNAL OF HUMAN GENETICS 64(5) 359-368 2019年5月査読有り

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MISC

高異型度PanIN/膵上皮内癌・小径膵癌の分子進化モデル(Molecular evolutionary model of early pancreatic cancer)

伊藤泰斗, 大森優子, 小野裕介, 高橋賢治, 岡村容伸, 木下賢吾, 正宗淳, 海野倫明, 水上裕輔, 古川徹

日本病理学会会誌 113(1) 318-318 2024年2月
高異型度PanIN/膵上皮内癌・小径膵癌の分子進化モデル(Molecular evolutionary model of early pancreatic cancer)

伊藤泰斗, 大森優子, 小野裕介, 高橋賢治, 岡村容伸, 木下賢吾, 正宗淳, 海野倫明, 水上裕輔, 古川徹

日本病理学会会誌 113(1) 318-318 2024年2月
スパコン・クラウドを生命科学に使う Data-visitingモデルによる機微性の高いデータ共有セキュリティレベルの異なる大容量データの共有

木下賢吾, 木下賢吾, 木下賢吾, 岡村容伸, 岡村容伸

実験医学 40(6) 2022年
患者由来IPMNオルガノイドとゲノム解析を用いた増殖形態の解明

椎原正尋, 石川智彦, 大森優子, 元井冬彦, 森川孝則, 中川圭, 林洋毅, 水間正道, 大塚英郎, 岡村容伸 …

日本外科学会定期学術集会(Web) 122nd 2022年
長鎖リードシークエンス技術を用いた日本人構造多型パネルJSV1の構築

大槻晃史, 大槻晃史, 岡村容伸, 岡村容伸, 勝岡史城, 勝岡史城, 木下賢吾, 木下賢吾, 木下賢吾, 木下賢吾 …

日本生化学会大会(Web) 95th 2022年
膵胆道癌オルガノイドの個別化医療モデルへの活用

椎原正尋, 椎原正尋, 樋口亮太, 岡村容伸, 木下賢吾, 山本雅一, 元井冬彦, 海野倫明, 古川徹

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 80th 2021年
Clinical Sequencing for Patients with Pancreatic Cancer

Hideyuki Hayashi, Shigeki Tanishima, Ryo Mori, Yasunobu Okamura, Toraji Amano, Ichiro Kinoshita, Yoshito Komatsu, Hirotoshi Dosaka-akita, Hiroshi Nishihara

ANNALS OF ONCOLOGY 28 88-88 2017年10月
Clinical implementation of a comprehensive targeted amplicon sequencing system for cancer in Japan.

Hideyuki Hayashi, Shigeki Tanishima, Ryo Mori, Yasunobu Okamura, Toraji Amano, Ichiro Kinoshita, Yoshito Komatsu, Hirotoshi Akita, Hiroshi Nishihara

JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 35 2017年5月
Gene module detection from the conservation of gene coexpression patterns among species

Yasunobu Okamura, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita

研究報告バイオ情報学（BIO） 2013(5) 1-2 2013年3月14日
生物種間の遺伝子発現パターンの比較解析

岡村容伸, 大林武, 木下賢吾

研究報告バイオ情報学（BIO） 2012(2) 1-2 2012年3月21日

共同研究・競争的資金等の研究課題

日本ゲノムコホート連携で挑む代謝性疾患関連コピー数バリアントの同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

中杤昌弘, 久島周, 岡村容伸, 中野詩織, 武林亨, 須藤洋一, 小柳友理子, 尾瀬功
ゲノム反復多型伸長変動と認知機能低下を伴う前臨床期神経変性筋疾患の遺伝病態の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

平良摩紀子, 岡村容伸, 布施昇男, 三木篤也, 田高周
オルガノイド培養を応用した大腸癌に対する次世代個別化医療の実現に向けて

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

唐澤秀明, 大沼忍, 山村明寛, 黒羽正剛, 小峰啓吾, 岡村容伸

岡村容伸

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論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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