Yoshihiro Okumura

Profile Information

Affiliation: 特定国立研究開発法人理化学研究所脳神経科学研究センター統合計算脳科学連携部門神経情報基盤開発ユニット

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-9650-0362
J-GLOBAL ID: 201101066983482420

External link: https://www.ni.riken.jp/

Research Interests

Research Areas

Life sciences / Neuroscience - general /

Research History

4 2018 - Present

Neuroinformatics Unit, Integrative Computational Brain Science Collaboration Division, RIKEN Center for Brain Science
4 2006 - 3 2018

Neuroinformatics Japan Center, RIKEN BSI
4 2003 - 3 2006

Laboratory for Neuroinformatics, RIKEN BSI

Papers

Open source code for behavior analysis in rodents

Satoko Hattori, Yoshihiro Okumura, Keizo Takao, Yoko Yamaguchi, Tsuyoshi Miyakawa

Neuropsychopharmacology Reports 39(1) 67 - 69 3 2019 Peer-reviewed
ViBrism DB: an interactive search and viewer platform for 2D/3D anatomical images of gene expression and co-expression networks.

Morita M, Shimokawa K, Nishimura M, Nakamura S, Tsujimura Y, Takemoto S, Tawara T, Yokota H, Wemler S, Miyamoto D, Ikeno H, Sato A, Furuichi T, Kobayashi N, Okumura Y, Yamaguchi Y, Okamura-Oho Y

Nucleic acids research 47(D1) D859 - D866 1 2019 Peer-reviewed
Neuroinformatics Infrastructure for data sharing developed in J-Node

Yamaguchi Yoko, Okumura Yoshihiro, Kannon Takayuki, Kazawa Tomoki, Suenaga Sawako, Ishii Itsuko, Honda Ayumi, Ogawa Miyabi, Usui Shiro

Frontiers in Neuroinformatics 10 2016 Peer-reviewed
Reprint of: Simulation Platform: A cloud-based online simulation environment

Tadashi Yamazaki, Hidetoshi Ikeno, Yoshihiro Okumura, Shunji Satoh, Yoshimi Kamiyama, Yutaka Hirata, Keiichiro Inagaki, Akito Ishihara, Takayuki Kannon, Shiro Usui

NEURAL NETWORKS 24(9) 927 - 932 11 2011 Peer-reviewed
Simulation Platform: A cloud-based online simulation environment

Tadashi Yamazaki, Hidetoshi Ikeno, Yoshihiro Okumura, Shunji Satoh, Yoshimi Kamiyama, Yutaka Hirata, Keiichiro Inagaki, Akito Ishihara, Takayuki Kannon, Shiro Usui

NEURAL NETWORKS 24(7) 693 - 698 9 2011 Peer-reviewed

Misc.

ニューロインフォマティクスにおけるシステム解析支援環境に関する研究

奥村嘉宏, 石原彰人, 臼井支朗

電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング 102(729) 37 - 42 3 10, 2003
視覚系のニューロインフォマティクス研究支援環境 : VISIOME PLATFORMの概要(企画セッション「ニューロインフォーマティックスとは何か」)

池野英利, 神山斉己, 山口功, 竹部啓輔, 藤井康夫, 奥村嘉宏, 臼井支朗

電子情報通信学会技術研究報告. MBE, MEとバイオサイバネティックス 103(489) 73 - 78 12 1, 2003
視覚系のニューロインフォマティクス研究支援環境 : VISIOME PLATFORMの概要(企画セッション「ニューロインフォーマティックスとは何か」)

池野英利, 神山斉己, 山口功, 竹部啓輔, 藤井康夫, 奥村嘉宏, 臼井支朗

電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング 103(490) 79 - 84 12 1, 2003
視覚系のニューロインフォマティクス研究支援環境 : VISIOME PLATFORM の概要

池野英利, 神山斉己, 山口功, 竹部啓輔, 藤井康夫, 奥村嘉宏, 臼井支朗

電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング 103(490) 79 - 84 12 1, 2003
Neuroinformaticsデータベース基盤システムの開発

山地一禎, 奥村嘉宏, 堺浩之, 永田憲範, 池野英利, 臼井支朗

日本神経回路学会第15回全国大会 9 2005

Professional Memberships

1 2020 - Present

The Japan Neuroscience Society

Committee Memberships

1 2020 - 12 2022

The Japan Neuroscience Society Brain Science Dictionary Committee
1 2020 - 12 2022

The Japan Neuroscience Society Information Infrastructure Committee

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