大友章裕 (Akihiro Otomo) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学助教

連絡先: otomoaims.ac.jp
研究者番号: 30886560
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-6709-4206
J-GLOBAL ID: 202001016497988950
researchmap会員ID: R000005437

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2024年10月 - 現在

京都大学, 大学院理学研究科化学専攻, 助教
2020年5月 - 2024年10月

分子科学研究所
2020年4月 - 2020年5月

日本学術振興会, 特別研究員PD
2019年10月 - 2020年3月

日本学術振興会, 特別研究員PD（資格変更）
2019年4月 - 2019年9月

日本学術振興会, 特別研究員DC2
2014年4月 - 2016年9月

日清食品ホールディングス株式会社, グローバル食品安全研究所

学歴

2016年10月 - 2019年9月

大阪大学, 大学院理学研究科, 化学専攻博士後期課程
2012年4月 - 2014年3月

大阪大学, 大学院理学研究科, 化学専攻博士前期課程
2008年4月 - 2012年3月

大阪大学, 理学部, 化学科

受賞

論文

Rational engineering of DNA-nanoparticle motor with high speed and processivity comparable to motor proteins

Takanori Harashima, Akihiro Otomo, Ryota Iino

Nature Communications 2025年1月16日査読有り
ATP synthesis of Enterococcus hirae V-ATPase driven by sodium motive force

Akihiro Otomo, Lucy Gao Hui Zhu, Yasuko Okuni, Mayuko Yamamoto, Ryota Iino

2024年12月27日筆頭著者責任著者
Visualizing Single V-ATPase Rotation Using Janus Nanoparticles

Akihiro Otomo, Jared Wiemann, Swagata Bhattacharyya, Mayuko Yamamoto, Yan Yu, Ryota Iino

Nano Letters 2024年12月11日査読有り筆頭著者
Na+-V-ATPase inhibitor curbs VRE growth and unveils Na+ pathway structure

Kano Suzuki, Yoshiyuki Goto, Akihiro Otomo, Kouki Shimizu, Shohei Abe, Katsuhiko Moriyama, Satoshi Yasuda, Yusuke Hashimoto, Jun Kurushima, Sho Mikuriya …

Nature Structural & Molecular Biology 2024年11月21日査読有り
Unusual Vibrational Coupling of the Schiff Base in the Retinal Chromophore of Sodium Ion-Pumping Rhodopsins

Taiki Nakamura, Yuka Shinozaki, Akihiro Otomo, Taito Urui, Misao Mizuno, Rei Abe-Yoshizumi, Manami Hashimoto, Keiichi Kojima, Yuki Sudo, Hideki Kandori …

The Journal of Physical Chemistry B 2024年8月15日査読有り
Mechanism-based design of DNA-nanoparticle motor with high speed and processivity comparable to motor proteins

Takanori Harashima, Akihiro Otomo, RYOTA IINO

bioRxiv 2024年5月28日
Sub-Tip-Radius Near-Field Interactions in Nano-FTIR Vibrational Spectroscopy on Single Proteins

Jun Nishida, Akihiro Otomo, Takanori Koitaya, Akitoshi Shiotari, Taketoshi Minato, Ryota Iino, Takashi Kumagai

Nano Letters 2024年1月9日査読有り
Protein dynamics of a light-driven Na⁺ pump rhodopsin probed using a tryptophan residue near the retinal chromophore

Akihiro Otomo, Misao Mizuno, Keiichi Inoue, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani

Biophysics and Physicobiology 2023年2月25日査読有り筆頭著者
Direct observation of stepping rotation of V-ATPase reveals rigid component in coupling between Vo and V1 motors.

Akihiro Otomo, Tatsuya Iida, Yasuko Okuni, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(42) e2210204119 2022年10月18日査読有り筆頭著者
Tackle “Molecular Engine” by early-career researchers

Akihiro Otomo, Takahiro Kosugi

Biophysics and Physicobiology 19 e190039 2022年査読有り筆頭著者責任著者
Resonance Raman Determination of Chromophore Structures of Heliorhodopsin Photointermediates.

Taito Urui, Misao Mizuno, Akihiro Otomo, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani

The journal of physical chemistry. B 125(26) 7155-7162 2021年7月8日査読有り
Allosteric Communication with the Retinal Chromophore upon Ion Binding in a Light-Driven Sodium Ion-Pumping Rhodopsin.

Akihiro Otomo, Misao Mizuno, Keiichi Inoue, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani

Biochemistry 59(4) 520-529 2020年2月4日査読有り筆頭著者
Resonance Raman Investigation of the Chromophore Structure of Heliorhodopsins.

Akihiro Otomo, Misao Mizuno, Manish Singh, Wataru Shihoya, Keiichi Inoue, Osamu Nureki, Oded Béjà, Hideki Kandori, Yasuhisa Mizutani

The journal of physical chemistry letters 9(22) 6431-6436 2018年11月15日査読有り筆頭著者
A Study of the Dynamics of the Heme Pocket and C-helix in CooA upon CO Dissociation Using Time-Resolved Visible and UV Resonance Raman Spectroscopy.

Akihiro Otomo, Haruto Ishikawa, Misao Mizuno, Tetsunari Kimura, Minoru Kubo, Yoshitsugu Shiro, Shigetoshi Aono, Yasuhisa Mizutani

The journal of physical chemistry. B 120(32) 7836-43 2016年8月18日査読有り筆頭著者

MISC

Sub-tip-radius near-field interactions in nano-FTIR vibrational spectroscopy on single protein particles

Jun Nishida, Akihiro Otomo, Ryota Iino, Takashi Kumagai

Enhanced Spectroscopies and Nanoimaging 2023 2023年10月3日
Structural changes in the heme and heme pocket upon CO dissociation of CooA observed by time-resolved resonance Raman spectroscopy

A. Otomo, H. Ishikawa, M. Mizuno, Y. Mizutani, S. Aono

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S287-S287 2014年3月

講演・口頭発表等

Sodium motive force-driven ATP synthesis by EhV-ATPase

Akihiro Otomo, Lucy ZHU, Mayuko Yamamoto, Yasuko Okuni, Ryota Iino

21st International Union for Pure and Applied Biophysics and 62nd Biophysics Society of Japan 2024年6月26日招待有り
Molecular Studies on Rotary V-ATPase

日本生物物理学会北海道支部講演会 2024年6月14日招待有り
回転型V-ATPaseのイオン選択性の変換

大友章裕, Yuan-E Lee, Raymond N Burton-Smith, 山守優, 鈴木花野, 村田武士, 富井健太郎, 村田和義, 飯野亮太

第24回日本蛋白質科学会年会 2024年6月13日
腸球菌由来V-ATPaseはナトリウムイオン駆動力でATPを合成する

大友章裕, Lucy Gao Hui Zhu, 山本真由子, 大国泰子, 飯野亮太

2023年度生物物理学会中部支部討論会 2024年3月19日
腸球菌由来V-ATPaseはナトリウムイオン駆動力でATPを合成する

日本生体エネルギー研究会第49回討論会 2023年12月15日
１分子散乱イメージングによる回転分子モーター V-ATPaseの回転機構の解明

第9回バイオダイナミクス研究会 2023年12月14日招待有り
腸球菌由来V-ATPaseはナトリウムイオン駆動力でATPを合成する

第61回日本生物物理学会年会 2023年11月15日
Sodium motive force-driven ATP synthesis of EhV-ATPase

第12回分子モーター討論会 2023年9月27日
多重配列アライメントとスクリーニング法による新規モータータンパク質の創生

大友章裕, Song Chihong、Raymo, N. Burton-Smith, 富井健太郎, 村田和義, 小嶋誠司, 飯野亮太

令和4年度日本生物物理学会中部支部講演会 2023年3月31日
１分子散乱イメージングによる回転分子モータータンパク質の構造ダイナミクス研究

物性研究所機能物性セミナー 2023年2月16日招待有り
生体内エネルギー変換機構の解明に向けた回転モータータンパク質改変体の創生

大友章裕, 原島崇徳, 飯野亮太

日本生体エネルギー研究会第48回討論会 2022年12月15日
Single-molecule analysis and engineering of Na+-pumping V-ATPase

Akihiro Otomo, Ryota Iino

East Asian Single-Molecule Biophysics Symposium 2022年10月招待有り
Single-molecule analysis and engineering of rotary V-ATPase

Akihiro Otomo, Tatsuya Iida, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月30日
Integrated research on rotary V-ATPase approached by single-molecule observation, biochemical assay, and protein engineering

Akihiro Otomo, Ryota Iino

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月29日招待有り
V-ATPaseのイオン結合部位を改造した新規モータータンパク質作製の取り組み

令和3年度日本生物物理学会中部支部講演会 2022年3月17日
Enterococcus hirae由来 V-ATPaseは ”硬い ”カップリングで対称性の不一致を気にせず回転する

日本生体エネルギー研究会第47回討論会 2021年12月16日
Direct Observation of Stepping Rotation of V-ATPase Reveals Rigid and Non-integer Coupling between Vo and V1 Motors

第59回日本生物物理学会年会 2021年11月25日
１分子計測法で明らかにする回転型V-ATPaseのイオン輸送と共役した回転機構

名古屋工業大学招聘セミナー 2021年5月28日招待有り
Na+輸送性 V-ATPase のイオン輸送と共役した回転ステップの１分子観察

令和2年度日本生物物理学会中部支部講演会 2021年3月31日
Enterococcus hirae由来V-ATPaseのナトリウムイオン濃度に依存した回転運動の1分子解析

第10回分子モーター討論会 2020年11月2日

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担当経験のある科目(授業)

2022年9月 - 2022年9月

応用生命科学特別講義 (静岡大学)

所属学協会

2019年4月 - 現在

日本分光学会
2018年4月 - 現在

日本化学会
2017年6月 - 現在

分子科学会
2013年4月 - 現在

日本生物物理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

V-ATPaseのナトリウム駆動力による回転１分子観察とイオン/ATP共役比の改変

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2024年4月 - 2027年3月

大友章裕
新しい分子モータータンパク質の創生を目指したボトムアップアプローチ

自然科学研究機構 OPEN MIX LAB公募研究プログラム 2023年4月 - 2025年3月

Raymond Burton-Smith, 山守優
一分子計測法で明らかにするV-ATPaseの機能と構造の相関

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2024年3月

大友章裕
V-ATPaseが電気化学ポテンシャルによって回転する機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2020年4月 - 2023年3月

大友章裕
ボトムアップアプローチによる分子モータータンパク質の機能改変

自然科学研究機構若手研究者による分野間連携研究プロジェクト 2022年 - 2023年

ソンチホン, 山守優
共通のタンパク質立体構造が多彩なイオン輸送を可能にする分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2019年4月 - 2021年3月

大友章裕

大友章裕

基本情報

研究分野

経歴

学歴

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論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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