武藤愛 (Ai Muto) - マイポータル

基本情報

J-GLOBAL ID: 201801014820372840
researchmap会員ID: B000334817

研究分野

ライフサイエンス / システムゲノム科学 /

受賞

2012年12月

鈴木紘一メモリアル賞, 日本生化学会

武藤愛

論文

Gene Deletion Algorithms for Minimum Reaction Network Design by Mixed-Integer Linear Programming for Metabolite Production in Constraint-Based Models: gDel_minRN

Takeyuki Tamura, Ai Muto-fujita, Yukako Tohsato, Tomoyuki Kosaka

Journal of Computational Biology 30(5) 553-568 2023年5月1日
Data integration aids understanding of butterfly-host plant networks

Ai Muto-Fujita, Kazuhiro Takemoto, Shigehiko Kanaya, Takeru Nakazato, Toshiaki Tokimatsu, Natsushi Matsumoto, Mayo Kono, Yuko Chubachi, Katsuhisa Ozaki, Masaaki Kotera

SCIENTIFIC REPORTS 7 1-14 2017年3月査読有り
GenoBase: comprehensive resource database of Escherichia coli K-12

Yuta Otsuka, Ai Muto, Rikiya Takeuchi, Chihiro Okada, Motokazu Ishikawa, Koichiro Nakamura, Natsuko Yamamoto, Hitomi Dose, Kenji Nakahigashi, Shigeki Tanishima …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 43(D1) D606-D617 2015年1月査読有り
Development and Mining of a Volatile Organic Compound Database

Azian Azamimi Abdullah, Md. Altaf-Ul-Amin, Naoaki Ono, Tetsuo Sato, Tadao Sugiura, Aki Hirai Morita, Tetsuo Katsuragi, Ai Muto, Takaaki Nishioka, Shigehiko Kanaya

BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL 2015 139254 2015年査読有り
Toward network biology in E. Coli cell

Hirotada Mori, Rikiya Takeuchi, Yuta Otsuka, Steven Bowden, Katsushi Yokoyama, Ai Muto, Igor Libourel, Barry L. Wanner

Advances in Experimental Medicine and Biology 883 155-168 2015年査読有り
PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: Effective implementation of reaction information in the IUBMB enzyme list

Masaaki Kotera, Yosuke Nishimura, Zen-Ichi Nakagawa, Ai Muto, Yuki Moriya, Shinobu Okamoto, Shuichi Kawashima, Toshiaki Katayama, Toshiaki Tokimatsu, Minoru Kanehisa …

JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY 12(6) 1442001 2014年12月査読有り
Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multistep metabolic pathways with a recursive supervised approach

Masaaki Kotera, Yasuo Tabei, Yoshihiro Yamanishi, Ai Muto, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Susumu Goto

BIOINFORMATICS 30(12) 165-174 2014年6月査読有り
Colony-live -a high-throughput method for measuring microbial colony growth kinetics- reveals diverse growth effects of gene knockouts in Escherichia coli

Rikiya Takeuchi, Takeyuki Tamura, Toru Nakayashiki, Yuichirou Tanaka, Ai Muto, Barry L. Wanner, Hirotada Mori

BMC MICROBIOLOGY 14 171 2014年6月査読有り
Modular architecture of metabolic pathways revealed by conserved sequences of reactions

Ai Muto, Masaaki Kotera, Toshiaki Tokimatsu, Zenichi Nakagawa, Susumu Goto, Minoru Kanehisa

Journal of Chemical Information and Modeling 53(3) 613-622 2013年3月25日査読有り
3P266 保存された連続反応を用いた代謝系のモジュール構造の同定とその進化に関する考察(22D.生命情報科学:分子進化,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Muto Ai, Kotera Masaaki, Tokimatsu Toshiaki, Moriya Yuki, Nakagawa Zenichi, Kanehisa Minoru, Goto Susumu

生物物理 53(1) S256 2013年
2PT107 酵素反応の分類と代謝パスウェイ検索への応用(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Goto Susumu, Kotera Masaaki, Tokimatsu Toshiaki, Moriya Yuki, Nakagawa Zen-ichi, Muto Ai, Kanehisa Minoru

生物物理 52 S122 2012年
Analysis Of Common Substructures Of Metabolic Compounds Within The Different Organism Groups

Ai Muto, Masahiro Hattori, Minoru Kanehisa

GENOME INFORMATICS 2007, VOL 18 18 299-307 2007年査読有り

MISC

Evolution of gustatory sensing mechanism for host selection in swallowtail butterflies

Katsuhisa Ozaki, Masasuke Ryuda, Masaaki Kotera, Ai Muto, Hiroshi Yoshikawa

CHEMICAL SENSES 41(9) E228-E228 2016年11月
GenoBase: comprehensive resource database of Escherichia coli K-12

Otsuka Yuta, Muto Ai, Takeuchi Rikiya, Okada Chihiro, Ishikawa Motokazu, Nakamura Koichiro, Yamamoto Natsuko, Dose Hitomi, Nakahigashi Kenji, Tanishima Shigeki …

2015年1月28日
保存された連続反応から見えてくる代謝ネットワークのモジュール構造

武藤愛, 小寺正明, 時松敏明, 中川善一, 五斗進, 金久實

日本生化学会大会(Web) 86th 3S07P-4 (WEB ONLY) 2013年
チョウ目昆虫オーソログデータベースの構築

武藤愛, 尾崎克久, 五斗進, 小寺正明

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th WEB ONLY 3P-0027 2013年
昆虫種横断遺伝子検索データベースの開発

武藤愛, 尾崎克久, 五斗進, 小寺正明

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th WEB ONLY 2PW12-3 2013年
大域的代謝ネットワーク中で保存された化学反応モジュールからみる代謝パスウェイの進化

武藤愛, 小寺正明, 時松敏明, 中川善一, 五斗進, 金久實

日本生化学会大会(Web) 85th WEB ONLY 3T11-08 2012年
メタボローム解析への応用を目指した化学構造に基づく酵素反応分類とオントロジー

小寺正明, 時松敏明, 中川善一, 武藤愛, 守屋勇樹, 金久實, 五斗進

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 34th 1P-0744 (WEB ONLY) 2011年

書籍等出版物

あなたのラボにAI(人工知能)×ロボットがやってくる〜研究に生産性と創造性をもたらすテクノロジー (実験医学別冊)

夏目徹

羊土社 2017年12月8日 (ISBN: 4758122369)

共同研究・競争的資金等の研究課題

薬剤持続性を介した大腸菌薬剤耐性獲得進化の定量的観察と耐性化抑制変異の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2029年3月

武藤愛
有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2025年3月

田村武幸, 高坂智之, 遠里由佳子, 武藤愛
大腸菌合成致死遺伝子の網羅的検出による代謝経路の論理的再構築

日本学術振興会科学研究費助成事業 2017年4月 - 2020年3月

武藤愛

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MISC

書籍等出版物

共同研究・競争的資金等の研究課題

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