舘野義男 (Yoshio Tateno) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター遺伝子機能研究室名誉教授

学位: Ph.D.(テキサス大学大学院（アメリカ合衆国）)
理学博士(東京都立大学)

J-GLOBAL ID: 200901013596727142
researchmap会員ID: 0000005366

外部リンク: http://www.cib.nig.ac.jp/gfr/home.html

研究キーワード

研究分野

学歴

- 1978年

テキサス大学大学院, 生物医科学, 集団遺伝学
- 1978年

University of Texas, Biomedical Sciences, Population genetics
- 1971年

茨城大学, 理学部, 生物学科
- 1971年

茨城大学

委員歴

受賞

1984年

日本科学技術情報センター丹羽賞学術賞

論文

The GTOP database in 2009: updated content and novel features to expand and deepen insights into protein structures and functions

Satoshi Fukuchi, Keiichi Homma, Shigetaka Sakamoto, Hideaki Sugawara, Yoshio Tateno, Takashi Gojobori, Ken Nishikawa

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 37 D333-D337 2009年1月査読有り
Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs

Tokumasa Horiike, Daisuke Miyata, Kazuo Hamada, Satoshi Saruhashi, Takao Shinozawa, Sudhir Kumar, Ranajit Chakraborty, Tomoyoshi Komiyama, Yoshio Tateno

GENE 429(1-2) 59-64 2009年1月査読有り
DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer

Hideaki Sugawara, Kazuho Ikeo, Satoshi Fukuchi, Takashi Gojobori, Yoshio Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 37 D16-D18 2009年1月査読有り
Identification of five phospho-beta-glycosidases from Lactobacillus gasseri ATCC33323(T) cultured in lactose medium

Seiji Nagaoka, Hiroyuki Honda, Satoru Ohshima, Yasushi Kawai, Haruki Kitazawa, Yoshio Tateno, Yukiko Yamazaki, Tadao Saito

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 72(7) 1954-1957 2008年7月査読有り
The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

Dawn Field, George Garrity, Tanya Gray, Norman Morrison, Jeremy Selengut, Peter Sterk, Tatiana Tatusova, Nicholas Thomson, Michael J. Allen, Samuel V. Angiuoli …

NATURE BIOTECHNOLOGY 26(5) 541-547 2008年5月査読有り
Development and public release of a comprehensive hepatitis virus database

Tadasu Shin-I, Yasuhito Tanaka, Yoshio Tateno, Masashi Mizokami

HEPATOLOGY RESEARCH 38(3) 234-243 2008年3月査読有り
An evolutionary origin and selection process of goldfish.

Komiyama, T, Kobayashi, H, Tateno, Y, Inoko, H, Gojobori, T, Ikeo, K

Gene 2008年査読有り
BioCaster: Mining the Web for global health surveillance

Collier, N, Doan, S, Kawazow, A, Matsuda-Goodwin , R, Tateno, Y, Ngo, Q. – H, Dein, D, Kawtrakul, A, Takeuchi, K …

Bioinformatics 24 2940-2941 2008年査読有り
International collaboration among DDBJ, EMBL Bank and GenBank

Tateno, Y

蛋白質核酸酵素 53(2) 182-189 2008年
DDBJ with new system and face

H. Sugawara, O. Ogasawara, K. Okubo, T. Gojobori, Y. Tateno

Nucleic Acids Research 36(1) D22-D24 2008年1月査読有り
β-galactosidase, phospho-β-galactosidase and phospho-β- glucosidase activities of lactobacilli strains isolated from human faces

Honda, H, Kataoka, F, Nagaoka, S, Kawai, Y, Kitazawa, K, Kimura, N, Taketomo, N, Yamazaki, Y, Tateno, Y, Saito, T

Lett Appl Microbiol 45(5) 461-466 2007年11月査読有り
A tree of life based on protein domain organizations

Kaoru Fukami-Kobayashi, Yoshiaki Minezaki, Yoshio Tateno, Ken Nishikawa

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 24(5) 1181-1189 2007年5月査読有り
eGenomics: Cataloguing our complete genome collection III

Dawn Field, George Garrity, Tanya Gray, Jeremy Selengut, Peter Sterk, Nick Thomson, Tatiana Tatusova, Guy Cochrane, Frank Oliver Gloeckner, Renzo Kottmann …

COMPARATIVE AND FUNCTIONAL GENOMICS 10 1-7 2007年査読有り
DDBJ working on evaluation and classification of bacterial genes in INSDC

Hideaki Sugawara, Takashi Abe, Takashi Gojobori, Yoshio Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35 D13-D15 2007年1月査読有り
Exploration and grading of possible genes from 183 bacterial strains by a common protocol to identification of new genes: Gene Trek in Prokaryote Space (GTPS)

Takehide Kosuge, Takashi Abe, Toshihisa Okido, Naoto Tanaka, Masaki Hirahata, Yutaka Maruyama, Jun Mashima, Aki Tomiki, Motoyoshi Kurokawa, Ryutaro Himeno …

DNA RESEARCH 13(6) 245-254 2006年12月査読有り
Evidence standards in experimental and inferential INSDC Third Party Annotation data

Guy Cochrane, Kirsty Bates, Rolf Apweiler, Yoshio Tateno, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Ilene Karsch Mizrachi, Susan Schafer, Michael Fetchko

OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY 10(2) 105-113 2006年6月査読有り
The concept of sampling in 'omics technology

Morrison, N, Cochrane, G, Faruque, N, Tatusova, T, Tateno, Y, Hancock, D, Field, D

OMICS 10 127-137 2006年査読有り
DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions.

Okubo, K, Sugawara, H, Gojobori, T, Tateno, Y

Nucleic Acids Res 34 6-9 2006年査読有り
Genomic evolution of MHC class I region in primates

K Fukami-Kobayashi, T Shiina, T Anzai, K Sano, M Yamazaki, H Inoko, Y Tateno

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 102(26) 9230-9234 2005年6月査読有り
Development of a spot reliability evaluation score for DNA microarrays

Y Matsumura, K Shimokawa, Y Hayashizaki, K Ikeo, Y Tateno, J Kawai

GENE 350(2) 149-160 2005年5月査読有り

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MISC

An evolutionary origin and selection process of goldfish

Tomoyoshi Komiyama, Hiroyuki Kobayashi, Yoshio Tateno, Hidetoshi Inoko, Takashi Gojobori, Kazuho Ikeo

GENE 430(1-2) 5-11 2009年2月
Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs

Tokumasa Horiike, Daisuke Miyata, Kazuo Hamada, Satoshi Saruhashi, Takao Shinozawa, Sudhir Kumar, Ranajit Chakraborty, Tomoyoshi Komiyama, Yoshio Tateno

GENE 429(1-2) 59-64 2009年1月
The GTOP database in 2009: updated content and novel features to expand and deepen insights into protein structures and functions

Satoshi Fukuchi, Keiichi Homma, Shigetaka Sakamoto, Hideaki Sugawara, Yoshio Tateno, Takashi Gojobori, Ken Nishikawa

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 37 D333-D337 2009年1月
DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer

Hideaki Sugawara, Kazuho Ikeo, Satoshi Fukuchi, Takashi Gojobori, Yoshio Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 37 D16-D18 2009年1月
BioCaster: detecting public health rumors with a Web-based text mining system

Nigel Collier, Son Doan, Ai Kawazoe, Reiko Matsuda Goodwin, Mike Conway, Yoshio Tateno, Quoc-Hung Ngo, Dinh Dien, Asanee Kawtrakul, Koichi Takeuchi …

BIOINFORMATICS 24(24) 2940-2941 2008年12月
Identification of five phospho-beta-glycosidases from Lactobacillus gasseri ATCC33323(T) cultured in lactose medium

Seiji Nagaoka, Hiroyuki Honda, Satoru Ohshima, Yasushi Kawai, Haruki Kitazawa, Yoshio Tateno, Yukiko Yamazaki, Tadao Saito

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 72(7) 1954-1957 2008年7月
The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

Dawn Field, George Garrity, Tanya Gray, Norman Morrison, Jeremy Selengut, Peter Sterk, Tatiana Tatusova, Nicholas Thomson, Michael J. Allen, Samuel V. Angiuoli …

NATURE BIOTECHNOLOGY 26(5) 541-547 2008年5月
Development and public release of a comprehensive hepatitis virus database

Tadasu Shin-I, Yasuhito Tanaka, Yoshio Tateno, Masashi Mizokami

HEPATOLOGY RESEARCH 38(3) 234-243 2008年3月
Rice annotation project database (RAP-DB)

Rice Annotation Project

Nucleic Acids Res 36 1028-1033 2008年
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts

Chisato Yamasaki, Katsuhiko Murakami, Yasuyuki Fujii, Yoshiharu Sato, Erimi Harada, Jun-Ichi Takeda, Takayuki Taniya, Ryuichi Sakate, Shingo Kikugawa, Makoto Shimada …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 36 D793-D799 2008年1月
DDBJ with new system and face

H. Sugawara, O. Ogasawara, K. Okubo, T. Gojobori, Y. Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 36 D22-D24 2008年1月
β-galactosidase, phospho-β-galactosidase and phospho-β- glucosidase activities of lactobacilli strains isolated from human feces

Honda, H, Kataoka, F, Nagaoka, S, Kawai, Y, Kitazawa, K, Kimura, N, Taketomo, N, Yamazaki, Y, Tateno, Y, Saito, T

Lett Appl Microbiol 45(5) 461-466 2007年11月
A tree of life based on protein domain organizations

Kaoru Fukami-Kobayashi, Yoshiaki Minezaki, Yoshio Tateno, Ken Nishikawa

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 24(5) 1181-1189 2007年5月
DDBJ working on evaluation and classification of bacterial genes in INSDC

Hideaki Sugawara, Takashi Abe, Takashi Gojobori, Yoshio Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35 D13-D15 2007年1月
Exploration and grading of possible genes from 183 bacterial strains by a common protocol to identification of new genes: Gene Trek in Prokaryote Space (GTPS)

Takehide Kosuge, Takashi Abe, Toshihisa Okido, Naoto Tanaka, Masaki Hirahata, Yutaka Maruyama, Jun Mashima, Aki Tomiki, Motoyoshi Kurokawa, Ryutaro Himeno …

DNA RESEARCH 13(6) 245-254 2006年12月
Evidence standards in experimental and inferential INSDC Third Party Annotation data

Guy Cochrane, Kirsty Bates, Rolf Apweiler, Yoshio Tateno, Jun Mashima, Takehide Kosuge, Ilene Karsch Mizrachi, Susan Schafer, Michael Fetchko

OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY 10(2) 105-113 2006年6月
Cochrane, G., Bates, K., Apweiler, R., Tateno, Y., Mashima, J., Kosuge, T., Mizrachi, I., Schafer, S. and Fetchko, M.

Morrison, N, Cochrane, G, Faruque, N, Tatusova, T, Tateno, Y, Hancock, D, Field, D, Cochrane, G, Bates, K, Apweiler, R …

OMICS 10 127-137 2006年
DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions. Nucleic Acids

Okubo, K, Sugawara, H, Gojobori, T, Tateno, Y

Nucleic Acids Res 34 6-9 2006年
Genomic evolution of MHC class I region in primates

K Fukami-Kobayashi, T Shiina, T Anzai, K Sano, M Yamazaki, H Inoko, Y Tateno

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 102(26) 9230-9234 2005年6月
Development of a spot reliability evaluation score for DNA microarrays

Y Matsumura, K Shimokawa, Y Hayashizaki, K Ikeo, Y Tateno, J Kawai

GENE 350(2) 149-160 2005年5月

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書籍等出版物

Quantum Bio-Informatics Evolution of MHC class I complex region with special reference to fragmentary LINE sequences

Tateno, Y, Fukami-Kobayashi, K, Inoko, H

World Scientific, New Jersey 2008年 (ISBN: 9789812793164)
Quantum Bio-Informatics

World Scientific 2008年 (ISBN: 9789812793164)
バイオインフォマティクス

裳華房 2008年 (ISBN: 9784785387853)
DDBJの利用法「国際塩基配列データファイルの構造」

舘野義男

共立出版 2005年
予防医学事典国際DNAデータベース

舘野義男

朝倉書店 2005年
細胞生物学事典「バイオインフォマティクス」、「プロテオーム」

舘野義男

朝倉書店 2005年
Proc. the 15th International Conference on Genome and Informatics 2004 Construction of H-invitational database CIB-DDBJ flat file server

Okido, T, Shigemoto, Y, Matsuo, M, Koike, T, Fukuchi, S, Imanishi, T, Miyazaki, S, Tateno, Y, Gojobori, T

Japan Society for Bioinformatics 2004年
ゲノミクス・プロテオミクスの新展開マイクロアレイ遺伝子発現データベース

池尾一穂, 舘野義男

エヌ・ティー・エス 2004年
ゲノミックスプロテオミックスの新展開マイクロアレイ遺伝子発現データベース

池尾一穂, 舘野義男

NTS出版 2004年
Populations and Genetics DNA Data Bank of Japan as an indispensable public database.

Miyazaki, S, Tateno, Y

Martinus Nijhoff Publishers, Leiden/Boston 2003年
DNA Data Bank of Japan as an Indispensable Public Database

Populations and Genetics, Marinus Nijihoff Pablishers, Leiden/Boston 2003年
DNA Data Bank of Japan as an Indispensable Public Database In:Populations and Genetics

Martinus Nijhoff Publishers, Leiden/Boston 2003年
ゲノム医科学がわかる DNAデータバンクとゲノム研究

舘野義男, 五條堀孝

羊土社 2001年
Currents in Computational Molecular Biology A new file format and tools for the large-scale data submission to DNA Data Bank of Japan (DDBJ

Miyazaki, S, Hashimoto, H, Shimada, A, Tateno, Y, Sugawara, H

Universal Academy Press, Tokyo 2000年

講演・口頭発表等

A tree of life constructed by genome-wide information

Y. Tateno

BioEco2007 International Conference 2007年6月26日招待有り
A tree of life constructed by domain organizations of proteins

Y. Tateno

Biodiversity Workshop 2007年6月6日招待有り
Molecular population genetics

Tateno, Y

The 6th China-Japan-Korea Bioinformatics Training Course 2007年3月27日
Genomic analysis of MHC genes in primates

Tateno, Y

ICQBIC2007 2007年3月14日招待有り
Bioinformatics

Tateno, Y

2007年1月11日
分子系統学、講義ならびに実習

舘野義男, 小見山智義

2006年11月13日
Genomic evolution of MHC class I region in primates

Tateno, Y

2006年10月31日
An evolutionary origin and the selction process of goldfish by the mtDNA analysis

Komiyama, T, Otake, A, Ikeo, K, Tateno, Y, Inoko, H, Gojobori, T

Marine Genonics 2006年10月27日
Search for the evolution of gap junction

Takaku, Y, Hayakawa, S, Wolf, A, Svensson, L, David, C, Fujisawa, T, Ikeo, K, Tateno, Y, Gojoboroi, T

Marine Genomics 2006年10月27日
Genomic evolution of MHC class I region in primates

Tateno, Y

2006年9月22日
Evaluation and Classification of Bacterial Genes

Tateno, Y

The 15th Korea Genome Organization Meeting 2006年9月21日招待有り
DDBJ activities of genome databases and evaluation of bacterial gene in INSDC

Tateno, Y

eGenomics 2006年9月11日招待有り
Evolution of LINEs and its implication about MHC and primate divergences

Tateno, Y

SMBE2006 2006年5月24日
発現解析データベースCIBEXについて

舘野義男

2006年2月4日
「ゲノムからみた霊長類の進化」

舘野義男

2005年12月20日
Novel mammalian microRNA targets identified by an extensive transcriptome-wide affinity screening

Roberto Barrero, Takuro Tamura, Hitomi Sakurai, Shiho Hayakawa, Yoshio Tateno, Kazuho Ikeo, Tadashi Imanishi, Takashi Gojobori

28th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2005年12月7日
Development of method for construction of phylogenetic tree with massive orthologs

堀池徳祐, 宮田大輔, 濱田一男, 猿橋智, 篠沢隆雄, 舘野義男

28th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2005年12月7日
Introduction of DDBJ activity: Contribution to the research of information biology

真島淳, 舘野義男, 斎藤成也, 大久保公策, 菅原秀明

28th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2005年12月7日
Construction of IS database targeted at eubacterial and archaeal genomes

小菅武英, 阿部貴志, 舘野義男, 菅原秀明

28th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2005年12月7日
Genomic evolution of MHC class I region in primate

Tateno, Y

Shanghai Center for Bioinformation Technology 2005年11月15日

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所属学協会

Works(作品等)

CIBEXデータベース

舘野義男, 池尾一穂

2002年データベース

共同研究・競争的資金等の研究課題

現地共同体制による進化基礎情報の収集と調査

科学研究費補助金 2004年 - 2008年
霊長類MHCクラスⅠならびにMIC遺伝子群のゲノム生物学的解析

共同研究 2004年 - 2006年
molecular evolution of genes and species, construction of biological databases by international collaboration molecular phylogeny and evolution of genes and species, construction of DNA and gene expression databases

Basic Research Promotion Service for Health and Medical Field 1973年

産業財産権

特願2005-330761 「コンピュータによる径路関係探索法」

舘野義男, 堀池徳祐, 宮田大輔, 猿橋智