本発明の含水堆積物の組成と元素濃度を定量する方法は、蛍光Ｘ線分析装置を用いた定量方法である。定量方法は、含水堆積物の透過Ｘ線強度画像データと蛍光Ｘ線強度画像データを取得する工程と、透過Ｘ線強度画像データを用いて含水堆積物の含水率を決定する工程と、蛍光Ｘ線強度画像データの含水率の影響を補正する工程と、蛍光Ｘ線強度画像データから、含水堆積物の元素含有量を定量する工程と、を備えている。