山根隆 (Takashi Yamane) - マイポータル

基本情報

学位: 理学博士
理学修士

J-GLOBAL ID: 200901043136033084
researchmap会員ID: 1000024028

外部リンク: http://www.nubio.nagoya-u.ac.jp/nubio2/yamane/yamane.html

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研究分野

経歴

名古屋大学大学院工学研究科化学・生物工学専攻大学院工学研究科・工学部化学・生物工学専攻, 教授

委員歴

1996年 - 1997年

日本結晶学会, 評議員

MISC

Large cryptic internal sequence repeats in protein structures from Homo sapiens

R. Sarani, N. A. Udayaprakash, R. Subashini, P. Mridula, T. Yamane, K. Sekar

JOURNAL OF BIOSCIENCES 34(1) 103-112 2009年3月
Large cryptic internal sequence repeats in protein structures from Homo sapiens

R. Sarani, N. A. Udayaprakash, R. Subashini, P. Mridula, T. Yamane, K. Sekar

JOURNAL OF BIOSCIENCES 34(1) 103-112 2009年3月
The novel structure of a pyridoxal-5’-phosphate-dependent fold-type I racemase, alpha-amino-epsilon-caprolactam racemase from Achromobacter obae.

OKAZAKI Seiji, SUZUKI Atsuo, MIZUSHIMA Tsunehiro, KAWANO Takeshi, KOMEDA Hidenobu, ASANO Yasuhisa, YAMANE Takashi

Biochemistry 48(5) 941-950 2009年2月
The Novel Structure of a Pyridoxal 5 '-Phosphate-Dependent Fold-Type I Racemase, alpha-Amino-epsilon-caprolactam Racemase from Achromobacter obae

Seiji Okazaki, Atsuo Suzuki, Tsunehiro Mizushima, Takeshi Kawano, Hidenobu Komeda, Yasuhisa Asano, Talashi Yamane

BIOCHEMISTRY 48(5) 941-950 2009年2月
ダイナミックな光学分割による光学活性アミノ酸の合成

蛋白質核酸酵素 54(11) 1389-1394 2009年
Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy

Yoshinobu Ichimura, Taichi Kumanomidou, Yu-shin Sou, Tsunehiro Mizushima, Junji Ezaki, Takashi Ueno, Eiki Kominami, Takashi Yamane, Keiji Tanaka, Masaaki Komatsu

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 283(33) 22847-22857 2008年8月
Deduced catalytic mechanism of D-amino acid amidase from Ochrobactrum anthropi SV3

Seiji Okazaki, Atsuo Suzuki, Hidenobu Komeda, Yasuhisa Asano, Takashi Yamane

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 15(3) 250-253 2008年5月
Deduced catalytic mechanism of D-amino acid amidase from Ochrobactrum anthropi SV3

Seiji Okazaki, Atsuo Suzuki, Hidenobu Komeda, Yasuhisa Asano, Takashi Yamane

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 15(3) 250-253 2008年5月
Structures of D-amino-acid amidase complexed with L-phenylalanine and with L-phenylalanine amide: insight into the D-stereospecificity of D-amino-acid amidase from Ochrobactrum anthropi SV3

Seiji Okazaki, Atsuo Suzuki, Tsunehiro Mizushima, Hidenobu Komeda, Yasuhisa Asano, Takashi Yamane

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 64(3) 331-334 2008年3月
Crystal structure of a chaperone complex that contributes to the assembly of yeast 20S proteasomes

Hideki Yashiroda, Tsunehiro Mizushima, Kenta Okamoto, Tomie Kameyama, Hidemi Hayashi, Toshihiko Kishimoto, Shin-ichiro Niwa, Masanori Kasahara, Eiji Kurimoto, Eri Sakata …

NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 15(3) 228-236 2008年3月
Structures of D-amino-acid amidase complexed with L-phenylalanine and with L-phenylalanine amide: insight into the D-stereospecificity of D-amino-acid amidase from Ochrobactrum anthropi SV3

Seiji Okazaki, Atsuo Suzuki, Tsunehiro Mizushima, Hidenobu Komeda, Yasuhisa Asano, Takashi Yamane

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 64(3) 331-334 2008年3月
Crystal structure of a chaperone complex that contributes to the assembly of yeast 20S proteasomes

Hideki Yashiroda, Tsunehiro Mizushima, Kenta Okamoto, Tomie Kameyama, Hidemi Hayashi, Toshihiko Kishimoto, Shin-ichiro Niwa, Masanori Kasahara, Eiji Kurimoto, Eri Sakata …

NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 15(3) 228-236 2008年3月
High throughput structure determination for single-wavelength laboratory X-ray source anomalous diffraction data sets using iodinated tyrosines

S. Selvanayagam, D. Velmurugan, T. Yamane, A. Suzuki

INDIAN JOURNAL OF PHYSICS 82(1) 27-37 2008年1月
D-アミノ酸アミド加水分解酵素群の発見とアミノ酸アミドの光学分割への利用

生化学 80(4) 294-299 2008年
Comparison of molecular packing between two kinds of hen egg-white lysozyme orthorohombic crystals.

J. Jpn. Soc. Microgravity, 23(2) 82-88 2008年
High throughput structure determination for single-wavelength laboratory X-ray source anomalous diffraction data sets using iodinated tyrosines

S. Selvanayagam, D. Velmurugan, T. Yamane, A. Suzuki

INDIAN JOURNAL OF PHYSICS 82(1) 27-37 2008年1月
Comparison of molecular packing between two kinds of hen egg-white lysozyme orthorohombic crystals.

J. Jpn. Soc. Microgravity, 23(2) 82-88 2008年
選択的オートファジーにおけるp62タンパク質の選別機構の構造的基盤

J. Biol. Chem., 283(33) 22847-22857 2008年
Crystal structure of Ufc1, the Ufm1-conjugating enzyme

Tsunehiro Mizushima, Kanako Tatsumi, Yoko Ozaki, Tatsukuni Kawakami, Atsuo Suzuki, Kyoko Ogasahara, Masaaki Komatsu, Eiki Kominami, Keiji Tanaka, Takashi Yamane

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 362(4) 1079-1084 2007年11月
Crystal structure of Ufc1, the Ufm1-conjugating enzyme

Tsunehiro Mizushima, Kanako Tatsumi, Yoko Ozaki, Tatsukuni Kawakami, Atsuo Suzuki, Kyoko Ogasahara, Masaaki Komatsu, Eiki Kominami, Keiji Tanaka, Takashi Yamane

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 362(4) 1079-1084 2007年11月

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書籍等出版物

ソーキングと共結晶化

タンパク質の結晶化, 京都大学学術出版会 2005年
重原子置換体の調製

タンパク質の結晶化、京都大学学術出版会 2005年
同型置換法

結晶解析ハンドブック、共立出版 1999年
振動カメラ

結晶評価技術ハンドブック、朝倉書店 1993年
Oscillation camera

1993年

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