井原邦夫 (Kunio Ihara) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学遺伝子実験施設准教授

学位: 理学博士(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 200901061526190022
researchmap会員ID: 1000024791

外部リンク: http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~ihara/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / システムゲノム科学 /

経歴

2012年6月 - 現在

名古屋大学, 遺伝子実験施設, 准教授
2014年4月 - 2018年3月

名古屋大学, 遺伝子実験施設共通／遺伝子実験施設, 共同利用シーケンサー・ゲノム解析室室長
2007年4月 - 2012年5月

名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教
2007年3月

名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助手

学歴

- 1989年

大阪大学, 理学研究科, 生理学専攻

委員歴

2017年12月 - 現在

遺伝子実験施設連絡協議会, 幹事

論文

132

Identification of plb1 mutation that extends longevity via activating Sty1 MAPK in Schizosaccharomyces pombe.

Yasukichi Maekawa, Kotaro Matsui, Keisuke Okamoto, Takafumi Shimasaki, Hokuto Ohtsuka, Motohiro Tani, Kunio Ihara, Hirofumi Aiba

Molecular genetics and genomics : MGG 299(1) 20-20 2024年2月29日
The GGDEF protein Dgc2 suppresses both motility and biofilm formation in the filamentous cyanobacterium Leptolyngbya boryana

Kazuma Toida, Wakana Kushida, Hiroki Yamamoto, Kyoka Yamamoto, Kaichi Ishii, Kazuma Uesaka, Robert A. Kanaly, Shinsuke Kutsuna, Kunio Ihara, Yuichi Fujita …

Microbiology Spectrum 2023年9月
Mutations in the stator protein PomA affect switching of rotational direction in bacterial flagellar motor

Hiroyuki Terashima, Kiyoshiro Hori, Kunio Ihara, Michio Homma, Seiji Kojima

Scientific Reports 12(1) 2022年12月
Loss of cell wall integrity genes cpxA and mrcB causes flocculation in Escherichia coli.

Keita Sugawara, Hayato Toyoda, Mami Kimura, Shunsuke Hayasaka, Hiromi Saito, Hiroshi Kobayashi, Kunio Ihara, Tomoaki Ida, Takaaki Akaike, Eiji Ando …

The Biochemical journal 478(1) 41-59 2021年1月15日
Energetics and kinetics of substrate analog-coupled staphylococcal nuclease folding revealed by a statistical mechanical approach.

Mizukami T, Furuzawa S, Itoh SG, Segawa S, Ikura T, Ihara K, Okumura H, Roder H, Maki K

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(33) 19953-19962 2020年7月31日査読有り
The role of ROC75 as a daytime component of the circadian oscillator in Chlamydomonas reinhardtii

Matsuo Takuya, Iida Takahiro, Ohmura Ayumi, Gururaj Malavika, Kato Daisaku, Mutoh Risa, Ihara Kunio, Ishiura Masahiro

PLOS GENETICS 16(6) e1008814-e1008814 2020年6月査読有り
Presynaptic MAST kinase controls opposing postsynaptic responses to convey stimulus valence in Caenorhabditis elegans.

Shunji Nakano, Muneki Ikeda, Yuki Tsukada, Xianfeng Fei, Takamasa Suzuki, Yusuke Niino, Rhea Ahluwalia, Ayana Sano, Rumi Kondo, Kunio Ihara …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(3) 1638-1647 2020年1月21日査読有り
Haloarcula mannanilytica sp. nov., a galactomannan-degrading haloarchaeon isolated from commercial salt

Shigeaki Enomoto, Yasuhiro Shimane, Kunio Ihara, Masahiro Kamekura, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Naoko Takahashi-Ando, Yasumasa Fukushima, Yasuhiko Yoshida, Ron Usami …

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70(12) 6331-6337 2020年
gas1 mutation extends chronological lifespan via Pmk1 and Sty1 MAPKs in Schizosaccharomyces pombe

Imai Yuki, Shimasaki Takafumi, Enokimura Chihiro, Ohtsuka Hokuto, Tsubouchi Satoshi, Ihara Kunio, Aiba Hirofumi

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 1-8 2019年10月13日査読有り
The mechanosensitive channel YbdG from Escherichia coli has a role in adaptation to osmotic up-shock.

Shun Amemiya, Hayato Toyoda, Mami Kimura, Hiromi Saito, Hiroshi Kobayashi, Kunio Ihara, Kiyoto Kamagata, Ryuji Kawabata, Setsu Kato, Yutaka Nakashimada …

The Journal of biological chemistry 294(33) 12281-12292 2019年8月16日査読有り
Cholecystokinin induces crowing in chickens

Shimmura Tsuyoshi, Tamura Mai, Ohashi Shosei, Sasaki Asuka, TakamichiYamanaka, Nakao Nobuhiro, Ihara Kunio, Okamura Shinsaku, TakashiYoshimura

SCIENTIFIC REPORTS 9(1) 3978 2019年3月8日査読有り
Comprehensive investigation of the gene expression system regulated by an Aspergillus oryzae transcription factor XlnR using integrated mining of gSELEX-Seq and microarray data.

Oka H, Kojima T, Ihara K, Kobayashi T, Nakano H

BMC genomics 20(1) 16 2019年1月8日査読有り
Obesity and mental health improvement following nutritional education focusing on gut microbiota composition in Japanese women: a randomised controlled trial.

Uemura M, Hayashi F, Ishioka K, Ihara K, Yasuda K, Okazaki K, Omata J, Suzutani T, Hirakawa Y, Chiang C …

European journal of nutrition 58(8) 3291-3302 2018年12月6日査読有り
Three-Step Isomerization of the Retinal Chromophore during the Anion Pumping Cycle of Halorhodopsin

Kouyama Tsutomu, Ihara Kunio, Maki Kosuke, Chan Siu Kit

BIOCHEMISTRY 57(41) 6013-6026 2018年10月16日査読有り
Draft Genome Sequence of Burkholderia vietnamiensis Strain RS1, a Nitrogen-Fixing Endophyte Isolated from Sweet Potato.

Rina Shinjo, Kazuma Uesaka, Kunio Ihara, Shunsuke Sakazaki, Katsuya Yano, Motohiko Kondo, Aiko Tanaka

Microbiology resource announcements 7(3) 2018年7月査読有り
In vivo transposon tagging in the nonheterocystous nitrogen-fixing cyanobacterium Leptolyngbya boryana

Chie Tomatsu, Kazuma Uesaka, Hisanori Yamakawa, Tohru Tsuchiya, Kunio Ihara, Yuichi Fujita

FEBS Letters 592(10) 1634-1642 2018年5月1日
Inverse association between height-increasing alleles and extreme longevity in Japanese women.

Tanisawa K, Hirose N, Arai Y, Shimokata H, Yamada Y, Kawai H, Kojima M, Obuchi S, Hirano H, Suzuki H …

The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences 73(5) 588-595 2018年4月17日査読有り
Co-expression of the calcitonin receptor gene in the hypothalamic kisspeptin neurons in female rats.

Assadullah, Nahoko Ieda, Narumi Kawai, Hirotaka Ishii, Kunio Ihara, Naoko Inoue, Yoshihisa Uenoyama, Hiroko Tsukamura

Reproductive medicine and biology 17(2) 164-172 2018年4月査読有り
SLO potassium channels antagonize premature decision making in C. elegans.

Aoki I, Tateyama M, Shimomura T, Ihara K, Kubo Y, Nakano S, Mori I

Communications biology 1 123-123 2018年査読有り
Salinarchaeum chitinilyticum sp nov., a chitin-degrading haloarchaeon isolated from commercial salt

Hiroaki Minegishi, Shigeaki Enomoto, Akinobu Echigo, Yasuhiro Shimane, Yusuke Kondo, Ayumi Inoma, Masahiro Kamekura, Ken Takai, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma …

INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 67(7) 2274-2278 2017年7月

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MISC

109

Three-Step Isomerization of the Retinal Chromophore during the Anion Pumping Cycle of Halorhodopsin

Kouyama Tsutomu, Ihara Kunio, Maki Kosuke, Chan Siu Kit

BIOCHEMISTRY 57(41) 6013-6026 2018年10月16日査読有り
In vivo transposon tagging in the nonheterocystous nitrogen-fixing cyanobacterium Leptolyngbya boryana

Chie Tomatsu, Kazuma Uesaka, Hisanori Yamakawa, Tohru Tsuchiya, Kunio Ihara, Yuichi Fujita

FEBS Letters 592(10) 1634-1642 2018年5月1日
Co-expression of the calcitonin receptor gene in the hypothalamic kisspeptin neurons in female rats.

Assadullah, Nahoko Ieda, Narumi Kawai, Hirotaka Ishii, Kunio Ihara, Naoko Inoue, Yoshihisa Uenoyama, Hiroko Tsukamura

Reproductive medicine and biology 17(2) 164-172 2018年4月査読有り
SLO potassium channels antagonize premature decision making in C. elegans.

Aoki I, Tateyama M, Shimomura T, Ihara K, Kubo Y, Nakano S, Mori I

Communications biology 1 123-123 2018年査読有り
Salinarchaeum chitinilyticum sp nov., a chitin-degrading haloarchaeon isolated from commercial salt

Hiroaki Minegishi, Shigeaki Enomoto, Akinobu Echigo, Yasuhiro Shimane, Yusuke Kondo, Ayumi Inoma, Masahiro Kamekura, Ken Takai, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma …

INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 67(7) 2274-2278 2017年7月
Identification of a novel protein kinase that affects the chronological lifespan in fission yeast

Tatsuhiro Kurauchi, Aya Hashizume, Yuki Imai, Kanako Hayashi, Satoshi Tsubouchi, Kunio Ihara, Hokuto Ohtsuka, Hirofumi Aiba

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS 364(2) 2017年1月
Complete chloroplast genome sequence of the early diverging green alga Palmophyllum crassum

Ryo Furukawa, Motoshi Kunugi, Kunio Ihara, Atsushi Takabayashi, Ayumi Tanaka

Genome Announcements 5(10) 2017年
Photochemical characterization of actinorhodopsin and its functional existence in the natural host

Shintaro Nakamura, Takashi Kikukawa, Jun Tamogami, Masakatsu Kamiya, Tomoyasu Aizawa, Martin W. Hahn, Kunio Ihara, Naoki Kamo, Makoto Demura

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS 1857(12) 1900-1908 2016年12月査読有り
A simple method for isolation and construction of markerless cyanobacterial mutants defective in acyl-acyl carrier protein synthetase

Kouji Kojima, Sumie Keta, Kazuma Uesaka, Akihiro Kato, Nobuyuki Takatani, Kunio Ihara, Tatsuo Omata, Makiko Aichi

APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 100(23) 10107-10113 2016年12月査読有り
Haloparvum alkalitolerans sp nova, alkali-tolerant haloarchaeon isolated from commercial salt

Yusuke Kondo, Hiroaki Minegishi, Akinobu Echigo, Yasuhiro Shimane, Masahiro Kamekura, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Akira Tanaka, Naoko Takahashi-Ando, Yasumasa Fukushima …

INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 66(12) 5314-5319 2016年12月査読有り
Shifting transcriptional machinery is required for long-term memory maintenance and modification in Drosophila mushroom bodies

Yukinori Hirano, Kunio Ihara, Tomoko Masuda, Takuya Yamamoto, Ikuko Iwata, Aya Takahashi, Hiroko Awata, Naosuke Nakamura, Mai Takakura, Yusuke Suzuki …

NATURE COMMUNICATIONS 7 13471 2016年11月査読有り
Complete Genome Sequence of Kosakonia sacchari Strain BO-1, an Endophytic Diazotroph Isolated from a Sweet Potato.

Rina Shinjo, Kazuma Uesaka, Kunio Ihara, Kseniia Loshakova, Yuri Mizuno, Katsuya Yano, Aiko Tanaka

Genome announcements 4(5) e00868-16 2016年9月8日査読有り
Crystal Structure of the 11-cis Isomer of Pharaonis Halorhodopsin: Structural Constraints on Interconversions among Different Isomeric States

Siu Kit Chan, Haruki Kawaguchi, Hiroki Kubo, Midori Murakami, Kunio Ihara, Kosuke Maki, Tsutomu Kouyama

BIOCHEMISTRY 55(29) 4092-4104 2016年7月査読有り
A Robust Analytical Pipeline for Genome-Wide Identification of the Genes Regulated by a Transcription Factor: Combinatorial Analysis Performed Using gSELEX-Seq and RNA-Seq

Takaaki Kojima, Emi Kunitake, Kunio Ihara, Tetsuo Kobayashi, Hideo Nakano

PLOS ONE 11(7) e0159011 2016年7月査読有り
Evolution of Green Plants Accompanied Changes in Light-Harvesting Systems

Motoshi Kunugi, Soichirou Satoh, Kunio Ihara, Kensuke Shibata, Yukimasa Yamagishi, Kazuhiro Kogame, Junichi Obokata, Atsushi Takabayashi, Ayumi Tanaka

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 57(6) 1231-1243 2016年6月査読有り
FliH and FliI ensure efficient energy coupling of flagellar type III protein export in Salmonella

Tohru Minamino, Miki Kinoshita, Yumi Inoue, Yusuke V. Morimoto, Kunio Ihara, Satomi Koya, Noritaka Hara, Noriko Nishioka, Seiji Kojima, Michio Homma …

MICROBIOLOGYOPEN 5(3) 424-435 2016年6月査読有り
Transcriptional regulation of CmpR, the LysR family protein involved in CO2-responsive gene regulation in the cyanobacterium Synechococcus elongatus

Lu-Lu Pan, Kiyoshi Onai, Kazuma Uesaka, Kunio Ihara, Takumi Natsume, Nobuyuki Takatani, Masahiro Ishiura, Tatsuo Omata

Biomedical Genetics and Genomics 1(5) 1-6 2016年査読有り
高度好塩性古細菌Haloarcula属のレチナールタンパク質の進化と構造

井原邦夫, 北島智美, 越後輝敦, 峯岸宏明, 神山勉

好塩微生物研究会講演要旨集 51st 20‐25 2015年12月
Identification of a Cyanobacterial RND-Type Efflux System Involved in Export of Free Fatty Acids

Akihiro Kato, Nobuyuki Takatani, Kazuhide Use, Kazuma Uesaka, Kazutaka Ikeda, Yajun Chang, Kouji Kojima, Makiko Aichi, Kunio Ihara, Kenji Nakahigashi …

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 56(12) 2467-2477 2015年12月査読有り
Probing the Cl--pumping photocycle of pharaonis halorhodopsin: Examinations with bacterioruberin, an intrinsic dye, and membrane potential-induced modulation of the photocycle

Takashi Kikukawa, Chikara Kusakabe, Asami Kokubo, Takashi Tsukamoto, Masakatsu Kamiya, Tomoyasu Aizawa, Kunio Ihara, Naoki Kamo, Makoto Demura

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS 1847(8) 748-758 2015年8月査読有り

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書籍等出版物

オプトジェネティクス─光工学と遺伝学による行動制御技術の最前線

井原邦夫, 神山勉

株式会社エヌ・ティー・エス刊 2013年4月10日
古細菌の生物学第13章、電子伝達系とATPアーゼ

若木高善, 井原邦夫 (担当:共著)

東京大学出版会 1998年
古細菌の生物学第12章、高度好塩菌のエナジェテイックス

井原邦夫 (担当:共著)

東京大学出版会 1998年
極限環境微生物ハンドブック・好塩性古細菌

向畑恭男, 井原邦夫 (担当:共著)

サイエンスフォーラム 1990年
Situation of archaebacterial ATPase among ion-translocating ATPase.

Bioenergetics ; molecular biology. biochemistry and pathology 1990年

講演・口頭発表等

ゲノム構造変化を感度良く検出する方法：SV-Quest

上坂一馬, 井原邦夫

第12回日本ゲノム微生物学会年会 2018年3月5日
ゲノムシーケンスにもとづく微生物分類手法；好塩性古細菌を例として

井原邦夫, 上坂一馬, 谷村要, 中邨真之, 越後輝敦, 峯岸宏明

第30回日本Archaea研究会 2017年9月1日
IBBP(Inter Bio-Backup Project)を利用した微生物遺伝子資源の保存

井原邦夫, 中邨真之

第11回日本ゲノム微生物学会年会 2017年3月2日
ショートリードデータのアセンブルによる微生物ゲノム構造決定のワークフロー構築

上坂一馬, 藤田祐一, 井原邦夫, 小俣達男

第11回日本ゲノム微生物学会年会 2017年3月2日
高度好塩菌Haloarcula属3株の完全ゲノム構造解析から原核生物における種分化を考える

谷村要, 越後輝敦, 峯岸宏明, 井原邦夫

第11回日本ゲノム微生物学会年会 2017年3月2日
高度好塩性古細菌 Haloarcula argentinensis, Ha. tradensis, Ha. salaria のゲノム構造比較に基づいた”種”分化の理解

谷村要, 越後輝敦, 峯岸宏明, 井原邦夫

第29回日本Archaea研究会講演会 2016年7月7日

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

近赤外光適応型酸素発生光合成の多様性と機構の解明、理論解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2024年3月

伊藤繁, 木村明洋, 井原邦夫
細胞寿命制御基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

饗場浩文, 井原邦夫
イオン輸送性ロドプシンの反応中間体の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2023年3月

神山勉, 井原邦夫
地衣類・藻類・植物の乾燥下での超高速過剰光エネルギー散逸の分子機構解明と利用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2023年3月

伊藤繁, 井原邦夫
強力な直接遺伝学を駆使して微生物走性システムの全貌を見る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

井原邦夫
遺伝子発現制御機構におけるシスエレメント機能の論理解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

兒島孝明, 井原邦夫
光合成の喪失と従属栄養の促進：長期継代培養による栄養性の進化

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2022年3月

藤田祐一, 井原邦夫
イオン輸送性ロドプシンの反応状態の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2020年3月

神山勉, 井原邦夫
緑藻の生物時計の分子基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2017年3月

松尾拓哉, 石浦正寛, 井原邦夫
セマフォリンシグナルによる多様な細胞特性制御の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2017年3月

高木新, 井原邦夫
網羅的遺伝子変異検出法を活用したマウスの食餌性糖尿病および肥満遺伝子の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

堀尾文彦, 大野民生, 小林美里, 大野欽司, 井原邦夫
レチナール蛋白質の高次構造と機能

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

神山勉, 村上緑, 井原邦夫, 岩佐達郎
世界トップレベルのスプリンターにおける全エクソン領域の塩基配列決定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

福典之, 田中雅嗣, 井原邦夫
日本各地の縄文系対弥生系人口比率と日本人成立過程；ミトコンドリアＤＮＡによる

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2009年4月 - 2014年3月

針原伸二, 住斉, 井原邦夫, 伊藤繁
光駆動性イオンポンプの時間分解構造解析

科学研究費助成事業特定領域研究、21023013 2009年4月 - 2011年3月

井原邦夫, 神山勉
ロドプシン群の構造と機能分化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

神山勉, 村上緑, 井原邦夫, 岩佐達郎
光エネルギーで作動するナノイオンポンプの構造・機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2009年 - 2010年

井原邦夫, 神山勉
ロドプシン群の共通構造モチーフの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2008年

神山勉, 村上緑, 井原邦夫
生物時計分子装置の作動原理解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2005年 - 2007年

石浦正寛, 井原邦夫, 伊藤繁, 難波啓一
光活性大腸菌を用いた光エネルギー共役システムの作成

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2006年 - 2006年

井原邦夫

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社会貢献活動

SSH事業「ワークショップ髪からDNAを取り出す」

講師

2017年5月 - 2017年8月

井原邦夫

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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