稲田利文 (Toshifumi Inada) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学医科学研究所教授

学位: 博士（理学）(東京大学)
理学修士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901084333398190
researchmap会員ID: 1000024808

外部リンク: http://www.inada-lab.ims.u-tokyo.ac.jp

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年1月 - 現在

東京大学, 医科学研究所, 教授
2018年4月 - 2022年3月

日本学術振興会, 学術システム研究センター研究員
2010年10月 - 2022年3月

東北大学大学院薬学研究科, 教授
2007年 - 2009年

文部科学省研究振興局学術調査官
2005年 - 2009年

戦略的創造研究推進事業（さきがけ）「代謝と機能制御」研究者
2002年7月

名古屋大学理学研究科生命理学専攻助教授
1992年 - 2002年

名古屋大学理学部分子生物学科助手
1998年 - 2001年

日本学術振興会海外特別研究員
1991年 - 1992年

日本学術振興会特別奨励研究員（DC）

学歴

委員歴

2025年1月 - 現在

分子生物学会, 執行部
2016年 - 現在

日本RNA学会, 評議員
2018年4月 - 2022年3月

日本学術振興会, 学術研究センター研究員
2017年1月 - 2020年12月

分子生物学会, 理事・庶務幹事（執行部）
2007年8月 - 2009年7月

文部科学省研究助成課, 学術調査官
2006年4月 - 2008年3月

日本 RNA学会, 評議員
日本RNA学会, 評議員

論文

Polyubiquitin architecture editing on collided ribosomes maintains persistent RQC activity.

Shota Tomomatsu, Yoshitaka Matsuo, Fumiaki Ohtake, Takuya Tomita, Yasushi Saeki, Toshifumi Inada

The EMBO journal 2025年9月16日査読有り最終著者責任著者
Herpes simplex virus 1 evades APOBEC1-mediated immunity via its uracil-DNA glycosylase in mice.

Akihisa Kato, Hayato Harima, Yuji Tsunekawa, Manabu Igarashi, Kouichi Kitamura, Kousho Wakae, Tomoaki Nishiyama, Satoru Morimoto, Toru Suzuki, Hiroko Kozuka-Hata …

Nature microbiology 10(7) 1758-1774 2025年7月
Structure of a Gcn2 dimer in complex with the large 60S ribosomal subunit.

Helge Paternoga, Lu Xia, Lyudmila Dimitrova-Paternoga, Sihan Li, Liewei L Yan, Malte Oestereich, Sergo Kasvandik, Ankanahalli N Nanjaraj Urs, Bertrand Beckert, Tanel Tenson …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(15) e2415807122 2025年4月15日責任著者
Crucial roles of Grr1 in splicing and translation of HAC1 mRNA upon unfolded stress response.

Nichika Sato, Yu Nakano, Yasuko Matsuki, Shota Tomomatsu, Sihan Li, Yoshitaka Matsuo, Toshifumi Inada

Nature communications 16(1) 2172-2172 2025年3月4日査読有り最終著者責任著者
The ribosome as a platform to coordinate mRNA decay.

Martin B D Müller, Thomas Becker, Timo Denk, Satoshi Hashimoto, Toshifumi Inada, Roland Beckmann

Nucleic acids research 53(4) 2025年2月8日査読有り
Genome-wide changes of protein translation levels for cell and organelle proliferation in a simple unicellular alga.

Yuko Mogi, Yoshitaka Matsuo, Yuiki Kondo, Tetsuya Higashiyama, Toshifumi Inada, Yamato Yoshida

Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences 101(1) 41-53 2025年
Multiprotein bridging factor 1 is required for robust activation of the integrated stress response on collided ribosomes.

Kyusik Q Kim, Jeffrey J Li, Ankanahalli N Nanjaraj Urs, Miguel E Pacheco, Victor Lasehinde, Timo Denk, Petr Tesina, Shota Tomomatsu, Yoshitaka Matsuo, Elesa McDonald …

Molecular Cell 2024年11月13日
HemK2 functions for sufficient protein synthesis and RNA stability through eRF1 methylation during Drosophila oogenesis.

Fengmei Xu, Ritsuko Suyama, Toshifumi Inada, Shinichi Kawaguchi, Toshie Kai

Development (Cambridge, England) 151(14) 2024年7月15日
Mechanisms of Translation-coupled Quality Control.

Toshifumi Inada, Roland Beckmann

Journal of molecular biology 436(6) 168496-168496 2024年3月15日筆頭著者責任著者
The UFM1 system: Working principles, cellular functions, and pathophysiology.

Masaaki Komatsu, Toshifumi Inada, Nobuo N Noda

Molecular Cell 84(1) 156-169 2024年1月4日査読有り責任著者
Mechanistic insights into the roles of the UFM1 E3 ligase complex in ufmylation and ribosome-associated protein quality control

Ryosuke Ishimura, Sota Ito, Gaoxin Mao, Satoko Komatsu-Hirota, Toshifumi Inada, Nobuo N. Noda, Masaaki Komatsu

Science Advances 9(33) 2023年8月18日査読有り責任著者
Translation of zinc finger domains induces ribosome collision and Znf598-dependent mRNA decay in vertebrates

Kota Ishibashi, Yuichi Shichino, Peixun Han, Kimi Wakabayashi, Toshifumi Inada, Seisuke Kimura, Shintaro Iwasaki, Yuichiro Mishima

PLoS biology 22(12) e3002887 2023年7月10日
No-go decay dampens zinc finger protein mRNAs in vertebrates

Kota Ishibashi, Yuichi Shichino, Peixun Han, Toshifumi Inada, Seisuke Kimura, Shintaro Iwasaki, Yuichiro Mishima

2023年7月10日
Nondomain biopolymers: Flexible molecular strategies to acquire biological functions.

Kazuharu Arakawa, Tetsuro Hirose, Toshifumi Inada, Takuhiro Ito, Toshie Kai, Masaaki Oyama, Yukihide Tomari, Takao Yoda, Shinichi Nakagawa

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 2023年5月30日
Molecular basis for recognition and deubiquitination of 40S ribosomes by Otu2.

Ken Ikeuchi, Nives Ivic, Robert Buschauer, Jingdong Cheng, Thomas Fröhlich, Yoshitaka Matsuo, Otto Berninghausen, Toshifumi Inada, Thomas Becker, Roland Beckmann

Nature communications 14(1) 2730-2730 2023年5月12日
Structural basis for clearing of ribosome collisions by the RQT complex

Katharina Best, Ken Ikeuchi, Lukas Kater, Daniel Best, Joanna Musial, Yoshitaka Matsuo, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Toshifumi Inada, Roland Beckmann

Nature Communications 14(1) 2023年2月17日査読有り責任著者
Co-Translational Quality Control Induced by Translational Arrest

Yoshitaka Matsuo, Toshifumi Inada

Biomolecules 13(2) 317-317 2023年2月7日
Molecular basis of eIF5A-dependent CAT tailing in eukaryotic ribosome-associated quality control

Petr Tesina, Shuhei Ebine, Robert Buschauer, Matthias Thoms, Yoshitaka Matsuo, Toshifumi Inada, Roland Beckmann

Molecular Cell 83(4) 607-621.e4 2023年2月責任著者
Decoding of the ubiquitin code for clearance of colliding ribosomes by the RQT complex.

Yoshitaka Matsuo, Takayuki Uchihashi, Toshifumi Inada

Nature communications 14(1) 79-79 2023年1月10日最終著者責任著者
Two modes of Cue2-mediated mRNA cleavage with distinct substrate recognition initiate no-go decay.

Shota Tomomatsu, Atsuya Watanabe, Petr Tesina, Satoshi Hashimoto, Ken Ikeuchi, Sihan Li, Yoshitaka Matsuo, Roland Beckmann, Toshifumi Inada

Nucleic acids research 51(1) 253-270 2022年12月30日最終著者責任著者

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MISC

108

60Sサブユニット内の新生鎖の特性が品質管理機構におけるRQC2依存性を決定する

海老根修平, 水野雅人, 庄内王功人, 中島静香, 友松翔太, 池内健, 池内健, 松尾芳隆, 稲田利文

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
コドン認識活性を失ったリボソームの異常は翻訳開始コドンで識別される

李思涵, 加藤海輝, 杉山誉人, 足達俊吾, 稲田利文

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
コドン認識活性を失ったリボソームの異常は翻訳開始コドンで識別される

李思涵, 加藤海輝, 杉山誉人, 足達俊吾, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 59th 2020年
小胞体ストレス応答におけるリボソームユビキチン化の新規機能

松木泰子, 松尾芳隆, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎, 横尾秀幸, 中野裕, 宇田川剛, 佐伯泰, 吉久徹, 田中啓二 …

日本RNA学会年会要旨集 21st 139 2019年7月17日
RQC(Ribosome‐associated Quality Control)による翻訳停滞産物の分解は神経細胞の生存と形態形成に重要である。

関萌香, 宇田川剛, 奥山卓, 足達俊吾, 夏目徹, 松沢厚, 野口拓也, 岡戸晴生, 稲田利文

日本RNA学会年会要旨集 21st 42 2019年7月17日
機能欠失リボソームの品質管理機構18S NRDにおける基質認識メカニズムの解析

LI Sihan, 加藤海輝, 杉山誉人, 池内健, 市村淳, 松尾芳隆, 稲田利文

日本RNA学会年会要旨集 21st 2019年
機能不全リボソームの分解機構を誘導するユビキチン化反応の解析

加藤海輝, 杉山誉人, 李思涵, 市村淳, 池内健, 松尾芳隆, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
多段階ユビキチン化反応が機能不全リボソームの分解を誘導する

杉山誉人, 李思涵, 加藤海輝, 池内健, 市村淳, 松尾芳隆, 稲田利文

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
翻訳停滞に起因したタンパク質品質管理機構RQCの内在性標的SDD1の解析

中島静香, 松尾芳隆, TESINA Petr, 水野雅人, BUSCHAUER Robert, CHENG Jingdong, 庄内王功人, 池内健, 池内健, 岩崎信太郎 …

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
小胞体ストレス応答におけるリボソームユビキチン化の新規機能

松木泰子, 松尾芳隆, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎, 横尾秀幸, 中野裕, 宇田川剛, 佐伯泰, 吉久徹, 田中啓二 …

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
小胞体ストレス応答におけるリボソームユビキチン化の新規機能

松木泰子, 松尾芳隆, 岩崎信太郎, 横尾秀幸, 中野裕, 宇田川剛, 佐伯泰, 吉久徹, 田中啓二, INGOLIA Nicholas …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
小胞体ストレス応答に関与する新規E3ユビキチン付加酵素の同定と機能解析

中野裕, 松木泰子, 松尾芳隆, 横尾秀幸, 岩崎信太郎, 宇田川剛, 佐伯泰, 田中啓二, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
RQC(Ribosome-associated Quality Control)による翻訳停滞産物の分解は神経細胞の生存と形態形成に重要である。

関萌香, 宇田川剛, 奥山卓, 足達俊吾, 夏目徹, 野口拓也, 松沢厚, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
コドン解読活性を持たないリボソームの認識・分解機構の解析

李思涵, 加藤海輝, 杉山誉人, 足達俊吾, 市村淳, 池内健, 松尾芳隆, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
翻訳伸長停滞に起因するmRNA品質管理機構No‐Go Decayは多段階のリボソームユビキチン化によって制御される

池内健, 杉山誉人, 松尾芳隆, 佐伯泰, 田中啓二, 稲田利文

日本RNA学会年会要旨集 20th 80 2018年7月9日
多段階ユビキチン化反応が機能不全リボソームの分解を誘導する

杉山誉人, 加藤海輝, 池内健, LI Sihan, 市村淳, 松尾芳隆, 稲田利文

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年
機能欠失リボソームの品質管理機構18S NRDにおけるサブユニット解離の誘導経路に関する解析

李思涵, 市村淳, 池内健, 杉山誉人, 加藤海輝, 松尾芳隆, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 57th 2018年
機能欠失リボソーム分解系を誘導する多段階ユビキチン化反応の解析

加藤海輝, 杉山誉人, 李思涵, 市村淳, 池内健, 松尾芳隆, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 57th 2018年
トリプトファン連続配列に起因するタンパク質品質管理機構RQCの解析

水野雅人, 中島静香, 池内健, 稲田利文

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 57th 2018年
機能欠失リボソーム品質管理機構18S NRDにおいて誘導されるE3ユビキチンライゲースのスクリーニング

加藤海輝, 杉山誉人, LI Sikan, 市村淳, 池内健, 松尾芳隆, 稲田利文

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年

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書籍等出版物

mRNAの動態とプロテアソーム

2008年
RNA実験ノート

羊土社 2008年
遺伝子改変によらない遺伝子疾患治療 ―異常mRNAから正常タンパク質を合成させる低分子化合物―

羊土社 2008年
「mRNAの品質管理機構」化学と生物

学会出版センター 2006年
「細胞の危機管理システムー細胞を脅かす不良RNAへの対応」科学

岩波書店 2006年
応用微生物学IV 微生物の遺伝・育種、４「翻訳とその制御」（清水昌、堀之内末治編）

文永堂 2006年
「正常と異常を識別する品質管理機構」蛋白質核酸酵素「遺伝暗号解読４０周年

共立出版 2006年
「新生ペプチド鎖によるリボソームの活性制御とmRNA品質管理機構」蛋白質核酸酵素

共立出版 2006年
「最も早い品質管理機構」

羊土社 2005年
「mRNA品質管理と創薬」『RNAと創薬』

メディカルドウ 2005年
「RNAとは」『RNA工学の最前線』

シーエムシー 2005年
「mRNA品質管理機構における翻訳の新たな役割ゲノム医学特別増刊、『RNA研究の新展開』

羊土社 2004年
「ゲノムからみた翻訳とRNAの品質管理」ゲノム医学特別企画『RNAとゲノム』

メディカルレビュー 2004年
RNAi: A Guide to Gene Silencing (Gregory J. Hannon ed.) Chapter 8 The Ribonuclease III superfamily: Forms and Functions in RNA

メディカルサイエンスインターナショナル 2004年
「RNAと品質管理」わかる実験医学シリーズ「RNAがわかる」トピックス遍第２章

羊土社 2003年
「新しいRNA機能による翻訳調節ネットワーク」

羊土社 2002年

所属学協会

Works(作品等)

遺伝子発現の正確性を保証するmRNA品質管理機構

2008年 - 2012年
ポリ（Ａ）鎖の翻訳によるノンストップｍＲＮＡの翻訳抑制と異常タンパク質の分解機構

2007年 - 2009年
Translation of the poly(A) tail plays crucial roles in nonstop mRNA surveillance via translation repression and protein destabilization by proteasome in yeast

2007年 - 2009年
プロテアソームによるナンセンス変異依存タンパク質分解機構の解析

2008年 - 2008年
機能性RNAによる代謝調節の分子基盤の解析

2005年 - 2008年
Molecular bases of metabolism regulation by functional noncoding RNA

2005年 - 2008年
「機能性RNAによる翻訳抑制機構の分子基盤の解明」

2005年 - 2007年
ｍＲＮＡ分解と翻訳抑制による異常タンパク質の合成抑制機構の解析

2005年 - 2006年
変異型リボソームの分離によるトランス翻訳の分子機構の解析

2004年 - 2005年

共同研究・競争的資金等の研究課題

多彩なリボソーム機能が支配する発現制御の分子基盤と生理機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2025年4月 - 2030年3月

稲田利文
非ドメイン型バイオポリマー領域の組織運営

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

中川真一, 廣瀬哲郎, 尾山大明, 稲田利文, 荒川和晴, 甲斐歳恵, 依田隆夫, 伊藤拓宏, 泊幸秀
mRNA非翻訳領域の非ドメイン型RNA配列の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

稲田利文, 今高寛晃
異常翻訳の感知応答と解消システムの分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2022年4月 - 2025年3月

稲田利文
特異的ユビキチン鎖を標的としたRQC制御の分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

稲田利文
コドンによる遺伝子発現制御のダイナミズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

三嶋雄一郎, 稲田利文
「新生鎖の生物学」推進のための国際連携

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年11月 - 2020年3月

田口英樹, 稲田利文, 田中元雅, 河野憲二, 藤木幸夫
新生鎖の生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

田口英樹, 稲田利文, 河野憲二, 藤木幸夫, 稲葉謙次, 田中元雅, 千葉志信
mRNAとタンパク質の品質管理機構における新生鎖の新規機能の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

稲田利文, 長尾翌手可, 岩川弘宙
異常mRNA由来のタンパク質分解促進機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

稲田利文
mRNA品質管理機構におけるユビキチン化の新規機能の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

稲田利文
多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム研究の総合的推進

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2008年11月 - 2014年3月

稲田利文, 井上邦夫, 中村輝, 大野睦人, 廣瀬哲郎, 星野真一, 米山光俊, 杉浦麗子
多様性と非対称性を獲得するＲＮＡプログラム

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2008年11月 - 2013年3月

稲田利文
UAAナンセンス変異におけるリードスルー効率の評価系の構築

産学が連携した研究開発成果の展開研究成果展開事業地域事業地域イノベーション創出総合支援事業シーズ発掘試験 2008年 - 2008年

稲田利文
プロテアソームによるナンセンス変異依存タンパク質分解機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2008年 - 2008年

稲田利文
機能性RNAによる代謝調節の分子基盤の解析

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業さきがけ 2005年 - 2008年

稲田利文
mRNA分解と翻訳抑制による異常タンパク質の合成抑制機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2005年 - 2006年

稲田利文
5'末端キャップ構造によるmRNA動態制御

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2002年 - 2006年

水本清久, 稲田利文
変異型リボソームの分離によるトランス翻訳の分子機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2004年 - 2005年

稲田利文
グルコース代謝系によろ情報処理と遺伝子発現制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2001年 - 2003年

饗場弘二, 稲田利文

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稲田利文

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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