荒木弘之 (Hiroyuki Araki) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所名誉教授

学位: 理学博士(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 200901052312305290
researchmap会員ID: 1000031308

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

1998年

- 国立遺伝学研究所教授
1998年

- National Institute of Genetics, Professor
1992年 - 1997年

大阪大学助教授
1992年 - 1997年

大阪大学
1982年 - 1992年

大阪大学助手
1982年 - 1992年

大阪大学

学歴

委員歴

2015年1月 - 2016年12月

日本遺伝学会, 評議員
2015年1月 - 2016年12月

日本分子生物学会, 理事長

論文

Sld3CBD–Cdc45 structural insights into Cdc45 recruitment for CMG complex formation on DNA replication

Hao Li, Izumi Ishizaki, Koji Kato, XiaoMei Sun, Sachiko Muramatsu, Hiroshi Itou, Toyoyuki Ose, Hiroyuki Araki, Min Yao

eLife 2024年8月30日査読有り
Coordination of cohesin and DNA replication observed with purified proteins

Yasuto Murayama, Shizuko Endo, Yumiko Kurokawa, Ayako Kurita, Sanae Iwasaki, Hiroyuki Araki

Nature 2024年2月15日査読有り
Increased contribution of DNA polymerase delta to the leading strand replication in yeast with an impaired CMG helicase complex

Michal Dmowski, Malgorzata Jedrychowska, Karolina Makiela-Dzbenska, Milena Denkiewicz-Kruk, Sushma Sharma, Andrei Chabes, Hiroyuki Araki, Iwona J. Fijalkowska

DNA Repair 110 103272-103272 2022年2月査読有り
Recombination and Pol ζ Rescue Defective DNA Replication upon Impaired CMG Helicase—Pol ε Interaction

Milena Denkiewicz-Kruk, Malgorzata Jedrychowska, Shizuko Endo, Hiroyuki Araki, Piotr Jonczyk, Michal Dmowski, Iwona J. Fijalkowska

21(24) 9484-9484 2020年12月13日査読有り
ゲノム反応中間体としての非B型核酸:その構造と生物学的意義一本鎖DNAと出芽酵母における複製開始蛋白との連係機構

川上広宣, 栗原拓也, 川畑健太, 千々布壮陽, 村岡龍哉, 大橋英治, 荒木弘之, 釣本敏樹, 片山勉

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 93回 [2S07e-01] 2020年9月
Replication fork pausing at protein barriers on chromosomes.

Hizume, K, Araki, H

FEBS Lett. 593(13) 1449-1458 2019年7月査読有り招待有り
CDK phosphorylation regulates Mcm3 degradation in budding yeast.

Yamamoto, K, Makino, N, Nagai, M, Araki, H, Ushimaru, T

Biochem. Biophys. Res. Comm. 506 680-684 2018年12月査読有り
TORC1 signaling regulates DNA replication via DNA replication protein levels.

Kaori Yamamoto, Nishiho Makino, Masayoshi Nagai, Yoshimi Honma, Hiroyuki Araki, Takashi Ushimaru

Biochemical and biophysical research communications 505(4) 1128-1133 2018年11月10日査読有り
DNA polymerase epsilon-dependent modulation of the pausing property of CMG helicase at the barrier.

Hizume, K, Endo, S, Muramatsu, S, Kobayashi, T, Araki, H

Genes & Dev. 32 1315-1320 2018年10月査読有り
Pre‐initiation complex assembly functions as a molecular switch that splits the Mcm2‐7 double hexamer

Miyazawa-Onami, M, Araki, H, Tanaka, S

EMBO Rep. 18(10) 1752-1761 2017年10月査読有り
Flexible DNA Path in the MCM Double Hexamer Loaded on DNA

Kohji Hizume, Hiroaki Kominam, Kei Kobayash, Hirofumi Yamada, Hiroyuki Araki

BIOCHEMISTRY 56(19) 2435-2445 2017年5月査読有り
New insights into the GINS complex explain the controversy between existing structural models

Marta Carroni, Matteo De March, Barbara Medagli, Ivet Krastanova, Ian A. Taylor, Heinz Amenitsch, Hiroyuchi Araki, Francesca M. Pisani, Ardan Patwardhan, Silvia Onesti

SCIENTIFIC REPORTS 7 40118 2017年1月査読有り
Conserved interaction of Ctf18-RFC with DNA polymerase ε is critical for maintenance of genome stability in Saccharomyces cerevisiae

Okimoto, H, Tanaka, S, Araki, H, Ohashi, E, Tsurimoto, T

Genes to Cells 21(5) 482-491 2016年5月査読有り
Role of CDK in replication initiation

Seiji Tanaka, Hiroyuki Araki

The Initiation of DNA Replication in Eukaryotes 263-278 2016年1月1日査読有り
High-level expression of limiting factors for the initiation of DNA replication counteracts chromatin silencing

Mayumi Onami, Hiroyuki Araki, Seiji Tanaka

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 388-388 2015年12月
The quaternary structure of the eukaryotic DNA replication proteins Sld7 and Sld3

Hiroshi Itou, Yasuo Shirakihara, Hiroyuki Araki

Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography 71 1649-1656 2015年8月1日査読有り
The quaternary structure of the eukaryotic DNA replication proteins Sld7 and Sld3

Hiroshi Itou, Yasuo Shirakihara, Hiroyuki Araki

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY 71 1649-1656 2015年8月査読有り
iAID: an improved auxin‐inducible degron system for the construction of a ‘tight’conditional mutant in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae.

Tanaka, S, Miyazawa-Onami, M, Iida, T, Araki, H

Yeast 32(8) 567-581 2015年8月査読有り
Fidelity consequences of the impaired interaction between DNA polymerase epsilon and the GINS complex

Marta Garbacz, Hiroyuki Araki, Krzysztof Flis, Anna Bebenek, Anna E. Zawada, Piotr Jonczyk, Karolina Makiela-Dzbenska, Iwona J. Fijalkowska

DNA REPAIR 29 23-35 2015年5月査読有り
Crystal Structure of the Homology Domain of the Eukaryotic DNA Replication Proteins SId3/Treslin

Hiroshi Itou, Sachiko Muramatsu, Yasuo Shirakihara, Hiroyuki Araki

STRUCTURE 22(9) 1341-1347 2014年9月査読有り

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MISC

Relationship between the initiation reaction of DNA replication and chromatin regulator in eukaryotes

Seiji Tanaka, Mayumi Miyazawa-Onami, Akari Hosoe, Hiroyuki Araki

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 340-340 2016年12月
Hiroyuki Araki [HTML] from embopress.org Full View Elucidating the DDK‐dependent step in replication initiation

荒木弘之

The EMBO journal e201694227 2016年3月
DNAポリメラーゼεとPCNAローダーCtf18-RFCのホロ複合体形成とその機能

釣本敏樹, 沖本寛子, 藤澤遼, 田栗蘭, 大橋英治, 田中誠司, 荒木弘之

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
DNA複製装置と染色体接着装置のクロストーク

釣本敏樹, 大橋英治, 沖本寛子, 田中誠司, 荒木弘之

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
The pre-LC complex at the initiation of chromosomal DNA replication in budding yeast

Hiroyuki Araki, Yoshimi Tanaka, Yoshimi Yanagisawa, Shizuko Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 400-400 2011年12月
Functions of mcm10 in chromosomal dna replication in budding yeast

Masaru Yagura, Hiroyuki Araki

GENES & GENETIC SYSTEMS 84(6) 434-434 2009年12月
Protein assembly in the initiation stage of DNA replication in budding yeast

Kazuyuki Hirai, Sachiko Muramatsu, Hiroyuki Araki

GENES & GENETIC SYSTEMS 84(6) 434-434 2009年12月
Isolation of new replication factors by genetic screenings in budding yeast and their characterization: approach to elucidation of molecular mechanism in the initiation of eukaryotic DNA replication

Hiroyuki Araki

GENES & GENETIC SYSTEMS 84(6) 482-482 2009年12月
CDK-dependent assembly of replication proteins at the initiation step of chromosomal DNA replication

Hiroyuki Araki, Kazuyuki Hirai, Yan Li, Tamon Tanaka, Sachiko Muramatsu, Seiji Tanaka

FASEB JOURNAL 23 2009年4月
真核細胞の細胞周期制御機構と染色体DAN複製

田中誠司, 荒木弘之

遺伝 63 51-58 2009年
真核生物染色体DNAの複製開始を担う複製蛋白質複合体の形成

荒木弘之

蛋白質核酸酵素 54 350-355 2009年
Protein assembly at the initiation step of DNA replication in budding yeast

Kazuyuki Hirai, Sachiko Muramatsu, Hiroyuki Araki

GENES & GENETIC SYSTEMS 83(6) 510-510 2008年12月
GINS is a DNA polymerase epsilon accessory factor during chromosomal DNA replication in budding yeast (Retraction of vol 281, pg 21422, 2006)

Takashi Seki, Masaki Akita, Yoichiro Kamimura, Sachiko Muramatsu, Hiroyuki Araki, Akio Sugino

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 283(17) 11860-11860 2008年4月
真核細胞染色体DNA複製開始反応とCDKによる制御

田中誠司, 荒木弘之

細胞工学 27 985-991 2008年
出芽酵母複製タンパク質Sld3のCDKによるリン酸化

梅森稔子, 平井和之, 上村陽一郎, 荒木弘之

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 389 2005年11月25日
染色体DNA複製開始領域への複製タンパク質の集合機構

坂本佐知子, 上村陽一郎, 荒木弘之

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 388 2005年11月25日
出芽酵母のGINSとDNAポリメラーゼε間の相互作用の解析

関丘, 橋本恵至, WANG C, 坪田智明, 真木智子, 上村陽一郎, 荒木弘之

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 622 2004年11月25日
染色体DNA複製開始領域への複製タンパク質の集合機構

坂本佐知子, 上村陽一郎, 荒木弘之

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 622 2004年11月25日
出芽酵母複製タンパク質Sld3の機能解析

梅森稔子, 平井和之, 坂本佐知子, 上村陽一郎, 荒木弘之

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 622 2004年11月25日
Noncompetitive counteractions of DNA polymerase epsilon and ISW2/yCHRAC for epigenetic inheritance of telomere position effect in Saccharomyces cerevisiae

T Iida, H Araki

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY 24(1) 217-227 2004年1月

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書籍等出版物

Role of CDK in replication initiation. In “The initiation of DNA replication in eukaryotes (ed. D. Kaplan)”

Tanaka, S, Araki, H

Springer International Publishing 2016年2月
Molecular mechanism of DNA replication in "DNA replication, recombination, and repair (eds. F. Hanaoka and K. Sugasawa)"

荒木弘之

Springer Japan, Tokyo 2016年2月
DNA replication / edited by Stephen D. Bell, Marcel Me ́chali, and Melvin L. DePamphilis. Helicase Activation and Establishment of Replication Forks at Chromosomal Origins of Replication

Tanaka, S, Araki, H

COLD SPRING HARBOR LABORATORY PRESS ・USA 2013年 (ISBN: 9781936113484)
実験医学27 遺伝学的手法を用いた酵母複製因子の探索—オリジナリティーとプライオリティーの大切さー

荒木弘之

羊土社 2009年
実験医学 CDKによる染色体DNAの複製開始制御機構

田中誠司, 荒木弘之

2007年
Cold Spring Harbor Laboratory Press Activation of pre-replication complexes. In DNA Replication and Human Disease

Walter, J. C, Araki, H

NY 2006年
実験医学， 23・9 真核生物染色体DNAの複製開始領域への複製タンパク質の集合機構

荒木弘之

羊土社 2005年
DNAの複製，バイオテクノロジーのための基礎分子生物学

荒木弘之

化学同人 2004年
真核生物の複製開始反応，DNA複製・修復がわかる

荒木弘之

羊土社 2004年
クロマチンと遺伝子機能制御複製とクロマチン構造

上村陽一郎, 荒木弘之

シュプリンガー・フェアラーク東京 2003年
複製とクロマチン構造

「クロマチンと遺伝子機能制御」（堀越正美編）、シュプリンガー・フェアラーク東京 2003年
真核細胞の複製開始過程の制御

「ゲノムの複製と分配」（松影昭夫，正井久雄編）、シュプリンガー・フェアラーク東京 2002年
染色体DNAを正確にコピーする機構とその制御

酵母(共立出版) 1996年
酵母分子遺伝学実験法(共著)

学会出版センター 1996年
酵母を用いた細胞周期の研究

病気のバイオサイエンス 1995年
Cell cycle of yeast

1995年
Chromosome engineering in yeast with a site-specific recombination system from a heterologous yeast plasmid (jointly worked)

Methods in Molecular Biology 1995年

講演・口頭発表等

236

DNA polymerase epsilon: its function at the initiation and elongation steps of chromosome replication

荒木弘之

Chromosome Dynamics 2019年12月9日
Non enzymatic function of yeast DNA polymerase epsilon in chromosomal DNA replication

Hiroyuki Araki, Shizuko Endo, Sachiko Muramatsu, Kohji Hizume

第４２回日本分子生物学会年会 2019年12月4日招待有り
酵母を用いた複製機構の解析

荒木弘之

第２５回DNA複製・組換え・修復ワークショップ 2019年11月10日
Requirements for replication fork pausing at the barriers

Koji Hizume, Shizuko Endo, Sachiko Muramatsu, Hiroyuki Araki

The 2019 meeting on Eukaryotic DNA Replication and Genome Maintenance 2019年9月3日
Formation and progression of replication forks in budding yeast; replication fork pausing at the barriers

Kohji Hizume, Shizuko Endo, Sachiko Muramatsu, Hiroyuki Araki

The 44th FEBS Congress 2019年7月8日 FEBS 招待有り
A novel role of DNA polymerase epsilon at replication forks; its involvement in replication fork pausing at the barriers

Kohji Hizume, Shizuko Endo, Sachiko Muramatsu, Takehiko Kobayashi, Hiroyuki Araki

岡崎フラグメントー不連続DNA複製モデル５０周年記念国際シンポジウム 2018年12月18日招待有り
出芽酵母の染色体DNA複製機構

日詰光治, 遠藤静子, 村松佐知子, 荒木弘之

第４１回日本分子生物学会年会 2018年11月29日招待有り
DNA複製バリアにおける複製ファークの停止機構

日詰光治, 遠藤静子, 村松佐知子, 小林武彦, 荒木弘之

第４１回日本分子生物学会年会 2018年11月28日招待有り
高い放射線耐性を持つクマムシに固有なDNA防護タンパク質DsupのDNA保護メカニズムの解析

柴原礼良, 日詰光治, 橋本拓磨, 荒木弘之, 國枝武和

第４１回日本分子生物学会年会 2018年11月28日
DNA polymerase epsilon-dependent modulation of the pausing property of the CMG helices at the barrier

Kohji Hizume, Shizuko Endo, Sachiko Muramatsu, Takehiko Kobayashi, Hiroyuki Araki

The 11th 3R & 3C Symposium 2018年11月13日招待有り
試験管内再構成系を用いた出芽酵母の染色体DNA複製機構の解析

荒木弘之, 遠藤静子, 村松佐知子, 日詰光治

第９１回日本生化学会大会 2018年9月25日招待有り
染色体DNA上の障害によるDNA複製フォークの停止機構

日詰光治, 遠藤静子, 村松佐知子, 小林武彦, 荒木弘之

第５１回酵母遺伝学フォーラム年会 2018年9月11日
Formation, progression and stalling of bidirectional replication forks in budding yeast

荒木弘之

EMBO/EMBL Symposium: DNA replication: From basic biology to disease 2018年5月9日 EMBO/EMBL 招待有り
高い放射線耐性を持つクマムシに固有なDNA防護タンパク質DsupのDNA結合様式の解析

柴原礼良, 日詰光治, 橋本拓磨, 荒木弘之, 久保康雄, 國枝武和

第４０回日本分子生物学会年会 2017年12月7日
ヒストンアセチル化酵素Esa1のDNA複製開始への関与

田中誠司, 大浪真由美, 細江朱里, 荒木弘之

第４０回日本分子生物学会年会 2017年12月6日
真核生物ヘリカーゼCMG複合体の、クロマチンあるいは複製バリア（Replication Fork Barrier）に対する活性の生化学的解析

日詰光治, 遠藤静子, 村松郁子, 小林武彦, 荒木弘之

第４０回日本分子生物学会年会 2017年12月6日
リーディング鎖ポリメラーゼPolε依存的な複製ヘリカーゼの停止反応

日詰光治, 遠藤静子, 村松郁子, 小林武彦, 荒木弘之

第２４回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ 2017年11月27日
structure and function of the Sld3-Sld7 complex essential for the initiation of chromosomal DNA replication

Hiroyuki Araki, Shizuko Endo, Masaru Yagura, Sachiko Muramatsu, Koji Hizume, Izumi Ishizaki, Koji Kato, Min Yao

The 2017 meeting on eukaryotic DNA replication & genome maintenance 2017年9月7日
CMG helices activity on chromatinized DNA and at the replication fork barrier

日詰光治, 遠藤静子, 村松郁子, 小林武彦, 荒木弘之

The 2017 meeting on eukaryotic DNA replication & genome maintenance 2017年9月6日
真核生物複製ヘリカーゼCMG複合体の進行阻害に関する生化学的研究

日詰光治, 遠藤静子, 小林武彦, 荒木弘之

第39回日本分子生物学会年会 2016年12月2日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

染色体3D構造の複製を基盤とした染色体動態の連携

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年6月 - 2020年3月

荒木弘之
DNA複製フォークでのクロマチン構造維持機構

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

荒木弘之
高次染色体構造を基質とした生化学及び微細構造解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

荒木弘之, 日詰光治
真核生物染色体DNAの複製開始機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

荒木弘之, 日詰光治
タンパク質の集合・リモデリングの分子機構とその制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2008年5月 - 2013年3月

荒木弘之
複製複合体の形成制御機構とチェックポイント・細胞分裂への関与の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2009年

荒木弘之
染色体DNA複製開始の分子機構ー活性なヘリカーゼの形成を指標としてー

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2008年 - 2008年

荒木弘之
栄養源飢餓に応答したDNA複製とリポソーム合成の生物学的リンクの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2006年 - 2007年

丑丸敬史, 荒木弘之
真核生物染色体DNA複製開始領域における複製因子集合の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2003年 - 2006年

荒木弘之, 上村陽一郎, 田中誠司
栄養源飢餓ストレス下におけるDNA複製とリボソーム合成との生物学的リンクの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2004年 - 2005年

丑丸敬史, 荒木弘之
出芽酵母Dpb11,RFCの複製モニター機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 1999年 - 2003年

荒木弘之, 杉本勝則, 田中誠司, 上村陽一郎
真核生物DNAポリメラーゼの複製開始領域へのローディング機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 1999年 - 2000年

荒木弘之, 上村陽一郎
出芽酵母DNAポリメラーゼεとその補助因子のDNA修復における役割

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1999年 - 1999年

荒木弘之
出芽酵母Dpb11のDNA複製とS期チェックポイントに於ける機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1999年 - 1999年

荒木弘之, 上村陽一郎
出芽酵母DNAポリメラーゼεとその補助因子のDNA修復における役割

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1998年

荒木弘之
出芽酵母Dpb11のDNA複製とS期チェックポイントに於ける機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1998年

荒木弘之
出芽酵母のDNA複製装置の変異による核分裂の異常

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1998年

荒木弘之
出芽酵母DNAポリメラーゼεとその補助因子のDNA修復における役割

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1997年 - 1997年

荒木弘之
出芽酵母Dpb11のDNA複製とS期チェックポイントに於ける機能

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1997年 - 1997年

荒木弘之
出芽酵母のDNA複製装置の変異による核分裂の異常

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1997年 - 1997年

荒木弘之

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社会貢献活動

会議等主催

その他

Araki, H. 3R Symposium 2008 静岡県掛川市 2008年10月27日
会議等主催

その他

荒木弘之酵母遺伝学フォーラム三島 2006年7月15日