2020年11月19日に「超秩序構造科学」が採択され、翌日に第一回目の総括班会議を立ち上げた。その際、総括班メンバーの役割分担の決定と2020年度の活動内容とそのスケジュールの策定を行った。総括班会議は年度内に合計４回行い、各計画研究の進捗・予算執行状況を記載した報告書(基本、3カ月に一度)に基づき、研究の進め方について議論を行った。
行事に関しては、まず、12月20日にキックオフミーティングをハイブリッド形式にて行った。この際、zoom機能のbreakout sessionを用いて、個別の連携研究の打ち合わせを行った。また、領域ホームページの作成も進め、12月25日に公開を行った。また、12～1月の間に、領域の特徴や目的を示すプロモーションビデオの撮影を行った。公募研究班の募集や海外も含めた領域の紹介を行うためのものであり、２月中旬にはyoutube上で公開を行った。第一期公募研究班募集のための説明会を、2月11日、23日の二回に分け、オンライン形式にて行った。説明の後にbreakout sessionを用いて、個別の相談会を行った。合計211名の参加者があり、その甲斐もあり、非常に多くの申請があった。
3月7-8日には、第一回領域報告会を行い、領域研究の到達点について再確認を行った。また、評価者やアドバイザーの先生より講評を戴き、領域活動に反映させることにした。同時に報告書の作成を行った。3月26日に第一回国際ワークショップをオンライン形式で行った。５名の海外研究者を招待し、合計50名の参加者とともに活発な議論が行われた。
その他、大型施設関係では、放射光実験施設SPring-8の2021A期の募集に合わせ、合計３８件の申請を行い、２８件の採択があった。また、成果公開課題に２件申請し採択された。