山乙教之 (Noriyuki Yamaotsu) - マイポータル

基本情報

所属: 北里大学薬学部生命創薬科学科創薬物理化学教室准教授

学位: 博士(薬学)(1999年3月北海道大学)

研究者番号: 60230322
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-4302-1085
J-GLOBAL ID: 200901080084325092
researchmap会員ID: 1000069305

外部リンク: https://www.pharm.kitasato-u.ac.jp/souyaku/Welcome.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

准教授
2012年4月 - 2022年3月

講師
2007年4月 - 2012年3月

助教
1990年9月 - 2007年3月

助手

委員歴

1999年 - 2001年

日本薬学会, ファルマシアトピックス小委員
1999年 - 2001年

The Pharmaceutical Society of Japan, Topics subcommittee of Farumashia

受賞

2004年7月

CBI学会2004年大会ポスター優秀賞
2004年

CBI学会2004年大会ポスター優秀賞
2003年11月

第31回構造活性相関シンポジウムポスター賞
2003年

第31回構造活性相関シンポジウムポスター賞
2002年9月

第3回CBI学会大会優秀論文賞（CBI学会2002年大会ポスター優秀賞）
2002年

第3回CBI学会大会優秀論文賞

論文

Synthesis and Evaluation of Habiterpenol Analogs

Miyuki Konya, Shiho Arima, Daiki Lee, Masaki Ohtawa, Kenta Shimoyama, Takashi Fukuda, Ryuji Uchida, Hiroshi Tomoda, Noriyuki Yamaotsu, Nobutada Tanaka …

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 70(4) 261-268 2022年4月1日
Identification of novel EED-EZH2 PPI inhibitors using an in silico fragment mapping method

Kensuke Misawa, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono

Journal of Computer-Aided Molecular Design 35(5) 601-611 2021年5月査読有り
Structure-based virtual screening for novel chymase inhibitors by in silico fragment mapping

Ozawa S, Takahashi M, Yamaotsu N, Hirono S

J. Mol. Graph. Model. 89 102-108 2019年6月査読有り
Identifying inhibitors of USP7-HDM2 protein-protein interaction (PPI) by the in silico fragment-mapping method

Misawa K, Ozawa S, Yoshida T, Nakagome I, Yamaotsu N, Hirono S

Yakugaku Zasshi 139(5) 827-835 2019年5月査読有り
Structural differences between the ligand-binding pockets of estrogen receptors alpha and beta

K. Kato, K. Fujii, T. Nakayoshi, Y. Watanabe, S. Fukuyoshi, K. Ohta, Y. Endo, N. Yamaotsu, S. Hirono, E. Kurimoto …

Journal of Physics: Conference Series 1136(1) 2018年12月24日査読有り
Effect of the Arg456His mutation on the three-dimensional structure of cytochrome P450 1A2 predicted by molecular dynamics simulations

Y. Watanabe, K. Kato, S. Fukuyoshi, M. Hiratsuka, N. Yamaotsu, S. Hirono, H. Gouda, A. Oda

Journal of Physics: Conference Series 1136(1) 2018年12月24日査読有り
Virtual screening for small-molecule inhibitors of PD-1/PD-L1 pro-tein-protein interaction using in silico fragment mapping method

Sako Y, Yamaotsu N, Hirono S

SDRP J Comput Chem Mol Model 2(4) 2018年12月査読有り
In silico fragment-mapping method: a new tool for fragment-based/structure-based drug discovery

Yamaotsu N, Hirono S

J Comput-Aided Mol Des 32(11) 1229-1245 2018年11月査読有り
Design of a new α-1-C-alkyl-DAB derivative acting as a pharmacological chaperone for β-glucocerebrosidase using ligand docking and molecular dynamics simulation

Nakagome I, Kato A, Yamaotsu N, Yoshida T, Ozawa S, Adachi I, Hirono S

Molecules 23(10) E2683 2018年10月18日査読有り
Validation of molecular force field parameters for peptides including isomerized amino acids

Akifumi Oda, Tomoki Nakayoshi, Shuichi Fukuyoshi, Eiji Kurimoto, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Ohgi Takahashi

Chirality 30(4) 332-341 2018年4月1日査読有り
Linear discriminant analysis for the in silico discovery of mechanism-based reversible covalent inhibitors of a serine protease: Application of hydration thermodynamics analysis and semi-empirical molecular orbital calculation

Yosuke Masuda, Tomoki Yoshida, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 66(4) 399-409 2018年査読有り
Gibbs Free Energy of Hydrolytic Water Molecule in Acyl-Enzyme Intermediates of a Serine Protease: A Potential Application for Computer-Aided Discovery of Mechanism-Based Reversible Covalent Inhibitors

Yosuke Masuda, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono

CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 65(10) 889-892 2017年10月査読有り
In silico analyses of the effects of a point mutation and a pharmacological chaperone on the thermal fluctuation of phenylalanine hydroxylase

Daichi Hayakawa, Noriyuki Yamaotsu, Izumi Nakagome, Shin-ichiro Ozawa, Tomoki Yoshida, Shuichi Hirono

BIOPHYSICAL CHEMISTRY 228 47-54 2017年9月査読有り
Precise prediction of activators for the human constitutive androstane receptor using structure-based three-dimensional quantitative structure-activity relationship methods

Harutoshi Kato, Noriyuki Yamaotsu, Norihiko Iwazaki, Shigeaki Okamura, Toshiyuki Kume, Shuichi Hirono

DRUG METABOLISM AND PHARMACOKINETICS 32(3) 179-188 2017年6月査読有り
Long chain fatty acids alter the interactive binding of ligands to the two principal drug binding sites of human serum albumin

Keishi Yamasaki, Saya Hyodo, Kazuaki Taguchi, Koji Nishi, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Victor Tuan Giam Chuang, Hakaru Seo, Toru Maruyama, Masaki Otagiri

PLOS ONE 12(6) e0180404 2017年6月査読有り
Investigation of substrate recognition for cytochrome P450 1A2 mediated by water molecules using docking and molecular dynamics simulations

Yurie Watanabe, Shuichi Fukuyoshi, Koichi Kato, Masahiro Hiratsuka, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Hiroaki Gouda, Akifumi Oda

Journal of Molecular Graphics and Modelling 74 326-336 2017年6月1日査読有り
Multi-step virtual screening to develop selective DYRK1A inhibitors

Tomoko Koyama, Noriyuki Yamaotsu, Izumi Nakagome, Shin-ichiro Ozawa, Tomoki Yoshida, Daichi Hayakawa, Shuichi Hirono

JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING 72 229-239 2017年3月査読有り
Prediction of three-dimensional structures and structural flexibilities of wild-type and mutant cytochrome P450 1A2 using molecular dynamics simulations

Yurie Watanabe, Shuichi Fukuyoshi, Masahiro Hiratsuka, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda

Journal of Molecular Graphics and Modelling 68 48-56 2016年7月1日査読有り
Molecular dynamics simulations to investigate the influences of amino acid mutations on protein three-dimensional structures of cytochrome P450 2D6.1, 2, 10, 14A, 51, and 62

Shuichi Fukuyoshi, Masaharu Kometani, Yurie Watanabe, Masahiro Hiratsuka, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono, Noriyoshi Manabe, Ohgi Takahashi, Akifumi Oda

PLoS ONE 11(4) 2016年4月1日査読有り
計算化学手法を用いたエストロゲン受容体αとβの立体構造の比較

藤井賢一朗, 福吉修一, 山乙教之, 広野修一, 小田彰史

日本薬学会年会要旨集 136年会(2) 294-294 2016年3月

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MISC

分子動力学シミュレーションを用いた野生型・変異型CYP1A2の立体構造および構造柔軟性の予測

渡邉友里江, 福吉修一, 伊藤雅, 平塚真弘, 山乙教之, 広野修一, 小田彰史, 小田彰史

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 42nd 2014年
分子動力学シミュレーションを用いた野生型・変異型CYP1A2の立体構造および構造柔軟性の予測

渡邉友里江, 福吉修一, 伊藤雅, 平塚真弘, 山乙教之, 広野修一, 小田彰史, 小田彰史

日本薬学会北陸支部総会及び例会プログラム・講演要旨集 126th 2014年
Evaluations of the conformational search accuracy of CAMDAS using experimental three-dimensional structures of protein-ligand complexes

A. Oda, N. Yamaotsu, S. Hirono, Y. Takano, S. Fukuyoshi, R. Nakagaki, O. Takahashi

Journal of Physics: Conference Series 454(1) 2013年
Identification of a new inhibitor of the Golgi system, targeting ADP-ribosylation Factor 1 (Arf1) with potential for cancer therapy

Yoshimi Ohashi, Hiroshi Iijima, Noriyuki Yamaotsu, Kanami Yamazaki, Shigeo Sato, Mutsumi Okamura, Kenji Sugimoto, Shingo Dan, Shuichi Hirono, Takao Yamori

CANCER RESEARCH 72 2012年4月
PPARγLBDと三環系PPARγパーシャルアゴニストの相互作用解析

中込泉, 豊岡尚樹, 峰平大輔, 竹田大輔, 加藤敦, 足立伊左雄, 松谷裕二, 川田耕司, 佐藤謙一, 山乙教之 …

日本薬学会年会要旨集 132年会(4) 160-160 2012年3月
Quantitative structure-activity relationship (QSAR) analysis to predict drug-drug interactions of ABC transporter ABCG2

T. Ishikawa, H. Hirano, H. Saito, K. Sano, Y. Ikegami, N. Yamaotsu, S. Hirono

Mini-Reviews in Medicinal Chemistry 12(6) 505-514 2012年査読有り
親水性リガンドの結合はタンパク質の自由度を増す

山乙教之

ファルマシア 47(5) 439-440 2011年5月1日
ブラウン動力学法によるタンパク質-リガンド複合体予測構造の評価インフルエンザノイラミニダーゼと阻害剤の複合体のシミュレーション

小田彰史, 小林佳奈, 高橋央宜, 山乙教之, 広野修一

東北薬科大学研究誌 56(56) 75-80 2009年12月
20aPS-115 タンパク質-リガンド複合体構造を利用した配座解析手法の比較(20aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

小田彰史, 高橋央宜, 山乙教之, 広野修一

日本物理学会講演概要集 63 291-291 2008年
アンジオテンシンII変換酵素阻害薬オルメサルタンメドキソミルのヒト血清アルブミンによる加水分解及びその触媒部位の同定(発表論文抄録(2006))

馬慎豊, 安楽誠, 岩尾康範, 山崎啓之, Kragh-Hansen U, 山乙教之, 広野修一, 池田敏彦, 小田切優樹

福山大学薬学部研究年報 25 83-83 2007年
1P045 タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価(蛋白質(機能),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

小田彰史, 鷹野優, 中村春木, 山乙教之, 広野修一, 高橋央宜, 松崎久夫

生物物理 47 S34 2007年
24aPS-103 GAFF力場による配座解析の精度評価(領域12ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

小田彰史, 高橋央宣, 松崎久夫, 山乙教之, 広野修一

日本物理学会講演概要集 62 389-389 2007年
ドッキングポーズ評価のためのコンセンサススコア戦略

小田彰史, 山乙教之, 広野修一

SAR News 11 13-17 2006年10月
超並列コンピュータを活用したLigand-Based Drug Design

山乙教之, 中込泉, 広野修一

スーパーコンピューティングニュース 8(Special Issue 1) 75-86 2006年9月
Use of Photoaffinity Labeling and Site-directed Mutagenesis for Identification of the Key Residue Responsible for Extraordinarily High Affinity Binding of UCN-01 in Human α1-Acid Glycoportein(共著)

KATSUKI M, CHUANG V T G, NISHI K, KAWAHARA K, NAKAYAMA H, YAMAOTSU N, HIRONO S, OTAGIRI M

J. Biol. Chem. 280(2) 1384-1391 2005年1月
New AMBER Force Field Parameters of Heme Iron for Cytochrome P450s Determined by Quantum Chemical Calculations of Simplified Models(共著)

ODA Akifumi, YAMAOTSU Noriyuki, HIRONO Shuichi

J. Comput. Chem. 26(8) 818-826 2005年
Use of photoaffinity labeling and site-directed mutagenesis for identification of the key residue responsible for extraordinarily high affinity binding of UCN-01 in human alpha 1-acid glycoprotein

M Katsuki, VTG Chuang, K Nishi, K Kawahara, H Nakayama, N Yamaotsu, S Hirono, M Otagiri

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 280(2) 1384-1391 2005年1月
New AMBER force field parameters of heme iron for cytochrome P450s determined by quantum chemical calculations of simplified models.

Akifumi Oda, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono

Journal of Computational Chemistry 26(8) 818-826 2005年
Studies of Binding Modes of (S)-Mephenytoin to Wild Types and Mutants of Cytochrome P450 2C19 and 2C9 using Homology Modeling and Computational Docking(共著)

Pharm. Res. 21(12) 2270-2278 2004年12月
Studies of binding modes of (S)-mephenytoin to wild types and mutants of cytochrome P450 2C19 and 2C9 using homology modeling and computational docking

Akifumi Oda, Noriyuki Yamaotsu, Shuichi Hirono

Pharmaceutical Research 21(12) 2270-2278 2004年12月

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書籍等出版物

(Ed. Nagase H) Chemistry of Opioids

Yamaotsu N, Hirono S (担当:共著)

Springer-Verlag 2011年
(Ed. Gundertofte K, Jorgensen FS) Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity

Tsuchida K, Yamaotsu N, Hirono S (担当:共著)

Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000年
Analysis of Affinities of Penicillins for a Class C β-Lactamase by Molecular Dynamics Simulations(共著)

Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000年
Analysis of Affinities of Penicillins for a Class C beta-Lactamase by Molecular Dynamics Simulations

Molecular Modeling and Prediction of Bioactivity, Kluwer Academic/Plenum Publishers 2000年
The Folding Simulation of α-Conotoxin MI Using Molecular Dynamics(共著)

Peptide Chemistry 1996, Protein Research Foundation 1997年
The Folding Simulation of alpha-Conotoxin MI Using Molecular Dynamics

Peptide Chemistry 1996, Protein Research Foundation 1997年

講演・口頭発表等

161

μ-オピオイド受容体アロステリックリガンドBMS-986122の結合様式の同定

山乙教之, 山本茉里奈, 田中信忠

日本薬学会第143年会 2023年3月28日
ポンペ病原因酵素リソソーム酸性α-グルコシダーゼに対する低分子シャペロン5-C-alkyl-L-ido-DNJのアルキル鎖長が活性や結合配向に及ぼす影響

中込泉, 加藤敦, 吉村洸亮, 兼清歌, 山乙教之, 田中信忠

日本薬学会第143年会 2023年3月28日
バーチャルスクリーニングのための既知フラグメント化合物-結合サイトデータベースの構築

山乙教之, 木村亮祐, 田中信忠

第50回構造活性相関シンポジウム 2022年11月10日
In silico フラグメントマッピング法を利用したマラリア原虫の酵素pfDXRに対する新規阻害剤の探索

中込泉, 長谷川桃子, 山乙教之, 田中信忠

日本薬学会第142年会 2022年3月27日
アロステリック・サイトは正に荷電したアミノ酸残基を好む

山乙教之, 茂原理沙, 木村亮祐, 田中信忠

日本薬学会第142年会 2022年3月27日
タンパク質-フラグメント複合体X線構造に基づくin silicoフラグメント・マッピング法

山乙教之, 広野修一, 田中信忠

第49回構造活性相関シンポジウム 2021年11月19日
Development of a 3DPharmacophore Model for P-gpSubstrates using in silico Fragment Mapping Method

Harutoshi Kato, Noriyuki Yamaotsu, Mika Nabeno, Nao Torimoto, Haruko Miyoshi, Tomoko Watanabe, NobutadaTanaka, Shuichi Hirono

日本薬物動態学会第36回年会 2021年11月19日
ゴーシェ病治療薬の開発を目指したβ-glucocerebrosidaseに対する新規allosteric activatorの探索

中込泉, 加藤敦, 廣瀬花穂, 島立優奈, 畑瑞希, 山乙教之, 田中信忠, 広野修一

日本薬学会第141年会 2021年3月29日
実験的に決定されたタンパク質-フラグメント複合体立体構造に基づくin silicoフラグメント・マッピング法の開発

山乙教之, 広野修一, 田中信忠

日本薬学会第141年会 2021年3月27日
アデニンバイオアイソスターとキナーゼ選択性に関する大規模解析(2)

山乙教之, 広野修一

日本薬学会第140年会 2020年3月28日
β-glucocerebrosidaseに対するallosteric activatorの相互作用様式の同定及び構造安定性解析

中込泉, 桑原愛実, 山乙教之, 吉田智喜, 小澤新一郎, 広野修一

日本薬学会第140年会 2020年3月28日
非ペプチド化を目指した結合部位類似性に基づくアミノ酸バイオアイソスターの探索

望月大愛, 吉田智喜, 山乙教之, 広野修一

第47回構造活性相関シンポジウム 2019年12月12日
In silicoアミノ酸残基マッピング法を用いたPPIフラグメントペプチドの結合様式予測法の開発

津島悠, 山乙教之, 広野修一

第47回構造活性相関シンポジウム 2019年12月12日
in silicoアミノ酸マッピング法と分子動力学計算を用いたPPIに重要な界面残基の予測

山乙教之, 田野隆也, 広野修一

第47回構造活性相関シンポジウム 2019年12月12日
β-glucocerebrosidaseに対するallosteric activatorの結合様式の同定

中込泉, 桑原愛実, 山乙教之, 広野修一

第47回構造活性相関シンポジウム 2019年12月12日
アデニンバイオアイソスターとヒトキナーゼ選択性に関する大規模解析

山乙教之, 広野修一

第63回日本薬学会関東支部大会 2019年9月14日
MDシミュレーションによるβ-glucocerebrosidase−ケミカルシャペロン α-1-C-tridecyl-DAB複合体の構造安定性解析

中込泉, 山乙教之, 広野修一

日本薬学会第139年会 2019年3月22日日本薬学会
アミノ酸残基マッピング法を用いたPPIフラグメントペプチドの結合様式予測法の開発

津島悠, 山乙教之, 広野修一

日本薬学会第139年会 2019年3月22日日本薬学会
結合部位類似性に基づくアミノ酸のバイオアイソスターの同定

望月大愛, 吉田智喜, 山乙教之, 広野修一

日本薬学会第139年会 2019年3月22日日本薬学会
アデニンバイオアイソスターとキナーゼ選択性に関する大規模解析

山乙教之, 広野修一

日本薬学会第139年会 2019年3月21日日本薬学会

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所属学協会

Works(作品等)

北里大学薬学部薬学部ニュース[No.4] 平成24年度昇任教員のあいさつ

山乙教之

2012年8月10日
DNA分子とたんぱく質の計算機構造生物学の研究

1997年 - 1999年
Computational Structural Biology for DNA and Protein

1997年 - 1999年

共同研究・競争的資金等の研究課題

創薬効率を高めるための計算機的フラグメントベース・ドラッグデザイン手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

広野修一, 山乙教之, 中込泉
架橋水をリガンドに組み込んだ仮想的水和リガンドドッキング法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年 - 2012年

山乙教之
新規抗ガン剤の創製を目指したCRK-C3G相互作用阻害剤のイン・シリコ分子設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2009年 - 2011年

広野修一, 合田浩明, 山乙教之, 中込泉
計算創薬技術を用いたマクロライド骨格を持つ新規キチナーゼ阻害剤の構造最適化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2009年 - 2011年

合田浩明, 広野修一, 山乙教之, 中込泉
In silico創薬技術を用いた新規キチナーゼ阻害剤の分子設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2007年 - 2008年

合田浩明, 広野修一, 山乙教之, 中込泉
動態を考慮した創薬研究のためのトランスポータリガンドの三次元ファーマコフォア解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2006年 - 2007年

広野修一, 合田浩明, 松下泰雄, 山乙教之, 中込泉
心臓血管系副作用(QT延長作用)を有する薬物の3次元定量的構造活性相関解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2003年 - 2004年

広野修一, 合田浩明, 松下泰雄, 山乙教之, 中込泉
ヒト血清アルブミンに対する薬物の結合配座決定と薬物―アルブミン複合体の構造構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2000年 - 2001年

広野修一, 山乙教之, 合田浩明, 松下泰雄, 中込泉
立体構造既知のタンパク質に対する薬物の結合サイト及び結合様式の計算化学的解析

2000年
Determination of the Binding Site and Binding Mode of Ligand Molecules for a Protein Using Computer-Aided Ligand Docking

2000年
NMR測定と計算化学習法による薬物の血清アルブミンに対するサイト別結合様式の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1998年 - 1999年

広野修一, 合田浩明, 山乙教之, 松下泰雄, 中込泉
分子動力学シミュレーションによるカルモデュリン-阻害剤複合体の溶液構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1999年

広野修一, 山乙教之, 合田浩明
分子動力学計算とTRNOE測定による血清アルブミン結合薬物の配座解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1995年 - 1996年

広野修一, 中込泉, 山乙教之, 合田浩明, 松下康雄
分子動力学シミュレーシヨンによる生体高分子の新しい立体配座解析法の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業一般研究(C) 1993年 - 1993年

広野修一, 中込泉, 山乙教之
ファジィ適応最小二乗法による有機化学物質の有害性予測

日本学術振興会科学研究費助成事業一般研究(C) 1991年 - 1993年

森口郁生, 中込泉, 山乙教之, 松下泰雄, 広野修一
分子動力学シミュレーションによるカルモデュリンの標的蛋白質認識・調節機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業一般研究(C) 1992年 - 1992年

広野修一, 山乙教之
分子動力学/自由エネルギー計算法を用いたタンパク質の安定性に関する研究

1990年
Study on Protein Stability Using Molecular Dynamics/Free Energy Calculation

1990年

山乙教之

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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