杉本 直己

J-GLOBALへ         更新日: 19/07/08 15:36
 
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研究者氏名
杉本 直己
 
スギモト ナオキ
URL
http://www.konan-fiber.jp/index.shtml
所属
甲南大学
部署
先端生命工学研究所(FIBER)
職名
所長・教授
学位
理学博士(京都大学), 理学修士(京都大学)
その他の所属
甲南大学
科研費研究者番号
60206430

研究分野

 
 

経歴

 
2017年3月
 - 
現在
南開大学客座教授
 
2012年8月
 - 
現在
学校法人甲南学園 理事
 
2009年
 - 
現在
甲南大学フロンティアサイエンス研究科  教授
 
2007年4月
 - 
現在
天津師範大学 客座教授
 
2003年
 - 
現在
甲南大学先端生命工学研究所  所長・教授
 
1997年4月
 - 
現在
河北工業大学 客座教授
 
2009年
 - 
2010年
甲南大学フロンティアサイエンス学部 教授 
 
1994年
 - 
2009年
甲南大学理工学部教授
 
2001年
 - 
2003年
甲南大学ハイテクリサーチセンター 所長
 
1991年
 - 
1994年
甲南大学理工学部助教授
 
1988年
 - 
1991年
甲南大学 講師
 
1985年
 - 
1988年
米国ロチェスター大学リサーチアソシエイト
 

学歴

 
 
 - 
1985年
京都大学 理学研究科 化学
 
 
 - 
1979年
京都大学 理学部 化学
 

委員歴

 
2018年4月
 - 
現在
ひょうご経済・雇用活性化プラン推進会議  構成員
 
2017年11月
 - 
現在
日本核酸化学会  会長
 
2015年3月
 - 
現在
Scientific Reports  編集委員
 
2012年9月
 - 
現在
RNA Nanotechnology編集委員
 
2012年6月
 - 
現在
計算科学振興財団  評議員
 
2012年3月
 - 
現在
神戸医療産業都市推進協議会委員
 
2011年7月
 - 
現在
ひょうご神戸サイエンスクラスター協議会委員
 
2010年5月
 - 
現在
兵庫県COEプログラム推進事業審査委員会委員
 
2010年4月
 - 
現在
International Review of Biophysical Chemistry編集委員
 
2010年4月
 - 
現在
京都大学化学研究所 共同研究委員会委員
 
2010年
 - 
現在
日本学術振興会学術システム研究センター研究員
 
2009年4月
 - 
現在
神戸エンタープライズプロモーションビューロー アドバイザリーボード
 
2007年
 - 
現在
Nucleic Acids Research編集委員
 
2005年4月
 - 
現在
独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構(NEDO) 産業技術実用化開発助成事業 評価委員
 
2005年4月
 - 
現在
近畿経済産業局 中小企業・ベンチャー挑戦支援事業 実用化研究開発事業評価委員
 
2005年4月
 - 
現在
独立行政法人科学技術振興機構(JST) 科学技術振興調整費 評価ワーキンググループ委員
 
2005年4月
 - 
現在
独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構(NEDO) ナノバイオ産業化委員会委員 (ナノバイオテクノロジー包括的ロードマップ作成 デバイス分野ワーキンググループ 座長)
 
2005年
 - 
現在
兵庫県科学技術会議委員
 
2004年4月
 - 
現在
NPO法人 近畿バイオインダストリー振興会議 関西バイオの未来を考える会 委員
 
2016年4月
 - 
2018年3月
兵庫県次世代産業雇用創造プロジェクト推進協議会委員
 
2015年12月
 - 
現在
九州工業大学バイオマイクロセンシング技術研究センター外部評価委員
 
2015年5月
 - 
2017年5月
日本化学会  理事
 
2016年7月
 - 
2017年3月
兵庫県ひょうご経済・雇用活性化プラン推進会議構成員
 
2016年4月
 - 
2017年3月
月刊『化学』編集委員会委員
 
2008年
 - 
2012年
Human Frontier Science Program委員
 
2005年
 - 
2010年
近畿化学協会  部会幹事,研究会運営委員,代議員,評議員
 
1998年
 - 
2001年
フロンティア生命化学研究会  会長, 監事
 
1993年
 - 
1999年
日本化学会  支部幹事, 生体機能関連化学部会幹事, 生命化学研究会会長, 生命化学研究会監事, バイオテクノロジー部会幹事, バイオテクノロジー部会主査, 生体機能関連化学部会副部会長, 生体機能関連化学部会部会長
 

受賞

 
2018年9月
IS3NA(International Society for Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids) The Imbach-Townsend Award
 
2016年6月
European Chemistry Congress (Euro Chemistry2016) Keynote Lecture Award
 
2015年10月
公益財団法人 井植記念会 第39回井植文化賞(科学技術部門)
 
2014年
錯体化学会 錯体化学会貢献賞
 
2013年
独立行政法人 日本学術振興会 第25回ひらめき☆ときめきサイエンス推進賞
 
2013年
公益財団法人長瀬科学技術振興財団 長瀬研究振興賞
 
2011年
中国科学院長春応用化学研究所 名誉講演者賞
 
2008年
第25回日本化学会学術賞
 
2006年
兵庫県科学賞
 
2005年
ICA(International Copper Association)Distinguish Scientist Award
 
2004年
堀場雅夫賞(堀場製作所)
 
1992年
第7回若い世代の特別講演者(日本化学会)
 
1990年
第6回化学のフロンティア(日本化学会)
 

論文

 
Conformational Dynamics of the RNA G-Quadruplex and its Effect on Translation Efficiency
T. Endoh and N. Sugimoto
Molecules   24 1613   2019年4月   [査読有り]
RNA-Capturing Microsphere Particles (R-CAMPs) for Optimization of Functional Aptamers
T. Endoh, T. Ohyama, and N. Sugimoto
Small   1805062   2019年4月   [査読有り]
Lighting up of thiazole orange on G-quadruplex DNA by high pressure
S. Bhowmik, S. Takahashi, and N. Sugimoto
ACS Omega   4 1081-1093   2019年   [査読有り]
Bisubstrate function of RNA polymerases triggered by molecular crowding conditions
S. Takahashi, H. Okura, and N. Sugimoto
Biochemistry   58 1081-1093   2019年   [査読有り]
Validation of the Nearest-neighbor Model for Watson–Crick Self-complementary DNA Duplexes in Molecular Crowding Condition
S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, S. Hazra, N. Sugimoto
Nucleic Acids Res.   47 3284-3294   2019年   [査読有り]
Characterization of intracellular crowding environments with topology-based DNA quadruplex sensors
S. Takahashi, J. Yamamoto, A. Kitamura, M. Kinjo, and N. Sugimoto
Anal. Chem.   91(4) 2586-2590   2019年2月   [査読有り]
Design and Properties of Ligand-Conjugated Guanine Oligonucleotides for Recovery of Mutated G-Quadruplexes
S. Takahashi, B. Chelobanov, K. T. Kim, B. H. Kim, D. Stetsenko, and N. Sugimoto
Molecules   23 3228   2018年12月   [査読有り]
Recovery of the formation and function of oxidized G-quadruplexes by a pyrene-modified guanine-tract
S. Takahashi, K. T. Kim, P. Podbevsek, J. Plavec, B. H. Kim, and N. Sugimoto
J. Am. Chem. Soc.   140(17) 5774-5783   2018年4月   [査読有り]
An anionic phthalocyanine decreases NRAS expression by breaking down its RNA G-quadruplex
K. Kawauchi, W. Sugimoto, T. Yasui, K. Murata, K. Itoh, K. Takagi, T. Tsuruoka, K. Akamatsu, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto, and D. Miyoshi
Nat. Commun.   9 2271   2018年   [査読有り]
テトラエチレングリコールで修飾されたグアニン四重鎖の安定性の分子動力学計算による解析
大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己
日本核酸化学会誌   2 3-10   2018年   [査読有り]
C-rich sequence in a non-template DNA strand regulates structure change of G-quadruplex in a template strand during transcription
Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto
Bull. Chem. Soc. Jpn.   92(3) 572-577   2019年   [査読有り]
A Turn-On Detection of DNA Sequences by Means of Fluorescence of DNA-Templated Silver Nanoclusters via Unique Interactions of a Hydrated Ionic Liquid
Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, T. Tsuruoka, and N. Sugimoto
Molecules   23 2889   2018年   [査読有り]
Co-Transcriptional Molecular Assembly Results in a Kinetically Controlled Irreversible RNA Conformational Switch
T. Endoh and N. Sugimoto
Anal. Chem.   90 11193-11197   2018年   [査読有り]
Mirror-image Dependence: Targeting Enantiomeric G-quadruplex DNA by 10 Pairs of Triplex Metallohelices
C. Zhao, H. Song, P. Scott, A. Zhao, H. Tateishi-Karimata, N.Sugimoto, J. Ren, and X. Qu
Angew. Chem. Int. Ed.   57 15723-15727   2018年   [査読有り]
S. Nakano, T. Watabe, and N. Sugimoto
Chem. Phys. Chem.   18 3614-3619   2018年   [査読有り]
Crowding Shifts the FMN Recognition Mechanism of Riboswitch AptameConformational Selection to Induced Fi
A. B. Rode, T. Endoh, and N. Sugimoto
Angew. Chem. Int. Ed.      2018年   [査読有り]
Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations
M. Trajkovski, T, Endoh, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, S. Tanaka, J. Plavec and N. Sugimoto
Nucleic Acids Res.   46 4301-4315   2018年   [査読有り]
Cotranslational protein assembly imposes evolutionary constraints on homomeric proteins
E. Natan, T. Endoh, L. Haim-Vilmovsky, T. Flock, G. Chalancon, J. T. S. Hopper, B. Kintses, P. Horvath, L. Daruka, G. Fekete, C. Pál, B. Papp, E. Oszi, Z. Magyar, J. A. Marsh, A. H. Elcock, M. N. Babu, C. V. Robinson, N. Sugimoto, S. A. Teichmann
Nat Struct Mol Biol.      2018年   [査読有り]
N. Satoa, S. Takahashi, H. Tateishi-Karimata, M. E. Hazemi, T. Chikuni, K. Onizuka, N. Sugimoto and F. Nagatsugi
Org. Biomol. Chem.   16 1436-1441   2018年   [査読有り]
Y. Teng, S. Pramanik, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, and N. Sugimoto
Biochem. Biophys. Res. Commun      2018年   [査読有り]
Destabilization of DNA G-quadruplexes by chemical environment changes during tumor progression facilitates transcription
J. Am. Chem. Soc.   139    2018年   [査読有り]
Quantitative analysis of nucleic acid stability with ligands under high pressure to design novel drugs targeting G-quadruplexes
S. Takahashi, N. Sugimoto
Curr. Protoc. Nucleic. Acid Chem.   70(17) 9.1-9.17   2017年9月   [査読有り]
Specific Light-Up System for Protein and Metabolite Targets Triggered by Initiation Complex Formation
H. Fujita, Y. Kataoka, R. Nagano, Y. Nakajima, M. Yamada, N. Sugimo, M. Kuwahara
Sci. Rep.   7(15191)    2017年   [査読有り]
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.   114 9605-9610   2017年   [査読有り]
J. Zhou, S. Amrane, F. Rosu, G.F. Salgado, Y. Bian, H. Tateishi-Karimata, E. Largy, D. N. Korkut, A. Bourdoncle, D. Miyoshi, J. Zhang, H. Ju, W. Wang, N. Sugimoto, V. Gabelica, and J. Mergny
139 7768-7779   2017年   [査読有り]
T. Fujii, P. Podbevšek, J. Plavec, N. Sugimoto
Journal of Inorganic Biochemistry   166 190-198   2017年   [査読有り]
S. Takahashi, S. Bhowmik and N. Sugimoto
Journal of Inorganic Biochemistry   166 199-207   2017年   [査読有り]
SI. Nakano, N. Sugimoto
Mol Biosyst.   13 32-41   2017年   [査読有り]
Through-bond effects in the ternary complexes of throumbin sandwiched by two DNA aptamers
A. Pica, I. R. Krauss, V. Parente, H. Tateishi-Karimata, S. Nagatoishi, K. Tsumoto, N. Sugimoto and F. Sica
Nucleic Acids Res.   44 461-469   2017年   [査読有り]
AB Rode, T. Endoh, N. Sugimoto
Angew. Chem. Int. Ed.   46 14315-14319   2016年   [査読有り]
M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, F. Tama, O. Miyashita, S. Nakano, N. Sugimoto
Chemical Physics Letters   660 250-255   2016年   [査読有り]
H. Tateishi-Karimata, T. Muraoka, K. Kinbara, N. Sugimoto
ChemBioChem.   17 1399-1402   2016年   [査読有り]
N. Yamaguchi, Y. Zouzumi, N. Shimada, S. Nakano, N. Sugimoto, A. Maruyama, D. Miyoshi
Chem Commun (Camb).   52 7446-7449   2016年   [査読有り]
T. Endoh, C. Annoni, D. Hnedzko, E. Rozners, N. Sugimoto
Chem Commun (Camb)   52 7935-7938   2016年   [査読有り]
S. Nakano, H. Oka, M. Fujii and N. Sugimoto
Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids   35 370-378   2016年   [査読有り]
H. Tateishi-Karimata and N. Sugimoto
ChemBioChem   17 1301-1303   2016年   [査読有り]
Y. Ueda, Y. Zouzumi, A. Maruyama, S. Nakano, N. Sugimoto and D. Miyoshi
Science and Technology of Advanced Materials   17 753-759   2016年   [査読有り]
S. Nakano, Y. Tanino, H. Hirayama, N. Sugimoto
Biophysical Journal   111 1350-1360   2016年   [査読有り]
H. Fujita, Y. Kataoka, S. Tobita, M. Kuwahara, N. Sugimoto
Anal. Chem.   88 7137-7144   2016年   [査読有り]
S. Nakano, N. Sugimoto
Biophysical Reviews   8 11-23   2016年   [査読有り]
J. Zhou, H. Tateishi-Karimata, JL Mergny, M. Cheng, Z. Feng, D. Miyoshi, N. Sugimoto, C. Li
Biochimie.   121 204-208   2016年   [査読有り]
A. Zhao, C. Zhao, H. Tateishi-Karimata, J. Ren, N. Sugimoto, X. Qu
Chem. Commum.   52 1903-1906   2016年   [査読有り]
T. Endoh, D. Hnedzko, E. Rozners,d N. Sugimoto
Angew. Chem. Int. Ed.   55 899-903   2016年   [査読有り]
Pressure effect on the folding of G-quadruplex DNA modified with hexaethylene glycol
S. Takahashi and N. Sugimoto
Mol. Enz. Drug Targ.   2 3   2016年   [査読有り]
T. Endoh, C. Annoni, D. Hnedzko, E. Rozners, N. Sugimoto
Phys. Chem. Chem. Phys.   18 32002-32006   2016年   [査読有り]
M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, F. Tama, O. Miyashita, S. Nakano, N. Sugimoto
Nucleic Acids Res.   43 10114-10125   2015年   [査読有り]
S. Nakano, Y. Kitagawa, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
J. Biol. Inorg. Chem.   20 1049-1058   2015年   [査読有り]
X. -B. Gu, S.Nakano, N. Sugimoto
ChemBioChem.   16 1803-1810   2015年   [査読有り]
Y. Ueda, T. Konno, K. Ishihara, N. Sugimoto, D. Miyoshi
Transact. Mater. Res. Soc. Japan   40 99-102   2015年   [査読有り]
T. Endoh and N. Sugimoto
Anal. Chem.   87 7628-7635   2015年   [査読有り]
T. Fujii and N. Sugimoto
Phys. Chem. Chem. Phys.   17 16719-16722   2015年   [査読有り]
H. Tateishi-Karimata, M. Nakano, S. Pramanik, S. Tanaka, and N. Sugimoto
Chem. Commun.   51 6909-6912   2015年   [査読有り]
H. Tateishi-Karimata, S. Pramanik, and N. Sugimoto
Analyst   140 4393-4398   2015年   [査読有り]
H. Yaku, T. Murashima, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
Sensors   15 9388-9403   2015年   [査読有り]
K. Usui, A. Okada, K. Kobayashi, N. Sugimoto
Org. Biomol.Chem.   13 2022-2025   2015年   [査読有り]
A.B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto
Angew. Chem. Int. Ed.   54 905-909   2015年   [査読有り]
M. Marušič, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto, and J. Plavec
Biochimie   108 169-177   2015年   [査読有り]
Choline ions stabilize A-T base pairs by fitting into minor groove
M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto
JPS Conf. Proc.   5 011008   2015年   [査読有り]
DNA G-quadruplex detection system employing a protein fibril ligand
R. Maeda, H. Yaku, T. Nakabayashi, T. Murashima, N. Sugimoto, N. Ohta, D. Miyoshi
Telomere and Telomerase.   2    2015年   [査読有り]
S. Takahashi and N. Sugimoto
Phys. Chem. Chem. Phys.   17 31004-31010   2015年   [査読有り]
A.B. Rode, T. Endoh, and N. Sugimoto
Bull. Chem. Soc. Jpn.   88 946-948   2015年   [査読有り]
N. Sugimoto
Bull.Jpn.Soc.Coord.Chem.   65 23-29   2015年   [査読有り]
N. Sugimoto
Nucleic Acids Research   42 12949-12959   2014年   [査読有り]
N. Sugimoto
Nucleic Acids Research   42 8831-8844   2014年   [査読有り]
N. Sugimoto
ChemMedChem   Sep;9 2045-2048   2014年   [査読有り]
N. Sugimoto
ChemMedChem   Sep;9 2150-2155   2014年   [査読有り]
N. Sugimoto
Molecules   19 11613-11627   2014年   [査読有り]
M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto
J. Phys. Chem. B   118 9583-9594   2014年   [査読有り]
H. Yaku, T. Murashima, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
J. Phys. Chem. B.   118 2605-2614   2014年   [査読有り]
T. Fujimoto, S. Nakano, D. Miyoshi, and N. Sugimoto
Chem.Rev.   114 2733-2758   2014年   [査読有り]
H. Tateishi-Karimata, N. Isono, and N. Sugimoto
PLoS ONE, DOI:10.1371   9 e90580   2014年   [査読有り]
M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto
J. Phys. Chem. B.   118 379-389   2014年   [査読有り]

Misc

 
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Chem. Commun.   47(10) 2790-2792   2011年
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Chem.Commun.   46(8) 1299-1301   2010年
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シングルセル解析の最前線   9-16   2010年
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Nucleic Acids Symp. Ser.   54 172-173   2010年
Unpaired region affecting hydration state of duplex
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Nucleic Acids Symp. Ser. (Oxf).   54 210-211   2010年
Roles of Anionic Functional Groups in G-quadruplex-ligands for Efficient Telomerase Inhibition
N. Sugimoto
Nucleic Acids Symp. Ser. (Oxf).   54 148-149   2010年
DNAチップの基礎 ハイブリダイゼーション
バイオチップ実用化ハンドブック      2010年
生体シグナル解析用の機能性核酸センサーの定量的デザイン
シングルセル解析の最前線   9-16   2010年
チャレンジロード「機能性拡散の秘密に迫る」
未来材料(エヌ・ティー・エス)      2010年
化学ツールとしての分子クラウディングの活用
化学フロンティア22 生命現象を理解する分子ツール(化学同人)   31-33   2010年
SASAKI Yoshiharu, SASAKI Yoshiharu, MIYOSHI Daisuke, SUGIMOTO Naoki
Applied Biochem. Biotech.   160(8) 2458-2466   2010年
RAJENDRAN Arivazhagan, NAKANO Shu‐ichi, SUGIMOTO Naoki
Chem. Commun.   46(8) 1299-1301   2010年
ZHANG Dong‐Hao, FUJIMOTO Takeshi, SAXENA Sarika, YU Hai‐Qing, MIYOSHI Daisuke, SUGIMOTO Naoki
Biochemisry   49(21) 4554-4563   2010年
Construction of detection system for amyloid beta peptide localization and aggregation using fluorescent and luminescent fusion proteins
Peptide Science   2009 111-112   2010年
SAXENA Sarika, MIYOSHI Daisuke, MIYOSHI Daisuke, SUGIMOTO Naoki, SUGIMOTO Naoki
Biochemistry   49(33) 7190-7201   2010年
DUTTA Kakoli, FUJIMOTO Takeshi, INOUE Mamiko, MIYOSHI Daisuke, SUGIMOTO Naoki
Chem Commun.   46(41) 7772-7774   2010年
WANG Xiaohui, WANG Chunyan, QU Konggang, SONG Yujun, REN Jinsong, MIYOSHI Daisuke, SUGIMOTO Naoki, QU Xiaogang
Advanced Functional Materials   20(22) 3967-3971   2010年
WANG Xiaohui, GENG Jie, MIYOSHI Daisuke, REN Jinsong, SUGIMOTO Naoki, QU Xiaogang
Biosens. Bioelectron.   26(2) 743-747   2010年
Investigations of the cation binding to nucleotides by monitoring the hairpin-duplex equilibrium of a self-complementary sequence
N. Sugimoto
Nucleic Acids Symp. Ser.   53 229-230   2009年
Chapter 8, Energy of Nucleic Acid Self-Assemblies:From Sequence to Function through Structure (Bottom-up Nanofabrication:Supramolecules
N. Sugimoto
Self-Assemblies,and Organized Films   3 191-215   2009年
Cu(?) ion inhibits early stages of amyloid β fibril formation in vitro
N. Sugimoto
J. Biol. Inorg. Chem.   1 118   2009年
N. Sugimoto
Bull. Chem. Coc. Jpn.   82(1) 1-10   2009年
「核酸アプタマー」のケミカル・ルネサンス “知る”から“活かす”への生命化学の新しい発想
N. Sugimoto
化学   64(64) 44-49   2009年

書籍等出版物

 
Development and Application of a Highly Efficient Protein Synthesis Technique Using Riboswitches in Microorganisms
T. Yamauchi, N. Sugimoto (担当:共著)
Applied RNA Bioscience (Springer)   2018年4月   
15章 新しい核酸医薬システムの構築, CSJカレントレビュー「生命機能に迫る分子化学」
建石寿枝、杉本直己
化学同人   2018年   
生体分子化学 基礎から応用まで
杉本 直己
講談社   2017年1月   
第4章 遺伝子診断の新手法, CSJカレントレビュー「医療・診断・創薬の化学」
建石寿枝, 杉本直己
化学同人   2017年   
Effect of ionic liquid and liposomes on the structure, stability, and function of nucleic acids
Chemical Biology of Nucleic Acids: Fundamentals and Clinical Applications (Springer)   2014年5月   
Noncanonical structures and their thermodynamics of DNA and RNA under molecular crowing: beyond the Watson-Crick double helix
杉本 直己
International Review of Cell and Molecular Biology (Elsevier)   2014年   
高圧下での核酸の挙動
杉本 直己 (担当:共著)
CSJカレントレビュー 極限環境の生命化学(化学同人)   2014年   
Chapter 5, Molecular crowding and hydration regulating of G-quadruplex formation
杉本 直己 (担当:共著)
Quadruplex Nucleic Acids (Springer)   2013年   
Chapter 8 Nucleic acid aptamers as molecular tags for omics analyses involving sequencing
杉本 直己 (担当:共著)
DNA SEQUENCING, METHODS AND APPLICATIONS (InTech)   2012年   
新しい薬学辞典
杉本 直己 (担当:共著)
A12 核酸医薬(朝倉書店)   2012年   
細胞内核酸化学 ここまで進んだバイオセンシング・イメージング 1分子から細胞,脳まで
杉本 直己 (担当:共著)
CSJカレントレビュー(化学同人)   2012年   
シグナル解析を目指した機能性核酸の構築-ライフサーベイヤ構築に向けて-
杉本 直己
シーエムシー出版   2012年   
核酸化学の定量的基礎と仮説
杉本 直己
CSJカレントレビュー 核酸化学のニュートレンド(化学同人,日本化学会編)   2011年   
G-quartet, G-quadruplex, and G-wire regulated by chemical stimuli
杉本 直己 (担当:共著)
DNA Nanotechnology (Methods in Molecular Biology series) (Springer)   2011年   
DNAチップの基礎 ハイブリダイゼーション
杉本 直己 (担当:共著)
バイオチップ実用化ハンドブック (エヌ・ティー・エス)   2010年   
生体シグナル解析用の機能性核酸センサーの定量的デザイン
杉本 直己 (担当:共著)
シングルセル解析の最前線 (シーエムシー出版)   2010年   
化学ツールとしての分子クラウディングの活用
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア22 生命現象を理解する分子ツール (化学同人)   2010年   
セントラルドグマに学ぶセントラルドグマの制御方法
杉本 直己 (担当:共著)
核酸医薬の最前線 (シーエムシー出版)   2009年   
機能性核酸のテーラーメード設計
杉本 直己 (担当:共著)
超分子サイエンス&テクノロジー(エヌ・ティー・エス)   2009年   
生命化学
丸善   2007年   ISBN:978-4-621-07907-2
2.7)リボザイム
杉本 直己 (担当:共著)
生物物理学ハンドブック(朝倉書店)   2007年   
核酸超分子と分子認識
杉本 直己 (担当:共著)
分子認識と超分子(三共出版)   2007年   
5) 天然高分子 核酸 エネルギーデータに基づく核酸医薬の設計
杉本 直己
絵で見てわかるナノDDS 遺伝子医学MOOK別冊(メディカルドゥ)   2007年   
Quantum Dot-量子ドット
杉本 直己 (担当:共著)
実験がうまくいく 蛍光・発光試薬の選び方と使い方(羊土社)   2007年   
Use of the polymorphic nature of high-order DNA structures for the design of dynamic and functional nanodevices
杉本 直己
Recent Devel, Nucleic Acids Res. (Transworld Research Network)   2006年   
デザイナブル核酸修飾
杉本 直己 (担当:共著)
ウィルスを用いない遺伝子法の材料、技術、方法論の新たな展開、遺伝子医学MOOK5 (メディカルドゥ)   2006年   
シグナル解析を目指した機能性核酸の構築
杉本 直己
-細胞定量解析の最前線-ライフサーベイヤ構築に向けて-(シーエムシー出版)   2006年   
細胞ナノエンジニアリング
杉本 直己
化学フロンティア13,ナノバイオエンジニアリング (化学同人)   2004年   
フォトバイオエンジニアリング
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア13,ナノバイオエンジニアリング(化学同人)   2004年   
生命分子間認識を解明するには、ラショナル法でいくべきかランダム法でいくべきか? それが問題だ
杉本 直己
先端化学シリーズⅢ 糖鎖/バイオマテリアル/分子認識/バイオインフォマティクス(丸善)   2003年   
2章 核酸の相互作用
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの(化学同人)   2002年   
5章 機能性核酸
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの(化学同人)   2002年   
10章 タンパク質の構造・機能化学
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの(化学同人)   2002年   
25章 生命分子と表面プラズモン効果
杉本 直己 (担当:共著)
化学フロンティア5 生命化学のニューセントラルドグマ テーラーメイド・バイオケミストリーのめざすもの(化学同人)   2002年   
遺伝子化学
杉本 直己
化学同人   2002年   
ゲノム化学とSNPs解析 化学の果たす役割
杉本 直己 (担当:共著)
別冊化学, ヒトゲノム最前線21世紀は遺伝子の時代(化学同人)   2001年   
遺伝子とバイオテクノロジー
丸善   1999年   
バイオテクノロジー-新しいタイプの酵素RNA酵素(リボザイム).
化学便覧 応用化学編(丸善)   1994年   
バイオテクノロジー-リボザイム反応の解析
新生化学実験講座(東京化学同人)   1993年   
Improved parameters for prediction of RNA secondary structure and insights into why RNA forms double helixes
杉本 直己 (担当:共著)
Structure and Dynamics of RNA (P. H. Van Kinppenberg and C. W. Hibers, Eds.)   1986年   

講演・口頭発表等

 
Adventure of Nucleic Acids in Molecular Crowding World [招待有り]
N. Sugimoto
The Seminar of Chemistry Department   2019年6月28日   
The Watson-Crick World Is Not Enough [招待有り]
N. Sugimoto
Gordon Research Conference(Nucleosides, Nucleotides and Oligonucleotides)   2019年6月27日   
DNA四重らせん構造はがんの悪性化を制御しているのか [招待有り]
建石寿枝, 杉本直己
第22回生命化学研究会   2019年6月21日   
細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築
杉本 直己
分子夾雑の生命科学 第3回領域会議   2019年5月20日   
Functions of Non-canonical Nucleic Acids (2) [招待有り]
N. Sugimoto
International Workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA) 2019”   2019年4月12日   
Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World [招待有り]
N. Sugimoto
The seminar of School of Pharmaceutical Sciences, The seminar of College of Chemistry   2019年4月11日   Peking University
The seminar of School of Pharmaceutical Sciences
The seminar of College of Chemistry
上記2ヵ所にて招待講演
神経変性疾患に関与するRNA/ペプチドによるPhase separationの機構解析
建石寿枝, Ye Teng, 大山達也, 田中成典, 杉本直己
第2回LLPS(液液相分離)研究会   2019年4月3日   
Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World [招待有り]
N. Sugimoto
The Department Seminar of City University of Hong Kong   2019年3月25日   
RNAs in Molecular Crowding World [招待有り]
N. Sugimoto
The Seminar of Hong Kong RNA Club   2019年3月25日   
Adventures of Nucleic Acids in Molecular Crowding World [招待有り]
N. Sugimoto
The Department Seminar of Sun Yat-sen University   2019年3月23日   
Elucidation for mechanism of diseases caused by non-canonical structures of DNA and regulation for DNA function
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (48) :Imaging of crowding in cells by using guanine-quadruplex DNA
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (49): Validation of the nearest-neighbor model for self-complementary DNA duplex under molecular crowding
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix(50):Phase separation of RNA/peptides in neurodegenerative diseases is promoted by chemical environment changes in cell
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (51): DNAとクラウディング分子の相互作用の分子動力学計算と電子状態計算による定量的解析
大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己,
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (52) : Optimization of RNA conformational switch using RNA-capturing microsphere particle (R-CAMP)
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (53): RNAグアニン四重らせん構造とカチオン性ペプチドによる特異的相分離現象
小畠一起, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (54):グアニン四重らせんおよびi-モチーフ選択的リガンドの開発
今川佳樹, 小畠一起, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (55): DNA四重らせん選択的リガンドのワンポットスクリーニング
長野香穂, 衣笠紫野, 萩原伸也, 佐藤綾人, 川内 敬子, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学(56): DNAの構造安定性に及ぼすメチル化と分子クラウディングの複合効果
杉谷優衣, 造住有輝, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第99回春季年会(2019)   2019年3月16日   
Functions of Nucleic Acids under Molecular Crowding Conditions [招待有り]
N. Sugimoto
The Lecture of Institute of Biophysics Czech Academy of Sciences   2019年3月13日   
Molecular Crowding Regulates RNA Phase Separations in Repeat Expansion Disorders
Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto
Gordon Research Conference(RNA Nanotechnology)   2019年1月13日   
Molecular Crowding Effect on Functions of Nucleic Acids: [招待有り]
N. Sugimoto
The Department seminar, Sungkyunkwan University School of Medicine, The Department seminar, Sungkyunkwan University School of Medicine, Seoul National University, Korea Institute of Science and Technology (KIST)   2018年12月19日   
THE WORLD OF NON-CANONICAL NUCLEIC ACIDS
N. Sugimoto
The 9th Asian Biological Inorganic Chemistry “AsBIC9”   2018年12月13日   
Functions of Nucleic Acids with Non-canonical Structures:To B or not to B
N. Sugimoto
KONAN RESEARCH SUMMIT   2018年12月4日   
Roles of Noncanonical Nucleic Acids on Gene Expressions [招待有り]
N. Sugimoto
The 2nd International Symposium on “Functional Nucleic Acids: From Laboratory to Targeted Molecular Therapy"   2018年11月22日   
Effects of molecular crowding on nearest-neighbor rules for Watson-Crick self-complementary DNA duplexes
S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, S. Hazra, and N, Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Transformation of selective i-motif DNAs into hairpin-like structures induced by a flavonoid compound
S. Takahashi, S. Bhowmik, S. Ghosh, and N. Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Structural Perspectives of the DNA binding properties of Ruthenium Polypyridyl Complexes
K. McQuaid, J. Hall, H. Abell1, S. Takahashi, N. Sugimoto, D. Allan, D. Cardin, J. Brazier, and C. Cardin
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Effect of G-quadruplex stability and structure in the template DNA on transcript mutations in normal and cancer cells
H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Phase separation of repeated RNA with amyloid-like protein in neurodegenerative diseases is promoted by RNA G-quadruplexes
Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Investigation for effects of polyethylene glycols on DNA structure and stability using molecular dynamics simulations
T. Ohyama, H.Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
Effect of noncanonical DNA structures on transcription
N. Sugimoto
The Third A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub   2018年11月   
Optimization of junction sequence between two aptamers for constructing signaling aptamer by using RNA library on microspheres
T.Endoh, N.Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年11月   
“To B or not to B” in Nucleic Acids Chemistry (2)
N. Sugimoto
Advances in Noncanonical Nucleic Acids "ANNA2018"   2018年10月25日   
Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding
N. Sugimoto
The seminar of the department f Pharmacy University of Naples "Federico II"   2018年10月21日   
Effects of molecular crowding on nearest-neighbor rules for Watson-Crick self-complementary DNA duplexes
S. Ghosh, S. Takahashi, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, S. Hazra, and N, Sugimoto
第45回国際核酸化学シンポジウム   2018年10月   
Beyond the Watson-Crick Double Helix:Make New History of Nucleic Acids (6) [招待有り]
N. Sugimoto
Asia 3 Roundtable on Nucleic Acids 2018 (A3RONA2018)   2018年9月4日   
Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding and high pressure [招待有り]
N. Sugimoto
The 10th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2018)   2018年9月   
Analysis of structural dynamics of RNA aptamer using high pressure
S. Takahashi, T. Endoh, A. B. Rode, N. Sugimoto
The 10th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2018)   2018年9月   
ポリエチレングリコールにより誘起される分子クラウディング環境がDNA四重鎖の構造安定性に与える影響の分子シミュレーション解析
大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2018年9月   
リガンド複合型核酸マテリアルによる塩基損傷を受けたグアニン四重鎖の機能回復
高橋俊太郎, Kim Byeang Hyean, Stetsenko Dmitry, Plavec Janez,杉本直己
第67回高分子討論会   2018年9月   
Gelation of RNA repeats in ALS/FTD is promoted in crowding conditions
Teng Ye, 建石寿枝, 杉本直己
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2018年9月   
グアニン四重鎖リガンドのトポロジー依存的結合様式によるDNA複製反応の制御
高橋俊太郎, Bhowmik Sudipta, Chang Ta-Cha, 佐藤しのぶ, 竹中繁織, 杉本直己
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2018年9月   
植物由来の天然代謝産物と核酸構造との相互作用解析
遠藤玉樹, 杉本直己
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2018年9月   
カリウムチャネルはがん遺伝子の転写活性をDNA四重鎖の形成によって制御しているのか?
建石寿枝, 川内敬子, 大山達也, 杉本直己
第12回バイオ関連化学シンポジウム   2018年9月   
Noncanonical world of nucleic acids under molecular crowding:To B or not to B [招待有り]
N. Sugimoto
XXIII International Roundtable of Nucleosides,Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2018)   2018年8月   
Nucleic Acids World under Molecular Crowding
N. Sugimoto
The 5th Asian Chemical Biology Conference (ACBC-5)   2018年8月   
Stability and Function of Noncanonical Nucleic Acids [招待有り]
N. Sugimoto
The seminar of Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine   2018年7月19日   
がん細胞の悪性化に及ぼすDNA四重鎖構造の解離と転写変異の影響
建石寿枝, 川内敬子, 杉本直己
日本核酸医薬学会第4回年会   2018年7月9日   
核酸物理化学と核酸医薬の設計指針
杉本 直己
日本核酸医薬学会第4回年会   2018年7月9日   
分子クラウディング環境下におけるFMNリボスイッチ由来のアプタマードメインの分子挙動
遠藤玉樹, Rode Anbadas, 杉本直己
第20回日本RNA学会年会   2018年7月   
Improved Efficiency of mRNA Sensing System by a Hydrated Ionic Liquid
Hisae Tateishi-Karimata, N. Sugimoto
Gordon Research Conference(Bioanalytical Sensors)   2018年6月24日   
Nucleic Acids Chemistry Beyond the Watson-Crick Double Helix:“To B or not to B” [招待有り]
N. Sugimto
The Department seminar, Sungkyunkwan University school of medicine   2018年6月8日   
Nucleic Acids Chemistry Beyond the Watson-Crick Double Helix:“To B or not to B” [招待有り]
N. Sugimoto
The Departmental seminar of College of Pharmacy, Ewha Womans University   2018年6月7日   
細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築
杉本 直己
分子夾雑の生命化学 第二回領域会議   2018年5月23日   
The world of non-canonical nucleic acids: To B or not to B
N. Sugimoto
The seminer of “The role of non-canonical structure of nucleic acids   2018年5月9日   
Functions of Non-canonical Nucleic Acid [招待有り]
N. Sugimoto
International workshop“Trends in Nucleic Acid (TINA) 2018”   2018年4月14日   
Topological impact of non-canonical DNA structures on the replication
S. Takahashi, N. Sugimoto
Gordon Research Conference, DNA Damage, Mutation and Cancer   2018年3月25日   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (47): RNA四重らせん構造リガンドを用いた分子標的型光線力学療法の構築
高木一樹, 安井貴俊, 伊藤功彦, 杉本渉, 川内敬子, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (46): Thioflavin Tを用いたDNA I-motifの配列特異的検出
小畠一起, 赤山詩織, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (45): ZnAPCによるグアニン四重らせん構造の選択的蛍光検出
今川佳樹, 杉本直己, 三好大輔
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (44): DNAの構造安定性に及ぼすヒストン模倣高分子と分子クラウディング環境の複合効果
造住有輝, 宮田貴史, 嶋田直彦, 杉本直己, 丸山厚, 三好大輔
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (42): Quantitative analysis for effects of molecular network by crowding agents on the G-quadruplex stability
T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto Nucleic Acids Chemistry
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (41): Construction of RNA display from DNAs immobilized on microsphere and its application for aptamer optimization
T. Endoh, T. Ohyama, N. Sugimoto
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (40): Crowding Regulates the Riboswitch Aptamer-Ligand Recognition Mechanism in Bacterial Pathogenesis Mimic Condition
A.B. Rode, T. Endoh, N. Sugimoto
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (39) : Control of replication of G-quadruplex containing oxidative lesion
S. Takahashi, P. Podbevsek, J. Plavec, B. H. Kim, N. Sugimoto
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (38): Effects of malignant alteration in cancer cells on the G-quadruplex formation and transcript mutations
H. Tateishi-Karimata, K. Kawaguchi, T, Ohyama, N. Sugimoto
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (37): The formation of RNA foci in repeat expansion disorders is promoted in molecular crowding conditions
Y. Teng, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto
日本化学会第98回春季年会   2018年3月   
Molecular Crowding Effect on Nucleic Acids Chemistry:“To B or not to B”
N. Sugimoto
First International Symposium on Chemistry for Multimolecular Crowding Biosystem   2017年12月12日   
共溶質存在下におけるDNA水和水の熱力学的性質の解析
中野美紀, 建石寿枝,田中成典、Tama Florence,宮下治、杉本直己
第31回分子シミュレーション討論会   2017年11月29日   
Effect of noncanonical DNA structures on DNA polymerase
N. Suigmoto
The Second A3 Roundtable Meeting on Asia Chemical Probe Research Hub   2017年11月25日   
水和イオン液体中で機能するDNAセンサー
建石寿枝, 杉本直己
第8回イオン液体討論会   2017年11月23日   
核酸化学における“To B or not to B” [招待有り]
杉本 直己
平成29年度富山大学生命融合科学教育学部シンポジウム“ライフサイエンスを開拓先導する分子科学”   2017年11月10日   
核酸化学における”To B or not to B" [招待有り]
杉本 直己
第15回公開セミナー(Chemical Biology), 群馬大学大学院理工学府   2017年11月6日   

担当経験のある科目

 
 

Works

 
A 24 mer peptide can discriminate a single-standard DNA from a double-standarded DNA Gordon Research Conforences(Nucleic Acids Section), RI, USA, July
1999年
分子レベルの生命現象(36)二重鎖DNAに導入した鏡像異性体核酸の挙動 日本化学会第76春季年会,3A601
1999年
分子レベルの生命現象(37)RNA/DNAハイブリッドのミスマッチ塩基対の安定性に及ぼすdUとdTの効果 日本化学会第76春季年会,3A602
1999年
分子レベルの生命現象(38)コンビナトリアルケミストリー法によるDNAテトラループを認識する短鎖ペプチドの選択 日本化学会第76春季年会,3A603
1999年
分子レベルの生命現象(39)各種の塩濃度条件下における核酸の二重鎖構造の安定性予測 日本化学会第76春季年会,3A607
1999年

競争的資金等の研究課題

 
細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御
日本学術振興会: 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
研究期間: 2018年10月 - 2021年3月    代表者: 杉本 直己
核酸の非標準構造を標的とした細胞応答の化学的制御技術の構築と先制核酸医
文部科学省: 私立大学戦略的研究基盤形成支援事業
研究期間: 2014年 - 2019年    代表者: 杉本 直己
細胞夾雑模倣系の構築と細胞内活性分子設計指針の構築 (計画研究)
日本学術振興会: 新学術領域研究(研究領域提案型)
研究期間: 2017年6月       代表者: 杉本 直己
分子クラウディングワールドを活用した変異導入不要の酵素機能変換システムの開発
日本学術振興会: 挑戦的萌芽研究
研究期間: 2016年4月       代表者: 杉本 直己
核酸構造の多様性に基づく新規の遺伝暗号Dimensional Codeの解析
日本学術振興会: 基盤研究(A)
研究期間: 2016年4月       代表者: 杉本 直己
分子認識核酸の速度調節に基づく遺伝子発現の制御デバイスの構築
日本学術振興会: 特別研究員推奨費
研究期間: 2015年4月 - 2016年3月    代表者: 杉本 直己
高圧力で遺伝暗号を改変する
日本学術振興会: 挑戦的萌芽研究
研究期間: 2014年4月 - 2016年3月    代表者: 杉本 直己
遺伝子発現に重要な関与をする核酸の非標準構造のエネルギーデータベース化とその活用
日本学術振興会: 基盤研究(A)
研究期間: 2012年4月 - 2015年3月    代表者: 杉本 直己
特異なmRNA構造を活用した翻訳フレームシフト及び産生タンパク質機能の制御
公益財団法人長瀬科学技術振興財団: 長瀬科学技術振興財団助成金
研究期間: 2013年4月 - 2014年3月    代表者: 杉本 直己
G-C塩基対よりA-T塩基対を安定化させることによる新規DNAナノスイッチの開発
日本学術振興会: 挑戦的萌芽研究
研究期間: 2012年4月 - 2014年3月    代表者: 杉本 直己
分子クラウディング環境を活用した遺伝子発現系で活躍する機能性分子のデザイン・開発システムの構築
文部科学省: 私立大学戦略的研究基盤形成支援事業
研究期間: 2009年4月 - 2014年3月    代表者: 杉本 直己
生命化学分野に関する学術動向の調査研究
文部科学省: 学術システム研究センター研究員
研究期間: 2011年4月 - 2012年3月    代表者: 杉本 直己
ひらめき☆ときめき サイエンス~要こそ大学の研究室~KAKENHI
文部科学省: 
研究期間: 2011年4月 - 2012年3月    代表者: 杉本 直己
DNAの高次構造に注目した細胞のがん化機構の解明と化学物質のリスク評価システムの構築
社団法人 日本化学工業協会: 長期自主研究LRI
研究期間: 2008年9月 - 2011年8月    代表者: 杉本 直己
生命化学分野に関する学術動向の調査研究
文部科学省: 学術システム研究センター研究員
研究期間: 2010年4月 - 2011年3月    代表者: 杉本 直己
ひらめき☆ときめき サイエンス~要こそ大学の研究室~KAKENHI
文部科学省: 「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業
研究期間: 2010年4月 - 2011年3月    代表者: 杉本 直己
Protein Folding Codonによるタンパク質機能調節機構の解明
日本学術振興会: 挑戦的萌芽研究
研究期間: 2010年4月 - 2011年3月    代表者: 杉本 直己
細胞内分子環境で機能する新規核酸マテリアル創製
日本学術振興会: 基盤研究(A)
研究期間: 2009年4月 - 2011年3月    代表者: 杉本 直己
高度診断でのニーズを満たす新規細胞組織保存液の研究開発
文部科学省: 企業研究者活用型基礎研究推進事業
研究期間: 2009年12月 - 2010年11月    代表者: 杉本 直己
目指せ分子デザイナー―DNAを学ぶ☆触る☆見る☆デザインする―
文部科学省: 「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業
研究期間: 2009年4月 - 2010年3月    代表者: 杉本 直己
DNAのヒミツ探検隊―バイオがひらく新しいナノワールド―
文部科学省: 「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業
研究期間: 2008年6月 - 2009年3月    代表者: 杉本 直己
分母化学概念に基づくテーラーメード・ナノ界面の構築と制御
文部科学省: 戦略的創造研究推進事業(CREST特定課題調査)
研究期間: 2007年10月 - 2008年3月    代表者: 杉本 直己
10億分の1への旅―DNAワールドへの招待状―
文部科学省: 「ひらめき☆ときめき サイエンス~ようこそ大学の研究室~KAKENHI」研究成果の社会還元・普及事業
研究期間: 2007年4月 - 2008年3月    代表者: 杉本 直己
細胞のガン化抑制に必要なテロメア核酸とテロメラーゼタンパク質の新規制御法の開発
日本学術振興会: 萌芽研究
研究期間: 2007年4月 - 2008年3月    代表者: 杉本 直己
有用な人工生命分子創製のためのテーラーメード・バイオケミストリー
文部科学省: 私立大学学術研究高度化推進事業
研究期間: 2004年4月 - 2008年3月    代表者: 杉本 直己
核酸構造に対する分子クラウディング効果の化学的解明と分子スイッチ開発への活用
日本学術振興会: 基盤研究(B)
研究期間: 2005年 - 2007年    代表者: 杉本 直己
核酸の構造予測に基づくRNA切断反応の解析
日本学術振興会: 特定領域研究
研究期間: 2001年 - 2004年    代表者: 杉本 直己
核酸の高次構造形成に及ぼす金属イオン効果のデータベース化
日本学術振興会: 基盤研究(B)
研究期間: 2001年 - 2004年    代表者: 杉本 直己
非天然核酸を導入した新規ジーンチップの開発
日本学術振興会: 基盤研究(B)
研究期間: 2000年 - 2003年    代表者: 杉本 直己
細胞内環境下における核酸相互作用エネルギーのデータベース化
日本学術振興会: 萌芽研究
研究期間: 2003年       代表者: 杉本 直己
リボザイムの機能解明を目指したローリング・シンクロナイゼーション法の開発
日本学術振興会: 特定領域研究
研究期間: 2001年 - 2002年    代表者: 杉本 直己
インビトロ選択法とコンビケム法による超分子認識素子の開発
日本学術振興会: 特定領域研究(A)
研究期間: 1998年 - 2000年    代表者: 杉本 直己
コンビナトリアル・ケミストリーとリボザイムによる機能性分子の分離・検出法の構築
日本学術振興会: 基盤研究(B)
研究期間: 1997年 - 2000年    代表者: 杉本 直己
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
日本学術振興会: 特定領域研究(A)
研究期間: 1998年 - 1999年    代表者: 杉本 直己
遺伝子発現に関与する核酸の特異構造と金属イオンの役割
日本学術振興会: 重点領域研究
研究期間: 1996年 - 1997年    代表者: 杉本 直己
核酸の機能構造とその蛋白質認識における役割
日本学術振興会: 基盤研究(B)
研究期間: 1995年 - 1996年    代表者: 杉本 直己
希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
日本学術振興会: 重点領域研究
研究期間: 1994年 - 1996年    代表者: 杉本 直己
酵素的触媒作用を有する機能性核酸分子の開発
日本学術振興会: 萌芽的研究
研究期間: 1996年       代表者: 杉本 直己
RNAの高速構造変化と機能の関係
日本学術振興会: 重点領域研究
研究期間: 1991年 - 1993年    代表者: 杉本 直己
核酸の二重らせん形成エネルギ-の予測と測定
日本学術振興会: 一般研究(C)
研究期間: 1992年       代表者: 杉本 直己
リボザイム(RNA)の機能発現機構の解明と機能制御方法の開発
日本学術振興会: 重点領域研究
研究期間: 1990年       代表者: 杉本 直己
分子夾雑の生命化学
日本学術振興会: 新学術領域研究(研究領域提案型)
研究期間: 2017年       代表者: 浜地 格
生体シグナル解析用分子材料群の創製
日本学術振興会: 特定領域研究
研究期間: 2005年 - 2008年    代表者: 浜地 格

特許

 
オリゴリボヌクレオチド/オリゴデオキシリボヌクレオチド相補塩基対構造の安定性解析方法
特許、発明者、特許出願7-124852、特許公開8-317790
三重鎖核酸の安定化方法、及び核酸三重体の形成方法
特許、発明者、特許出願9-66427、特許公開10-257889
核酸四量体の検出方法、及び核酸四量体の存在を検知、定量する方法
特許、発明者、特許出願9-66426、特許公開10-260186
ペプチド核酸の精製方法
特許、発明者、特許出願2001-200371、特許公開2003-9858
ペプチド核酸の設計方法
特許、発明者、特許出願2001-200370、特許公開2003-9876
カルシウムイオン依存性短鎖デオキシリボザイムを用いたセンサーチップ及び塩基配列検出方法
特許、発明者、特許出願2001-243392、特許公開2003-52373
固定化デオキシリボザイム
特許、発明者、特許出願2002-69930、特許公開2003-265168
変異核酸
特許、発明者、特許出願2002-69931、特許公開2003-267990
ペプチド核酸およびオリゴペプチドからなる化合物、その製造方法ならびにその用途
特許、発明者、特許出願2002-100475、特許公開2003-289871
無細胞タンパク質合成系におけるタンパク質またはペプチドの製造方法、およびこれを用いて製造したタンパク質またはペプチド
特許、発明者、特許出願2002-133209、特許公開2003-325174
pH指示薬、およびそれを用いたpH測定方法
特許、発明者、特許出願2002-281837、特許公開2004-117217、
金ナノ粒子が固定化されたインプリントポリマー
特許、発明者、特許出願2003-144271、特許公開2004-346177
環状一本鎖DNAの製造方法、および環状一本鎖DNAの製造に使用するポリヌクレオチド配列の決定方法
特許、発明者、特許出願2004-95807、特許公開2005-278465、
細胞に導入するためのポリヌクレオチドの前処理方法、ポリヌクレオチドの細胞導入方法、およびそれに用いる細胞導入用キャリアー
特許、発明者、特許出願2005-67604、特許公開2006-246787
修飾核酸鎖・金属イオン多量体
特許、発明者、特許出願2006-59056、特許公開2006-316043
修飾核酸鎖化合物
特許、発明者、特許出願2006-59203、特許公開2006-316044
分子論理素子
特許、発明者、特許出願2005-281941、特許公開2007-96627
蛍光プローブ及び蛍光検出方法
特許、発明者、特許出願2005-295246、特許公開2007-101498
標的RNAを加水分解する方法および加水分解剤
特許、発明者、特許出願2006-41055、特許公開2007-215502
遺伝子発現制御ポリヌクレオチド
特許、発明者、特許出願2006-90838、特許公開2007-259787
ヌクレアーゼ活性の促進法
特許、発明者、特許出願2006-1848 、特許公開2008-11478
核酸を用いた紫外線吸収剤
特許、発明者、特許出願2006-3222、特許公開2008-133402
プラセンタを用いた紫外線吸収剤
特許、発明者、特許出願2007-8395、特許公開2008-174475
核酸合成を促進する化合物を含む組成物およびその利用、並びに当該化合物の製造方法
特許、発明者、特許出願2007-270700、特許公開2009-96766
核酸を用いた紫外線吸収剤
特許、発明者、特許出願2008-280356、特許公開2009-275205

社会貢献活動

 
高校生向け実験講座 『FIBER リサーチカップ』
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2018年9月25日 - 2018年9月25日
ひらめき☆ときめきサイエンス 分子の世界でナノ工作体験!
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2018年8月18日 - 2018年8月18日
高校生向け実験講座 『FIBER リサーチカップ』
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2017年8月9日 - 2017年8月9日
同DNAから性質の異なるタンパク質を作ろう!
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2017年7月29日 - 2017年7月29日
高校生向け実験講座 『FIBER リサーチカップ』
【講師, 運営参加・支援】  2017年3月 - 2017年3月
「DNAから健康生活を考えてみましょう」
【講師】  公益財団法人井植記念会  垂水文化講座  2017年
『健康科学を楽しく学ぶ』
【講師】  兵庫県  ひょうご講座  2016年
新しいDNAセンサーをつくって遺伝子のヒミツを探ろう
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2016年
高校生向け実験講座 『FIBER リサーチカップ』
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学先端生命工学研究所  2016年
DNAの姿・カタチでタンパク質の“はたらき(活性)”を変えよう
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2015年
溶液環境でDNAの“カタチ”や“はたらき”を変えてみよう
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2014年
NanoBioCollege2014社会人向け連続講座
【講師】  甲南大学 先端生命工学研究所  2014年
遺伝暗号を解く~光で視る遺伝子からタンパク質ができるまで~
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2013年
人工DNAによる次世代バイオセンサー~遺伝子の情報を探れ!~
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2012年
NanoBioCollege2012社会人向け連続講座
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2012年
NanoBioCollege2011社会人向け連続講座
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2011年
生体分子を未来センサーとして使おう ~DNA で陽イオンを検出する~
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2011年
最新ノーベル賞堪能ツアー -蛍光タンパク質と光るDNA実験-
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2010年
NanoBioCollege2010社会人向け連続講座/10億分の1から無限大へ
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2010年
NanoBioCollege2010社会人向け連続講座/次世代パートナー“バイオ分子”
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2010年
NanoBioCollege2010社会人向け連続講座/FIBERから発信する最先端テクノロジー
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2010年
目指せ分子デザイナーDNAを学ぶ☆触る☆見る☆デザインする
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  ひらめき☆ときめきサイエンス  2009年
NanoBioCollege2009社会人向け連続講座/分子をコントロールしてナノバイオを創る
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2009年
NanoBioCollege2009社会人向け連続講座/生命のしくみに隠された新しい未来技術ナノバイオの基本を学ぶ
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2009年
NanoBioCollege2009社会人向け連続講座/ナノバイオで自分の設計図を読み取る
【講師, 運営参加・支援】  甲南大学 先端生命工学研究所  2009年