MORI Hirotada

J-GLOBAL         Last updated: Nov 9, 2018 at 18:57
 
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Name
MORI Hirotada
E-mail
hmorigtc.naist.jp
Affiliation
Nara Institute of Science and Technology
Section
Graduate School of Biological Sciences, Department of Cell Biology, Bioinformatics
Job title
Professor
Degree
Doctor of Philosophy(Kyoto University)
Other affiliation
Keio University
Research funding number
90182203

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
1985
 - 
1985
1. 1985 - 1985, Assistant Professor, Biochemistry, Shiga Medical University
 
1985
 - 
1989
2. 1985 - 1989, Assistant Professor, Molecular Genetics, Medical Department, Kumamoto University
 
1989
 - 
1993
3. 1989 - 1993, Assistant Professor, Molecular Genetics, The Institute for Virus Research, Kyoto University
 
1993
 - 
1996
4. 1993 - 1996, Associate Professor, Bioinformatics, Research and Education Center for Genetic Information, Nara Institute of Science and Technology
 
1996
 - 
2005
5. 1996 - 2005, Professor, Bioinformatics, Research and Education Center for Genetic Information, Nara Institute of Science and Technology
 

Education

 
 
 - 
1985
Graduate School, Division of Natural Science, Kyoto University
 
 
 - 
1985
生物物理, Graduate School, Division of Natural Science, Kyoto University
 

Published Papers

 
Almagro G, Viale AM, Montero M, Muñoz FJ, Baroja-Fernández E, Mori H, Pozueta-Romero J
Scientific reports   8(1) 15509   Oct 2018   [Refereed]
Maier L, Pruteanu M, Kuhn M, Zeller G, Telzerow A, Anderson EE, Brochado AR, Fernandez KC, Dose H, Mori H, Patil KR, Bork P, Typas A
Nature   555(7698) 623-628   Mar 2018   [Refereed]
Murata M, Ishii A, Fujimoto H, Nishimura K, Kosaka T, Mori H, Yamada M
PloS one   13(2) e0189487   2018   [Refereed]
Monk JM, Lloyd CJ, Brunk E, Mih N, Sastry A, King Z, Takeuchi R, Nomura W, Zhang Z, Mori H, Feist AM, Palsson BO
Nature biotechnology   35(10) 904-908   Oct 2017   [Refereed]
Wyche TP, Alvarenga RFR, Piotrowski JS, Duster MN, Warrack SR, Cornilescu G, De Wolfe TJ, Hou Y, Braun DR, Ellis GA, Simpkins SW, Nelson J, Myers CL, Steele J, Mori H, Safdar N, Markley JL, Rajski SR, Bugni TS
ACS chemical biology   12(9) 2287-2295   Sep 2017   [Refereed]

Misc

 
Kitagawa, M., Ara, T., Arifuzzaman, M., Ioka-Nakamichi, T., Inamoto, E., Toyonaga, H., and Mori, H.
DNA Res   12(5) 291-299   2005
Arifuzzaman, M., Maeda, M., Itoh, A., Nishikata, K., Takita, C., Saito, R., Ara, T., Nakahigashi, K., Huang, H.C., Hirai, A., Tsuzuki, K., Nakamura, S., Altaf-Ul-Amin, M., Oshima, T., Baba, T., Yamamoto, N., Kawamura, T., Ioka-Nakamichi, T., Kitagawa, M., Tomita, M., Kanaya, S., Wada, C., and Mori, H.
Genome Res   16 686-691   2006
Baba, T., Ara, T., Hasegawa, M., Takai, Y., Okumura, Y., Baba, M., Datsenko, K.A., Tomita, M., Wanner, B.L., and Mori, H.
Mol Syst Biol   2 0008   2006
Hayashi, K., Morooka, N., Yamamoto, Y., Fujita, K., Isono, K., Choi, S., Ohtsubo, E., Baba, T., Wanner, B.L., Mori, H., and Horiuchi, T.
Mol Syst Biol   2 0007   2006
Riley, M., Abe, T., Arnaud, M.B., Berlyn, M.K., Blattner, F.R., Chaudhuri, R.R., Glasner, J.D., Horiuchi, T., Keseler, I.M., Kosuge, T., Mori, H., Perna, N.T., Plunkett, G., 3rd, Rudd, K.E., Serres, M.H., Thomas, G.H., Thomson, N.R., Wishart, D., and Wanner, B.L.
Nucleic Acids Res   34(1) 1-9   2006

Books etc

 
Regulation of Stress Response 1. in Procaryote
Stress Proteins   1993   

Works

 
EMBO

Research Grants & Projects

 
細胞の生存 - 自然界における大腸菌の場合
Japan Society for the Promotion of Science: Kakenhi
Project Year: 2016 - 2019    Investigator(s): Hirotada Mori
大腸菌K-12株のリソース群を活用し、種間相互作用による相互作用ネットワーク解析手法の確立と解析を進める。
1)各成育期の細胞内外の物質及び状態の定量解析: 細胞生育時の物理的・化学的定量方法の確立を進め、特にin vivoでの細胞内pHの変動解析を可能にした。C、N及びP源枯渇による細胞死、再生育開始までの時間変動、細胞寿命の変化の解析から、一部の分子機構解明への糸口を掴んだ。
2)Chemical genomics解析、異種間競合、宿主腸内環境での解析に向けたBar-code欠失株ライ...
長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略
Japan Society for the Promotion of Science: 科研費 基盤研究(A)
Project Year: 2013 - 2016    Investigator(s): Hirotada Mori
20塩基分子バーコードを持つ大腸菌一遺伝子欠失株ライブラリー構築を行い、1)全欠失株混合培養液の長期定常期中のpopulation変動、2)薬剤を含んだ培地中の各欠失株のpopulation変動解析、3)宿主のBW38029株のゲノム配列の決定と遺伝的背景の確認を行った。長期定常期における解析は、LB培地を用いた混合培養液中の各欠失株の相対的populationをバーコードシーケンスで決定した。さらに各サンプリング中の細胞の再生育能の違いを、取得各サンプルをLB培地で希釈し再増殖後、バーコ...
バクテリア細胞における環境状態感知システムによる細胞内ネットワーク解析
Japan Society for the Promotion of Science: Kaken
Project Year: 2013 - 2015    Investigator(s): Hirotada Mori
バクテリアにおける細胞内ネットワーク解明をバーコードを導入した2種類のトランスポゾンを利用した超高効率網羅的2重欠失株解析法の確立を目的とした。すでに単一欠失株を遺伝子単位で、接合により組合せる方法を開発し解析を進めている。しかし、環境条件の違いによる細胞内ネットワーク構造の動的変化や、網羅的リソースが完備されていない非モデル生物においても適用可能な普遍性の高い方法論の開発は非常に重要である。
1次元目のトランスポゾンをTn5で、2次元目をMarinerを利用した。Tn5はトランスポゼース...
大腸菌バーコード欠失株による化合物-遺伝子相互作用Multiplex解析
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: 新学術領域研究(研究領域提案型)
Project Year: 2013 - 2015    Investigator(s): Hirotada Mori
barcodeライブラリの完成、欠失を相補する接合可動型低コピー発現プラスミドライブラリーの構築、そして欠失株相補ライブラリーのリソース群の完成を目指した。その後構築したライブラリーによる高効率生理活性物質探索システムの構築を行うことを目的とした開発を目指した。barcodeによる混合培養液を用いて、長期定常期での各欠失株のpopulation変動を定量的にモニターすることが可能かどうかの評価を行った結果、少なくともbarcodeの量的変動をdeep sequencingで定量的に解析可能...
mRNAと新生ペプチドの局所構造による翻訳効率変化のゲノムワイド解析
Japan Society for the Promotion of Science: Kaken
Project Year: 2012 - 2015    Investigator(s): Kenji Nakahigashi
遺伝子mRNAからタンパク質が翻訳される状況を新しい実験手法で解析し、ゲノム全体の遺伝子を見た場合、翻訳開始の構造が翻訳の効率に大きな影響を与えることを明らかにした。対して、翻訳伸長の効率にも差はあったが、遺伝子全体の翻訳効率に大きな影響は与えていなかった。
また、コドン-アンチコドンの3文字目の認識や、small RNA/Hfqによる翻訳制御の実体など、ネイティブな翻訳関連因子の性質についてや、様々な抗生物質の作用機序など、これまで知られていなかった性質を示す新たな知見を得た。