Satoru Miyazaki

Profile Information

Degree: Doctor (Natural Science)(Tokyo University of Science)

Contact information: smiyazakrs.noda.tus.ac.jp
J-GLOBAL ID: 200901094001929464
researchmap Member ID: 1000206284

External link

Research Interests

Bioinformatics,database

Research Areas

Life sciences / Genomics /

Committee Memberships

Apr, 2022 - Mar, 2024

学会理事等, 日本微生物資源学会
Aug, 2004 - Mar, 2011

発起人, 情報処理学会のバイオ情報学研究会
Apr, 2007 - Mar, 2008

日本薬学会薬学教育改革大学人会議CBT問題員会, 日本薬学会
Apr, 2004 - Mar, 2005

ソフトウェア高速化および共有化委員会委員, 科学研究費、特定領域研究「ゲノム」4領域の委員会
Apr, 2003 - Mar, 2004

ソフトウェア高速化および共有化委員会委員, 科学研究費、特定領域研究「ゲノム」4領域の委員会
Apr, 2003 - Mar, 2004

オントロジー委員会委員, 科学研究費、特定領域研究「ゲノム」4領域の委員会
Apr, 2002 - Mar, 2003

オントロジー委員会委員, 科学研究費、特定領域研究「ゲノム」4領域の委員会

Awards

Nov, 2013

日本私立薬科大学協会教育賞
1998

日本動物実験代替法学会論文賞

Papers

Risk Factors for Hepatic Toxicity of High-dose Methotrexate in Patients With Osteosarcoma

Kentaro Abe , Ayako Maeda-Minami , Taku Ishizu, Shintaro Iwata , Eisuke Kobayashi, Tatsunori Shimoi, Yohei Kawano , Hironobu Hashimoto, Masakazu Yamaguchi, Tetsuya Furukawa , Satoru Miyazaki , Yasunari Mano

ANTICANCER RESEARCH, 42(2) 1043-1050, Feb, 2022 Peer-reviewed
Alfaxalone improved in acute stress-induced tactile hypersensitivity and anxiety-like behavior in mice

Kazumi Yoshizawa , Saki Ukai , Junpei Kuroda , Tsugumi Yamauchi , Daisuke Yamada , Akiyoshi Saitoh , Satoshi Iriyama , Shoichi Nishino , Satoru Miyazaki

Neuropsychopharmacol Report, Feb, 2022 Peer-reviewed
Cold-restraint stress–induced ultrasonic vocalization as a novel tool to measure anxiety in mice

Tsugumi Yamauchi, Toshinori Yoshioka, Daisuke Yamada, Takumi Hamano, Misaki Ohashi, Maki Matsumoto, Keita Iio, Maika Ikeda, Masato Kamei, Takaya Otsuki, Yasuo Sato, Kyoko Nii, Masashi Suzuki, Hiroko Ichikawa, Hiroshi Nagase, Satoshi Iriyama, Kazumi Yoshizawa, Shoichi Nishino, Satoru Miyazaki, Akiyoshi Saitoh

BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN, Jan, 2022 Peer-reviewed
Concomitant Use of High-dose Methotrexate and Glycyrrhizin Affects Pharmacokinetics of Methotrexate, Resulting in Hepatic Toxicity

Kentaro Abe , Tsukasa Higurashi , Mio Takahashi , Ayako Maeda-Minami , Yohei Kawano , Satoru Miyazaki , Yasunari Mano

IN VIVO, 35(4) 2163-2169, Jul, 2021 Peer-reviewed
Significant Variants of Type 2 Diabetes in the Arabian Region through an Integration of Exome Databases

Kosuke Goto,Katsuhiko Mineta,Satoru Miyazaki ,Takashi Gojobori

PLoS One, 16(4) e0249226, Apr, 2021 Peer-reviewed
Identification of novel heat shock-induced long non-coding RNA in human cells

Rena Onoguchi-Mizutani, Yoshihiro Kishi, Yoko Ogura, Yuuki Nishimura, Naoto Imamachi, Yutaka Suzuki, Satoru Miyazaki, Nobuyoshi Akimitsu

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, mvaa126(4) 497-505, Oct, 2020 Peer-reviewed
Gene Expression Level and Gene Set Enrichment Analysis of Host Genes

Yosuke Kondo and Satoru Miyazaki

Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics, 11(1) 100221, Mar, 2020 Peer-reviewed
Molecular Modeling and Simulation of Human Stomatin and Predictions for its Membrane Association

Yosuke Kondo, Hideshi Yokoyama, Ikuo Matsui and Satoru Miyazaki

Journal of Data Mining in Genomics & Proteomics, 9(1) 100216, Sep, 2018 Peer-reviewed
Evolutionary Analysis of Post-translational Modification Sites in Translation Elongation Factor 1A

Yosuke Kondo, Satoru Miyazaki

Japan Journal of Medicine, 1(6) 285-290, 2018 Peer-reviewed
ユーザーの求める機能性乳酸菌株のオンライン選抜システムの開発

田中尚人, 宮崎智, 鈴木智典, 冨田理, 梶川揚申, 内野昌孝, 五十君靜信, 岡田早苗

日本微生物資源学会, 33(1) 31-37, Jun, 2017 Peer-reviewed
Comparative Analysis of Intronic Noncoding RNA Genes among Organisms

Kondo Y, Hayashi C, Miyazaki S

Journal of Molecular and Genetic Medicine, 11(2) 271, 2017 Peer-reviewed
Comparative Genome Analysis of p38α MAPK Substrates Based on Transcriptional Regulatory Regions

Kei Akoshima, Yosuke Kondo, Satoru Miyazaki

Journal of Genomics and Bioinformatics, Oct, 2016 Peer-reviewed
薬局薬剤師の疑義照会による医療費削減効果及び医薬分業率との関連性 —全国薬局疑義照会調査—

鹿村恵明, 真野泰成, 小茂田昌代, 根岸健一, 佐藤嗣道, 宮崎智

YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN, 136(9) 1263-1273, Sep, 2016 Peer-reviewed
Dynamics of the Large Progenitor Toxin Complex of Clostridium botulinum

Yosuke Kondo, Satoru Miyazaki

Journal of Computer Science & Systems Biology, 9(1) 001-005, Dec, 2015 Peer-reviewed
MeSH ORA framework: R/Bioconductor packages to support MeSH over-representation analysis

Koki Tsuyuzaki, Gota Morota, Manabu Ishii, Takeru Nakazato, Satoru Miyazaki, Itoshi Nikaido

BMC BIOINFORMATICS, 16, Feb, 2015 Peer-reviewed
Genome-wide analysis of long noncoding RNA turnover.

Hidenori Tani, Naoto Imamachi, Rena Mizutani, Katsutoshi Imamura, Yeondae Kwon, Satoru Miyazaki, Sho Maekawa, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1262 305-20, 2015 Peer-reviewed
Protein functional site prediction using a conservative grade and a proximate grade.

Yosuke Kondo, Satoru Miyazaki

Journal of Data Mining in Genomics & Proteomic, 6 175, 2015 Peer-reviewed
Identification of the interaction region between hemagglutinin components of the botulinum toxin complex

Tomonori Suzuki, Shin-Ichiro Miyashita, Shintaro Hayashi, Keita Miyata, Ken Inui, Yosuke Korido, Satoru Miyazaki, Tohru Ohyama, Koichi Niwa, Toshihiro Watanabe …

INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, 65 284-288, Apr, 2014 Peer-reviewed
Gene Expression Level Analysis of Protein Coding Genes including Non-Coding RNA Genes in Intronic Regions

Yosuke Kondo and Satoru Miyazaki

QP-PQ: Quantum Probability and White Noise Analysis - Vol.31, Quantum Bio-Informatics VI, 6 93-100, Mar, 2014 Peer-reviewed
Detection of Key Residues Involving Functional Divergence Into the Translation Elongation Factor Tu/1A Family Using Quantitative Measurements for Specific Conservation of Protein Subfamilies

Yosuke Kondo, Yeondae Kwon, Satoru Miyazaki

Journal of Computer Science and Systems Biology, 2(7) 54-61, Jan, 2014 Peer-reviewed

Misc.

情報科学的手法によるnon-coding RNAの遺伝的発現制御の解析

林知里, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2013-BIO-34(2) 1-6, Jun, 2013
医薬品の構造式を起点としたADME予測モデルの構築

川島悠一, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2013BIO-34(3) 1-5, Jun, 2013
生物医学文献情報を用いた酸化ストレス起因疾患の標的候補遺伝子データベースの構築

湯浅友子, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2012-BIO-32(22) 1-6, Dec, 2012
ボツリヌス毒素関連タンパク質のホモロジーモデリング

近藤洋介, 山井太成, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2012-BIO-32(23) 1-7, Dec, 2012
生活習慣病に関連した遺伝子オントロジーの構築

宮本稔也, 權娟大, 宮崎智

情報知識学会誌, 22(2) 156-161, May, 2012
複数の疾患との共起性に着目した生物医学文献からの創薬標的遺伝子候補の抽出

權娟大, 清水將吾, 宮崎智

言語処理学会第18回年次大会発表論文集, 311-312, Mar, 2012
転写因子とそのシスエレメント配列の共進化解析

本郷沙妃, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2011-BIO-027(10) 1-6, Dec, 2011
フィブロネクチン分子由来インテグリン機能抑制性ペプチドの相互作用部位の予測

近藤洋介, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2011-BIO-027(12) 1-6, Dec, 2011
フィブロネクチン分子由来インテグリン機能抑制性ペプチドの相互作用部位の予測

近藤洋介, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2011-BIO-027(12) 1-6, Dec, 2011
Two-way AIC: マイクロアレイデータに基づく発現量変動遺伝子検出の新手法

露﨑弘毅, 富永大介, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2011-BIO-027(4) 1-6, Dec, 2011
符号理論を用いた薬剤耐性菌の金属トランスポーター遺伝子の同定

佐藤勲興, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2011-BIO-027(11) 1-6, Nov, 2011
遺伝子転写制御領域を利用した遺伝子群の共通性探索について

赤坂志津, 權娟大, 宮崎智

情報処理学会研究報告バイオ情報学, 2010-BIO-023(19) 1-6, Dec, 2010
Construction of reference cis-regulatory module database as a tool for the pattern analysis of cis-regulatory regions on Human genome sequence

Eri Kibukawa, Yoshiaki Tanaka

The 16th International Conference on Genome Informatics, Dec, 2005

Books and Other Publications

クラーク分子生物学

著/David, P. Clark 監訳, 田沼靖一, 訳者, 秋本和憲, 有賀寛芳, 石田健一郎, 礒辺俊明, 稲田利文, 井上加代子, 井上邦夫, 遠藤仁司, 岡本尚, 門松健治, 加納康正, 川崎勝己, 北潔, 小林信之, 酒井潤一, 菅原二三男, 鈴木勉, 高澤涼子, 立花章, 永田恭介, 長野光司, 堀越正美, 松野健治, 宮崎智, 宮澤宏, 村上康文, 村松正明 (Role: Joint translator)

丸善株式会社, Dec 10, 2007 (ISBN: 9784621079188)
ポストゲノムの分子生物学入門

浴俊彦, 村上康文, 宇津木孝彦, 田代文夫, 長谷川伸彦, 辻孝, 養王田正文, 小野田文俊, 宮崎智 (Role: Joint author)

㈱講談社, May 10, 2007
バイオインフォマティクス事典

編集委員, 宮野悟, 江口至洋, 金久實, 高木利久, 中井謙太, 執筆者, 編集委員を含め (Role: Joint author)

共立出版, Jul 1, 2006 (ISBN: 4320056280)
DDBJの利用法－配列データの登録・検索・解析－

五條堀孝, 菅原秀明, 斎藤成也, 舘野義男, 宮崎智, 深海-小林薫, 鈴木善幸, 福地佐斗志, 阿部貴志, 金城玲, 飯塚高康, 渡邊康司, 大久保公策 (Role: Joint author)

共立出版㈱, May 25, 2005
インターネット生物学

著者)Leonard F, Peruski Jr, Anne Harwood, Peruski(訳者, 菅原秀明, 宮崎智, 深海-小林薫, 丸山穣 (Role: Joint author)

㈱学会出版センター, May 10, 2005
時間論の諸パラダイム（生命現象における可逆と非可逆）

志村純子, 菅原秀明, 宮崎智 (Role: Joint author)

サイエンス社, Oct, 2004
バイオインフォマティクスがわかる

菅原秀明, 宮崎智, 深海-小林薫, 太田元規, 五十嵐芳暢, 五斗進, 野口英樹, 宇高恵子, 馬見塚拓, 遠藤俊徳, 土井淳, 長崎正朗, 松野浩嗣, 宮野悟, 松尾洋, 北島正人, 江崎孝行 (Role: Joint author)

㈱羊土社, Aug 15, 2003
あなたにも役立つバイオインフォマティクス

池尾一穂, 今西規, 太田元規, 木寺詔紀, 楠木正巳, 五斗進, 斎藤成也, 菅原秀明, 中井謙太, 深海-小林薫, 宮崎智, 八杉悦子, 矢田哲士, 渡邊清博 (Role: Joint author)

共立出版㈱, Oct 15, 2002
実験動物代替法マニュアル(共著)

共立出版, 1994

Presentations

116

遺伝子オントロジーを用いた発現量変動遺伝子解析法の比較

上野恵治,中野義雄,松本華奈,吉澤一巳,宮崎智

日本微生物資源学会第２８回大会, Jul 2, 2022
スキンケアによる皮膚常在菌への影響につ

柴田未央、中野義雄、宮崎

日本微生物資源学会第２８回大会, Jul 2, 2022
薬学共用試験CBTの結果解析 -2021-

石川さと子、伊藤智夫、中村明弘、増野匡彦、石塚忠男、松野純男、前田定秋、小澤孝一郎、出口芳春、三田智文、飯島史朗、宮崎智、矢ノ下良平、奥直人

日本薬学会第142年会, Mar 25, 2022
分子動力学計算を用いたアミノ酸変異によるSARS-CoV-2 Spikeタンパク質の揺らぎ解析

中野義雄、宮崎智

日本薬学会第142年会, Mar 25, 2022
ヒト遺伝子に存在しない塩基配列を利用したコロナウイルスゲノム配列の解析

徳永智史、中野義雄、宮崎智

日本薬学会第142年会, Mar 25, 2022
薬学共用試験 CBT―2020 年度結果について

石川さと子, 伊藤智夫, 中村明弘, 増野匡彦, 石塚忠男, 松野純男, 前田定秋, 小澤孝一郎, 出口芳春, 三田智文, 飯島史朗, 宮崎智, 矢ノ下良平,奥直人

第６回日本薬学教育学会大会, Aug 21, 2021
薬学共用試験CBTの結果解析 -2020-

石川さと子、伊藤智夫、中村明弘、増野匡彦、石塚忠男、松野純男、前田定秋、小澤孝一郎、出口芳春、三田智文、飯島史朗、宮崎智、矢ノ下良平、奥直人

日本薬学会第141年会, Mar 26, 2021
Comparative evolutionary analysis of influenza A virus genome sequences between human and swine to elucidate the selective genome packaging mechanism

Mai Imada

The Virtual QBIC Workshop 2020, Oct 14, 2020
ガン関連long non-coding RNAの発現制御の解析

近藤洋介、宮崎智

第42回日本分子生物学会年会, Dec 5, 2019
2. TCRマイクロクラスターの単位構造予測、 2019.12.5、マリンメッセ福岡

石田卓也、近藤洋介、宮崎智

第42回日本分子生物学会年会, Dec 5, 2019
in silicoによるA型インフルエンザウイルスゲノムの変異解析

今田眞位、近藤洋介、宮崎智

第42回日本分子生物学会年会, Dec 3, 2019
ゲノム配列情報の現状と活用

宮崎智

日本医薬品安全性学会, Jul 28, 2019
2018年度薬学共用試験報告

石川さと子、伊藤智夫、中村明弘、増野匡彦、石塚忠男、橋詰勉、松野純男、前田定秋、小澤孝一郎、出口芳春、三田智文、野田幸裕、岡村昇、田村豊、飯島史朗、宮崎智、矢ノ下良平、奥直人

第51回日本医学教育学会大会, Jul 26, 2019
シス制御モジュールを利用したp38alpha MAPK基質遺伝子の制御ネットワークの再構築

阿子島圭, 近藤洋介, 宮崎智

第39回日本分子生物学会, Dec 2, 2016
DNAを標的とする医薬品設計のためのin silico解析の一手法

高橋翔, 近藤洋介, 宮崎智

第39回日本分子生物学会, Dec 2, 2016
ヒトとマウスの遺伝子発現制御に係る配列を用いた遺伝子ネットワークの比較解析

宮崎智

第39回日本分子生物学会年会, Dec 1, 2016
ヒトとマウスのゲノム配列に基づいたイントロンに存在するノンコーディングRNAの比較解析

近藤洋介, 阿子島圭, 林知里, 宮崎智

第39回日本分子生物学会, Dec 1, 2016
翻訳伸長因子1Aの配列情報に基づいた機能分岐に関わる重要な残基の予測

近藤洋介, 宮崎智

第54回日本生物物理学会年会, Nov 27, 2016
ＭＭＰ-3と相互作用するタンパク質のアミノ酸の同定

白井徹, 近藤洋介, 宮崎智

第38回日本分子生物学会年会, Dec 1, 2015
生準相関分析を利用したRNA-seqの正当な比較方法の確立

安藤彩華, 宮崎智

第38回日本分子生物学会年会, Dec 1, 2015

Profile Information

Research Interests

Research Areas

Committee Memberships

Awards

Papers

Misc.

Books and Other Publications

Presentations

Professional Memberships

Research Projects

Menu